早期膀胱癌血清miRNAs特异表达谱及诊断模型制造技术

技术编号:10338259 阅读:173 留言:0更新日期:2014-08-20 20:38
本发明专利技术公开了一种早期膀胱癌血清miRNAs特异表达谱,由表达上调的miR-152,miR-148b-3p,以及表达下调的miR-3187-3p,miR-15b-5p,miR-27a-3p,miR-30a-5p构成。所述早期膀胱癌血清miRNAs特异表达谱中特异表达miRNAs的逆转录引物和检测引物,如SEQIDNO:1~13所示。本发明专利技术还提供了一种早期膀胱癌血清miRNAs诊断模型,利用以下公式:logit(P=BC)=0.439+0.1775*(miR-152)+0.0767*(miR-148b-3p)-0.475*(miR-3187-3p)-0.2395*(miR-15b-5p)-0.625*(miR-27a-3p)-0.1693*(miR-30a-5p)计算,用于膀胱癌的早期诊断,经ROC曲线分析,此血清miRNAs模型对膀胱癌具有较高的诊断效率,高于传统的尿液脱落细胞学,此模型能够诊断膀胱癌早期患者(Ta和T1)。

【技术实现步骤摘要】
早期膀胱癌血清m i RNAs特异表达谱及诊断模型
本专利技术涉及早期膀胱癌血清miRNAs特异表达谱,其逆转录引物和检测引物,以及诊断模型,属于医学诊断

技术介绍
膀胱癌是泌尿系统最常见的恶性肿瘤,在我国其发病率和死亡率均居泌尿系统肿瘤的首位,且近年有逐渐上升的趋势。20% -30%的膀胱癌病人初诊时已发生肌层浸润,而在最初诊断为非侵袭性膀胱癌的病人中,约15%的膀胱癌病人五年内发展为侵袭性膀胱癌。因此,早期诊断和早期治疗是改善膀胱癌预后、降低死亡率的关键。目前,用于膀胱癌的诊断方法主要包括膀胱镜、尿脱落细胞学及影像学检查等。膀胱镜检查虽然具有较高的诊断效能,但该检查方法的有创性限制了其在膀胱癌筛查中的广泛应用;尿液脱落细胞学检查虽特异性较高,但敏感性较低,尤其对低分级肿瘤的敏感性仅为20%~40%,且易受监测这主观因素的影响;CT和超声检查不易发现膀胱内较小的病变,对膀胱癌分期预测具有一定的有限性。寻找临敏感性高和特异性高的早期肿瘤标志物,建立一种安全有效的血清学膀胱癌诊断方法是临床亟待解决的难题。MicroRNA(miRNAs)是一类广泛分布于真核生物的高度保守的、非蛋白编码的单链小分子RNAs,通过对靶mRNA降解或翻译抑制,在转录后水平调节靶基因的表达,进而调控细胞分化、生长、代谢和凋亡等功能。以往研究证实,miRNAs在肿瘤中异常表达,与肿瘤的发生、发展、转移和预后存在密切的联系。近年来研究发现,血清中存在丰富且稳定的miRNAs,通过对比分析肿瘤患者和对照组血清中miRNAs表达谱,发现不同肿瘤具有其特定的miRNAs表达谱,为肿瘤的无创性早期诊断提供了新的依据。因此,确定膀胱癌miRNAs特异表达谱,筛选差异表达的miRNAs,建立膀胱癌血清miRNAs诊断模型,有助于实现对膀胱癌的早期诊断。
技术实现思路
针对上述现有技术的不足,本专利技术提供了膀胱癌患者血清miRNA特异表达谱,及其逆转录引物和检测引物、检测试剂盒,以及诊断模型,为临床上膀胱癌的早期发现和早期治疗提供支持。为实现上述目的,本专利技术采用下述技术方案:一种早期膀胱癌miRNAs特异表达谱,由上调表达的miR-152, miR-148b_3p以及下调表达的 miR-3187_3p, miR-15b_5p, miR-27a_3p, miR-30a_5p 构成。所述miRNAs来自外周静脉血的血清。所述膀胱癌miRNAs特异表达谱中特异表达miRNAs的逆转录引物和检测引物,如下: ((l)miR-152的逆转录引物和前向检测引物:逆转录引物的序列如SEQIDNO:1所示,前向检测引物的序列如SEQIDNO:2所示:SEQIDNO: I:[0011 ] 5 ’ -CTCAACTGGTGTCGTGGAGTCGGCAATTCAGTTGAGCCAAGTTC-3,;SEQIDNO:2:5’ -ACACTCCAGCTGGGTCAGTGCATGACAGA-3’ ;(2)miR-148b-3p的逆转录引物和前向检测引物:逆转录引物的序列如SEQIDNO:3所示,前向检测引物的序列如SEQIDNO:4所示:SEQIDNO:3:5, -CTCAACTGGTGTCGTGGAGTCGGCAATTCAGTTGAGACAAAGTT-3,;SEQIDNO:4:5’ -ACACTCCAGCTGGGTCAGTGCATCACAGAA-3’ ;(3)miR-3187-3p的逆转录引物和前向检测引物:逆转录引物的序列如SEQIDNO:5所示,前向检测引物的序列如SEQIDNO:6所示:SEQIDNO:5:5’ -CTCAACTGGTGTCGTGGAGTCGGCAATTCAGTTGAGCCGCGCAG-3’ ;SEQIDNO:6:5,-ACACTCCAGCTGGGTTGGCCATGGGGCT-3,;(4)miR-15b-5p的逆转录引物和前向检测引物:逆转录引物的序列如SEQIDNO:7所示,前向检测引物的序列如SEQIDNO:8所示:SEQIDNO:7:5’ -CTCAACTGGTGTCGTGGAGTCGGCAATTCAGTTGAGTGTAAACC-3’ ;SEQIDNO:8:5,-ACACTCCAGCTGGGTAGCAGCACATCATGG-3,;(5)miR-27a-3p的逆转录引物和前向检测引物:逆转录引物的序列如SEQIDNO:9所示,前向检测引物的序列如SEQIDNO:10所示:SEQIDNO:9:5’ -CTCAACTGGTGTCGTGGAGTCGGCAATTCAGTTGAGGCGGAACT-3’ ;SEQIDNO:10:5,-ACACTCCAGCTGGGTTCACAGTGGCTAAGT-3,;(6)miR-30a-5p的逆转录引物和前向检测引物:逆转录引物的序列如SEQIDNO:11所示,前向检测引物的序列如SEQIDNO:12所示:SEQIDNO: 11:5’ -CTCAACTGGTGTCGTGGAGTCGGCAATTCAGTTGAGCTTCCAGT-3’ ;SEQIDNO:12:5,-ACACTCCAGCTGGGTGTAAACATCCTCGAC-3,;(7)六种miRNAs的通用反向检测引物如SEQIDNO:13所示:SEQIDNO:13:5,-TGGTGTCGTGGAGTCG-3,。一种用于早期膀胱癌诊断用试剂盒或生物芯片,包括上述特异表达miRNAs的逆转录引物和检测引物。一种早期膀胱癌血清miRNAs诊断模型。具体如下:运用以下公式计算:1git (P = BC) = 0.439+0.1775* (miR-152)+0.0767* (miR-148b-3p)-0.475*(miR-3187-3p) — 0.2395*(miR-15b_5p) — 0.625*(miR-27a_3p)—0.1693*(miR-30a-5p)公式中的“(miR-152) ”、“(miR-148b_3p) ”、“ (miR-3187_3p) ”、“miR-15b_5p) ”、“miR-27a-3p”、“miR-30a-5p”分别表示相对应的miRNAs的表达量。一种利用上述诊断模型诊断的方法,如下:首先,利用上述特异表达miRNAs的逆转录引物和检测引物测定待诊断患者的血清中六种miRNAs的表达量,包括miR-152,miR-148b-3p, miR-3187_3p,miR-15b_5p,miR-27a_3p 和 miR-30a_5p,然后,运用下述公式计算:logit (P = BC) = 0.439+0.1775* (miR-152)+0.0767* (miR-148b-3p)-0.475*(miR-3187-3p) — 0.2395*(miR-15b_5p) — 0.625*(miR-27a_3p)—0.1693*(miR-30a-5p)将六种miRNAs的表达量分别输入Matlab软件(该软件为所属领域的常规软件,为现有技术中已有的软件),若1git (P = BC)为1,可以判断为膀胱癌;若1git (P = BC)为0,判断为非膀胱癌。本专利技术首先基于临床常规收集的非侵袭性膀胱癌患者、侵袭性膀胱癌患者及对照者血清样本筛查差异本文档来自技高网
...

【技术保护点】
一种早期膀胱癌miRNAs特异表达谱,其特征在于:由上调表达的miR‑152,miR‑148b‑3p,以及下调表达的miR‑3187‑3p,miR‑15b‑5p,miR‑27a‑3p,miR‑30a‑5p构成。

【技术特征摘要】
1.一种早期膀胱癌miRNAs特异表达谱,其特征在于:由上调表达的miR-152,miR-148b-3p,以及下调表达的 miR-3187_3p,miR-15b_5p,miR-27a_3p,miR-30a_5p 构成。2.根据权利要求1所述的早期膀胱癌miRNAs特异表达谱,其特征在于:所述miRNAs来自外周静脉血的血清。3.权利要求1所述的早期膀胱癌miRNAs特异表达谱中特异表达miRNAs的逆转录引物和检测引物,其特征在于:包括以下引物: (1)miR-152的逆转录引物和前向检测引物:逆转录引物的序列如SEQIDNO:1所示,前向检测引物的序列如SEQIDNO:2 所示: SEQIDN0: I:5’ _CTCAACTGGTGTCGTGGAGTCGGCAATTCAGTTGAGCCAAGTTC_3’ ;SEQIDNO:2:5’ -ACACTCCAGCTGGGTCAGTGCATGACAGA-3’ ; (2)miR-148b-3p的逆转录引物和前向检测引物:逆转录引物的序列如SEQIDNO:3所示,前向检测引物的序列如SEQIDNO:4所示:SEQIDNO:3:5’ _CTCAACTGGTGTCGTGGAGTCGGCAATTCAGTTGAGACAAAGTT_3’ ;SEQIDNO:4:5’ -ACACTCCAGCTGGGTCAGTGCATCACAGAA-3’ ; (3)miR-3187-3p的逆转录引物和前向检测引物:逆转录引物的序列如SEQIDNO:5所示,前向检测引物的序列如SEQIDNO:6所示:SEQIDNO:5:5’ _CTCAACTGGTGTCGTGGAGTCGGCAATTCAGTTGAGCCGCGCAG_3’ ;SEQIDNO:6:5’ -ACACTCCAGCTGGGTTGGCCATGGGGCT-3’ ; (4)miR-15b-5p的逆转录引物和前向检测引物:逆转录引物的序列如SEQIDNO:7所示,前向检测引物的序列如SEQIDNO:8所示:SEQIDNO:7:5’ _CTCAACTGGTGTCGTGGAGTCGGCAATTCAGTTGAGTGTAAACC_3’ ;SEQIDNO:8:5’ -ACACTCCAGCTGGGTAGCAGCACATCATGG-3’ ; (5)miR-27a-3p的逆转录引物和前向检测引物:逆转录引物的序列如SEQIDNO:9所示,前向检测引物的序列如SEQIDNO:10所示:SEQIDNO:9:5’ _CTCAACTGGTGTCGTGGAGTCGGCAATTCAGTTGAGGCGGAACT_3’ ;SEQIDNO:10:5’ -ACACTCCAGCTGGGTTCACAGTGGCTAAGT-3’ ; (6)miR-30a-5p的逆转录引物和前向检测引物:逆转录引物的序列如SEQIDNO:11所示,前向检测引物的序列如SEQIDNO:12所示:SEQIDNO:11:5’ -CTCAACTGGTGTCGTGGAGTCGGCAATTCAGTTGAGCTTCCAGT-3’ ;SEQIDNO:12:5’ -ACACTCCAGCTGGGTGTAAACATCCTCGAC-3’ ; (7)六种miRNAs的通用反向检测引物如SEQIDNO:13所示:SEQIDNO:13:5’ -TGGTGTCGTGGAGTCG-3’。4.一种用于早期膀胱癌诊断用试剂盒或生物芯片,其特征在于:包括特异表达miRNAs的逆转录引物和检测引物,如下: (1)miR-152的逆转录引物和前向检测引物:逆转录引物的序列如SEQIDNO:1所示,前向检测引物的序列如SEQIDNO:2所示: SEQIDNO: I:.5’ _CTCAACTGGTGTCGTGGAGTCGGCAATTCAGTTGAGCCAAGTTC_3’ ;SEQIDNO:2:5’ -ACACTCCAGCTGGGTCAGTGCATGACAGA-3’ ; (2)miR-148b-3p的逆转录引物和前向检测引物:逆转录引物的序列...

【专利技术属性】
技术研发人员:王传新杜鲁涛蒋秀梅张欣杨咏梅
申请(专利权)人:山东大学齐鲁医院
类型:发明
国别省市:山东;37

网友询问留言 已有0条评论
  • 还没有人留言评论。发表了对其他浏览者有用的留言会获得科技券。

1