用于检测疟疾的组合物和方法技术

本公开描述了用于快速检测生物学或非生物学样品中疟疾寄生虫(包括疟原虫)的存在或不存在的方法。所述方法可以包括执行扩增步骤、杂交步骤和检测步骤。此外，测定可以是多重测定，以同时扩增和检测多个疟原虫靶标，这提供了优于单重测定的优势。此外，还提供了靶向疟疾寄生虫(包括疟原虫)的寡核苷酸引物和寡核苷酸探针以及试剂盒，其设计用于检测疟原虫，所述疟原虫包括但不限于恶性疟原虫、间日疟原虫、卵形疟原虫、诺氏疟原虫和三日疟原虫的疟原虫物种。还描述了用于扩增和检测疟疾寄生虫(包括疟原虫)的试剂盒、反应混合物和寡核苷酸(例如，引物和探针)。引物和探针)。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】用于检测疟疾的组合物和方法
[0001]相关申请的交叉引用
[0002]本专利申请要求于2020年12月4日提交的美国临时专利申请号63/121,338的优先权，该美国临时专利申请的内容全文以引用方式并入本文。


[0003]本公开涉及体外诊断领域。在该领域内，本专利技术涉及使用引物和探针对可能存在于样品中的靶核酸的扩增和检测，并且特别是对疟疾寄生虫的包括序列变异和/或个体突变的靶核酸的扩增、检测和定量。本专利技术进一步提供了含有用于疟疾的扩增和检测的引物和探针的反应混合物和试剂盒。

技术介绍

[0004]疟疾是一种通过蚊子传播的传染性疾病，其会影响人类和其他动物。疟疾是一种由单细胞微生物疟原虫(Plasmodium)寄生虫引起的疾病，其在被受感染的雌性按蚊(Anopheles mosquitoe)叮咬后传播给人类。疟疾的最初症状包括发热、头痛和寒战，并且可以使用现有的抗疟疾药物进行治疗。如果不加以治疗，可能会发展成严重的疟疾，其症状包括贫血、脑型疟疾和呼吸窘迫，此可能最终导致死亡。
[0005]根据2018年世界卫生组织本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】1.一种用于检测样品中一种或多种疟疾寄生虫物种的方法，所述方法包括：(a)执行扩增步骤，所述扩增步骤包括使所述样品与一组或多组寡核苷酸引物接触以产生扩增产物，如果所述一种或多种疟疾寄生虫物种的靶核酸存在于所述样品中的话；(b)执行杂交步骤，所述杂交步骤包括使一种或多种寡核苷酸探针与所述扩增产物接触，如果所述一种或多种疟疾寄生虫物种的靶核酸存在于所述样品中的话；以及(c)检测所述扩增产物的存在或不存在，其中所述扩增产物的存在指示所述样品中所述一种或多种疟疾寄生虫物种的存在，并且其中所述扩增产物的不存在指示所述样品中所述一种或多种疟疾寄生虫物种的不存在；并且其中所述一组或多组寡核苷酸引物和所述一种或多种寡核苷酸探针包括：(1)一组寡核苷酸引物，所述一组寡核苷酸引物包括含有SEQ ID NO：34、35和36的核酸序列或其互补序列的寡核苷酸引物；以及含有SEQ ID NO：4的核酸序列或其互补序列的寡核苷酸探针；和/或(2)一组寡核苷酸引物，所述一组寡核苷酸引物包括含有SEQ ID NO：56和57的核酸序列或其互补序列的寡核苷酸引物；以及含有SEQ ID NO：58的核酸序列或其互补序列的寡核苷酸探针。2.根据权利要求1所述的方法，其中所述一组或多组寡核苷酸引物和所述一种或多种寡核苷酸探针包括：(1)一组寡核苷酸引物，所述一组寡核苷酸引物包括含有SEQ ID NO：34、35和36的核酸序列或其互补序列的寡核苷酸引物；以及含有SEQ ID NO：4的核酸序列或其互补序列的寡核苷酸探针；以及(3)一组寡核苷酸引物，所述一组寡核苷酸引物包括含有SEQ ID NO：56和57的核酸序列或其互补序列的寡核苷酸引物；以及含有SEQ ID NO：58的核酸序列或其互补序列的寡核苷酸探针。3.根据权利要求1至2中任一项所述的方法，其中所述一种或多种疟疾寄生虫物种属于疟原虫属。4.根据权利要求3所述的方法，其中属于疟原虫属的所述一种或多种疟疾寄生虫物种为恶性疟原虫、间日疟原虫、卵形疟原虫、三日疟原虫和/或诺氏疟原虫。5.根据权利要求1至4中任一项所述的方法，其中所述样品为生物学样品。6.根据权利要求5所述的方法，其中所述生物学样品为全血、呼吸道样本、尿液、粪便样本、血液样本、血浆、皮肤拭子、鼻拭子、伤口拭子、血培养物、皮肤、或软组织感染。7.根据权利要求6所述的方法，其中所述生物学样品为全血。8.根据权利要求1至7中任一项所述的方法，其中所述一种或多种寡核苷酸探针是经标记的。9.根据权利要求8所述的方法，其中所述一种或多种寡核苷酸探针用供体荧光部分和对应的受体部分进行标记。10.根据权利要求9所述的方法，其中步骤(c)进一步包括检测所述一种或多种寡核苷酸探针的所述供体荧光部分与所述受体部分之间荧光共振能量转移(FRET)的存在或不存在，其中荧光的存在或不存在指示所述样品中所述一种或多种疟疾寄生虫物种的存在或不存在。
11.一种用于检测样品中一种或多种疟疾寄生虫物种的第一靶核酸和/或第二靶核酸的方法，所述方法包括：(a)执行扩增步骤，所述扩增步骤包括使所述样品与一组或多组寡核苷酸引物接触以产生扩增产物，如果所述一种或多种疟疾寄生虫物种的所述第一靶核酸和/或所述第二靶核酸存在于所述样品中的话；(b)执行杂交步骤，所述杂交步骤包括使一种或多种寡核苷酸探针与所述扩增产物接触，如果所述一种或多种疟疾寄生虫物种的所述第一靶核酸和/或所述第二靶核酸存在于所述样品中的话；以及(c)检测所述扩增产物的存在或不存在，其中所述扩增产物的存在指示所述样品中所述一种或多种疟疾寄生虫物种的存在，并且其中所述扩增产物的不存在指示所述样品中所述一种或多种疟疾寄生虫物种的不存在；并且其中所述一组或多组寡核苷酸引物和所述一种或多种寡核苷酸探针包括：(1)用于所述一种或多种疟疾寄生虫物种的第一靶核酸的一组寡核苷酸引物以及寡核苷酸探针，其中所述一组寡核苷酸引物包括含有SEQ ID NO：34、35和36的核酸序列或其互补序列的寡核苷酸引物；并且其中所述寡核苷酸探针含有SEQ ID NO：4的核酸序列或其互补序列；以及(2)用于所述一种或多种疟疾寄生虫物种的所述第二靶核酸的一组寡核苷酸引物以及寡核苷酸探针，其中所述一组寡核苷酸引物包括含有SEQ ID NO：56和57的核酸序列或其互补序列的寡核苷酸引物；并且其中所述寡核苷酸探针含有SEQ ID NO：58的核酸序列或其互补序列。12.一种用于检测样品中一种或多种疟疾寄生虫物种的方法，所述方法包括：(a)执行扩增步骤，所述扩增步骤包括使所述样品与一组或多组寡核苷酸引物接触以产生扩增产物，如果所述一种或多种疟疾寄生虫物种的靶核酸存在于所述样品中的话；(b)执行杂交步骤，所述杂交步骤包括使一种或多种寡核苷酸探针与所述扩增产物接触，如果所述一种或多种疟疾寄生虫物种的所述靶核酸存在于所述样品中的话；以及(c)检测所述扩增产物的存在或不存在，其中所述扩增产物的存在指示所述样品中所述一种或多种疟疾寄生虫物种的存在，并且其中所述扩增产物的不存在指示所述样品中所述一种或多种疟疾寄生虫物种的不存在；并且其中所述一组或多组寡核苷酸引物和所述一种或多种寡核苷酸探针包括：一组寡核苷酸引物，所述一组寡核苷酸引物包括含有SEQ ID NO：34、35和36的核酸序列或其互补序列的寡核苷酸引物；以及含有SEQ ID NO：4的核酸序列或其互补序列的寡核苷酸探针。13.一种用于检测样品中一种或多种疟疾寄生虫物种的方法，所述方法包括：(a)执行扩增步骤，所述扩增步骤包括使所述样品与一组或多组寡核苷酸引物接触以产生扩增产物，如果所述一种或多种疟疾寄生虫物种的靶核酸存在于所述样品中的话；(b)执行杂交步骤，所述杂交步骤包括使一种或多种寡核苷酸探针与所述扩增产物接触，如果所述一种或多种疟疾寄生虫物种的所述靶核酸存在于所述样品中的话；以及(c)检测所述扩增产物的存在或不存在，其中所述扩增产物的存在指示所述样品中所述一种或多种疟疾寄生虫物种的存在，并且其中所述扩增产物的不存在指示所述样品中所述一种或多种疟疾寄生虫物种的不存在；并且
其中所述一组或多组寡核苷酸引物和所述一种或多种寡核苷酸探针包括：一组寡核苷酸引物，所述一组寡核苷酸引物包括含有S...

【专利技术属性】
技术研发人员：M，
申请(专利权)人：豪夫迈，
类型：发明
国别省市：