【技术实现步骤摘要】
可用于胃癌HER2伴随诊断的基因甲基化标记物或其组合和应用
[0001]本专利技术属于生物
,具体涉及可用于胃癌HER2蛋白过表达或基因扩增伴随诊断的基因甲基化标记物或其组合和应用。
技术介绍
[0002]胃癌(gastriccarcinoma GC)是常见的恶性肿瘤之一,近年来虽然全球范围内胃癌发病率有所下降,但其依然是癌症相关死亡的第二大常见肿瘤,据估计每年有930000新发病例,年死亡人数超过700000例,其发病率存在较大的地域差异,与饮食、生活方式、经济状况以及幽门螺旋杆菌感染流行相关,超过2/3 新发病例和死亡病例发生于发展中国家,其中东亚占42.4%(主要是中国)。
[0003]胃癌现有靶向治疗手段有限,其中HER2(人表皮生长因子受体2)是肿瘤靶向治疗中的关键靶点,HER2蛋白能够激活细胞生长与增殖相关信号传导通路,该蛋白的过度表达与乳腺癌、胃癌等肿瘤的发生有密切关系。随着精准治疗时代的到来,伴随诊断这一体外诊断技术日益受到广泛关注,该技术可用于检测生物标志物并与特定药物的使用相关联,是肿瘤精准诊治领域的重要一环。针对乳腺癌的HER2伴随诊断检测已广泛应用于乳腺癌患者的临床诊治之中,而胃癌由于病变组织具有较高的异质性且传统的组织活检、免疫组织化学染色法、原位杂交检测等方法对样本采集、样本量和处理要求较高,在多次取样对患者也会造成一定伤害,且在检测实践中的一些问题也不断显现,例如胃镜活检标本HER2检测未得到普及;原位杂交检测率低下,并由此导致大多数免疫组织化学染色(IHC)2+的胃癌病例 ...
【技术保护点】
【技术特征摘要】
1.一种可用于胃癌HER2蛋白过表达或基因扩增伴随诊断的甲基化标记物或其组合,其特征在于,所述甲基化标记物或其组合包括选自以下标记物中的任意一种或两种及以上的组合:chr17:37879893、chr17:37881021、chr17:37886390、chr17:37893765、chr17:37860353、chr17:37843592。2.根据权利要求1所述的可用于胃癌HER2蛋白过表达或基因扩增伴随诊断的甲基化标记物或其组合,其特征在于,所述甲基化标记物或其组合包括chr17:37879893和/或chr17:37843592标记物。3.根据权利要求2所述的可用于胃癌HER2蛋白过表达或基因扩增伴随诊断的甲基化标记物或其组合,其特征在于,所述甲基化标记物或其组合包括标记物chr17:37879893和chr17:37860353。4.根据权利要求1所述的可用于胃癌HER2蛋白过表达或基因扩增伴随诊断的甲基化标记物或其组合,其特征在于,所述甲基化标记物或其组合还包括选自以下的至少一种:chr17:37862986,chr17:37862178,chr17:37884314,chr17:37879819,chr17:37895887,chr17:37893999,chr17:37855528,chr3:38080799,chr17:37843863,chr17:37821433,chr17:37856695,chr17:37926322标记物。5.根据权利要求4所述的可用于胃癌HER2蛋白过表达或基因扩增伴随诊断的甲基化标记物或其组合,其特征在于,所述甲基化标记物组合包括chr17:37879893,chr17:37886390和chr17:37893999标记物。6.根据权利要求4所述的可用于胃癌HER2蛋白过表达或基因扩增伴随诊断的基因甲基化标记物或其组合,其特征在于,所述甲基化标记物或其组合包括chr17:37879893,chr17:37886390,chr17:37893765,chr17:37862178,和chr17:37893999标记物。7.根据权利要求2所述的可用于胃癌HER2蛋白过表达或基因扩增伴随诊断的甲基化标记物或其组合,其特征在于,所述甲基化标记物组合包括chr17:37843592、chr17:37879893和chr17:37860353标记物。8.根据权利要求2所述的可用于胃癌HER2蛋白过表达或基因扩增伴随诊断的甲基化标记物或其组合,其特征在于,所述甲基化标记物组合包括chr17:37843592、chr17:37893999和chr17:37860353标记物。9.根据权利要求2所述的可用于胃癌HER2蛋白过表达或基因扩增伴随诊断的甲基化标记物或其组合,其特征在于,所述甲基化标记物组合包括chr17:37843592、chr17:37862178标记物。10.根据权利要求1
‑
8任一项所述的可用于胃癌HER2蛋白过表达或基因扩增伴随诊断的甲基化标记物或其组合,其特征在于,所述甲基化标记物或其组合还包括选自以下标记物中至少一种:chr8:41309473,chr17:37843265,chr17:37843818,chr17:37843793,chr17:37886349,chr17:37886390,chr17:37820452,chr17:37820496,chr17:37968912,chr17:37968904,chr17:37893804,chr17:37894352,chr17:37893005,chr17:37894334,chr17:37893813,chr17:37894439,chr17:37894258,chr17:37894288,chr17:37886321,chr17:37926309,chr17:37894165,chr17:37894469,chr17:37873266,chr17:37894233,chr17:37894252,chr18:19745506,
chr17:37894413,chr17:37785459,chr17:37894403,chr17:37785442,chr17:37895880,chr18:19745476,chr18:19745494,chr17:37896175,chr17:37873304,chr17:37894485,chr18:19745514,chr17:37785429,chr17:37873326,chr18:19745472,chr17:37894482,chr18:19745487,chr17:37896050,chr18:19745442,chr17:37896074,chr17:37785426,chr17:37894347,chr18:19745458,chr3:38080799,chr2:27938352,chr17:37895919,chr18:19745509,chr17:37894397,chr2:27938360,chr17:37896203,chr17:37926366,chr18:19745504,chr19:36232197,chr17:37896165,chr17:37896063,chr1:26551710,chr1:26551791,chr6:167276600,chr1:26551681,chr1:26551782,chr17:38024048,chr18:19745530,chr18:19745445,chr1:28919250,chr17:37820516,chr19:50832069,chr2:157178147,chr2:157178249,chr2:27938342,chr6:167276599,chr1:28919276,chr17:37784733,chr6:167276619,chr2:157178298,chr6:43211253,chr1:46632751,chr1:26551788,chr11:94473568,chr1:46632737,chr19:50832047。11.根据权利要求10所述的可用于胃癌HER2蛋白过表达或基因扩增伴随诊断的甲基化标记物或其组合,其特征在于,所述甲基化标记物组合包括chr17:37879893,chr17:37862178,chr17:37862986,chr17:37894352,chr17:37820452,chr17:37893765,chr17:37886349,chr17:37856695,chr17:37843793,chr17:37886390标记物。12.根据权利要求10所述的可用于胃癌HER2蛋白过表达或基因扩增伴随诊断的甲基化标记物或其组合,其特征在于,所述甲基化标记物组合包括chr17:37879893,chr17:37881021,chr17:37886390,chr17:37893765,chr17:37860353,chr17:37862986,chr17:37862178,chr17:37884314,chr17:37879819,chr17:37895887,chr17:37893999,chr17:37855528,chr8:41309473,chr17:37843592,chr17:37843863,chr17:37843265,chr17:37843818,chr17:37843793,chr17:37886349,chr17:37886390,chr17:37820452,chr17:37820496,chr17:37968912,chr17:37968904,chr17:3789...
【专利技术属性】
技术研发人员:刘鑫,李慧,杨婷,陈志伟,范建兵,
申请(专利权)人:广州市基准医疗有限责任公司,
类型:发明
国别省市:
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