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深圳吉因加医学检验实验室专利技术
深圳吉因加医学检验实验室共有37项专利
一种用于核酸杂交的组合物及其应用制造技术
本公开涉及一种用于核酸杂交的组合物,属于分子生物学领域,所述组合物包含三价阳离子盐,应用本公开所述杂交捕获体系,能够加快杂交反应进程,缩短杂交时间,并获得良好的杂交捕获效果。
一种用于小麦原生质体分离的酶解液及分离方法和应用技术
本文提供了一种用于小麦原生质体分离的酶解液及分离方法和应用。该酶解液包括纤维素酶和果胶酶,其中,所述纤维素酶和果胶酶的质量比为(5‑30):1。采用本文的酶解液制备的小麦原生质体单细胞悬液细胞活性高达90%以上,单细胞分选的细胞捕获率高...
一种用于去除宿主核酸的探针设计方法及试剂盒技术
一种用于去除宿主核酸的探针设计方法及试剂盒,试剂盒中探针设计方法包括:参考基因组拆分步骤,包括将宿主参考基因组按预设步长、预设窗口拆分成原始探针序列集合,去掉完全重复的冗余序列,得到探针集;筛选步骤,包括将所述探针集中的所有探针进行两两...
心血管系统细胞特异性的甲基化标志物及其应用技术方案
一种细胞特异性的甲基化标志物及其组合方式,以及一种确定样本中目的细胞来源的游离DNA量的方法。应用所述标志物及其组合方式,结合所述方法,可以体现来源于不同个体和不同时期的不同样本之间存在的差异。基于此效用,不仅可以用于疾病或损伤状态的早...
一种基于甲基化差异预测样本来源的方法及装置制造方法及图纸
一种基于甲基化差异预测样本来源的方法及装置,该方法包括甲基化状态获取步骤,包括获取待测样本的甲基化测序数据中的甲基化状态;片段分析步骤,包括使用选自对照组基线概率算法、平均甲基化率算法、空间连续性算法中的至少一种分析待测样本测序数据中片...
一种用于目标微生物标记物的筛选方法及其应用技术
本发明的一种用于筛选目标微生物的标记物的方法,筛选得到的标记物及其检测探针组能够快速、准确、高灵敏度、高特异性地靶向检测目标微生物。相比于现有技术,该发明方法对病原检测目标性更强,受人源核酸影响更小,可以有效降低宿主背景噪音,对于低载量...
一种用于玉米原生质体分离的酶解液及分离方法和应用技术
本文提供了一种用于玉米原生质体分离的酶解液及分离方法和应用。该酶解液包括纤维素酶、离析酶和半纤维素酶,其中,所述纤维素酶、离析酶和半纤维素酶的质量比为(1‑5):(0.5‑3):1。采用本文的酶解液制备的玉米原生质体单细胞悬液细胞活性高...
一种基于DSN构建微生物测序文库的方法与试剂盒技术
一种构建微生物测序文库的方法及其检测方法与试剂盒,杂交步骤,包括将探针与连接有测序接头的核酸分子混合,反应得到杂交产物;酶处理步骤,包括使用双链特异性核酸酶去除或切断体系中的双链核酸分子;扩增步骤,包括对去除双链核酸分子后的核酸进行PC...
DNA文库构建方法、装置及其应用制造方法及图纸
本公开提供了一种DNA文库构建方法、试剂盒及其应用。使用本公开所述方法,能够对探针或引物进行质控。无需对引物探针实际使用的效果进行评估质控,该方法仅需要对测序文库的下机数据与探针序列进行比对即可完成质控,节省了时间成本及昂贵的实际测试成...
一种甲基化标志物分层筛选的方法及装置制造方法及图纸
一种甲基化标志物分层筛选的方法及装置,对样本进行分层的方法,包括:数据获取步骤,包括获取样本的甲基化修饰数据;预处理步骤,包括对所述甲基化修饰数据进行预处理,获得预处理后的各个类型样本;降维处理步骤,包括对预处理后的各个类型样本分别进行...
一种同时检测甲基化和突变信息的方法及装置制造方法及图纸
一种同时检测甲基化和突变信息的方法及装置,该方法包括:甲基化检测步骤,包括将模板链分为XM模板链、F1R2模板链、F2R1模板链,如果XM模板链存在错配,则预测为突变,如果F2R1模板链存在C到T的错配,则预测为突变,如果F1R2模板链...
一种构建病原生物基因组数据库的方法及装置制造方法及图纸
一种构建病原生物基因组数据库的方法及装置,该方法包括:获取基因组数据步骤,包括从数据库获取选定的病原生物的基因组数据;同源区域屏蔽步骤,包括对基因组数据进行质粒同源区域屏蔽、宿主源同源区域屏蔽,获得屏蔽同源区域后的基因组数据;融合基因组...
一种检测样本污染率的方法及装置制造方法及图纸
一种检测样本污染率的方法及装置,该方法包括:位点MAF提取步骤,包括提取待测样本的测序数据中的位点在数据库中的MAF;过滤步骤,包括过滤去除不符合条件的SNP位点;错误率计算步骤,包括计算不同碱基替换的错误率;似然值计算步骤,包括计算待...
一种用于结构变异检测的方法、装置和存储介质制造方法及图纸
本申请公开了一种用于结构变异检测的方法、装置和存储介质。本申请方法包括,获取比对文件,从比对文件中按照设定长度提取区间内reads,将异常reads分成DP信号、SR信号和SU信号;对DP信号进行聚类,每个簇作为一结构变异候选,对每个簇...
一种检测结构变异的方法及装置制造方法及图纸
一种检测结构变异的方法及装置,检测结构变异的方法包括:计算步骤,包括计算待测样本测序文库的最大插入片段长度;信号提取步骤,包括从待测样本的测序数据中提取SU信号、DP信号、SR信号;信号处理步骤,包括对SR信号、SU信号、DP信号进行处...
一种矫正同源重组修复缺陷评分的方法及装置制造方法及图纸
一种矫正同源重组修复缺陷评分的方法及装置,该方法包括:矫正步骤,包括按如下公式对同源重组修复缺陷评分进行矫正,获得矫正后的同源重组修复缺陷评分:HRDscore
一种mNGS鉴定微生物的数据处理方法、装置及存储介质制造方法及图纸
本申请公开了一种mNGS鉴定微生物的数据处理方法、装置及存储介质。本申请的数据处理方法包括,利用Linux系统提供的内存映射/dev/shm加载数据库;在读取数据库之前,先检查数据库大小,如小于硬盘中原始加载的数据库大小,则通过虚拟内存...
一种同源重组修复缺陷的评估方法、装置和存储介质制造方法及图纸
本申请公开了一种同源重组修复缺陷的评估方法、装置和存储介质。本申请方法包括,获取待测样本低深度全基因组测序数据,去接头,比对到参考基因组上,过滤PCR重复序列;对数据进行质控和污染数据过滤,然后用ACE软件进行CNV分析,获得total...
一种差异性甲基化区域筛选方法及其装置制造方法及图纸
一种差异性甲基化区域筛选方法及其装置,筛选方法包括:CpG簇的提取步骤;CpG簇的筛选步骤;肿瘤组织特异的差异性甲基化区域筛选步骤;肿瘤cfDNA特异的差异性甲基化区域筛选步骤,以健康样本的cfDNA测序数据和患病样本的cfDNA测序数...
一种组合物及其试剂盒与纯化方法技术
一种组合物及其试剂盒与纯化方法,组合物包含磁珠以及聚乙二醇。该组合物可用于纯化经过酸性还原试剂还原后的核酸分子,聚乙二醇的加入,可以显著提升核酸的还原回收率,而且使得回收率更稳定。该组合物作为纯化体系,可以更方便地匹配自动化仪器,提升样...
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