System.ArgumentOutOfRangeException: 索引和长度必须引用该字符串内的位置。 参数名: length 在 System.String.Substring(Int32 startIndex, Int32 length) 在 zhuanliShow.Bind() 一种快速检测番茄髓部坏死病的方法及所用引物技术_技高网
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一种快速检测番茄髓部坏死病的方法及所用引物技术

技术编号:40639422 阅读:4 留言:0更新日期:2024-03-13 21:21
本发明专利技术属于病害快速诊断领域,涉及一种环介导等温扩增技术,特别是番茄髓部坏死病的快速检测方法。本发明专利技术公开了一种用于快速检测番茄髓部坏死病的引物,包括内引物对和环引物对,还包括外引物对。本发明专利技术还同时提供了一种快速检测番茄髓部坏死病的试剂盒。本发明专利技术还同时提供了一种快速检测番茄髓部坏死病的方法:利用如上所述引物设定反应体系;65℃~70℃反应30~60min;当反应结果不变色,仍然为紫罗兰色时,模板为阴性;反之,当反应结果变色(呈现绿色)时,模板为阳性。本发明专利技术能用于高效、便捷判断番茄髓部坏死病。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术属于病害快速诊断领域,涉及一种环介导等温扩增技术,特别是番茄髓部坏死病的快速检测方法。


技术介绍

1、番茄是世界主要蔬菜和经济作物之一,番茄病害种类多、危害重,极大地制约了番茄产业的发展。番茄髓部坏死病,是番茄栽培上严重影响产量的一类重要病害。该病害在全球范围内均有发生,巴西、意大利、美国、墨西哥、沙特阿拉伯都是该病发生的主要分布地。在国内,广东省、浙江省、山东省、江苏省,上海、湖北省、湖南省、河北省、山西省、福建省等对各地的番茄髓部坏死病的发生状况,栽培设施和种植模式等进行了多方面的报道,番茄髓部坏死病对产业带来了巨大的威胁。

2、已报道的番茄髓部坏死病病原菌中,明确引起病症的有绿黄假单胞菌(pseudomonas viridiflava),皱纹假单胞菌(pseudomonas corrugata),菊苣假单胞菌(pseudomonas cichori)。其中,按照冯晓晓,施斌,陈恩磊等“番茄髓部坏死病病原菌分离鉴定及药剂筛选[j].实验技术与管理,2023,40(03):14-20.doi:10.16791/j.cnki.sjg.2023.03.003”的文章告知绿黄假单胞菌(pseudomonas viridiflava)代表菌株为zjup0398-2(冯晓晓等),皱纹假单胞菌(pseudomonas corrugata)代表菌株为cgmcc1.3068,菊苣假单胞菌(pseudomonas cichori)代表菌株为cgmcc 1.4934。番茄细菌性髓部坏死症状包括番茄植株叶片有v形侵入,失绿变黄,茎和叶柄出现深褐色条纹,病茎扭曲变形,表面长瘤状突起和不定根;病茎纵剖可见髓部中空、褐色至黑褐色,在茎基部有时会有不定根。

3、在番茄生产上,青枯病也是引起重大损失的病害,其病原菌是β-变形菌纲的茄科雷尔氏菌,简称青枯病菌(ralstonia solanacearum)。青枯病菌主要随病残体在土壤中越冬,从根部或茎基部伤口或自然孔口侵入,在根部皮层定殖,随后侵入木质部导管,并沿着植物木质部导管蔓延扩散,导致植株出现萎蔫、维管束褐变、直至整株枯死。

4、仅靠田间症状,番茄髓部坏死病和青枯病常容易混淆。常规的选择性分离技术,需要进行纯培养和生化鉴定等多个步骤,检测周期长,灵敏性低,不能实现大批量植物组织的快速检测,通常要花费3天以上时间,两者在显微镜均有喷菌现象。近年来发展的pcr技术虽能提高检测效率,但是需要专用pcr仪和专业操作人员和电泳观测结果,在基层农业部门难以大规模推广应用。lamp技术是2000年notomi等开发的一种新型核酸扩增技术,针对待测靶基因的6个区域设计4-6条特异性引物,在bst dna聚合酶的作用下,在65℃左右等温条件lh内可以进行特异高效快速的核酸扩增,达到多拷贝,扩增结果可直接观察焦磷酸镁沉淀或者加入显色剂进行判断。lamp方法与pcr技术相比,检测时间短,具有更高的灵敏度和特异性,操作简单。

5、番茄是全球重要的蔬菜作物之一,在中国有着广泛的种植。番茄髓部坏死病对番茄生产造成了严重威胁,因此迫切需要一种高效、便捷的病原检测方法,以帮助农民及时采取控制措施,减少产量损失。


技术实现思路

1、本专利技术要解决的技术问题是提供一种快速、特异好、灵敏高的利用环介导等温扩增检测番茄髓部坏死病的检测引物组,利用该检测引物组可以特异性的检测番茄髓部坏死病。

2、为解决上述技术问题,本专利技术提供一种用于快速检测番茄髓部坏死病的引物,包括以下引物组:内引物对和环引物对:

3、内引物对:

4、上游内引物fip(5'-3'):cgtctgaagtcaaaaccgccgt-gggttttccagcaggaagt;下游内引物bip(5'-3'):accagcttgtctttggtctgcg-tgacagcgatcatctccgtt;

5、环引物对:

6、环引物lf(5'-3'):acaagagatgggtaaatacttctcg;

7、环引物lb(5'-3'):agctgaacttgggatcggg。

8、作为本专利技术的用于快速检测番茄髓部坏死病的引物的改进:还包括外引物对:

9、外引物对:

10、上游外引物f3(5'-3'):ttgccgacaacagccttg;

11、下游外引物b3(5'-3'):gtgacgatgcgcgtgaag。

12、本专利技术还同时提供了一种快速检测番茄髓部坏死病的试剂盒,利用如上所述引物;

13、包括标准反应缓冲液、l-hnb变色指示剂、mg2+、dntp、bst 4.2dna/rna聚合酶、引物组及模板。

14、本专利技术还同时提供了一种快速检测番茄髓部坏死病的方法:利用如上所述引物;

15、设定25μl反应体系为:标准反应缓冲液2.5μl、l-hnb变色指示剂1μl、mg2+4μl、dntp2.5μl、bst 4.2dna/rna聚合酶0.5μl、引物组2.5μl、模板1μl、dd h2o 11μl;

16、所述引物组由内引物对和环引物对组成;或者引物组由内引物对、外引物对和环引物对组成;

17、65℃~70℃反应30~60min;

18、当反应结果不变色,仍然为紫罗兰色时,模板为阴性;

19、反之,当反应结果变色(呈现绿色)时,模板为阳性。

20、说明:绿色包括偏绿色、浅绿色或黄绿色等绿色系颜色,以下同。

21、作为本专利技术的快速检测番茄髓部坏死病的方法的改进,反应体系中:

22、引物组fip/bip浓度为8μm,lf/lb浓度为4μm;

23、或者:

24、引物组fip/bip浓度为16μm,lf/lb浓度为4~8μm,f3/b3浓度为2μm。

25、作为本专利技术的快速检测番茄髓部坏死病的方法的进一步改进:

26、反应体系中的模板为以下任一(即,检测对象如如下任一):植物组织或者细菌培养物(来自番茄的菌液)或者细菌基因组dna;

27、当模板为阴性时,判定植物组织,或者来自番茄的菌液或者基因组dna没有感染番茄髓部坏死病,即,植物组织或者细菌培养物或者细菌基因组dna不含番茄髓部坏死病病原菌;

28、当模板为阳性时,则判定植物组织,或者来自番茄的菌液或者基因组dna感染了番茄髓部坏死病。

29、作为本专利技术的快速检测番茄髓部坏死病的方法的进一步改进,

30、番茄髓部坏死病的病原菌包括绿黄假单胞菌(pseudomonas viridiflava),皱纹假单胞菌(pseudomonas corrugata),菊苣假单胞菌(pseudomonas cichori)中的至少任一(即,为任一或其任意组合)。

31、作为本专利技术的快速检测番茄髓部坏死病的方法的进一步改进,

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【技术保护点】

1.用于快速检测番茄髓部坏死病的引物,其特征是包括以下引物组:内引物对和环引物对:

2.根据权利要求1所述的用于快速检测番茄髓部坏死病的引物,其特征是:还包括外引物对:

3.一种快速检测番茄髓部坏死病的试剂盒,其特征是:利用如权利要求1或2所述引物;

4.一种快速检测番茄髓部坏死病的方法,其特征是:利用如权利要求1或2所述引物;

5.根据权利要求4所述的快速检测番茄髓部坏死病的方法,其特征是反应体系中:

6.根据权利要求4或5所述的快速检测番茄髓部坏死病的方法,其特征是:

7.根据权利要求4~6任一所述的快速检测番茄髓部坏死病的方法,其特征是:番茄髓部坏死病的病原菌包括绿黄假单胞菌(Pseudomonas viridiflava),皱纹假单胞菌(Pseudomonas corrugata),菊苣假单胞菌(Pseudomonas cichori)中的至少任一。

8.根据权利要求4~7任一所述的快速检测番茄髓部坏死病的方法,其特征是:优选反应条件为70℃反应30min。

【技术特征摘要】

1.用于快速检测番茄髓部坏死病的引物,其特征是包括以下引物组:内引物对和环引物对:

2.根据权利要求1所述的用于快速检测番茄髓部坏死病的引物,其特征是:还包括外引物对:

3.一种快速检测番茄髓部坏死病的试剂盒,其特征是:利用如权利要求1或2所述引物;

4.一种快速检测番茄髓部坏死病的方法,其特征是:利用如权利要求1或2所述引物;

5.根据权利要求4所述的快速检测番茄髓部坏死病的方法,其特征是反应体系中:

6.根据权利要...

【专利技术属性】
技术研发人员:冯晓晓郑永利吴慧明
申请(专利权)人:浙江大学
类型:发明
国别省市:

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