一种从哺乳动物粪便中高效富集宿主DNA的方法技术

一种从哺乳动物粪便中高效富集宿主DNA的方法，属于分子生物学技术领域。针对目前哺乳动物粪便样本提取DNA时，宿主DNA富集效率低、对陈旧粪便提取效果差、大量细菌DNA的残留严重干扰后续反应，而且成本居高不下等问题，本发明专利技术提供了一种从粪便中高效富集宿主DNA的方法，在提取前，对粪便样本进行SDS预处理：将粪便样本与10mmol/L磷酸缓冲液PBS溶液混合后，加入SDS溶液至终浓度为0.01％～5％(质量)混匀，在室温下静置1min～30min；然后离心取上清，从上清液中提取DNA。本发明专利技术成本低廉，不受样本数量的限制，拓展了粪便样本在动物研究和保护监测中的应用。

【技术实现步骤摘要】
一种从哺乳动物粪便中高效富集宿主DNA的方法
本专利技术属于分子生物学
，具体涉及一种从哺乳动物粪便中高效富集宿主DNA的方法。
技术介绍
近年来，非损伤性取样在保护生物学以及分子生态学中的应用得到了广泛的关注和重视，而粪便由于：(1)可以非损伤性地获取研究对象的肠上皮细胞，具有无创、无痛、无侵害性的优点；(2)动物排便具有常规性和节律性，因此粪便样品的数量充足，相比较于其他样本类型而言可提供足量的样本来源；(3)粪便样本可以在不触及甚至在看不到动物实体的情况下进行采集，尤其在针对凶猛大型食肉动物的情况下，可最大程度地保证采样人员的安全，同时也将采集过程中对动物的干扰降至最低；(4)粪便采集容易操作，成本较低。因此粪便是野外动物研究和动物园等人工饲养动物管理中最为常用的样品。通过从粪便中存在的宿主肠道上皮细胞中提取出的宿主DNA，在物种鉴定、交配系统分析、遗传多样性评价、种群遗传结构分析、系统地理学研究等方面都发挥着重要作用。研究表明，每克新鲜粪便中含有105个肠上皮细胞，其中大多数仍然保持完整，继续维持正常的生命活动，然而粪便干本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种从哺乳动物粪便中高效富集宿主DNA的方法，其特征在于，在提取粪便DNA前，先将粪便样本经SDS预处理，所述预处理方法如下：/n1)将粪便样本与10mmol/L磷酸缓冲液PBS溶液混合后，加入SDS溶液至终浓度为0.01％-5％(质量)混匀，在室温下静置1～30min；/n2)然后离心取上清，上清液用于DNA的提取。/n

【技术特征摘要】
1.一种从哺乳动物粪便中高效富集宿主DNA的方法，其特征在于，在提取粪便DNA前，先将粪便样本经SDS预处理，所述预处理方法如下：
1)将粪便样本与10mmol/L磷酸缓冲液PBS溶液混合后，加入SDS溶液至终浓度为0.01％-5％(质量)混匀，在室温下静置1～30min；
2)然后离心取上清，上清液用于DNA的提取。


2.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，步骤1)中针对草食兽粪便样本时，经所述预处理后室温下静置时间1～15min。


3.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，步骤1)中针对肉食兽粪便样本时，经所述预处理后室温下静置时间为1～10min。


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【专利技术属性】
技术研发人员：徐艳春，崔靓玉，杨淑慧，马跃，
申请(专利权)人：东北林业大学，
类型：发明
国别省市：黑龙江;23