【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】核酸文库、肽文库及它们的用途描述本专利技术涉及编码多于一种肽的核酸文库,所述肽代表天然存在的蛋白质的片段。每种肽可以选自物种或生物体的蛋白质组,并且多于一种肽可以共同代表物种或生物体的蛋白质组,或者此类肽可以选自一个以上的蛋白质组,并且因此多于一种肽可以共同代表宏蛋白质组。肽也可以选自在细胞或组织类型之间差异表达的蛋白质。本专利技术还涉及此类肽的文库,涉及牵涉核酸和/或肽的此类文库的方法,和/或涉及包含与此类文库相关的信息的计算机可读介质或数据处理系统。鉴定新的治疗靶是药物发现的关键起点。药物发现工作传统上集中于鉴定经典的可成药靶(druggabletarget),例如激酶、G蛋白偶联受体(GPCR)和离子通道。然而,此类化学上容易获得的靶并不总是代表生物学上最重要的用于治疗干预的靶。将蛋白质:蛋白质相互作用(PPI)成药(drugging)特别令人感兴趣,因为它们代表了参与癌细胞利用的缺陷信号传导途径中的主要靶类型,以及人类疾病中一大组潜在可作用的接口。不幸的是,对将PPI和其他“不可成药”的靶成药的系统尝试受到技术的限制,这在很大程度上是由于当前基于高通量DNA和RNA的基因组学技术对于能够在蛋白质组水平上鉴定新的可成药空间的限制。可以使用无偏的“表型”测定来鉴定与疾病生物学相关的候选药物靶的目前的基于基因组学的技术,通常使用基因敲除(例如CRISPR)来执行,或者在转录物组水平上使用RNAi来执行。这些方法产生了关于哪些靶可以代表疾病进展和疾病治疗干预中的重要节点的重要信息,但是受到严重限制:因为它们是在基因水平而不是蛋 ...
【技术保护点】
1.一种核酸文库,每种核酸包含编码肽的确定的核酸序列的编码区,所述肽具有25和110个氨基酸之间的长度,并且具有为选自一种或更多种生物体的天然存在的蛋白质的氨基酸序列中的序列区域的氨基酸序列;其中所述文库包含编码至少10,000种不同的此类肽中的多于一种肽的核酸,并且其中至少50种此类肽中的每一种肽的氨基酸序列是多于一种不同的此类天然存在的蛋白质中的不同蛋白质的氨基酸序列中的序列区域,并且其中每种编码的氨基酸序列的等电点(pI)大于8.0或小于6.0。/n
【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】20181009 GB 1816440.01.一种核酸文库,每种核酸包含编码肽的确定的核酸序列的编码区,所述肽具有25和110个氨基酸之间的长度,并且具有为选自一种或更多种生物体的天然存在的蛋白质的氨基酸序列中的序列区域的氨基酸序列;其中所述文库包含编码至少10,000种不同的此类肽中的多于一种肽的核酸,并且其中至少50种此类肽中的每一种肽的氨基酸序列是多于一种不同的此类天然存在的蛋白质中的不同蛋白质的氨基酸序列中的序列区域,并且其中每种编码的氨基酸序列的等电点(pI)大于8.0或小于6.0。
2.根据权利要求1中任一项所述的核酸文库,其中所述多于一种不同的天然存在的蛋白质中的每一种满足一个或更多个预定标准。
3.根据权利要求2所述的核酸文库,其中所述多于一种天然存在的蛋白质中的每一种与给定的疾病诸如癌症相关。
4.根据权利要求3所述的核酸文库,其中所述疾病是乳腺癌。
5.根据权利要求2所述的核酸文库,其中所述多于一种天然存在的蛋白质中的每一种蛋白质是细胞质蛋白质。
6.根据权利要求5所述的核酸文库,其中所述多于一种天然存在的蛋白质中的每一种蛋白质是细胞质激酶。
7.根据权利要求2所述的核酸文库,其中所述多于一种天然存在的蛋白质中的每一种蛋白质与给定的蛋白质或来自蛋白质(功能)类中的至少一种蛋白质相互作用。
8.根据权利要求7所述的核酸文库,其中所述多于一种天然存在的蛋白质中的每一种蛋白质与KRas相互作用。
9.根据权利要求1至8中任一项所述的核酸文库,其中所述文库包含编码至少50,000种不同的此类肽中的多于一种肽的核酸,并且其中至少100种此类肽的每一种肽的氨基酸序列是至少100种不同的天然存在的蛋白质的氨基酸序列中的序列区域;特别地,其中所述文库包含编码至少100,000种不同的此类肽中的多于一种肽的核酸,并且其中至少150种此类肽的每一种肽的氨基酸序列是至少150种不同的天然存在的蛋白质的氨基酸序列中的序列区域。
10.根据权利要求1至9中任一项所述的核酸文库,其中所述文库包含编码至少10,000种不同的此类肽中的多于一种肽的核酸,并且其中至少1,000种此类肽的每一种肽的氨基酸序列是此类多于一种不同的天然存在的蛋白质的不同蛋白质的氨基酸序列中的序列区域。
11.根据权利要求1至10中任一项所述的核酸文库,其中所述文库包含编码至少200,000种不同的此类肽中的多于一种肽的核酸,并且其中至少20,000种此类肽的每一种肽的氨基酸序列是至少20,000种不同的天然存在的蛋白质的氨基酸序列中的序列区域;特别地,其中所述文库包含编码至少300,000种不同的此类肽中的多于一种肽的核酸,并且其中至少25,000种此类肽的每一种肽的氨基酸序列是至少25,000种不同的天然存在的蛋白质的氨基酸序列中的序列区域。
12.根据权利要求1或11任一项所述的核酸文库,其中对于至少约1%的天然存在的蛋白质,多于一种所述核酸编码来自此类天然存在的蛋白质的氨基酸序列的不同肽。
13.根据权利要求12所述的核酸文库,其中对于至少约50%的天然存在的蛋白质,多于一种所述核酸编码来自此类天然存在的蛋白质的氨基酸序列的不同肽。
14.根据权利要求13所述的核酸文库,其中所述多于一种核酸编码不同的肽,并且所述不同的肽的氨基酸序列是沿着所述天然存在的蛋白质的氨基酸序列间隔的序列区域。
15.根据权利要求14所述的核酸文库,其中所述序列区域沿着所述天然存在的蛋白质的氨基酸序列被一个氨基酸窗口或多于一个此类窗口分隔开,其中所述窗口在1和约55个氨基酸之间;特别地其中所述窗口在约5和约20个氨基酸之间;最特别地,其中所述间隔窗口是约8、10、12或15个氨基酸。
16.根据权利要求1至14中任一项所述的核酸文库,所述核酸文库包含编码来自至少10,000种不同的天然存在的蛋白质的至少100,000种不同肽的核酸。
17.根据权利要求1至16中任一项所述的核酸文库,其中每种核酸编码不同的肽。
18.根据权利要求1至17中任一项所述的核酸文库,其中编码来自所述天然存在的蛋白质的不同肽的核酸的平均数目大于1;特别地每种此类蛋白质约1.01和1...
【专利技术属性】
技术研发人员:马库斯·米尔纳,乔安妮·L·雅克,
申请(专利权)人:福慕斯特有限公司,
类型:发明
国别省市:英国;GB
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