一种建兰SSR引物组及应用该引物组构建建兰品种指纹图谱的方法技术

本发明专利技术公开了一种建兰SSR引物组及应用该引物组构建建兰品种指纹图谱的方法。该建兰SSR引物组包括14对SSR引物序列。本发明专利技术利用该14对SSR引物序列对建兰基因组DNA进行多重PCR扩增，利用毛细管荧光电泳检测PCR产物，对SSR标记数据进行分析，构建70种建兰SSR指纹图谱，并能够有效的鉴定出建兰品种。本发明专利技术构建建兰品种指纹图谱的方法具有高通量、高精度、成本低的优点，应用前景良好。应用前景良好。应用前景良好。

【技术实现步骤摘要】
一种建兰SSR引物组及应用该引物组构建建兰品种指纹图谱的方法


[0001]本专利技术涉及生物
，具体涉及一种建兰SSR引物组及应用该引物组构建建兰品种指纹图谱的方法。

技术介绍

[0002]建兰(Cymbidium ensifolium)，是兰科兰属地生种。株型适中、叶姿优美，总状花序具5
‑
10朵花，有幽香，是我国传统国兰中难得得可以多季开花种类，因此又名四季兰，在国内外市场深受欢迎。尽管建兰拥有悠久栽培历史和文化传承，但品种鉴定大多取决于传统形态指标，在尚未开花的时候难以通过叶片和株型精准鉴定品种。近年来，随着建兰的推广和市场发展壮大，加之互联网技术的迅速发展，各大电商平台、社交媒体和论坛提供了更加多样化的交易渠道，兰花市场上出现的建兰品种超500种，然而尚无统一规范的品种鉴定标准，产品以次充好，品种混淆的现象普遍存在。为促进适应市场需求的品种选育、鉴定和推广，势必要求建立与之相适应的兰花品种鉴定标准。
[0003]兰科植物在全球分布广泛，有801属，超27500种。近年来，分子标记，主要包括RAPD、ISSR、SSR、SRAP和ScoT等广泛用于兰花种内、种间及品种间的分类鉴定、遗传多样性、亲缘关系的分析以及种质资源与种群方面的研究。然而对我国特色资源的鉴定评价受限于地域局限和品种收集难度，目前在国内还未见基于毛细管电泳技术和SSR分子标记对建兰品种进行高通量鉴定的相关报道。因此，开展本专利技术采用SSR分子标记对建兰品种进行鉴定，将对种质资源鉴评、种质创新利用以及商品花质量监督和市场规范等方面具有重要意义。

技术实现思路

[0004]本专利技术旨在针对现有技术的技术缺陷，提供一种建兰SSR引物组及利用该引物组、将毛细管电泳技术与SSR
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PCR技术结合的构建建兰品种指纹图谱的方法，以快速高效鉴定建兰品种。
[0005]本专利技术的第一个目的是提供一种建兰SSR引物组，其包括以下14对SSR引物序列：
[0006]SSR_41756_c0_g2
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F:5
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[0007]ꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀ
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[0008]SSR_44148_c1_g1
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[0009]ꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀ
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[0010]SSR_44775_c0_g1
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[0011]ꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀ
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[0012]SSR_44824_c2_g1
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[0013]ꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀ
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[0014]SSR_45085_c1_g2
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F:5
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[0015]ꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀ
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[0016]SSR_47270_c0_g2
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[0017]ꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀ
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[0018]SSR_49506_c0_g1
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[0019]ꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀ
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[0020]SSR_50081_c2_g1
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[0021]ꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀ
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[0022]SSR_51250_c1_g6
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TGCTAATTGCCTGTGACCAA
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[0023]ꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀ
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[0024]SSR_52068_c3_g3
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[0026]SSR_54963_c0_g1
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CAATCAGCCTAGGGTTCCAA
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[0027]ꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀ
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AAGGAGAAACTTCCTGCGGT
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[0028]SSR_55127_c0_g1
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F:5
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CGATGGAGGACAGCACTTTT
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[0029]ꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀ
R:5
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GCACCTTCTTCTCCCTCACA
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[0030]SSR_56903_c1_g2
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GCGTTGAAGAAAGGCAAAAG
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[0031]ꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀ...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.建兰SSR引物组，其特征在于，包括以下14对SSR引物序列：2.权利要求1所述的建兰SSR引物组在构建建兰品种指纹图谱中的应用。
3.权利要求1所述的建兰SSR引物组在鉴定建兰品种中的应用。4.一种建兰品种指纹图谱的构建方法，其特征在于，包括以下步骤：(1)提取建兰样品的DNA；(2)以提取的DNA为模板，以权利要求1所述SSR引物组为扩增引物，建立PCR反应体系并进行PCR扩增；(3)将扩增产物进行毛细管电泳，根据毛细管电泳结果对建兰每个品种的样品DNA的扩增结果形成扩增片段长度数据化编码，构建得到建兰品种指纹图谱。5.根据权利要求4所述的建兰品种指纹图谱的构建方法，其特征在于，步骤(2)中的PCR反应体系包括：10
×
PCR Buffer 3μL、2.5mM dNTP 2μL、MgCl
2 2μL、Primer A 2μL、Primer B 2μL、Template 1μL、ddH2O 18μL、Taq酶0.2μL；所述PCR扩增的反应程序为：95℃ 5min；95℃ 30s，60℃ 30s，72℃ 30s，30个循环；95℃ 30s，55℃ 30s，72℃ 30s，10个循环；60℃ 30min；4℃保存。6.根据权利要求4所述的建兰品种指纹图谱的构建方法，其特征在于，步骤(3)中将扩增产物进行毛细管电泳，根据毛细管电泳结果对建兰每个品种的样品DNA的扩增结果形成扩增片段长度数据化...

【专利技术属性】
技术研发人员：杨凤玺，朱根发，高洁，魏永路，金建鹏，陆楚桥，
申请(专利权)人：肇庆雅兰芳农业科技有限公司，
类型：发明
国别省市：