用于检测或测定病毒载体组合物对真核细胞及其所用生物标记的影响的方法技术

本发明专利技术涉及用于表征在响应病毒载体组合物引入靶细胞时的总体细胞变化的方法和组合物。更具体地讲，它涉及用于评价将转基因转入靶细胞的病毒载体组合物的质量的方法，所述方法包括测定选自以下的至少一种生物标记的表达水平：CXCL2和EREG，和/或选自以下的至少一种生物标记的表达水平：ASPM、AURKB、CENPA、CENPF、CKS1B、E2F8、ERCC6L、FAM83D、KIFC1、MKI67、NEK2、NUSAP1、OIP5、PRC1、RRM2、SGOL1、SPC25、TOP2A和TTK。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】本专利技术一般而言涉及病毒载体介导的基因治疗和重组基因表达领域。更具体地讲，本专利技术涉及使用一组特定的基因产物(“生物标记”)和它们的差异表达方式(“表达特征”)的方法和组合物，其中所述表达方式关系到病毒载体组合物可能对任何指定靶细胞、尤其是任何指定真核细胞的影响。本专利技术是基于在病毒载体转导的细胞中差异表达的一组特定的生物标记的鉴定，所述生物标记可用于预测病毒载体组合物的质量，即纯度和/或浓度。该组基因也可用于设计具有改进的治疗功效的特定辅助形式。基于病毒的载体是常用于将遗传物质递送到细胞中的工具。这样的载体最先开发用作裸DNA转染的备选，用于分子遗传学实验和用于治疗用途例如基因治疗或疫苗。病毒载体分为两个主要类别：将自身插入受体基因组的整合载体，和通常形成染色体外遗传元件的非整合载体。整合载体例如γ-逆转录病毒载体(RV)和慢病毒载体(LV)是稳定遗传的。非整合载体，例如腺病毒载体(ADV)和腺伴随病毒(AAV)载体从迅速分裂的细胞中快速丢失。具体地讲，逆转录病毒载体源自属于逆转录病毒科(Retroviridiae)的病毒，其包含具有复杂大分子结构的包膜RNA病本文档来自技高网...

【技术保护点】
用于评价将转基因转入靶细胞的病毒载体组合物的质量的方法，所述方法包括：(a) 在尚未与病毒载体组合物接触的靶细胞中测定选自以下的至少一种生物标记的表达水平：CXCL2和EREG；(b) 在与所述病毒载体组合物接触后测定靶细胞中所述至少一种生物标记的表达水平；和(c) 比较(b)中的所述生物标记表达和(a)中的生物标记表达，其中与(a)相比，(b)中的生物标记表达水平显著上调表明病毒载体组合物的质量不足。

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】2012.07.26 US 61/6760981. 用于评价将转基因转入靶细胞的病毒载体组合物的质量的方法，所述方法包括：(a) 在尚未与病毒载体组合物接触的靶细胞中测定选自以下的至少一种生物标记的表达水平：CXCL2和EREG；(b) 在与所述病毒载体组合物接触后测定靶细胞中所述至少一种生物标记的表达水平；和(c) 比较(b)中的所述生物标记表达和(a)中的生物标记表达，其中与(a)相比，(b)中的生物标记表达水平显著上调表明病毒载体组合物的质量不足。
2. 权利要求2的方法，其中与(a)相比，在高MOI的显著上调是两倍上调。
3. 权利要求1-2中任一项的方法，进一步包括以下步骤：(d) 在尚未与病毒载体组合物接触的靶细胞中测定选自以下的至少一种生物标记的表达水平：ASPM、AURKB、CENPA、CENPF、CKS1B、E2F8、ERCC6L、FAM83D、KIFC1、MKI67、NEK2、NUSAP1、OIP5、PRC1、RRM2、SGOL1、SPC25、TOP2A和TTK；(e) 在与所述病毒载体组合物接触后测定靶细胞中所述至少一种生物标记的表达水平；和(f) 比较(e)中的所述生物标记表达和(d)中的生物标记表达，其中与(d)相比，(e)中的生物标记表达水平的显著下调表明病毒载体组合物的质量不足。
4. 权利要求3的方法，其中与(d)相比，在最佳MOI的显著下调是1.5倍下调。
5. 权利要求1-4中任一项的方法，进一步包括以下步骤：(g) 在与对照病毒载体组合物接触后测定靶细胞中选自以下的至少一种生物标记的表达水平：CXCL2和EREG；和(h) 比较(g)中的所述生物标记表达与(a)中的生物标记表达，其中与(a)相比，检测到(g)中的生物标记无显著差异表达。
6. 权利要求1-5中任一项的方法，进一步包括以下步骤：(j) 在与对照病毒载体组合物接触后测定靶细胞中选自以下的至少一种生物标记的表达水平：ASPM、AURKB、CENPA、CENPF、CKS1B、E2F8、ERCC6L、FAM83D、KIFC1、MKI67、NEK2、NUSAP1、...

【专利技术属性】
技术研发人员：P布耶，R加永，A伊谢，
申请(专利权)人：韦克塔里斯公司，
类型：发明
国别省市：法国;FR