一种快速生长型大口黑鲈选育用分子标记及其应用制造技术

本发明专利技术提供了一种快速生长型大口黑鲈选育用分子标记及其应用，属于水产育种技术领域。本发明专利技术通过简化基因组测序在美国原种F1代中筛选快长相关的标记，验证快长标记富集与生长性能的关联性，利用开发的标记结合相应的验证与配组技术完成新品种的连续选育工作。实验证明SNP19140160、SNP23355498、SNP9639603和SNP9639605均与实验中测定大口黑鲈原种F1代体长显著相关；并且SNP19140160位点还与大口黑鲈原种F1代体重、体高、体厚均呈显著相关。本发明专利技术提供了所述分子标记能够精准高效筛选鉴定快速生长型大口黑鲈，从而提高快速生长型大口黑鲈新品种选育效率。口黑鲈新品种选育效率。口黑鲈新品种选育效率。

【技术实现步骤摘要】
一种快速生长型大口黑鲈选育用分子标记及其应用


[0001]本专利技术属于水产育种
，具体涉及一种快速生长型大口黑鲈选育用分子标记及其应用。

技术介绍

[0002]在大口黑鲈养殖过程中，许多养殖户反馈苗种成活率较低，病害易发生。结合大口黑鲈的遗传特征与应激特性，亲本遗传多样性低与苗种抗应激性差可能是限制其产业发展的关键问题。由于种质退化严重，养殖大口黑鲈的抗病力急剧降低，致使近年来病害频发。因此，选育大口黑鲈新品种不仅有助于解决亲本种质退化，而且能够缓解良种缺乏引起的苗种与成鱼养殖效益下降问题。中国水产科学研究院淡水渔业研究中心从美国引进大口黑鲈北方亚种原种苗种7000尾。这些原种遗传谱系清晰，遗传多样性高，所用亲本均通过美国农业部有机认证的生物安全检测，不携带任何病毒。基于11个微卫星多态位点的遗传信息，发现大口黑鲈北方亚种原种与目前市场上主养的优鲈1号和中国台湾品系大口黑鲈遗传距离较远，遗传多样性高，具有良好的选育潜力。
[0003]系统开展大口黑鲈的良种保存和选育工作是解决目前大口黑鲈亲本品质退化的重要途径，也是提高大口黑鲈产量、增加养殖户收益的必要措施。分子标记辅助育种(Marker Assisted Selection,MAS)可有效克服传统育种方法的缺点，准确、高效地达到选育目的。该方法是利用与目标基因紧密连锁或表现共分离的分子标记对选择个体进行目标性状的筛选，从而减少连锁累赘，获得期望的个体，达到提高育种效率的目的。
[0004]然而目前还未有关于能够选育具有快速生长性状的大口黑鲈的分子标记，这无疑阻碍大口黑鲈的育种工作。

技术实现思路

[0005]有鉴于此，本专利技术的目的在于提供一种快速生长型大口黑鲈选育用分子标记，所述分子标记与快速生长指标紧密连锁，是一种选育快速生长型大口黑鲈新品种的良好分子标记，从而解决大口黑鲈种质退化问题。
[0006]本专利技术提供了一种快速生长型大口黑鲈选育用分子标记，包括以下SNP分子标记；SNP19140160、SNP23355498、SNP9639603和SNP9639605；
[0007]所述SNP19140160是RefSeq GCF_014851395.1基因版本中第NW_024044570.1号染色体19140160位置存在多态性位点A/C；
[0008]所述SNP23355498是RefSeq GCF_014851395.1基因版本中第NW_024044348.1号染色体23355498位置存在多态性位点G/A；
[0009]所述SNP9639603是RefSeq GCF_014851395.1基因版本中第NW_024044237.1号染色体9639603位置存在多态性位点T/G；
[0010]所述SNP9639605是RefSeq GCF_014851395.1基因版本中第NW_024044237.1号染色体9639605位置存在多态性位点T/A。
[0011]优选的，所述SNP19140160是位于SEQ ID NO:3所示的序列中第100
[0012]位的多态性位点A/C。
[0013]优选的，所述SNP23355498是位于SEQ ID NO:13所示的序列中第100位的多态性位点G/A。
[0014]优选的，所述SNP9639603是位于SEQ ID NO:10所示的序列中第100位的多态性位点T/G。
[0015]优选的，所述SNP9639605是位于SEQ ID NO:12所示的序列中第100位的多态性位点T/A。
[0016]本专利技术提供了一种检测快速生长型大口黑鲈的引物，包括扩增所述的分子标记的引物对；
[0017]扩增SNP19140160分子标记的引物对包括核苷酸序列如SEQ ID NO:18所示的正向引物和核苷酸序列如SEQ ID NO:19所示的反向引物；
[0018]扩增SNP23355498分子标记的引物对包括核苷酸序列如SEQ ID NO:36所示的正向引物和核苷酸序列如SEQ ID NO:37所示的反向引物；
[0019]扩增SNP9639603分子标记的引物对包括核苷酸序列如SEQ ID NO:32所示的正向引物和核苷酸序列如SEQ ID NO:33所示的反向引物；
[0020]扩增SNP9639605分子标记的引物对包括核苷酸序列如SEQ ID NO:34所示的正向引物和核苷酸序列如SEQ ID NO:35所示的反向引物。
[0021]本专利技术提供了一种检测快速生长型大口黑鲈的试剂盒，包括所述引物和PCR反应液。
[0022]本专利技术提供了所述的分子标记、所述引物对或所述试剂盒在快速生长型大口黑鲈品种的辅助育种中的应用。
[0023]优选的，所述快速生长型大口黑鲈品种的辅助育种的方法，包括以下步骤：
[0024]利用所述引物扩增待选育样本的分子标记，当待测样本的基因组DNA富集了所述分子标记的优势生长基因型，并且待选育样本的生长速度比未选育群体提高12％以上时，待选育样本作为材料用于育种。
[0025]优选的，所述分子标记的优势生长基因型包括以下SNP分子标记优势生长基因型的2种以上：
[0026]SNP19140160的优势生长基因型为AA；
[0027]SNP9639603的优势生长基因型为GG或TT；
[0028]SNP9639605的优势生长基因型为AA；
[0029]SNP23355498的优势生长基因型为AA或GG。
[0030]本专利技术提供了一种快速生长型大口黑鲈选育用分子标记，包括以下至少一种SNP分子标记；SNP19140160、SNP23355498、SNP9639603和SNP9639605；所述SNP19140160是RefSeq GCF_014851395.1基因版本中第NW_024044570.1号染色体19140160位置存在多态性位点A/C；所述SNP23355498是RefSeq GCF_014851395.1基因版本中第NW_024044348.1号染色体23355498位置存在多态性位点G/A；所述SNP9639603是RefSeq GCF_014851395.1基因版本中第NW_024044237.1号染色体9639603位置存在多态性位点T/G；所述SNP9639605是RefSeq GCF_014851395.1基因版本
[0031]中第NW_024044237.1号染色体9639605位置存在多态性位点T/A。所述SNP19140160、SNP23355498、SNP9639603和SNP9639605与生长性状紧密连锁。经过关联分析，结果表明SNP19140160、SNP23355498、SNP9639603和SNP9639605分子标记均与实验中测定大口黑鲈原种F1代体长显著相关，且SNP19140160位点与大口黑鲈原种F1代体重、体高、体厚和体长均呈显著相关。通过进一步分析4个本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种快速生长型大口黑鲈选育用分子标记，其特征在于，包括以下SNP分子标记；SNP19140160、SNP23355498、SNP9639603和SNP9639605；所述SNP19140160是RefSeq GCF_014851395.1基因版本中第NW_024044570.1号染色体19140160位置存在多态性位点A/C；所述SNP23355498是RefSeq GCF_014851395.1基因版本中第NW_024044348.1号染色体23355498位置存在多态性位点G/A；所述SNP9639603是RefSeq GCF_014851395.1基因版本中第NW_024044237.1号染色体9639603位置存在多态性位点T/G；所述SNP9639605是RefSeq GCF_014851395.1基因版本中第NW_024044237.1号染色体9639605位置存在多态性位点T/A。2.根据权利要求1所述分子标记，其特征在于，所述SNP19140160是位于SEQ ID NO:3所示的序列中第100位的多态性位点A/C。3.根据权利要求1所述分子标记，其特征在于，所述SNP23355498是位于SEQ ID NO:13所示的序列中第100位的多态性位点G/A。4.根据权利要求1所述分子标记，其特征在于，所述SNP9639603是位于SEQ ID NO:10所示的序列中第100位的多态性位点T/G。5.根据权利要求1所述分子标记，其特征在于，所述SNP9639605是位于SEQ ID NO:12所示的序列中第100位的多态性位点T/A。6.一种检测快速生长型大口黑鲈的引物，其特征在于，包括扩增权利要求1～5任意一项所述的...

【专利技术属性】
技术研发人员：强俊，张茂友，徐钢春，华吉祥，李岩，陶易凡，陈文华，徐跑，
申请(专利权)人：苏州市水产技术推广站，
类型：发明
国别省市：