四物汤治疗痛经作用靶点的筛选方法技术

本发明专利技术涉及一种四物汤治疗痛经作用靶点的筛选方法，包括如下步骤：（1）挑选差异表达基因，（2）作用靶点预测分析，（3）通路富集分析，（4）选择步骤（3）所得富集通路中与四物汤治疗痛经作用相关的通路，并筛选出所述通路下富集的靶点，即得四物汤治疗痛经作用靶点。本发明专利技术提供了一种快速、精确的四物汤治疗辐射作用靶点的筛选方法，通过本发明专利技术可成功筛选出四物汤治疗痛经的作用靶点（靶向蛋白），有助于从分子层面解释其治疗痛经的作用机理，为治疗痛经的天然药物的开发以及其他中药确切作用靶点的筛选提供了新思路。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术属于生物信息
，具体涉及利用基因芯片技术和中药数据库来筛选四物汤治疗痛经作用靶点的方法。
技术介绍
四物汤首见于宋代《太平惠民和剂局方》，由熟地、当归、白芍、川芎配伍而成。四物汤在临床广泛应用，历来被视为补血调经之基本方，用以治月经不调，痛经等症，症见眩晕、耳聋、惊惕、唇爪无华。方中当归补血养肝，和血调经；熟地滋养阴血；佐以白芍和营养肝，使以川芎，活血行滞。四药合用，则补中有通，补而不滞。但是，四物汤作为调经良方，其作用靶点和作用机制尚不清楚。因此，寻找一种科学、精确的方法用以筛选四物汤治疗痛经的作用靶点，从而探寻其分子层面的作用机制十分必要。
技术实现思路
针对现有技术存在的上述问题，本申请人经过研究，提供一种快速、精确的。通过本专利技术方可成功筛选出四物汤治疗痛经的作用靶点(靶向蛋白)，有助于从分子层面解释其治疗痛经的作用机理。本专利技术的技术方案如下: 一种，包括如下步骤: (1)挑选差异表达基因: 从基因表达谱数据库GEO中下载编号为GSE23610的基因芯片数据，得到经高浓度四物汤处理的乳腺癌细胞MCF-7和的经二甲基亚砜处理的乳腺癌细胞MCF-7的表达谱数据，以前者作为试验组，后者作为对照组，挑选出二者差异表达基因； (2)作用靶点预测分析: 利用中药数据库TCMID搜集得到四物汤作用靶点，并将其与步骤(I)所得差异表达基因进行交集，得到四物汤预测作用靶点； (3)通路富集分析: 对步骤(2)所得预测作用靶点进行通路富集分析； (4)选择步骤(3)所得富集通路中与四物汤治疗痛经作用相关的通路，并筛选出所述通路下富集的靶点，即得四物汤抗辐射作用靶点。 其进一步的技术方案为: 步骤(I)中，设定P值(P-value)小于0.05,倍数变化值(Fold change大于1.5。步骤(3)所述通路富集分析工具为网络分析软件Cytoscape的插件ClueGO,设定P 值(P-value)小于 0.05。本专利技术有益的技术效果在于: 本专利技术将基因芯片技术和中药靶点数据库创造性地结合起来，提供了一种快速、精确的；运用本专利技术方法成功地筛选出两个四物汤治疗痛经作用的靶点(靶向蛋白)，即原癌基因蛋白f0S，转录因子AP-1，有助于从分子层面解释其治疗痛经的作用机理，为治疗痛经的天然药物的开发以及其他中药确切作用靶点的筛选提供了新思路。具体实施例方式下面结合实施例，说明本专利技术具体的实施方式。一种，具体包括如下步骤: 1.挑选差异表达基因 从基因表达谱数据库GEO中下载编号为GSE23610的基因芯片数据；得到经高浓度四物汤(质量浓度为2.56mg/ml)处理的乳腺癌细胞MCF-7和的经二甲基亚砜(质量分数为0.001%)处理的乳腺癌细胞MCF-7的表达谱数据，以前者作为试验组，后者作为对照组，挑选出二者差异表达基因；在该步骤中，设定P值小于0.05，倍数变化值大于1.5，共计得到2405个差异表达基因。2.四物汤作用靶点预测分析 从中药数据库 TCMID (http://www.megabionet.0rg/tcmid/)中，搜集得到 102 个四物汤的靶点数据；由于mRNA水平的上下调与其编码蛋白质的增加与减少并不完全正相关，因此我们利用搜集到 的上述靶点的标识(symbol)与步骤I所得2405个差异表达基因进行交集，共计得到20个四物汤预测作用靶点。3.通路富集分析 在步骤3所得20个四物汤预测作用靶点的基础上，利用网络分析软件Cytoscape 2.6的插件ClueGO做通路富集分析；在该步骤中，设定P值小于0.05，共计得到40条通路。4.选择步骤3所得富集通路中与四物汤治疗痛经作用相关的通路，并筛选出所述通路下富集的靶点，即得四物汤抗辐射作用靶点。选择“转录因子DREAM介导的痛觉抑制通路”作为与四物汤治疗痛经作用相关的通路，该通路已被证实可通过调节前强啡肽原的表达来抑制痛觉(Cheng HY, Pitcher GM,Laviolette SR，Whishaw IQj Tong KIj Kockeritz LKj Wada T，Joza NA，Crackower Μ，Goncalves Jj Sarosi I， Woodgett JRj Oliveira-dos-Santos AJj Ikura Μ， van derKooy Dj Salter MWj Penninger JMj DREAM is a critical transcriptional repressorfor pain modulation [J].Cell，2002，108(1):31-43.);筛选该通路下富集的四物汤预测作用靶点，共得到两个靶点(靶向蛋白)，即原癌基因蛋白fos，转录因子AP-1，相关研究已证实，上述两个革巴点与痛觉的传递密切相关(Naranjo JRj Mellstr m B，Achaval M，Sassone-Corsi P， Molecular pathways of pain: Fos/Jun-mediated activation of anoncanonical AP-1 site in the prodynorphin gene[J].Neuron，1991，6(4):607-617.)，证明四物汤通过靶向这两个蛋白产生镇痛效果，从而达到治疗痛经的目的。综上所述，本专利技术方法成功筛选出四物汤治疗痛经的分子作用靶点。以上所述的仅是本专利技术的优选实施方式，本专利技术不限于以上实施例。可以理解，本领域技术人员在不脱离本专利技术的基本构思的前提下直接导出或联想到的其他改进和变化，均应认为包含在本专利技术的保护范围之内。本文档来自技高网...

【技术保护点】
一种四物汤治疗痛经作用靶点的筛选方法，其特征在于包括如下步骤：???（1）挑选差异表达基因：从基因表达谱数据库GEO中下载编号为GSE23610的基因芯片数据，得到经高浓度四物汤处理的乳腺癌细胞MCF?7和的经二甲基亚砜处理的乳腺癌细胞MCF?7的表达谱数据，以前者作为试验组，后者作为对照组，挑选出二者差异表达基因；???（2）作用靶点预测分析：????利用中药数据库TCMID搜集得到四物汤作用靶点，并将其与步骤（1）所得差异表达基因进行交集，得到四物汤预测作用靶点；???（3）通路富集分析：????对步骤（2）所得预测作用靶点进行通路富集分析；????（4）选择步骤（3）所得富集通路中与四物汤治疗痛经作用相关的通路，并筛选出所述通路下富集的靶点，即得四物汤抗辐射作用靶点。

【技术特征摘要】
1.一种四物汤治疗痛经作用靶点的筛选方法，其特征在于包括如下步骤: (1)挑选差异表达基因: 从基因表达谱数据库GEO中下载编号为GSE23610的基因芯片数据，得到经高浓度四物汤处理的乳腺癌细胞MCF-7和的经二甲基亚砜处理的乳腺癌细胞MCF-7的表达谱数据，以前者作为试验组，后者作为对照组，挑选出二者差异表达基因； (2)作用靶点预测分析: 利用中药数据库TCMID搜集得到四物汤作用靶点，并将其与步骤(I)所得差异表达基因进行交集，得到四物汤预测作用靶点； (3)通...

【专利技术属性】
技术研发人员：石铁流，方钊，
申请(专利权)人：无锡力盟生物科技有限公司，
类型：发明
国别省市：