单一核甘酸突变型的引物组与检测方法技术

技术编号:11871167 阅读:124 留言:0更新日期:2015-08-12 22:30
本发明专利技术公开了一种单一核甘酸突变型的引物组与检测方法,该方法包括以下步骤:步骤一,采集待检全血样本,提取循环肿瘤DNA;步骤二,将获取的DNA产物加入扩增引物对进行油包水扩增反应;步骤三,去除产物中的油以及残留在反应体系中的寡核苷酸;步骤四,将经过纯化处理后的扩增产物加入测序转接头以及条形码序列,进行延伸反应;步骤五,使用磁珠纯化延伸产物;步骤六,将纯化好的延伸产物进行DNA质量评估;步骤七,评估通过的延伸产物直接进行第二代测序仪上机检测;步骤八,读取并分析检测数据。本发明专利技术对疾病做到预测、预防等积极主动管理,做到早期发现早期治疗,或提早预测提早预防。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及一种引物组与检测方法,特别是涉及一种单一核甘酸突变型的引物 组与检测方法。
技术介绍
目前针对全球及华人发生率与死亡率高的癌症为主要研宄标的,例如:开发以非 侵入式诊断策略进行结直肠癌早期肿瘤基因诊断标记的研发;针对肺癌的标靶与化疗用药 后复发、转移与抗药性,开发循环肿瘤细胞捕获技术、验证预后突变基因群检测,监控肿瘤 化疗与靶向用药的疗效等。都需要高阶基因组技术平台、转化医学研宄与验证为解决方案, 满足这些医疗上还未被解决的急迫需求。 传统疾病诊断都通过临床经验、病理检测、与细胞检测作为依据,有灵敏度的限 制,也无法做到早期发现早期治疗,或提早预测提早预防。
技术实现思路
本专利技术所要解决的技术问题是提供一种, 其对疾病做到预测、预防等积极主动管理,做到早期发现早期治疗,或提早预测提早预防。 本专利技术是通过下述技术方案来解决上述技术问题的:本专利技术提供一种单一核甘酸 突变型的引物组,其特征在于,其包括五十二组扩增引物对,其分别对应下表组号的扩增引 物对:【主权项】1. 一种单一核甘酸突变型的引物组,其特征在于,其包括五十二组扩增引物对,其分别 对应下表组号的扩增引物对:O2. -种单一核甘酸突变型的检测方法,其特征在于,其包括以下步骤: 步骤一,采集待检全血样本,提取循环肿瘤DNA ; 步骤二,将获取的DNA产物加入扩增引物对进行油包水扩增反应; 步骤三,使用去稳定剂以及磁珠纯化扩增产物,去除产物中的油以及残留在反应体系 中的寡核苷酸; 步骤四,将经过纯化处理后的扩增产物加入测序转接头以及条形码序列,进行延伸反 应; 步骤五,使用磁珠纯化延伸产物; 步骤六,将纯化好的延伸产物进行DNA质量评估; 步骤七,评估通过的延伸产物直接进行第二代测序仪上机检测; 步骤八,读取并分析检测数据,确认样本的肿瘤基因的单一核甘酸突变型。【专利摘要】本专利技术公开了一种,该方法包括以下步骤:步骤一,采集待检全血样本,提取循环肿瘤DNA;步骤二,将获取的DNA产物加入扩增引物对进行油包水扩增反应;步骤三,去除产物中的油以及残留在反应体系中的寡核苷酸;步骤四,将经过纯化处理后的扩增产物加入测序转接头以及条形码序列,进行延伸反应;步骤五,使用磁珠纯化延伸产物;步骤六,将纯化好的延伸产物进行DNA质量评估;步骤七,评估通过的延伸产物直接进行第二代测序仪上机检测;步骤八,读取并分析检测数据。本专利技术对疾病做到预测、预防等积极主动管理,做到早期发现早期治疗,或提早预测提早预防。【IPC分类】C12N15-11, C12Q1-68【公开号】CN104830856【申请号】CN201510270886【专利技术人】杨鑫, 陈根德, 童凯泽, 张天昫, 陈昱廷, 张汉铭 【申请人】上海基龙生物科技有限公司【公开日】2015年8月12日【申请日】2015年5月26日本文档来自技高网...

【技术保护点】
一种单一核甘酸突变型的引物组,其特征在于,其包括五十二组扩增引物对,其分别对应下表组号的扩增引物对: 组号扩增引物对组号扩增引物对组号扩增引物对1SEQ ID NO:1和SEQ ID NO:5319SEQ ID NO:19和SEQ ID NO:7137SEQ ID NO:37和SEQ ID NO:892SEQ ID NO:2和SEQ ID NO:5420SEQ ID NO:20和SEQ ID NO:7238SEQ ID NO:38和SEQ ID NO:903SEQ ID NO:3和SEQ ID NO:5521SEQ ID NO:21和SEQ ID NO:7339SEQ ID NO:39和SEQ ID NO:914SEQ ID NO:4和SEQ ID NO:5622SEQ ID NO:22和SEQ ID NO:7440SEQ ID NO:40和SEQ ID NO:925SEQ ID NO:5和SEQ ID NO:5723SEQ ID NO:23和SEQ ID NO:7541SEQ ID NO:41和SEQ ID NO:936SEQ ID NO:6和SEQ ID NO:5824SEQ ID NO:24和SEQ ID NO:7642SEQ ID NO:42和SEQ ID NO:947SEQ ID NO:7和SEQ ID NO:5925SEQ ID NO:25和SEQ ID NO:7743SEQ ID NO:43和SEQ ID NO:958SEQ ID NO:8和SEQ ID NO:6026SEQ ID NO:26和SEQ ID NO:7844SEQ ID NO:44和SEQ ID NO:969SEQ ID NO:9和SEQ ID NO:6127SEQ ID NO:27和SEQ ID NO:7945SEQ ID NO:45和SEQ ID NO:9710SEQ ID NO:10和SEQ ID NO:6228SEQ ID NO:28和SEQ ID NO:8046SEQ ID NO:46和SEQ ID NO:9811SEQ ID NO:11和SEQ ID NO:6329SEQ ID NO:29和SEQ ID NO:8147SEQ ID NO:47和SEQ ID NO:9912SEQ ID NO:12和SEQ ID NO:6430SEQ ID NO:30和SEQ ID NO:8248SEQ ID NO:48和SEQ ID NO:10013SEQ ID NO:13和SEQ ID NO:6531SEQ ID NO:31和SEQ ID NO:8349SEQ ID NO:49和SEQ ID NO:10114SEQ ID NO:14和SEQ ID NO:6632SEQ ID NO:32和SEQ ID NO:8450SEQ ID NO:50和SEQ ID NO:10215SEQ ID NO:15和SEQ ID NO:6733SEQ ID NO:33和SEQ ID NO:8551SEQ ID NO:51和SEQ ID NO:10316SEQ ID NO:16和SEQ ID NO:6834SEQ ID NO:34和SEQ ID NO:8652SEQ ID NO:52和SEQ ID NO:10417SEQ ID NO:17和SEQ ID NO:6935SEQ ID NO:35和SEQ ID NO:87  18SEQ ID NO:18和SEQ ID NO:7036SEQ ID NO:36和SEQ ID NO:88  。...

【技术特征摘要】

【专利技术属性】
技术研发人员:杨鑫陈根德童凯泽张天昫陈昱廷张汉铭
申请(专利权)人:上海基龙生物科技有限公司
类型:发明
国别省市:上海;31

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