一种检测幽门螺杆菌毒力型及耐药基因型的基因芯片及其套组和方法技术

本发明专利技术公开了一种可判断幽门螺杆菌毒力型以及耐药基因型的基因芯片及其套组和检测方法。它是利用ＰＣＲ扩增将核酸样品中含有的靶序列标记上标记物，利用特异探针与靶序列的杂交作用，使基因芯片上该特异探针点位置上积聚标记物，从而使该点可被特异地检出。经过扫描仪观察杂交结果并对照基因芯片点阵排布图进行分析，便可获得样品的相关基因型信息。这种方法具有基因芯片的高度并行性、多样性、操作简便、结果可靠等特点，可省去繁琐的培养法药敏检测过程以及昂贵的药敏试纸条，检测快捷经济，在临床诊断和科研领域都具有强大的应用潜力。

Gene chip for detecting Helicobacter pylori virulence type and drug-resistant genotype, and kit and method thereof

The invention discloses a gene chip capable of judging the virulence type of a Helicobacter pylori and a drug resistant genotype, and a kit and a detection method thereof. It is the amplification of a nucleic acid in a sample containing the target sequence tag marking by PCR, using the hybrid effect of a specific probe and target sequence, the gene chip probe on the point position of the specific markers to accumulate, so that the point can be specifically detected. After scanning the results of hybridization and comparing the microarray layout of the gene chip, the relative genotype information of the sample can be obtained. This method has high parallelism, gene diversity, simple operation, reliable results, can avoid the cumbersome culture drug sensitivity test process and drug sensitivity test of expensive, fast detection of economy, has a strong application potential in clinical diagnosis and scientific research.

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及医学领域的体外诊断技术和检测领域，更具体地，涉及一种基因芯片，以及包括该芯片的检测幽门螺杆菌毒力型以及耐药基因型的寡核苷酸芯片套组和方法。
技术介绍
幽门螺杆菌全世界人群感染率高达50%我国的感染率达60%-卯％，而在活动性慢性胃炎、消化性溃疡病人中的幽门螺杆菌感染率更是达到98%和100%。研究表明幽门螺杆菌是消化性溃疡、慢性胃炎、胃部恶性肿瘤的高危致病因素。而且学者们还发现，幽门螺杆菌的毒力基因决定其毒力强弱，从而导致不同程度的临床症状，直接影响诊治及预后。研究表明，感染幽门螺杆菌的CagA+患者胃中幽门螺杆菌的定植密度是CagA-患者的5倍多，可以增加多核细胞的浸润，诱导胃上皮细胞分泌过多的炎症因子，因此对胃粘膜上皮造成更大的损伤。同时反复的炎症可刺激胃酸分泌过多，诱导胃溃疡的发生。另外，VacA也是幽门螺杆菌的重要致病因子，其致病机制主要是通过受体介导的内吞作用进入细胞内，引起晚期溶酶体与胞内体的融合和积累，导致细胞内空泡样变性，同时还可使细胞间的紧密连接松弛，增强极化上皮单层细胞的渗透性，导致细胞死亡，另外还可抑制细胞增殖。并认为胃溃疡和胃癌与其sl型、ml本文档来自技高网...

【技术保护点】
一种检测幽门螺杆菌毒力基因型及耐药基因型的基因芯片，包括片基，多个检测区域的微阵列排列的核苷酸片段，连接于片基之上，其特征在于所述核苷酸片段，为一组长度在１１－２０００个碱基的人工编码寡核苷酸序列，每个序列由支持片段和特异片断组成。

【技术特征摘要】
1、一种检测幽门螺杆菌毒力基因型及耐药基因型的基因芯片，包括片基，多个检测区域的微阵列排列的核苷酸片段，连接于片基之上，其特征在于所述核苷酸片段，为一组长度在11-2000个碱基的人工编码寡核苷酸序列，每个序列由支持片段和特异片断组成。2根据权利要求1所述的一种检测幽门螺杆菌毒力基因型及耐药基因型的基因芯片，其特征在于所述及的支持片段为胸腺嘧啶的重复序列(polyT),长度为5-30个碱基，其5'端与 片基连接。3、 根据权利要求1所述的一种检测幽门螺杆菌毒力基因型及耐 药基因型的基因芯片，其特征在于所述及的特异片段至少包 括序列号为SEQ ID NO.l至32的核苷酸序列或具有与上述序 列85%以上同源的连续核苷酸序列的人工编码序列，或者是 具有上述特征的PCR产物，该特异片段的5'端的第一个碱基 与权利要求2所述的支持片段的3'端的最后一个碱基相连。4、 根据权利要求1所述的一种检测幽门螺杆菌毒力基因型及耐 药基因型的基因芯片，其特征在于所述及的片基包括玻璃、 硅芯片、陶瓷材料、金属、聚二氟乙烯膜或醋酸纤维膜等材 料。5、 根据权利要求1所述的一种检测幽门螺杆菌毒力基因型及耐 药基因型的基因芯片，其特征在于所述及的片基是经过表面 修饰的，修饰的手段包括醛基修饰、氨基修饰、特殊标记物 表面包被等化学及生物学表面处理。6、 根据权利要求1或2所述的一种检测幽门螺杆菌毒力基因型 及耐药基因型的基因芯片，其特征在于所述及核苷酸片段的 5'端可带有氨基修饰。7、 根据权利要求1所述的一种检测幽门螺杆菌毒力基因型及耐 药基因型的基因芯片，其特征在于所述及的多个检测区域的 微阵列，是12个或少于12个包含相同探针排列、但彼此独 立的检测区，每个检测区里排列了 15 100个探针点，探针 点直...

【专利技术属性】
技术研发人员：郜恒骏，吴彩云，
申请(专利权)人：上海芯超生物科技有限公司，
类型：发明
国别省市：31[中国|上海]