基因组鉴定系统技术方案

技术编号:5477811 阅读:246 留言:0更新日期:2012-04-11 18:40
本发明专利技术属于基因组学与核酸测序领域。其涉及一种对生物材料进行测序以及对测序信息中短字符串进行实时概率匹配来鉴定所有出现在所述生物材料中的物种的新方法。其涉及测序信息的实时概率匹配,更特别涉及单一分子核酸的多个序列中短字符串的比较,所述核酸可是扩增的或者是未扩增的,可是化学合成或者是物理性探询的,随序列信息的产生随时进行,且与持续的序列信息产生与收集并行。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】
本专利技术涉及鉴定生物体、更特别涉及在手持或者大型电子装置中通过概率数据匹 配(probabilistic data matching)确定核酸以及其它多聚或者链型分子的序列的系统和 方法。
技术介绍
存在各种各样的威胁生命的情况,其中分析和测序DNA或RNA样品将有用,例如为 了应对将致命病原物质释放到环境中的生物恐怖主义行为。过去,此类结果需要很多人的 参与,需要太多时间。结果,快捷性和准确性受会到影响。在生物恐怖主义分子袭击或者紧急传染病事件中,对于最早的应对者即急诊室医 师(他们的选择或病床边治疗)以及对于食品制造商、分销商、零售商和对于全国公共卫 生人员能够迅速、准确并且可靠地鉴定出该病原物质以及其引起的疾病是重要的。病原物 质可包含在样品来源如食物、空气、土壤、水、病原物质的组织以及临床呈递物(clinical presentation)。因为所述物质和/或潜在疾病可以是威胁生命并高度传染的,因而此鉴定 方法应迅速完成。这是在现有国土安全生物恐怖主义应对中的一个明显弱点。需要系统和方法,其可基于样品中存在的核酸的基因组对比来鉴定不仅仅是单一 生物体(多重技术(multi本文档来自技高网...

【技术保护点】
一种鉴定样品中生物材料的方法,包括:获得包含所述生物材料的样品,从所述样品中提取一或多种核酸分子,通过瞬时直接概率匹配(instant direct probabilistic matching)从所述核酸分子产生序列信息用于将所述序列信息与数据库中的核酸序列进行对比。

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】...

【专利技术属性】
技术研发人员:RR科尔韦尔JP姚库普切克J春
申请(专利权)人:考斯摩斯德公司
类型:发明
国别省市:US[美国]

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