一种用于薏苡品种鉴定的SSR引物组合及其鉴定方法技术

本发明专利技术涉及分子标记技术领域，具体涉及一种用于薏苡品种和/或种质资源鉴定的SSR分子标记、SSR引物组合及其鉴定方法。鉴定薏苡品种和/或种质资源的SSR位点根据Coixlacryma

【技术实现步骤摘要】
一种用于薏苡品种鉴定的SSR引物组合及其鉴定方法


[0001]本专利技术涉及分子标记
，具体涉及一种用于薏苡品种和/或种质资源鉴定的SSR引物组合及其鉴定方法。

技术介绍

[0002]薏苡是我国传统药食兼用作物，南北均可种植，贵州不仅是我国薏苡主产区，也是全国最大的薏苡加工集聚区和产品集散地，来自全国的薏苡品种在贵州种植、加工、汇集和流通，易造成品种混杂、张冠李戴，给市场监管带来了极大的挑战。另外，随着人们对健康饮食的注重，薏苡作为营养丰富的小杂粮受到市场推崇，不同地区的薏苡种质资源交流频繁、品种选育力度加大，品种登记数量逐年急剧增多，不仅出现同名异种现象，同时派生系或衍生系品种增多，给品种管理带来困难。再者，薏苡自然异交率为35.9％
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72.8％，繁种过程中即使严格控制条件，也难免会有一定数量的杂株出现，影响种子生产的纯度。综上所述，需要一套科学、准确、可操作的品种鉴定方法为薏苡种业管理和市场监管提供依据。
[0003]目前，薏苡品种的鉴定主要依靠田间表型，但很多农艺性状受微效多基因控制，易受环境条件的影响，本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种用于薏苡品种和/或种质资源鉴定的SSR分子标记，其特征在于，所述分子标记包括如下30个分子标记中的一种或多种：CL02_GAG9_138，位于薏苡参考基因组中NCBI Genbank CM019822.1所述序列的第18275142
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18275168位；CL02_TCT13_159，位于薏苡参考基因组中NC BI Genbank CM019822.1所述序列的第49134490
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49134531位；CL01_GAC9_6，位于薏苡参考基因组中NCBI Genbank CM019823.1所述序列的第179895861
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179895878位；CL01_CGA14_18，位于薏苡参考基因组中NCBI Genbank CM019823.1所述序列的第162400083
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162400120位；CL03_AAG9_237，位于薏苡参考基因组中NCBI Genbank CM019824.1所述序列的第178887434
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178887460位；CL 03_TGT11_246，位于薏苡参考基因组中NCBI Genbank CM019824.1所述序列的第168855678
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168855710位；CL03_CAA10_281，位于薏苡参考基因组中NCBI Genbank CM019824.1所述序列的第48421460
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48421489位；CL03_CTTG7_310，位于薏苡参考基因组中NCBI Genbank CM019824.1所述序列的第112812150
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112812173位；CL04_TAT11_324，位于薏苡参考基因组中NCBI Genbank CM019825.1所述序列的第1845079
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1845111位；CL04_TTA10_355，位于薏苡参考基因组中NCBI Genbank CM019825.1所述序列的第55294636
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55294665位；CL04_T GA14_377，位于薏苡参考基因组中NCBI Genbank CM019825.1所述序列的第127661701
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127661743位；CL04_ATG11_402，位于薏苡参考基因组中NCBI Gen bank CM019825.1所述序列的第158437947
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158437973位；CL05_TGA9_503，位于薏苡参考基因组中NCBI Genbank CM019826.1所述序列的第159792618
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159792641位；CL05_ATC15_493，位于薏苡参考基因组中NCBI Genbank CM019826.1所述序列的第144746297
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144746329位；CL05_TCTA9_512，位于薏苡参考基因组中NCBI Genbank CM019826.1所述序列的第42693057
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42693113位；CL06_GAA16_547，位于薏苡参考基因组中NCBI Genbank CM019827.1所述序列的第118744609
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118744646位；CL08_TAT10_727，位于薏苡参考基因组中NCBI Genbank CM019828.1所述序列的第18531746
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18531775位；CL08_CAT9_739，位于薏苡参考基因组中NCBI Genbank CM019828.1所述序列的第50140563
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50140589位；CL08_CAT9_740，位于薏苡参考基因组中NCBI Genbank CM019828.1所述序列的第50144777
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50144803位；CL08_TAG9_716，位于薏苡参考基因组中NCBI Genbank CM019828.1所述序列的第2217115
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2217142位；CL08_CTT1 3_776，位于薏苡参考基因组中NCBI Genbank CM019828.1所述序列的第146977378
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146977440位；CL08_ATC22_749，位于薏苡参考基因组中NCBI Genbank CM019828.1所述序列的第104139096
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104139168位；CL10_TCA10，位于薏苡参考基因组中NCBI Genbank CM019829.1所述序列的第114715781
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114715810位；CL10_TTA10_895，位于薏苡参考基因组中NCBI Genbank CM019829.1所述序列的第17981504
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17981530位；CL10_GGA13_885，位于薏苡参考基因组中NCB I Genbank CM019829.1所述序列的第10100327
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10100341位；CL10_CCA9_879，位于薏苡参考基因组中NCBI Genbank CM019829.1所述序列的第2510104
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2510137位；CL07_AAG9_626，位于薏苡参考基因组中NCBI Genbank CM019831.1所述序列的第1221177
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1221203位；CL07_ATG15_667，位于薏苡参考基因组中NCBI Genbank CM019831.1所述序列的第71338383
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71338424位；CL07_CAT10_669，位于薏苡参考基因组中NCBI Genbank CM019831.1所述序列的第75083331
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75083351位；CL07_ATAG7_698，位于薏苡参考基因组中NCBI Genbank CM019831.1所述序列的第28068144
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28068161位。
2.一种用于薏苡品种和/或种质资源鉴定的引物组合，其特征在于，所述引物组合包括如下30个引物对中的一种或多种：CL02_GAG9_138FR、CL02_TCT13_159FR、CL01_GAC9_6FR、CL01_CGA14_18FR、CL03_AAG9_237FR、CL03_TGT11_246FR、CL03_CAA10_281FR、CL03_CTTG7_310FR、CL04_TAT11_324FR、CL04_TTA10_355FR、CL04_TGA14_377FR、CL04_ATG11_402FR、CL05_TGA9_503FR、CL05_ATC15_493FR、CL05_TCTA9_512FR、CL06_GAA16_547FR、CL08_TAT10_727FR、CL08_CAT9_739FR、CL08_CAT9_740FR、CL08_TAG9_716FR、CL08_CTT13_776FR、CL08_ATC22_749FR、CL10_TCA10FR、CL10_TTA10_895FR、CL10_GGA13_885FR、CL10_CCA9_879FR、CL07_AAG9_626FR、CL07_ATG15_667FR、CL07_CAT10_669FR、CL07_ATAG7_698FR；其中，引物对CL02_GAG9_138FR用于扩增所述CL02_GAG9_138，其序列如SEQ ID NO:1和SEQ ID NO:2所示；引物对CL02_TCT13_159FR用于扩增所述CL02_TCT13_159，其序列如SEQ ID NO:3和SEQ ID NO:4所示；引物对CL01_GAC9_6FR用于扩增所述CL01_GAC9_6，其序列如SEQ ID NO:5和SEQ ID NO:6所示；引物对CL01_CGA14_18FR用于扩增所述CL01_CGA14_18，其序列如SEQ ID NO:7和SEQ ID NO:8所示；引物对CL03_AAG9_237FR用于扩增所述CL03_AAG9_237，其序列如SEQ ID NO:9和SEQ ID NO:10所示；引物对CL03_TGT11_246FR用于扩增所述CL03_TGT11_246，其序列如SEQ ID NO:11和SEQ ID NO:12所示；引物对CL03_CAA10_281FR用于扩增所述CL03_CAA10_281，其序列如SEQ ID NO:13和SEQ ID NO:14所示；引物对CL03_CTTG7_310FR用于扩增所述CL03_CTTG7_310，其序列如SEQ ID NO:15和SEQ ID NO:16所示；引物对CL04_TAT11_324FR用于扩增所述CL04_TAT11_324，其序列如SEQ ID NO:17和SEQ ID NO:18所示；引物对CL04_TTA10_355FR用于扩增所述CL04_TTA10_355，其序列如SEQ ID NO:19和SEQ ID NO:20所示；引物对CL04_TGA14_377FR用于扩增所述CL04_TGA14_377，其序列如SEQ ID NO:21和SEQ ID NO:22所示；引物对CL04_ATG11_402FR用于扩...

【专利技术属性】
技术研发人员：付瑜华，李秀诗，尚昆，蒙秋伊，敖茂宏，刘凡值，
申请(专利权)人：贵州省亚热带作物研究所，
类型：发明
国别省市：