一种用于检测先天性肢体畸形的基因包、试剂盒及其应用制造技术

本发明专利技术公开了一种用于检测先天性肢体畸形的基因包、试剂盒及其应用，所述基因包包含359个基因，并通过进一步研究和筛选，提供了针对22种不同类型的先天性肢体畸形的各种基因组合(基因检测包(1)至(22))。应用本发明专利技术基因包，能够一次性对与先天性肢体畸形相关的多个基因进行深度测序，进一步结合生物学和生物信息学的相关手段进行分析，并结合家族相关病史，一方面可以用于产前检测，提高对先天性肢体畸形胎儿的产前诊断和检出率，降低先天性肢体畸形患儿的出生率；另一方面可用于产后肢体畸形患儿的致病基因的鉴定，有效评价该患儿的预后及对靶向治疗药物的敏感性。本发明专利技术检测灵敏度高，且成本和操作难度低，便于临床推广和应用。应用。应用。

【技术实现步骤摘要】
一种用于检测先天性肢体畸形的基因包、试剂盒及其应用


[0001]本专利技术属于生物基因和医学
，具体涉及一种用于检测先天性肢体畸形的基因包、试剂盒及其应用。

技术介绍

[0002]先天性肢体畸形发病率约为38/10000，而因为中国庞大的人口基数，患病人数众多。近年来，因为环境、生育习惯等改变，先天性肢体畸形发病率仍在逐年上升，目前已成为发病率仅次于先天性心脏病的第二大出生缺陷。
[0003]先天性肢体畸形表现或轻或重，对于多指畸形等症状较轻的肢体畸形，手术可以获得较好的预后，而对于分裂手、巨指、尖头并指综合征等严重的肢体畸形，则会对患儿的肢体功能及外观产生巨大影响，如不加以干预往往造成终生的身心残疾，给患者家庭带来极大的痛苦与负担，也成为了许多患病家庭生育意愿下降的一个重要原因。同时，由于手术花费或者因病致残、致贫，先天性肢体畸形也给社会经济造成了严重的负担，每年医保基金也为此支付巨额费用。
[0004]目前，产前筛查中无创筛查NIPT只用于18三体，13三体和21三体的检测，不涉及先天性肢体畸形的基因筛查。而产前影像筛本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种用于检测先天性肢体畸形的基因包，其特征在于，其包括下列基因检测包(1)至(22)中的任意一个或多个的组合：(1)用于检测短指的基因检测包：GDF5、BMPR1B、ROR2、HOXD13、GDF5
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AS1、IHH、PTHLH、NOG、CHSY1、PDE3A、BMP2、PRMT7、TRPV4、BDA1B、RUNX2、GNAS、HDAC4、CHST11、LOC109611589、TRPS1、COL2A1、FBN1、HDAC6、LTBP2、PDE4D、FGFR3、FGF9、CPBHM、ADAMTS10、ADAMTS17；(2)用于检测多指的基因检测包：DYNC2H1、GLI3、WDR35、IFT172、NEK1、DYNC2I1、LMBR1、DYNC2I2、BBS10、IFT80、GLI1、TTC21B、DYNLT2B、EVC2、SHH、KIAA0586、CC2D2A、WDR19、CEP120、DYNC2LI1、ZRS、EVC、KIF7、IFT140、IQCE、ZNF141、BBS12、PAPA2、KIAA0825、CIBAR1、SALL4、HOXD13、TMEM216、MKS1、AKT3、TBX3；(3)用于检测并指的基因检测包：LRP4、GJA1、HOXD13、BHLHA9、GLI3、NECTIN4、LMBR1、FGFR2、CUP2Q35、SHH、EDSS2、CCNQ、MEGF8、IQCE、FGFR3、FREM2、FRAS1、LRP4
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AS1、APC、TP63、CKAP2L、NOG、FBLN1、SOST、NECTIN1、TULP1、GRIP1、ZD1、CACNA1C、TWIST1；(4)用于检测先天性指间关节粘连的基因检测包：NOG、GDF5、GDF5
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AS1、FGF9、ROR2、BMPR1B、IHH、BHLHA9、HOXD13、PTDSS1；(5)用于检测横向缺损的基因检测包：CPT2、HADHA、ACADVL、OTC、G6PD、ACADM、PSAP、SERPINC1、BTD、GH1、MTHFR、SLC2A1、SERPINA1、ADA、PC、F8、HLCS、F9、PDHA1、F7、F5、GAMT、F11、CYP21A2、PROC、ADSL、FH、ETFDH、PROS1、CYP11B2；(6)用于检测桡侧纵裂发育不全的基因检测包：SALL4、SERPINC1、GH1、MTHFR、SERPINA1、ADA、F7、CYP21A2、IGF1、F5、F11、F2、CYP11B2、PROS1、PDHA1、GATA2、ITGB2、MMUT、ACADS、POR、RSPH9、SERPINE1、G6PC1、PHGDH、CBS、TTPA、QDPR、GLI3、POMC、BRCA2；(7)用于检测尺桡骨融合的基因检测包：SMAD6、MECOM、FGFR2、HOXA11、FGFR3、POR、TWIST1、MYH3、NOG、SF3B4、LRP4、FGFR1、SLC26A2、B3GALT6、RECQL4、FLNA、MASP1、B4GALT7、SALL4、B3GAT3、COLEC11、ZIC1、HOXD13、TCF12、COLEC10、TBX22、ESCO2、LOC101927513、CHD7、MSX2；(8)用于检测肱胸关节融合的基因检测包：FGFR2、NOG、POR、FGFR3、GDF5、TWIST1、FGF9、ESCO2、FGFR1、GDF5
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AS1、ERF、TCF12、SF3B4、FLNA、GLI3、MAP3K7、MSX2、B3GALT6、MEGF8、BMPR1B、B4GALT7、TBX4、GDF6、B3GAT3、TBX15、EFNB1；(9)用于检测甲
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髌综合征的基因检测包：LMX1B、WT1、COL5A1、NPHS1、COL4A3、COL4A4、NPHS2、COL5A2、TSC1、PAX2、PLCE1、MEFV、KAT6B、FOXC1、CD2AP、TBX4、ACTN4、INF2、DUSP29、TELO2、AK1、EXT1、ASS1、WNT7A、LDB1、PDLIM5、GSN、ABL1、TTI2；(10)用于检测三节拇的基因检测包：LMBR1、ZRS、SHH、L1CAM、GLI3、FGFR2、EP300、SALL1、TBX5、HOXD13、SALL4、NOG、FGFR3、RPL5、GLI1、FGF10、SF3B4、RPL11、DACT1、ATP6V1B2、PTCH1、GDF5、FANCL、RPS24、RPS10、RPS19、FANCD2、FANCB、FANCA、GATA1；(11)用于检测背腹轴错位的基因检测包：SHH、GLI3、ZRS、WNT7A、GREM1、EN1、SOX9、HOXD12、HOXD13、DHCR7、HAND2、ZP2、BOC；(12)用于检测甲发育不良的基因检测包：PLEC、LMX1B、FOXN1、COL7A1、GJA1、FZD6、MSX1、HOXC13、EDAR、ARID1B、COL17A1、LAMB3、TP63、RSPO4、RIPK4、NKX2
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5、TBX4、EDARADD、GJB6、SMARCA4、NOTCH1、WNT10A、EVC2、SMARCE1、ENAM、ROR2、SMARCB1、ATP6V1B2、SOX11、ARID1A；
(13)用于检测屈指症的基因检测包：PRG4、FGFR3、CAMPD1、TPR、PIEZO2、TNNI2、TNNT3、MT
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ATP6、TPM2、EZH2、EED、MYH3、NSD1、SUZ12、CRLF1、NALCN、KLHL7、CL...

【专利技术属性】
技术研发人员：王斌，冒海蕾，俞沁圆，崔恒庆，孙滨，方霞，周家腾，
申请(专利权)人：上海交通大学医学院附属第九人民医院，
类型：发明
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