与血脂水平相关的单核苷酸多态性rs4377290检测系统及相关应用技术方案

本发明专利技术提供了一种与血脂水平相关的单核苷酸多态性rs4377290检测系统及其应用；具体而言本发明专利技术确定了单核苷酸多态性rs4377290与血脂水平相关，提供了检测来自待测个体的样品中rs4377290位点的多态性的试剂材料和/或仪器设备在制备用于评估血脂水平和/或血脂异常发病风险的检测系统中的应用，还提供了一种评估血脂水平和/或血脂异常发病风险的检测系统，其包括：检测来自待测个体的样品中rs4377290位点的多态性的试剂材料和/或仪器设备；其中，rs4377290与TC水平显著相关，rs4377290位点T等位基因携带者比非携带者具有较高的总胆固醇水平和/或较高的血脂异常发病风险。

Single nucleotide polymorphic rs4377290 detection system related to blood lipid level and its related applications

The present invention provides a correlation with blood lipid level of rs4377290 single nucleotide polymorphism detection system and its application; the invention specifically identified single nucleotide polymorphisms rs4377290 and lipid levels, provides material polymorphism and / or equipment in preparation for the detection of samples from individuals under test in rs4377290 site application detection system evaluation of lipid levels and / or the risk of dyslipidemia, also provides an assessment of lipid levels and / or dyslipidemia risk detection system, including: rs4377290 polymorphism detection reagent material from the measured individual sample sites and / or equipment; among them, significant correlation rs4377290 and TC levels, the incidence of dyslipidemia total cholesterol level of rs4377290 T allele carriers than in non carriers with high and / or higher Risk.

【技术实现步骤摘要】
与血脂水平相关的单核苷酸多态性rs4377290检测系统及相关应用
本专利技术涉及与血脂水平相关的单核苷酸多态性rs4377290检测系统及相关应用，具体而言本专利技术涉及检测来自待测个体的样品中CD16基因rs4377290位点的多态性的试剂材料和/或仪器设备在制备用于评估血脂水平和/或血脂异常发病风险的检测系统中的应用，还涉及一种评估血脂水平和/或血脂异常发病风险的检测系统。
技术介绍
大量研究资料表明，血脂异常是冠心病、心肌梗死、心脏性猝死和缺血性脑卒中的独立危险因素。它通过加速全身动脉粥样硬化，对身体造成隐匿、逐渐、进行性、全身性和器质性的损害。研究显示，人群血胆固醇水平每升高1％，冠心病(CAD)发病增加2％～3％。我国血脂异常患者总数上升呈显著趋势，2007～2008年中国国家糖尿病和代谢紊乱研究结果提示，我国20岁以上人群胆固醇水平与2002年相比增加了23.9％，血脂异常已经成为我国居民的重要公共卫生问题。2011年度北京市卫生与人群健康状况报告数据显示，北京市常住居民中超半数市民血脂异常，其中18～30岁男性的血脂异常患病率已经达到58.5％。血浆总胆固醇(TC)、低密度脂蛋白胆固醇(LDL-C)、高密度脂蛋白胆固醇(HDL-C)和甘油三酯(TG)浓度是心血管疾病最重要的危险因素和治疗干预的靶点和目标。世界卫生组织最新资料提示心血管疾病防控获益中，血脂异常危险因素控制所带来的贡献最大。美国1980～2000年期间冠心病死亡下降一半，完全归功于开展国民胆固醇教育所作出的贡献。大多数血脂异常具有复杂的病因机制，是多个基因之间或多个基因与环境因长期相互作用的结果。全基因组关联研究成功地确定了多个与血脂相关的遗传位点。然而，几乎所有这些位点最初都是在欧洲血统的人群中确定的，缺乏亚洲人群特别是中国人群中的研究数据。中国人和欧洲人之间的环境暴露和遗传背景的差异巨大，因此亟需鉴定中国汉族人群特异血脂变异位点，将有助于对国人高脂血症预防、新药开发、诊断和个体化治疗。
技术实现思路
本专利技术的主要目的在于确定亚洲人群特别是东亚人群特异性的与血脂水平相关的遗传位点，提供通过检测相关遗传位点评估血脂水平和/或血脂异常发病风险的方法，并提供评估血脂水平和/或血脂异常发病风险的检测系统及相关应用。本案专利技术人以东亚人群包括中国人、菲律宾人、美籍华人、新加坡籍华裔、新加坡籍马来西亚人等为研究对象，分析研究了11万多个单核苷酸多态性(SNP)与TC、LDL-C、HDL-C、TG的关联关系，确定了单核苷酸多态性位点rs4377290与血脂水平相关。rs4377290位点为东亚人群特异性的与血脂水平相关的遗传位点。本专利技术的初筛实验阶段研究数据表明，ACVR1C基因区域的rs4377290与总胆固醇(TC)显著相关，达全基因组显著性水平(P＝4.69×10-8)；在重复验证阶段中，该位点P值依然显著(P＝0.022)，说明该关联可靠性强。将两个阶段样本合并分析，P值达到3.27×10-9，显著性水平更强。T等位基因可以引起总胆固醇(TC)升高。从而，通过检测来自待测个体的样品中rs4377290位点的多态性，可以用于评估待测个体血脂水平特别是总胆固醇(TC)水平，也可以用来评估待测个体和/或血脂异常发病风险。一方面，本专利技术提供了检测来自待测个体的样品中rs4377290位点的多态性的试剂材料和/或仪器设备在制备用于评估血脂水平和/或血脂异常发病风险的检测系统中的应用。根据本专利技术的具体实施方案，本专利技术中，血脂水平包括总胆固醇(TC)。根据本专利技术的具体实施方案，本专利技术中，rs4377290的风险等位基因为T。根据本专利技术的具体实施方案，本专利技术中，rs4377290位点T等位基因携带者比非携带者具有较高的总胆固醇水平和/或较高的血脂异常发病风险。根据本专利技术的具体实施方案，本专利技术中，所述待测个体为东亚人群，包括中国人、菲律宾人、美籍华人、新加坡籍华裔、新加坡籍马来西亚人等。具体检测时，所述样品可来自待测个体的血液、尿、唾液、胃液、头发或活组织检查等，优选为血液。可用本领域中任何的可行技术在DNA水平、RNA水平检测本专利技术所述的单核苷酸多态性位点。例如：可以采用直接测序的方法，通过DNA直接测序可以直接揭示对照基因和携带突变基因之间的序列差异，具体可以是传统的使用商业测序试剂盒或自动测序仪对DNA直接进行测序，或是近年来发展的焦磷酸测序(Pyrosequencing)、微测序(SNaPshot)等。也可以采用基于杂交的方法，具体包括Taqman探针法，DNA芯片法等。还可以采用基于引物延伸的方法，如基质辅助激光解析离子飞行时间质谱(MALDI-Tof-MS)。还可以采用基于构象的方法，具体例如限制性片段长度多态性(RFLP)分析、单链构象多态性(single-strandconformationalpolymorphism，SSCP)分析、变性梯度凝胶电泳(denaturinggradientgelelectrophoresis，DGGE)分析、变性高效液相色谱技术(denaturinghighperformanceliquidchromatography，dHPLC)等分析技术。还可以采用高分辨率溶解曲线分析技术(HRM)。在具体实施时，本领域的技术人员可以根据实际情况选择上述的任一种技术体外检测本专利技术所述单核苷酸多态性位点，也可以采用多种技术的组合来体外检测所述单核苷酸多态性位点。根据本专利技术的具体实施方案，本专利技术中，所述检测rs4377290位点的多态性的试剂材料和/或仪器设备可以是任何可行的检测所述单核苷酸多态性位点的技术中所用到的试剂材料和/或仪器设备等。例如：用于直接测序法的试剂；或用于聚合酶链式反应与限制性片断长度多态性分析相结合的试剂；或用于聚合酶链式反应与直接测序法相结合的试剂；或用于聚合酶链式反应与直接测序法相结合的试剂；或用于以下任一种SNP分型方法的试剂：基于杂交的方法、基于引物延伸的方法、基于构象的方法或高分辨率溶解曲线分析技术等。另一方面，本专利技术还提供了一种评估血脂水平、和/或血脂异常发病风险的检测系统，其包括：检测来自待测个体的样品中rs4377290位点的多态性的试剂材料和/或仪器设备。根据本专利技术的具体实施方案，本专利技术的评估血脂水平、和/或血脂异常发病风险的检测系统，其包括检测单元和评估单元，其中：所述检测单元包括检测来自待测个体的样品中rs4377290位点的多态性的试剂材料和/或仪器设备，用于获得待测个体携带rs4377290位点风险等位基因情况的检测结果；所述评估单元包括用于根据检测单元的检测结果进行评估处理的处理单元；其中，rs4377290位点T等位基因携带者比非携带者具有较高的总胆固醇水平和/或较高的血脂异常发病风险。本专利技术的评估血脂水平和/或血脂异常发病风险的检测系统，可以是虚拟装置，只要能实现所述检测单元以及评估单元的功能即可。所述的检测单元可以是包括各种检测试剂材料和/或检测仪器设备等；所述的数据分析单元可以是任何可以实现对检测单元的检测结果进行分析处理而得出血脂水平和/或血脂异常发病风险评估状况的运算仪器、模块或是虚拟设备，例如可以是预先将各种可能的检测结果与对应的血脂水平(包括TC本文档来自技高网...

【技术保护点】
检测来自待测个体的样品中rs4377290位点的多态性的试剂材料和/或仪器设备在制备用于评估血脂水平和/或血脂异常发病风险的检测系统中的应用。

【技术特征摘要】
1.检测来自待测个体的样品中rs4377290位点的多态性的试剂材料和/或仪器设备在制备用于评估血脂水平和/或血脂异常发病风险的检测系统中的应用。2.根据权利要求1所述的应用，其中，血脂水平包括总胆固醇(TC)水平。3.根据权利要求1所述的应用，其中，rs4377290的风险等位基因为T。4.根据权利要求1所述的应用，其中，rs4377290位点T等位基因携带者比非携带者具有较高的总胆固醇水平。5.根据权利要求1所述的应用，其中，rs4377290位点T等位基因携带者比非携带者具有较高的血脂异常发病风险。6.根据权利要求1所述的应用，其中，所述待测个体为东亚人群。7.根据权利要求1所述的应用，其中，所述样品来自待测个体的血液、尿、唾液、胃液、头发或活组织检查，优选为血液。8.一种评估血脂水平、和/或血脂异常发病风险的检测系统，其包括：检测来自待测个体的样品中rs4377290位点的多态性的试剂材料和/或仪器设备。9...

【专利技术属性】
技术研发人员：顾东风，黄建凤，鲁向锋，李宏帆，杨学礼，
申请(专利权)人：中国医学科学院阜外医院，
类型：发明
国别省市：北京,11