【技术实现步骤摘要】
基于细胞区域特征和局部图特征的细胞跟踪方法及装置
本专利技术属于计算机视觉
,尤其涉及基于细胞区域特征和局部图特征的细胞跟踪方法及装置。
技术介绍
细胞动态分析在细胞生物学和生物医学中都具有重要的研究意义和应用价值,其通常是通过对细胞进行跟踪来实现的,然而传统的细胞跟踪方法不仅需要大量繁琐的人为操作,还需要使用物理、化学等操作,使研究结果不能客观的反映细胞的自然运动。 申请人:在同时提交的名称为“基于区域特征的细胞跟踪方法及装置”的专利申请中提出了一种基于区域特征的细胞跟踪方法及装置,该方法对显微拍摄的细胞视频进行转换得到连续的细胞图像帧,并对每一帧细胞图像进行图像分割,在细胞图像中标记细胞区域,根据每个细胞区域的质心求出与待跟踪细胞之间的欧式距离,如果小于细胞运动的平均距离,则认为该细胞是待跟踪细胞的候选细胞,并记录所有的候选细胞信息;最后对所有的候选细胞,分别计算与待跟踪细胞之间的区域特征相似度,以区域特征相似度值最大的候选细胞为该待跟踪细胞的匹配细胞。该专利技术申请的对粘连细胞的识别和分离准确率高,能够快速有效地进行细胞跟踪。然而基于细胞 ...
【技术保护点】
一种基于细胞区域特征和局部图特征的细胞跟踪方法,用于根据显微视频的帧图像进行细胞跟踪,其特征在于,所述方法包括步骤:步骤1、对显微拍摄的细胞视频进行转换得到连续的细胞图像帧,基于区域特征对细胞进行跟踪;步骤2、以第一帧细胞图像为当前细胞图像,搜索当前细胞图像中遗留的还没有匹配成功的细胞区域,标记该没有匹配成功的细胞区域为待跟踪细胞;步骤3、输入当前细胞图像的下一帧细胞图像,计算出该下一帧细胞图像中没有匹配成功的细胞区域的质心与待跟踪细胞的欧式距离,如果小于指定的阈值,则认为该细胞是待跟踪细胞的候选细胞,并记录所有的候选细胞信息;步骤4、分别在当前细胞图像和当前细胞图像的下一 ...
【技术特征摘要】
1.一种基于细胞区域特征和局部图特征的细胞跟踪方法,用于根据显微视频的帧图像进行细胞跟踪,其特征在于,所述方法包括步骤: 步骤1、对显微拍摄的细胞视频进行转换得到连续的细胞图像帧,基于区域特征对细胞进行跟踪; 步骤2、以第一帧细胞图像为当前细胞图像,搜索当前细胞图像中遗留的还没有匹配成功的细胞区域,标记该没有匹配成功的细胞区域为待跟踪细胞; 步骤3、输入当前细胞图像的下一帧细胞图像,计算出该下一帧细胞图像中没有匹配成功的细胞区域的质心与待跟踪细胞的欧式距离,如果小于指定的阈值,则认为该细胞是待跟踪细胞的候选细胞,并记录所有的候选细胞信息; 步骤4、分别在当前细胞图像和当前细胞图像的下一帧细胞图像中以待跟踪细胞和候选细胞为中心,以匹配成功的细胞为相邻细胞建立两个局部图,并计算局部图特征相似度; 步骤5、对所有候选细胞,根据细胞区域特征相似度和局部图特征相似度分别计算与待跟踪细胞之间的相似度,以相似度值最大的候选细胞为待跟踪细胞的匹配细胞; 步骤6、判断是否所有细胞图像跟踪完毕,是则结束细胞跟踪,否则以下一帧细胞图像为当前细胞图像,以匹配细胞为待跟踪细胞,返回步骤3。2.根据权利要求1所述的细胞跟踪方法,其特征在于,所述步骤3中指定的阈值为4d,其中d为细胞运动的平均距离。3.根据权利要求1所述的细胞跟踪方法,其特征在于,所述局部图特征相似度计算公式为: 4.根据权利要求3所述的细胞跟踪方法,其特征在于,所述候选细胞与待跟踪细胞的相似度为: E (k, k’)= 3 jEl (k, k’)+ 3 2Ee (k, k’) 式中E (k, k,)表示待跟踪细胞k和候选细胞k,相似度大小,Ek(k,k’)和El(k, k’)分别表示细胞区域特征相似度和局部图特征相似度,3 !表示局部图相似度在相似度函数中的权重,P2表示区域特征相似度在相似度函数中的权重,^和P2取值范围在0和I之间,之和为I。5.根据权利要求4所述的细胞跟踪方法,其特征在于,所述区域特征相似度Ek(k,k’)计算公式如下:...
【专利技术属性】
技术研发人员:汪晓妍,邹祎杰,朱辰,陈胜勇,管秋,陈磊,
申请(专利权)人:浙江工业大学,
类型:发明
国别省市:
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