【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及细胞转录组数据分析，尤其涉及一种溶血血液样本单细胞转录组数据分析方法、介质和设备。
技术介绍
1、基于微流控技术的单细胞转录组测序能够在单个实验中对数万个细胞的基因表达进行量化。其主要是基于两段序列标签来识别单个细胞和单条转录本，其中用来标记单个细胞的标签通常称为barcode（条形码），用来标记单条转录本的标签称为umi（uniquemolecular identifiers，唯一分子标识符）。正常情况下，同一个液滴只会被一个barcode，而同一液滴下的不同转录本会有不同umi，而一个捕获了细胞的barcode可能带有几百到上万个umi，umi数量取决于液滴中的转录本数量。转录本加上标签后，再经过反转录、pcr扩增、文库构建、测序等过程，即可获得可供分析的数据。
2、血液中包含大量红细胞，其在体外遇到低渗溶液、机械性强力振荡、突然低温冷冻（-20℃～—25℃）或突然化冻、过酸或过碱、酒精、乙醚、皂碱、胆碱盐等条件，均可能溶解，通常将红细胞溶解称为溶血。由于血液采集后到进行单细胞转录组实验这段过程往往不可控，...
【技术保护点】
1.一种溶血血液样本单细胞转录组数据分析方法，其特征在于，包括以下步骤：
2.根据权利要求1所述的一种溶血血液样本单细胞转录组数据分析方法，其特征在于，所述有效序列数的统计方法如下：
3.根据权利要求2所述的一种溶血血液样本单细胞转录组数据分析方法，其特征在于，以最低的有效序列数来矫正测序深度的方法如下：
4.根据权利要求1所述的一种溶血血液样本单细胞转录组数据分析方法，其特征在于，生成各样本的细胞表达谱的方法如下：
5.根据权利要求1所述的一种溶血血液样本单细胞转录组数据分析方法，其特征在于，在统计各样本的有效序列数之...
【技术特征摘要】
1.一种溶血血液样本单细胞转录组数据分析方法，其特征在于，包括以下步骤：
2.根据权利要求1所述的一种溶血血液样本单细胞转录组数据分析方法，其特征在于，所述有效序列数的统计方法如下：
3.根据权利要求2所述的一种溶血血液样本单细胞转录组数据分析方法，其特征在于，以最低的有效序列数来矫正测序深度的方法如下：
4.根据权利要求1所述的一种溶血血液样本单细胞转录组数据分析方法，其特征在于，生成各样本的细胞表达谱的方法如下：
5.根据权利要求1所述的一种溶血血液样本单细胞转录组数据分析方法，其特征在于，在统计各样本的有效序列数之前，还包括去除低质量细胞和血红蛋白基因的步骤。...
【专利技术属性】
技术研发人员：陈哲名，葛长利，李浩，叶祯皓，
申请(专利权)人：杭州联川生物技术股份有限公司，
类型：发明
国别省市：
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