System.ArgumentOutOfRangeException: 索引和长度必须引用该字符串内的位置。 参数名: length 在 System.String.Substring(Int32 startIndex, Int32 length) 在 zhuanliShow.Bind() 一种特异性结合反转录酶的RNA适配体及其应用制造技术_技高网

一种特异性结合反转录酶的RNA适配体及其应用制造技术

技术编号:40055726 阅读:5 留言:0更新日期:2024-01-16 21:54
本发明专利技术公开一种特异性结合反转录酶的RNA适配体及其应用。本发明专利技术首先公开了一种特异性结合反转录酶的RNA适配体,所述RNA适配体为如SEQ ID NO.1‑4任一所示的RNA分子。进一步公开了上述RNA适配体在抑制反转录酶活性中的应用。本发明专利技术RNA适配体在37℃以下能以极高亲和力与反转录酶结合,封闭反转录酶活性;而当温度达到50℃时,适配体变性,从反转录酶脱离,实现了反转录酶的温启动,且对反转录酶原本的功能未产生影响,从而减少了非特异性产物的积累,尤其提升了全预混qPCR的产品性能。同时,RNA适配体为人工体外合成,生产技术成熟,合成序列简单、长度较短,生产周期短,适用于大规模的商业生产。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及生物。更具体地,涉及一种特异性结合反转录酶的rna适配体及其应用。


技术介绍

1、在荧光定量rcr进行分子诊断,当以rna作为模板时,需要先进行反转录生成dna序列,作为后续扩增的模板,因此,rna扩增体系中会使用反转录酶。反转录酶的活性发挥一般为50℃左右,但在低于该温度范围下活性依然存在。体系中游离的单链引物容易互搭或与模板配对,在反转录酶和taq酶的作用下配对并延伸,即形成引物二聚体或非特异性产物。这些非特异性产物又回在后续的反应里作为模板继续扩增,导致非特异性产物的不断积累。最终严重干扰目的片段的扩增,更严重的情况会导致特异性条带不能扩增出来。为避免在反应前期产生引物二聚体和非特异性产物,一般会对体系中的酶进行热启动修饰,使其在低温时与酶结合封闭酶活性,高温时释放恢复酶活性。目前使用最多的是抗体和化学修饰,以实现热启动。例如taq酶通常使用抗体修饰或化学修饰来封闭低温下的酶活,在高温下抗体变性失去封闭酶功能。而对于反转录酶通常为50℃左右的中等温度进行反应,该温度不足以破坏抗体或化学修饰的封闭作用。因此,中等温度反应的反转录酶不能使用抗体或化学修饰。

2、核酸适配体是一类具有特定结构的寡聚核苷酸,其与抗体或化学修饰作用类似,当处于低温或室温时,可形成特定的结构与酶结合,封闭酶活性;当温度升高时,核酸适配体变性,从酶上脱离,从而酶可以发挥活性。荧光定量rcr全预混体系提前将核酸扩增缓冲液、酶混合液、引物探针反应液预混,需要长时间封闭反转录酶活性,以解决扩增灵敏度下降和阴性样本中出现非特异性扩增的问题。

3、因此,需要提供一种可提升荧光定量rcr全预混体系的性能的rna适配体。


技术实现思路

1、本专利技术的一个目的在于提供可特异性结合反转录酶的rna适配体,以解决反转录酶应用于荧光定量rcr时的热启动问题。

2、本专利技术的另一个目的在于提供上述rna适配体在抑制反转录酶活性中的应用。

3、为达到上述目的,本专利技术采用下述技术方案:

4、本专利技术首先提供了一种可特异性结合反转录酶的rna适配体,所述rna适配体为如下1)或2):

5、1)如seq id no.1-4任一所示的rna分子;

6、2)与1)所示的rna分子具有60%以上的同源性,且能够特异结合逆转录酶的序列。

7、优选的,所述60%以上的同源性,可以为65%、70%、80%、85%、90%、95%等及以上的同源性。

8、进一步,所述rna适配体中间互补碱基数量为16-20。

9、进一步,所述rna适配体末端非配对碱基数量为4-12。

10、进一步,所述rna适配体可连接荧光标记物和/或放射性物质和/或治疗性物质和/或非放射性标记物(如生物素或地高辛)和/或纳米发光材料和/或酶。

11、进一步,所述rna适配体的3’端碱基可被磷酸化、氧甲基化、甲基化、氨基化或巯基化。

12、本专利技术提供的rna适配体经过理性设计得到,能在常温下与反转录酶特异性结合以封闭反转录酶活性,当温度达到50℃时,rna适配体变性,从而实现了反转录酶温启动的目的,经过染料法全预混qpcr和探针法全预混qpcr测试,可在37℃条件下长时间抑制反转录酶活性且对其原本的功能不产生影响。

13、本专利技术进一步提供了上述rna适配体在如下任一中的应用:

14、1)在抑制反转录酶活性中的应用;

15、2)在反转录反应中的应用;

16、3)在荧光定量rcr中的应用。

17、本专利技术进一步还提供了一种反转录试剂盒或荧光定量rcr试剂盒,所述反转录试剂盒或荧光定量rcr试剂盒包含上述rna适配体。

18、进一步,所述试剂盒还包括用于反转录反应或荧光定量rcr的其他试剂,如反转录酶、反应缓冲液、dntp、引物和无核酸酶水中的至少一种。

19、在本专利技术具体的实施方式中,所述荧光定量rcr为染料法和探针法全预混荧光定量rcr。

20、本专利技术的有益效果如下:

21、本专利技术提供的rna适配体在37℃以下能以极高亲和力与反转录酶结合,封闭反转录酶活性;而当温度达到50℃时,rna适配体变性,从反转录酶脱离,实现了反转录酶的温启动,且对反转录酶原本的功能未产生影响,从而减少了非特异性产物的积累,尤其提升了全预混qpcr的产品性能。同时,本专利技术提供的rna适配体序列简单,为人工体外合成,所用生产技术成熟,合成序列简单、长度较短,生产周期短,适用于大规模的商业生产。

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【技术保护点】

1.一种可特异性结合反转录酶的RNA适配体,其特征在于,所述RNA适配体为如SEQ IDNO.1-4任一所示的RNA分子。

2.根据权利要求1所述的RNA适配体,其特征在于,所述RNA适配体中间互补碱基数量为16-20。

3.根据权利要求1所述的RNA适配体,其特征在于,所述RNA适配体末端非配对碱基数量为4-12。

4.根据权利要求1所述的RNA适配体,其特征在于,所述RNA适配体连接荧光标记物和/或放射性物质和/或治疗性物质和/或非放射性标记物和/或纳米发光材料和/或酶。

5.根据权利要求1所述的RNA适配体,其特征在于,所述RNA适配体的3’端碱基被磷酸化、氧甲基化、甲基化、氨基化或巯基化。

6.权利要求1-5任一所述的RNA适配体在抑制反转录酶活性中的应用。

7.权利要求1-5任一所述的RNA适配体在反转录反应中的应用。

8.权利要求1-5任一所述的RNA适配体在荧光定量RCR中的应用。

9.一种反转录试剂盒,其特征在于,所述反转录试剂盒包含权利要求1-5任一所述的RNA适配体

10.一种荧光定量RCR试剂盒,其特征在于,所述荧光定量RCR试剂盒包含权利要求1-5任一所述的RNA适配体。

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【技术特征摘要】

1.一种可特异性结合反转录酶的rna适配体,其特征在于,所述rna适配体为如seq idno.1-4任一所示的rna分子。

2.根据权利要求1所述的rna适配体,其特征在于,所述rna适配体中间互补碱基数量为16-20。

3.根据权利要求1所述的rna适配体,其特征在于,所述rna适配体末端非配对碱基数量为4-12。

4.根据权利要求1所述的rna适配体,其特征在于,所述rna适配体连接荧光标记物和/或放射性物质和/或治疗性物质和/或非放射性标记物和/或纳米发光材料和/或酶。

5.根据权利要求1所述的rna...

【专利技术属性】
技术研发人员:李倩雯宋新文耿亮辛文
申请(专利权)人:北京全式金生物技术股份有限公司
类型:发明
国别省市:

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