本发明专利技术涉及分子医学领域，特别涉及用于白血病诊疗的基因芯片，所述芯片含有如SEQ?ID?NO：1-137中所述序列的寡核苷酸探针，本芯片解决了我国血液系统肿瘤诊疗过程中的实际需求，通过筛选白血病形态学、免疫学、细胞遗传学和分子生物学检测指标中的关键指标来定制基因芯片，是集合白血病的早期诊断、预警、预防、诊治的多功能基因芯片，可以提高白血病个体化的诊断效率和疗效，缩短住院时间，降低医疗费用，提高基层医疗卫生机构技术水平。
【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及分子医学领域，特别涉及用于白血病诊疗的基因芯片。
技术介绍
白血病的发病率逐年上升，已成为危害青少年健康的头号杀手，对儿童白血病的治疗目标已不再是简单的追求缓解率，而要通过完善的实验室检查结果和预后评估体系，根据危险因素对患儿进行分组，使每个患儿都能得到适当强度的个体化治疗，提高其远期生活质量。近20年来，以形态学、免疫学、细胞遗传学、分子生物学(MICM)和危险因素为基础进行分型的规范化治疗及中枢神经系统白血病的预防已成为儿童白血病治疗成功的关键。尽量降低低危患儿化疗不良反应和远期并发症，同时对高危患 儿实施适度或强有力的化疗方案，对病人进行明确的亚型分类将有助于制定合适的治疗方案并预测其治疗效果，判断预后。准确评估肿瘤的细胞基因学和早期化疗反应是确保高危因素患儿不会错误地进入低危方案的关键。研究者们发现，即使是同一类型、同一治疗方案、甚至是同一剂量强度的治疗，不同的白血病患ノL会表现出不同的疗效和药物毒副反应。如果所有的儿童白血病患者都能进行免疫学、染色体及基因学方面的检查，使所有患儿都能得到严格规范的诊断，危险度都能得到准确的评价，从而使患儿得到适度的规范化化疗，将大大提高长期存活率，降低化疗远期不良反应及治疗费用。因此，对白血病患儿的早期准确诊断、危险因素与预后评估对其实施个体化治疗尤为重要。另ー方面，越来越突出的问题在于不同患者对同一化疗的反应性不一，究其根本原因，是因为患者体内存在不同基因及基因的多态性，因此，对每个患儿的个体化治疗需要对其治疗反应相关的基因进行确定。但由于目前对患者分型、判断预后等所使用的细胞形态检测、流式细胞术、巢式RT-PCR、常规染色体显带技术等方法繁多，所需的实验条件和对技术人员培训的要求高，检测费用昂贵，限制了 MICM分型与诊断在基层医院的大規模开展，使得我国基层医院住院的大部分白血病患儿仍然限于进行形态学检测为主，不能完全而准确地对患儿进行早期诊断、危险评估和个体化治疗，总体控制水平较低。因此，迫切需要ー种结果准确、简单快速、费用较低、适宜于大規模推广的实验室检测方法来将众多白血病诊断方法统一与替代。
技术实现思路
本专利技术的目的在于提供ー种基因芯片，该基因芯片仅集合了少量的寡核苷酸探针就实现了多指标，其准确性高。上述芯片主要分为基因表达类检测单元、基因多态性(SNP)检测单元和染色体拷贝数(CNV)检测单元，其中基因表达类检测单元包含融合基因寡核苷酸探针18种和表达基因寡核苷酸探针48种；SNP单元包含基因SNP 47种探针；CNV检测单元包含24种探针。本试剂盒基因表达类检测单元的融合基因寡核苷酸探针能特异性检测融合基因为白血病诊断、分型、临床治疗和预后判断提供重要依据，同时也是白血病微小残留病的检测基础，检测对象包括包括 BCR/ABL a2b3、BCR/ABL a2el、BCR/ABL a2b2、TEL/ABL、TEL/PDGFR, E2A/PBX1、ETV6-RUNX1、TEL-AMLU CBFP -MYHlI、MLL-AFX, MLL-AFlp, MLL-AFlO,MLL-AF4、MLL-AF9、AML-ETO, PML/RARa、NPM/RAR 和 SET/CAN 中的任一中或多种。本试剂盒基因表达类检测单元的表达基因寡核苷酸探针能特异性检测MDR1、MRPl、LRP、GST- π、NPMl、c_myb、HOXlI、EVII、FLT3、H0XA9、H0XA10, GATAl、GATA2、MYC,Notch I、CEBPA、CD19、CD79a、CD3、CD7、CD2、CD5、CD8、CDla、CD4、CD20、CD23、CD64、CD34、CD13、CD33、CD38、CD56、CD117、CD41、CD61、GPA、T-I、T-II、T-III、T-IV、MP0、Ta / β ,Ty/δ、IgH、TCR δ , TCR y或IgG中的任ー种或多种；本试剂盒的基因多态性(SNP)检测单元中，含有突变或缺失基因的寡核苷酸探针，能特异性的检测以下基因Nras、P53、BRAF, SHIP、NPMU JAK2、FLT3、MGMT, Kras、WTUCDKN2A、RBI、TET2、PTEN、TPMT, MTHFR、CYP, TERT, MDRl。 本试剂盒的染色体拷贝数(CNV)检测单元中，能检测染色体拷贝数的变化，能检测全部染色体的拷贝数改变。为实现上述目的，本专利技术的技术方案为I、基因芯片，所述基因芯片含有如SEQ ID NO :1-18中任一项或多项所示的融合基因寡核苷酸探针，含有如SEQ ID NO :19-66中任一项或多项所示的表达基因寡核苷酸探针，含有如SEQ ID NO :67-72中任一项或多项所示的Nras突变基因寡核苷酸探针，含有如SEQID NO :73-78任一项或多项所示的P53突变基因寡核苷酸探针，含有如SEQ ID NO :79所示的Braf突变基因寡核苷酸探针，含有如SEQID NO 80所示的SHIP突变基因寡核苷酸探针，含有如SEQ ID NO 81所示的NPMl突变基因寡核苷酸探针，含有如SEQ ID NO ，82-83中任一项或多项所示的JAK2突变基因寡核苷酸探针，含有如SEQ ID NO :84-85任ー项或多项所示的MGMT突变基因寡核苷酸探针，含有如SEQ ID NO :,86-88中任一项或多项所示的FLT3突变基因寡核苷酸探针，含有如SEQ ID NO :89-92中任一项或多项所示的Kras突变基因寡核苷酸探针，含有如SEQ ID NO 93-95中任一项或多项所示的WTl突变基因寡核苷酸探针，含有如SEQ ID N0:96所示的⑶KN2A96突变基因寡核苷酸探针，含有如SEQ IDNO ，97-99中任一项或多项所示的RBl突变基因寡核苷酸探针，含有如SEQ ID NO :100所示的TET2突变基因寡核苷酸探针，含有如SEQ ID NO :101所示的PTEN突变基因寡核苷酸探针，含有如SEQ ID NO =102-103中任一项或多项所示的TPMT突变基因寡核苷酸探针，含有如SEQ ID NO :104所示的MHTFR突变基因寡核苷酸探针，含有如SEQ ID NO =105-109中任一项或多项所示的CYP突变基因寡核苷酸探针，含有如SEQ ID NO =110-112中任ー项或多项所示的TERT突变基因寡核苷酸探针，含有如SEQ ID NO :113所示的MKRl突变基因寡核苷酸探针，含有如SEQ ID NO =114-137所示的染色体CNV探针。2、根据I所述的基因芯片，所述基因芯片含有如SEQ ID NO : 1_18所示的融合基因寡核苷酸探针，含有如SEQ ID NO :19-66所示的表达基因寡核苷酸探针，含有如SEQ IDNO :67-72所示的Nras突变基因寡核苷酸探针，含有如SEQ ID NO :73-78所示的P53突变基因寡核苷酸探针，含有如SEQ ID NO 79所示的Braf突变基因寡核苷酸探针，含有如SEQID NO :80所示的SHIP突变基因寡核苷酸探针，含有如SEQ ID NO :81所示的NPMl突变基因寡核苷酸探针，含有如SEQ ID本文档来自技高网...
【技术保护点】
【技术特征摘要】
2011.03.07 CN 201110053214.11.基因芯片，其特征在于所述基因芯片含有如SEQID NO :1-18中任一项或多项所示的融合基因寡核苷酸探针，含有如SEQ ID NO :19-66中任一项或多项所示的表达基因寡核苷酸探针，含有如SEQ IDNO 67-72中任一项或多项所示的Nras突变基因寡核苷酸探针，含有如SEQ ID NO :73-78任一项或多项所示的P53突变基因寡核苷酸探针，含有如SEQ IDNO 79所示的Braf突变基因寡核苷酸探针，含有如SEQID NO 80所示的SHIP突变基因寡核苷酸探针，含有如SEQ ID NO :81所示的NPMl突变基因寡核苷酸探针，含有如SEQ ID NO:82-83中任一项或多项所示的JAK2突变基因寡核苷酸探针，含有如SEQ IDNO :84-85任ー项或多项所示的MGMT突变基因寡核苷酸探针，含有如SEQ ID NO :86-88中任一项或多项所示的FLT3突变基因寡核苷酸探针，含有如SEQ ID NO :89-92中任一项或多项所示的Kras突变基因寡核苷酸探针，含有如SEQ ID NO 93-95中任一项或多项所示的WTl突变基因寡核苷酸探针，含有如SEQ IDNO ，96所示的⑶KN2A96突变基因寡核苷酸探针，含有如SEQ IDNO :97-99中任一项或多项所示的RBl突变基因寡核苷酸探针，含有如SEQ ID NO :100所示的TET2突变基因寡核苷酸探针，含有如SEQ IDNO :101所示的PTEN突变基因寡核苷酸探针，含有如SEQ ID NO =102-103中任一项或多项所示的TPMT突变基因寡核苷酸探针，含有如SEQ ID NO :104所示的MHTFR突变基因寡核苷酸探针，含有如SEQ IDNO : 105-109中任一项或多项所示的CYP突变基因寡核苷酸探针，含有如SEQ ID NO =110-112中任ー项或多项所示的TERT突变基因寡核苷酸探针，含有如SEQ ID NO :113所示的MKRl突变基因寡核苷酸探针，含有如SEQ ID NO :114-137所示的染色体CNV探针。2.根据权利要求I所述的基因芯片，其特征在于所述基因芯片含有如SEQID NO:1-18所示的融合基因寡核苷酸探针，含有如SEQ ID NO ...
【专利技术属性】
技术研发人员：邹琳，谭俊杰，张鹏辉，
申请(专利权)人：重庆医科大学附属儿童医院，
类型：发明
国别省市：
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