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【技术实现步骤摘要】
本专利技术属于病害快速诊断领域,涉及一种环介导等温扩增技术,特别是番茄髓部坏死病的快速检测方法。
技术介绍
1、番茄是世界主要蔬菜和经济作物之一,番茄病害种类多、危害重,极大地制约了番茄产业的发展。番茄髓部坏死病,是番茄栽培上严重影响产量的一类重要病害。该病害在全球范围内均有发生,巴西、意大利、美国、墨西哥、沙特阿拉伯都是该病发生的主要分布地。在国内,广东省、浙江省、山东省、江苏省,上海、湖北省、湖南省、河北省、山西省、福建省等对各地的番茄髓部坏死病的发生状况,栽培设施和种植模式等进行了多方面的报道,番茄髓部坏死病对产业带来了巨大的威胁。
2、已报道的番茄髓部坏死病病原菌中,明确引起病症的有绿黄假单胞菌(pseudomonas viridiflava),皱纹假单胞菌(pseudomonas corrugata),菊苣假单胞菌(pseudomonas cichori)。其中,按照冯晓晓,施斌,陈恩磊等“番茄髓部坏死病病原菌分离鉴定及药剂筛选[j].实验技术与管理,2023,40(03):14-20.doi:10.16791/j.cnki.sjg.2023.03.003”的文章告知绿黄假单胞菌(pseudomonas viridiflava)代表菌株为zjup0398-2(冯晓晓等),皱纹假单胞菌(pseudomonas corrugata)代表菌株为cgmcc1.3068,菊苣假单胞菌(pseudomonas cichori)代表菌株为cgmcc 1.4934。番茄细菌性髓部坏死症状包括番茄植株叶片有v形侵入,失绿变黄
3、在番茄生产上,青枯病也是引起重大损失的病害,其病原菌是β-变形菌纲的茄科雷尔氏菌,简称青枯病菌(ralstonia solanacearum)。青枯病菌主要随病残体在土壤中越冬,从根部或茎基部伤口或自然孔口侵入,在根部皮层定殖,随后侵入木质部导管,并沿着植物木质部导管蔓延扩散,导致植株出现萎蔫、维管束褐变、直至整株枯死。
4、仅靠田间症状,番茄髓部坏死病和青枯病常容易混淆。常规的选择性分离技术,需要进行纯培养和生化鉴定等多个步骤,检测周期长,灵敏性低,不能实现大批量植物组织的快速检测,通常要花费3天以上时间,两者在显微镜均有喷菌现象。近年来发展的pcr技术虽能提高检测效率,但是需要专用pcr仪和专业操作人员和电泳观测结果,在基层农业部门难以大规模推广应用。lamp技术是2000年notomi等开发的一种新型核酸扩增技术,针对待测靶基因的6个区域设计4-6条特异性引物,在bst dna聚合酶的作用下,在65℃左右等温条件lh内可以进行特异高效快速的核酸扩增,达到多拷贝,扩增结果可直接观察焦磷酸镁沉淀或者加入显色剂进行判断。lamp方法与pcr技术相比,检测时间短,具有更高的灵敏度和特异性,操作简单。
5、番茄是全球重要的蔬菜作物之一,在中国有着广泛的种植。番茄髓部坏死病对番茄生产造成了严重威胁,因此迫切需要一种高效、便捷的病原检测方法,以帮助农民及时采取控制措施,减少产量损失。
技术实现思路
1、本专利技术要解决的技术问题是提供一种快速、特异好、灵敏高的利用环介导等温扩增检测番茄髓部坏死病的检测引物组,利用该检测引物组可以特异性的检测番茄髓部坏死病。
2、为解决上述技术问题,本专利技术提供一种用于快速检测番茄髓部坏死病的引物,包括以下引物组:内引物对和环引物对:
3、内引物对:
4、上游内引物fip(5'-3'):cgtctgaagtcaaaaccgccgt-gggttttccagcaggaagt;下游内引物bip(5'-3'):accagcttgtctttggtctgcg-tgacagcgatcatctccgtt;
5、环引物对:
6、环引物lf(5'-3'):acaagagatgggtaaatacttctcg;
7、环引物lb(5'-3'):agctgaacttgggatcggg。
8、作为本专利技术的用于快速检测番茄髓部坏死病的引物的改进:还包括外引物对:
9、外引物对:
10、上游外引物f3(5'-3'):ttgccgacaacagccttg;
11、下游外引物b3(5'-3'):gtgacgatgcgcgtgaag。
12、本专利技术还同时提供了一种快速检测番茄髓部坏死病的试剂盒,利用如上所述引物;
13、包括标准反应缓冲液、l-hnb变色指示剂、mg2+、dntp、bst 4.2dna/rna聚合酶、引物组及模板。
14、本专利技术还同时提供了一种快速检测番茄髓部坏死病的方法:利用如上所述引物;
15、设定25μl反应体系为:标准反应缓冲液2.5μl、l-hnb变色指示剂1μl、mg2+4μl、dntp2.5μl、bst 4.2dna/rna聚合酶0.5μl、引物组2.5μl、模板1μl、dd h2o 11μl;
16、所述引物组由内引物对和环引物对组成;或者引物组由内引物对、外引物对和环引物对组成;
17、65℃~70℃反应30~60min;
18、当反应结果不变色,仍然为紫罗兰色时,模板为阴性;
19、反之,当反应结果变色(呈现绿色)时,模板为阳性。
20、说明:绿色包括偏绿色、浅绿色或黄绿色等绿色系颜色,以下同。
21、作为本专利技术的快速检测番茄髓部坏死病的方法的改进,反应体系中:
22、引物组fip/bip浓度为8μm,lf/lb浓度为4μm;
23、或者:
24、引物组fip/bip浓度为16μm,lf/lb浓度为4~8μm,f3/b3浓度为2μm。
25、作为本专利技术的快速检测番茄髓部坏死病的方法的进一步改进:
26、反应体系中的模板为以下任一(即,检测对象如如下任一):植物组织或者细菌培养物(来自番茄的菌液)或者细菌基因组dna;
27、当模板为阴性时,判定植物组织,或者来自番茄的菌液或者基因组dna没有感染番茄髓部坏死病,即,植物组织或者细菌培养物或者细菌基因组dna不含番茄髓部坏死病病原菌;
28、当模板为阳性时,则判定植物组织,或者来自番茄的菌液或者基因组dna感染了番茄髓部坏死病。
29、作为本专利技术的快速检测番茄髓部坏死病的方法的进一步改进,
30、番茄髓部坏死病的病原菌包括绿黄假单胞菌(pseudomonas viridiflava),皱纹假单胞菌(pseudomonas corrugata),菊苣假单胞菌(pseudomonas cichori)中的至少任一(即,为任一或其任意组合)。
31、作为本专利技术的快速检测番茄髓部坏死病的方法的进一步改进,
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【技术保护点】
1.用于快速检测番茄髓部坏死病的引物,其特征是包括以下引物组:内引物对和环引物对:
2.根据权利要求1所述的用于快速检测番茄髓部坏死病的引物,其特征是:还包括外引物对:
3.一种快速检测番茄髓部坏死病的试剂盒,其特征是:利用如权利要求1或2所述引物;
4.一种快速检测番茄髓部坏死病的方法,其特征是:利用如权利要求1或2所述引物;
5.根据权利要求4所述的快速检测番茄髓部坏死病的方法,其特征是反应体系中:
6.根据权利要求4或5所述的快速检测番茄髓部坏死病的方法,其特征是:
7.根据权利要求4~6任一所述的快速检测番茄髓部坏死病的方法,其特征是:番茄髓部坏死病的病原菌包括绿黄假单胞菌(Pseudomonas viridiflava),皱纹假单胞菌(Pseudomonas corrugata),菊苣假单胞菌(Pseudomonas cichori)中的至少任一。
8.根据权利要求4~7任一所述的快速检测番茄髓部坏死病的方法,其特征是:优选反应条件为70℃反应30min。
【技术特征摘要】
1.用于快速检测番茄髓部坏死病的引物,其特征是包括以下引物组:内引物对和环引物对:
2.根据权利要求1所述的用于快速检测番茄髓部坏死病的引物,其特征是:还包括外引物对:
3.一种快速检测番茄髓部坏死病的试剂盒,其特征是:利用如权利要求1或2所述引物;
4.一种快速检测番茄髓部坏死病的方法,其特征是:利用如权利要求1或2所述引物;
5.根据权利要求4所述的快速检测番茄髓部坏死病的方法,其特征是反应体系中:
6.根据权利要...
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