【技术实现步骤摘要】
本专利技术属于生物信息
,具体涉及利用基因芯片技术和中药数据库来筛选四物汤抗辐射作用靶点的方法。
技术介绍
四物汤首见于宋代《太平惠民和剂局方》,由熟地、当归、白芍、川弯配伍而成。熟地为君,滋阴养血。填精补髓;辅以当归,补血养肝,活血调经;佐以白芍,和营养肝;使以川芎,活血行滞。四物汤临床上广泛应用,近年来大量研究证实,服用四物汤可增强人们对X射线、Y射线以及紫外光等辐射的抵抗能力,已被用作抗辐射中药良方。但是,四物汤的抗辐射作用靶点和作用机制尚不清楚。因此,寻找一种科学、精确的方法用以筛选四物汤抗辐射的作用靶点,从而探索其分子层面的作用机制十分必要。
技术实现思路
针对现有技术存在的上述问题,本申请人经过研究,提供一种快速、精确的。通过本专利技术可成功筛选出四物汤发挥抗辐射作用的靶点(靶向蛋白),有助于从分子层面解释其抗辐射作用机理。本专利技术的技术方案如下: 一种,包括如下步骤: (1)挑选差异表达基因: 从基因表达谱数据库GEO中下载编号为GSE23610的基因芯片数据,得到经高浓度四物汤处理的乳腺癌细胞MCF-7和的经二甲基亚砜处理的乳腺癌细胞MCF-7的表达谱数据,以前者作为试验组,后者作为对照组,挑选出二者差异表达基因; (2)作用靶点预测分析: 利用中药数据库TCMID搜集得到四物汤作用靶点,并将其与步骤(I)所得差异表达基因进行交集,得到四物汤预测作用靶点; (3)通路富集分析: 对步骤(2)所得预测作用靶点进行通路富集分析; (4)选择步骤(3)所得富集通路中与四物汤抗辐射作用相关的通路,并筛选出所述通路下富集的靶点, ...
【技术保护点】
一种四物汤抗辐射作用靶点的筛选方法,其特征在于包括如下步骤:??(1)挑选差异表达基因:从基因表达谱数据库GEO中下载编号为GSE23610的基因芯片数据,得到经高浓度四物汤处理的乳腺癌细胞MCF?7和的经二甲基亚砜处理的乳腺癌细胞MCF?7的表达谱数据,以前者作为试验组,后者作为对照组,挑选出二者差异表达基因;??(2)作用靶点预测分析:???利用中药数据库TCMID搜集得到四物汤作用靶点,并将其与步骤(1)所得差异表达基因进行交集,得到四物汤预测作用靶点;??(3)通路富集分析:????对步骤(2)所得预测作用靶点进行通路富集分析,得到富集通路;??(4)选择步骤(3)所得富集通路中与四物汤抗辐射作用相关的通路,并筛选出所述通路下富集的靶点,即得四物汤抗辐射作用靶点。
【技术特征摘要】
1.一种四物汤抗辐射作用靶点的筛选方法,其特征在于包括如下步骤: (1)挑选差异表达基因: 从基因表达谱数据库GEO中下载编号为GSE23610的基因芯片数据,得到经高浓度四物汤处理的乳腺癌细胞MCF-7和的经二甲基亚砜处理的乳腺癌细胞MCF-7的表达谱数据,以前者作为试验组,后者作为对照组,挑选出二者差异表达基因; (2)作用靶点预测分析: 利用中药数据库TCMID搜集得到四物汤作用靶点,并将其与步骤(I)所得差异表达基因进行交集,得到四物汤预测作用靶点; (3)通路富集...
【专利技术属性】
技术研发人员:石铁流,方钊,
申请(专利权)人:无锡力盟生物科技有限公司,
类型:发明
国别省市:
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