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【技术实现步骤摘要】
本申请涉及细胞周期检测的,尤其是涉及一种高通量的细胞周期检测方法、装置、介质及电子设备。
技术介绍
1、细胞周期分析是通过检测细胞中的dna含量来确定细胞的生长和增殖状态,它可以用来检测细胞的健康状况、检测药物的毒性、检测致癌物质、检测肿瘤细胞等,它还可以用来研究细胞的凋亡、基因突变、衰老等。
2、细胞周期分析就需要监测细胞的周期,细胞周期的检测一般采用流式细胞术和荧光染色技术,先通过用荧光染料对细胞的dna进行染色,然后用流式细胞仪检测每个细胞的荧光强度,从而对细胞核中的dna含量进行检测,并确定其细胞周期阶段。
3、然而,对于贴壁细胞,高通量(例如96孔板或384孔板)细胞的流式检测需要耗费大量人工逐孔进行细胞的消化和重悬,而使用高内涵成像系统则不需要消化细胞;并且,流式细胞术需要根据人为经验对细胞群所属的周期阶段进行划分,存在一定的主观性和误差。
技术实现思路
1、为了解决上述技术问题,提出了本申请。本申请的实施例提供了一种高通量的细胞周期检测方法、装置、介质及电子设备,利用高分辨率的成像技术可以准确获取细胞群体的荧光强度信息,并基于荧光强度信息一次性分析大量细胞的dna含量,从而提高细胞周期检测的效率和准确性。
2、根据本申请的一个方面,提供了一种高通量的细胞周期检测方法,包括:获取待检测细胞的图像数据;其中,所述待检测细胞包括多组荧光染色后的样本细胞;根据所述图像数据,识别得到所述待检测细胞的核密度分布图;其中,所述核密度分布图表征位于
3、在一实施例中,所述核密度分布图包括对照细胞的对照核密度分布图,所述对照细胞为所述待检测细胞的初始细胞;所述计算所述核密度分布图中的第一极值点和第二极值点包括:计算所述对照核密度分布图中两个极值点,得到所述第一极值点和所述第二极值点。
4、在一实施例中,所述核密度分布图包括多组所述对照细胞的所述对照核密度分布图;所述计算所述核密度分布图中的第一极值点和第二极值点包括:分别计算多组所述对照核密度分布图中的极值点,得到多个第一对照极值点和第二对照极值点;其中,所述第一对照极值点对应的荧光强度小于所述第二对照极值点对应的荧光强度;分别计算多个所述第一对照极值点的平均值和多个所述第二对照极值点的平均值,得到所述第一极值点和所述第二极值点。
5、在一实施例中,所述基于所述第一极值点和所述第二极值点,分别确定所述待检测细胞的合成前期对应的第一荧光强度范围和合成后期对应的第二荧光强度范围包括:基于所述第一极值点和所述待检测细胞的合成前期对应的荧光强度范围宽度、所述第二极值点和所述待检测细胞的合成后期对应的荧光强度范围宽度,分别确定所述第一荧光强度范围和所述第二荧光强度范围。
6、在一实施例中,所述根据所述第一荧光强度范围和所述第二荧光强度范围,确定所述待检测细胞各个周期内的细胞数量包括:根据所述第一荧光强度范围和所述第二荧光强度范围,确定所述待检测细胞的各个周期对应的荧光强度范围;根据所述待检测细胞的各个周期对应的荧光强度范围和所述核密度分布图,统计所述待检测细胞各个周期内的细胞数量。
7、在一实施例中,在所述获取待检测细胞的图像数据之后,所述高通量的细胞周期检测方法还包括:基于所述图像数据,提取每组所述样本细胞的位置信息;所述根据所述第一荧光强度范围和所述第二荧光强度范围,确定所述待检测细胞各个周期内的细胞数量包括:根据所述第一荧光强度范围和所述第二荧光强度范围、每组所述样本细胞的位置信息,确定每组所述样本细胞各个周期内的细胞数量。
8、在一实施例中,所述根据所述图像数据,识别得到所述待检测细胞的核密度分布图包括:提取所述图像数据中所述待检测细胞的信号强度;根据所述待检测细胞的信号强度,统计得到所述待检测细胞的核密度分布图。
9、根据本申请的另一个方面,提供了一种高通量的细胞周期检测装置,包括:图像获取模块,用于获取待检测细胞的图像数据;其中,所述待检测细胞包括多组荧光染色后的样本细胞;密度识别模块,用于根据所述图像数据,识别得到所述待检测细胞的核密度分布图;其中,所述核密度分布图表征位于各个信号强度的所述待检测细胞的数量,所述信号强度表征所述待检测细胞的荧光强度;极值计算模块,用于计算所述核密度分布图中的第一极值点和第二极值点;其中,所述第一极值点对应的荧光强度小于所述第二极值点对应的荧光强度;范围确定模块,用于基于所述第一极值点和所述第二极值点,分别确定所述待检测细胞的合成前期对应的第一荧光强度范围和合成后期对应的第二荧光强度范围;数量确定模块,用于根据所述第一荧光强度范围和所述第二荧光强度范围,确定所述待检测细胞各个周期内的细胞数量。
10、根据本申请的另一个方面,提供了一种计算机可读存储介质,所述存储介质存储有计算机程序,所述计算机程序用于执行上述任一项所述的高通量的细胞周期检测方法。
11、根据本申请的另一个方面,提供了一种电子设备,包括:处理器;用于存储所述处理器可执行指令的存储器;所述处理器用于执行上述任一项所述的高通量的细胞周期检测方法。
12、本申请提供的一种高通量的细胞周期检测方法、装置、介质及电子设备,通过获取待检测细胞的图像数据,其中待检测细胞包括多组荧光染色后的样本细胞;根据图像数据,识别得到待检测细胞的核密度分布图,其中核密度分布图表征位于各个信号强度的待检测细胞的数量,信号强度表征待检测细胞的荧光强度,计算核密度分布图中的第一极值点和第二极值点,其中第一极值点对应的荧光强度小于第二极值点对应的荧光强度,基于第一极值点和第二极值点,分别确定待检测细胞的合成前期对应的第一荧光强度范围和合成后期对应的第二荧光强度范围,根据第一荧光强度范围和第二荧光强度范围,确定待检测细胞各个周期内的细胞数量;即利用高分辨率的成像技术可以准确获取待检测细胞群体的图像数据,并基于图像数据识别表征荧光强度的核密度分布图,根据核密度分布图可以快速地对待检测细胞群体进行分析以得到各个周期内的细胞数量,从而一次性分析大量细胞的dna含量,从而提高细胞周期检测的效率和准确性。
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1.一种高通量的细胞周期检测方法,其特征在于,包括:
2.根据权利要求1所述的高通量的细胞周期检测方法,其特征在于,所述核密度分布图包括对照细胞的对照核密度分布图,所述对照细胞为所述待检测细胞的初始细胞;所述计算所述核密度分布图中的第一极值点和第二极值点包括:
3.根据权利要求2所述的高通量的细胞周期检测方法,其特征在于,所述核密度分布图包括多组所述对照细胞的所述对照核密度分布图;所述计算所述核密度分布图中的第一极值点和第二极值点包括:
4.根据权利要求1所述的高通量的细胞周期检测方法,其特征在于,所述基于所述第一极值点和所述第二极值点,分别确定所述待检测细胞的合成前期对应的第一荧光强度范围和合成后期对应的第二荧光强度范围包括:
5.根据权利要求1所述的高通量的细胞周期检测方法,其特征在于,所述根据所述第一荧光强度范围和所述第二荧光强度范围,确定所述待检测细胞各个周期内的细胞数量包括:
6.根据权利要求1所述的高通量的细胞周期检测方法,其特征在于,在所述获取待检测细胞的图像数据之后,所述高通量的细胞周期检测方法还包括:<
...【技术特征摘要】
1.一种高通量的细胞周期检测方法,其特征在于,包括:
2.根据权利要求1所述的高通量的细胞周期检测方法,其特征在于,所述核密度分布图包括对照细胞的对照核密度分布图,所述对照细胞为所述待检测细胞的初始细胞;所述计算所述核密度分布图中的第一极值点和第二极值点包括:
3.根据权利要求2所述的高通量的细胞周期检测方法,其特征在于,所述核密度分布图包括多组所述对照细胞的所述对照核密度分布图;所述计算所述核密度分布图中的第一极值点和第二极值点包括:
4.根据权利要求1所述的高通量的细胞周期检测方法,其特征在于,所述基于所述第一极值点和所述第二极值点,分别确定所述待检测细胞的合成前期对应的第一荧光强度范围和合成后期对应的第二荧光强度范围包括:
5.根据权利要求1所...
【专利技术属性】
技术研发人员:胡凯强,高强,潘鹏炜,贺芳,
申请(专利权)人:康龙化成北京新药技术股份有限公司,
类型:发明
国别省市:
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