成年男性高原适应性肠道真菌标志物及其应用制造技术

本发明专利技术涉及一种成年男性高原适应性肠道真菌标志物，所述标志物包括刺盾炱目（Chaetothyriales）。本发明专利技术采用肠道菌群变化来预测评估急性高原反应程度，为非侵入性操作，检测便捷且无伤害。检测便捷且无伤害。检测便捷且无伤害。

【技术实现步骤摘要】
成年男性高原适应性肠道真菌标志物及其应用


[0001]本专利技术属于医药
，具体涉及一种成年男性高原适应性肠道真菌标志物及其应用。

技术介绍

[0002]高原环境是以低压、低氧、强辐射等特点为主要特征，这种独特的环境会对人体造成不同程度的损伤。部分平原人群进入高原环境，特别是急进高原的人群常因不适应低压低氧环境而引起急性高原反应，如头疼、恶心、胸闷、失眠等，特别严重的个体能引发高原肺气肿、脑水肿等，严重者甚至导致死亡。这对人民群众的生命健康造成了极大的挑战。因此，如何筛选评价早期高原反应严重程度的生物标志物，实现早期预防早干预已经成为亟待解决的科学问题。
[0003]肠道微生物是与人体息息相关的复杂生态系统，其不仅仅是与人体协同进化的共生菌，更是能够影响机体的营养、代谢、免疫等功能。多项研究证实肠道菌群的微生物群落结构和多样性的变化与高原环境密切相关，特别是高原缺氧的环境能够影响肠道菌群物种组成和丰度变化, 这种变化对评估高原反应具有重要的作用。另外，由于急进高原更易引起急性高原反应，尤其是男性群体，研究此类人群的肠道菌群变化来预测评估急性高原反应更有价值，同时临床上也缺乏针对急性高原反应的预测性生物标记物。本专利技术鉴定了急性高原反应相关的肠道菌群物种以及相对丰度的变化，提供了用于评价急性高原反应程度的微生物标志物以及筛选方法。

技术实现思路

[0004]基于上述
技术介绍
，本专利技术所要解决的技术问题在于提供一种成年男性高原适应性肠道真菌标志物及其应用。为了实现本专利技术的专利技术目的，拟采用如下技术方案：本专利技术一方面涉及一种成年男性高原适应性肠道真菌标志物，所述标志物包括刺盾炱目（Chaetothyriales）。
[0005]本专利技术另一方面涉及一种诊断成年男性高原适应性的试剂盒，所述试剂盒包括用于定量测定上述肠道真菌标志物丰度的试剂。
[0006]本专利技术另一方面涉及上述标志物或试剂盒的应用，所述标志物或试剂盒用于制备诊断成年男性高原适应性的诊断试剂。
[0007]在本专利技术的一个优选实施方式中，所述成年男性高原适应性包括急性高原病。
有益效果
[0008]本专利技术采用肠道菌群变化来预测评估急性高原反应程度，为非侵入性操作，检测便捷且无伤害。
附图说明
[0009]图1为Chaetothyriales（刺盾炱目）下科水平与属水平所属的菌在重度急性高原反应组（H）和轻度（或无）急性高原反应组（NH）的平均相对丰度柱状图，不同颜色代表刺盾炱目下相应菌科或菌属在各组所占的相对丰度%值。H为重度急性高原反应；NH为（轻度或无）急性高原反应。
[0010]图2为差异物种的LDA值分布图和进化分支图。利用微生物群落多样性（LEfSe）分析，筛选并找出的物种的进化树：LDA Effect Size (LEfSe) 进化分支图，通过线性判别分析（linear discriminant analysis，LDA）效应大小分析潜在的生物标志物，LDA 效应因子用于指示能力强弱。
具体实施方式
[0011]为了进一步理解本专利技术，下面将结合本专利技术实施例，对本专利技术实施例中的技术方案进行清楚、完整地描述，显然，所描述的实施例仅仅是本专利技术一部分实施例，而不是全部的实施例。基于本专利技术中的实施例，本领域普通技术人员在没有做出创造性劳动前提下所获得的所有其他实施例，都属于本专利技术保护的范围。
[0012]如无特殊说明，本专利技术实施例中所涉及的试剂均为市售产品，均可以通过商业渠道购买获得。
实施例1
[0013]为了填补目前高原肠道菌群中真菌微生物组分析的空白，为高原反应人群的临床诊断和预防提供微生物标志物。另外，近期的研究发现，肠道菌群及其代谢产物形成的多样化和复杂的肠道生态环境深刻地影响高原反应。本专利技术前期分别收集了人群上高原前的粪便标本，以及上高原3个月后的粪便标本，通过构建新型真菌微生物组DNA提取方法，从粪便中提取真菌微生物组DNA，同时运用ITS测序进行真菌微生物组分析，目的在鉴定可靠的真菌标志物。
[0014]本专利技术基于对真菌与高原反应之间关联的分析，经过严格的筛选和分类，对微生物组进行深入研究，利用粪便样本中的微生物DNA序列，发现和鉴定能够有效区分强高原反应与低高原反应男性人群的粪便样本，深入分析来自不同高原反应人群与微生物遗传特性之间的关联。
[0015]一、样本人群和排除标准了研究人群的高原反应差异，我们入组了10名身体正常的成年男性，年龄不超过40岁，身体健康。统一上高原前留取粪便标本，并且能够在高原环境中（拉萨）适应超过2个月，统一回到平原留取粪便标本。排除具有慢性疾病史，进藏前细菌感染，以及饮食上食用益生菌等干扰肠道菌群的个体。所有入组人群均被告知研究的性质。二、信息和生物样本收集1.信息收集受试群体均在正常状态下完成问卷调查，进入高原2
‑
3小时实施，且采用国际上通用的AMS评分标准来反应高原反应程度，具体的AMS评分标准如下表1。
[0016]表1：Lake Louise国际急性高原反应评分标准
[0017]1.在对每项症状按0、1、2、3计分时必须是整数；2.总计分最低为0分，最高为15分；3.自我判定是对具有高中文化程度以上的建设者。进入高原前发放此表并经专业人员讲解如何填写，在进入高原后自我评分；但如大群体或本人文化低对此计分系统理解不深，应是由医生填写。自我判定的目的是及早自我处理(如登山时)或及早找医生处理，达到早期诊治的目的。
[0018]4.对一个大群体进行AMS观察时，一般在进入高原后最初2～3小时填表计分。在最初一周内，每天最好计分2次，第一次在早晨清醒后1小时，第二次在每天收工后即进行。
[0019]最后诊断要依综合判分：自我评分+临床判分AMS诊断：必须有头痛，计分≥3。
[0020]AMS严重度判别：计分0～2为无 ；3～4为轻度；≥5为重度。
[0021]表2：高原人群AMS评分
[0022]（2）将脂质体与尼莫地平注射液按照体积比1：1超声混合，形成待测药物。
[0023]2. 生物样本收集上高原前将粪便样品收集在无菌冻存管中。取得粪便后立即放入干冰中暂存，并在8h内放入
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80℃冰箱中冷冻保存。从高原回到平原地区后，立即收取受试者的粪便标本，取得粪便后立即放入干冰中暂存，并在8h内放入
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80℃冰箱中冷冻保存。
[0024]三、DNA提取和测序根据说明书使用Qiagen QIAmp DNA Stool Mini Kit(Qiagen)用粪便样本的DNA提取。
[0025]ITS核糖体RNA NGS方法的一个主要优点是它们提供了一种经济高效的技术，可以鉴定传统方法可能无法发现的菌株。与毛细管测序或基于PCR的方法不同，新一代测序无需培养即可分析样本中的整个微生物群落。使用NGS进行ITS分析可以快速鉴定真菌，有助于我们深入了解真菌微生物组。此外，NGS还能在单次测序运行中本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种成年男性高原适应性肠道真菌标志物，所述标志物包括刺盾炱目（Chaetothyriales）。2.一种诊断成年男性高原适应性的试剂盒，所述试剂盒包括用于定量测定权利要求1所述肠道真菌标志物丰度的试剂。3.权利要求1所述的标志物...

【专利技术属性】
技术研发人员：薛新颖，潘磊，臧学磊，刘鹏飞，赵晟，魏华英，翟怀远，陈明利，李天宇，郭海峰，黄晓瑞，
申请(专利权)人：中国铁道科学研究院集团有限公司节能环保劳卫研究所中国铁道科学研究院集团有限公司中国国家铁路集团有限公司，
类型：发明
国别省市：