【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及高通量基因组甲基化DNA检测领域,尤其涉及一种多样本多片段DNA 甲基化高通量测序方法。
技术介绍
DNA甲基化是一种重要的表观遗传调控因子。在哺乳动物细胞中,DNA甲基化通常 发生在CpG二核苷酸的胞嘧啶上,形成5甲基胞嘧啶。DNA甲基化的改变,尤其是抑癌基因 启动子区的高甲基化在多种肿瘤的形成和发展过程当中起着重要的作用,同时DNA低甲基 化也与癌基因的过表达和染色体的不稳定相关。 当前,研宄DNA甲基化的方法有基因组整体甲基化检测的甲基化DNA免疫共沉 淀芯片(microarray analysis following methylated DNA immunoprecipitation, MeMe DIP-chip)、甲基化 DNA 免疫共沉淀测序(sequencing analysis following methylated DNA immunoprecipitation, MeDIP-seq)、简化的表观亚硫酸氢盐测序技术(reduced representation bisulfite sequencing, RRBS) ...
【技术保护点】
一种多样本多片段DNA甲基化高通量测序方法,其特征在于包括以下步骤:步骤一:提取基因组DNA,对基因组DNA进行重亚硫酸盐处理,然后对处理好的基因组DNA进行PCR扩增,其中针对不同基因片段使用不同的PCR引物,相同的基因片段使用标签序列区分不同的样本;步骤二:将步骤一中不同的PCR产物进行混合,使用混合好的PCR产物进行测序文库制备;步骤三:对测序文库进行QPCR质检定量;步骤四:上机测序,对不同样本特异性片段甲基化状况进行高精度分析。
【技术特征摘要】
【专利技术属性】
技术研发人员:陈静,吴奇涵,窦同海,王曦路,
申请(专利权)人:上海昂朴生物科技有限公司,
类型:发明
国别省市:上海;31
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