【技术实现步骤摘要】
本申请是申请日为2010年3月5日的题为“从分子阵列制备复制物或衍生物的装置和方法、及其应用”的中国专利申请No.201080019880.7的分案申请。
本专利技术涉及从分子阵列例如生物分子或化学方法制备的分子制备复制物或衍生物的方法,特别是涉及适合用于制备所述分子的微阵列的复制物或衍生物和/或从其衍生的分子,例如DNA微阵列、RNA微阵列或蛋白质微阵列的此类方法和装置,还涉及所述阵列用于鉴定与涉及一级序列的反应相关的DNA序列、其拷贝或其衍生物的应用。
技术介绍
微阵列可理解为表示许多不同的生物分子在单个点的表面上或表面内的排布。所述点还被称作斑点并且通常具有10μm-约1000μm的直径。一个斑点内存在一个或数个相同的生物分子群。但是除了一些有目的的冗余之外,各种斑点表示不同的生物分子。生物分子可沉积在表面,可存在于表面上的层内,可存在于腔室内,或者以固定化方式存在于颗粒上或颗粒内,有可能将所述颗粒排布成阵列。按照常规,有许多制备微阵列的方法。根据一项技术,例如使用光合成、化学合成、斑点合成、印刷法(printing process)等直接在表面合成生物分子(原位合成)。例如Affymetrix应用此类光合成技术,Agilent可进行斑点合成。Combimatrix通过真实的可电寻址的反应室制备DNA微阵列。根据另一项技术,首先合成(生物)分子,然后以排布的阵列沉积到表面上,此类技术被例如Agilent、Gesim和Biofluidix使用。两种技术均需要高额的技术费用。所述技术费用随着不同生物分子数量的增加和沉积斑点直径的减小而高于线性程度地增加。 ...
【技术保护点】
一种制备分子(16,32,50)阵列的复制物或衍生物的方法,所述阵列包括分离的分子(16,32,50)样品的空间排布,所述方法包括:为每个样品形成至少一个与其他样品的有效区域(24,35,54)分离的空间受限的有效区域(24,35,54’),位于所述有效区域(24,35,54’)的边界上的载体(20,34,60)的具有结合接头(22,38,62)或结合性质的表面;通过所述有效区域(24,35,54’)内的扩增剂来扩增所述分子(16,32,50),从而产生所述样品的复制物(18,32,64)或衍生物;通过所述结合接头或结合性质(22,38,62)使所述样品的复制物或衍生物(18,32,64)结合至所述载体(20,34,60),从而使所述载体上的所述样品的拷贝或衍生物的空间排布对应于所述阵列中的所述样品的空间排布;以及从所述阵列除去包含所述样品的复制物或衍生物(18,32,64)的所述载体(20,34,60)。
【技术特征摘要】
2009.03.06 DE 102009012169.21.一种制备分子(16,32,50)阵列的复制物或衍生物的方法,所述阵列包括分离的分子(16,32,50)样品的空间排布,所述方法包括:为每个样品形成至少一个与其他样品的有效区域(24,35,54)分离的空间受限的有效区域(24,35,54’),位于所述有效区域(24,35,54’)的边界上的载体(20,34,60)的具有结合接头(22,38,62)或结合性质的表面;通过所述有效区域(24,35,54’)内的扩增剂来扩增所述分子(16,32,50),从而产生所述样品的复制物(18,32,64)或衍生物;通过所述结合接头或结合性质(22,38,62)使所述样品的复制物或衍生物(18,32,64)结合至所述载体(20,34,60),从而使所述载体上的所述样品的拷贝或衍生物的空间排布对应于所述阵列中的所述样品的空间排布;以及从所述阵列除去包含所述样品的复制物或衍生物(18,32,64)的所述载体(20,34,60)。2.根据权利要求1所述的方法,-其中,产生空间受限的有效区域包括产生空间受限的扩增剂区域(24,35),或-其中,所述空间受限的扩增剂区域(24,35)至少部分地由所述阵列的阵列基片(10)内或所述载体(34)内的微结构或纳米结构(12,36)限定,或-其中,所述微结构或纳米结构包括特别是基于滤膜、水凝胶或气凝胶的无序基质,或其中,所述微结构或纳米结构是基于有序的三维基片。3.根据权利要求1所述的方法,-其中,为每个样品产生至少一个空间受限的扩增剂区域(24)包括将所述样品提供于所述阵列基片(10)内分离地相互关联的凹槽(12)内,将所述扩增剂引入所述凹槽(12)中,并且用所述载体(20)封闭所述凹槽(12),或-其中,至少部分地通过两种液体(54,56)、液体和气体之间的相界,或者物理边界,特别是脂膜,分离所述空间受限的扩增剂区域(54’),或-其中,至少部分地通过两种液体(54,56)、液体和气体之间的相界,或者物理边界,特别是脂膜,分离所述空间受限的扩增剂区域(54’),并且其中,为每个样品产生至少一个空间受限的扩增剂区域包括将所述样品提供于相互分离的液滴(54)中,所述液滴(54)包含所述扩增剂并且固定在所述阵列的阵列基片(52)上的空间排布中,在所述液滴(54)之间排布更为稀薄的液体(56),并且相对于所述阵列基片(52)排布所述载体(60),使得所述载体(60)的具有所述结合接头(62)的表面位于所述液滴(54)的边界上。4.根据权利要求2所述的方法,其中,产生至少一个空间受限的扩增剂区域(35)包括提供具有至少一个凹槽(36)的载体(34),将所述扩增剂引入所述凹槽(36)中,以及通过所述阵列基片(30)封闭所述凹槽(36),从而使所述样品暴露于所述扩增剂区域(35),所述凹槽(36)与每个样品关联并且具有结合接头(38)排布于其中。5.根据权利要求1所述的方法,其中,为每个样品提供空间受限的扩增剂区域包括将所述样品提供于测序仪芯片(10)或纳米孔板内。6.根据权利要求1所述的方法,-其中,与所述扩增同时进行将所述复制物或衍生物结合至所述载体的过程,或-其中,所述有效区域的空间限定在于:在所述载体上存在作为互补引物、形式为包含规则或不规则的斑点分布的引物阵列的所述结合接头,所述载体上的斑点大小和斑点密度与所述阵列上的相等或比所述阵列上的更小。7.根据权利要求1所述的方法,其中,通过应用能量场实现所述有效区域的空间限定。8.根据权利要求1所述的方法,其中,以结合至颗粒(14,50)的分子的形式提供所述样品。9.根据权利要求1所述的方法,-其中,所述分子阵列为非合成的生物分子阵列,或-其中,所述分子是单链或双链的寡聚核苷酸、多聚核苷酸、DNA或类似于DNA的合成分子(PNA),或-其中,所述阵列由用于衍生基因...
【专利技术属性】
技术研发人员:罗兰·泽格莱,费利克斯·冯斯泰滕,京特·罗斯,约亨·霍夫曼,
申请(专利权)人:弗赖堡阿尔伯特路德维格大学,
类型:发明
国别省市:德国;DE
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