特发性肺纤维化疾病中高表达的低氧相关基因集及其应用制造技术

本发明专利技术提供一种特发性肺纤维化疾病中高表达的低氧相关基因集及其在制备诊断或预后工具中的应用，涉及医学诊断标志物及工具技术领域，本申请提供了由5个基因组成的与低氧相关的基因集，包含ASPHD1(Gene ID:253982）、BYSL(Gene ID:705）、CTSE(Gene ID:1510)、FJX1(Gene ID:24147)和GNL3(Gene ID:26354)5个基因，这5个基因的表达水平在特发性肺纤维化患者中显著高于健康人，并且根据这5个基因表达水平计算的评分高的特发性肺纤维化患者生存期显著低于评分低的患者，提示该基因集可应用于辅助特发性肺纤维化患者的诊断和预测预后。于辅助特发性肺纤维化患者的诊断和预测预后。于辅助特发性肺纤维化患者的诊断和预测预后。

【技术实现步骤摘要】
特发性肺纤维化疾病中高表达的低氧相关基因集及其应用


[0001]本专利技术涉及医学诊断标志物及工具
，尤其涉及一种特发性肺纤维化疾病中高表达的低氧相关基因集及其应用。

技术介绍

[0002]正常的肺泡组织被损坏后若修复异常会导致结构异常（疤痕形成），出现以成纤维细胞增殖及大量细胞外基质聚集并伴炎症损伤、组织结构破坏为特征的终末期改变，这一大类肺部疾病被称为肺纤维化。绝大部分肺纤维化患者病因不明，被称为特发性肺纤维化（idiopathic pulmonary fibrosis, IPF），其发病与年龄、性别、遗传、吸烟、环境和职业等因素相关（DOI：10.1016/S0140
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6736(17)30866
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8；DOI:10.3390/jcm7080201; DOI: 10.1056/NEJMra1705751）。IPF被称为“不是癌症的癌症”，近一半患者在确诊后的2
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3年内死亡，5年生存率低于30%，且全球IPF患病发病率呈现逐步上升的趋势，而死亡率居高不下，因此关于肺纤维化的研究引起了广泛关注。
[0003]肺纤维化患者早期诊断易混淆，且不同肺纤维化患者的疾病进程和对于治疗的反应差异较大，难以预测患者的预后。目前常用性别
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年龄
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生理指数（Gender
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Age
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Physiology (GAP) index），包含患者的性别、年龄以及用力肺活量和肺一氧化碳弥散功能指标来预测患者预后，但效果仍不尽人意（DOI:10.3390/jcm7080201; DOI: 10.7326/0003
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4819
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156
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10
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201205150
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00004）。

技术实现思路

[0004]本专利技术的目的是为了解决现有技术中GAP指标预测患者预后的效果不尽人意的技术问题 。
[0005]为了实现上述目的，本专利技术采用了如下技术方案：一种低氧相关基因表达产物作为分子标志物在制备特发性肺纤维化患者诊断和预后工具中的应用。
[0006]优选的，所述低氧相关基因及其编码序列如下：a. ASPHD1，其Gene ID: 253982；b. BYSL ，其Gene ID: 705；c. CTSE ，其Gene ID: 1510；d. FJX1 ，其Gene ID: 24147 ；e. GNL3 ，其Gene ID: 26354；上述5个基因的编码序列包括以下任意一种DNA序列：（1）序列表中SEQ ID NO.1
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5所示的DNA序列；（2）与（1）限定的DNA序列杂交且编码相同功能蛋白质的DNA序列；（3）与（1）或（2）限定的DNA序列具有70％以上同源性，且编码相同功能蛋白质的DNA分子。
[0007]一种诊断或预后工具，用于对特发性肺纤维化患者诊断和预后，使用上述所述的低氧相关基因中的至少一种作为分子标志物。
[0008]优选的，包括通过RT
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PCR、实时定量PCR、免疫组织化学、原位杂交、芯片、高通量测序平台或LC
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MS/MS质谱检测所述低氧相关基因的全部基因或部分基因的表达水平以诊断特发性肺纤维化疾病的产品。
[0009]优选的，所述通过实时定量PCR诊断特发性肺纤维化的产品至少包括一对特异扩增低氧相关基因的全部或部分基因的基因引物。
[0010]优选的，通过免疫检测诊断特发性肺纤维化的产品包括与低氧相关基因全部或部分基因基因表达产物特异性结合的抗体。
[0011]优选的，通过原位杂交诊断特发性肺纤维化的产品包括与低氧相关基因全部或部分基因的基因核酸序列杂交的探针。
[0012]优选的，通过芯片诊断特发性肺纤维化的产品包括蛋白芯片和基因芯片，其中蛋白芯片包括与上述全部或部分基因蛋白表达产物特异性结合的抗体，基因芯片包括与低氧相关基因全部或部分基因的核酸序列杂交的探针。
[0013]本专利技术的目的是提供一个可应用于特发性肺纤维化患者诊断和预后预测的基因集，该基因集中的基因与肺纤维化患者组织低氧状态相关，可根据该基因集中基因的表达水平来辅助诊断IPF和预测 IPF患者的预后。
附图说明
[0014]图1为本申请一实施方式中特发性肺纤维化患者肺组织与正常肺组织的低氧评分对比示意图；图2为本申请一实施方式中特发性肺纤维化患者肺泡灌洗液与正常肺泡灌洗液的低氧评分对比示意图；图3为本申请一实施方式中不同低氧评分患者的生存周期对比示意图；图4为本申请一实施方式中低氧评分与GAP指数预测特发性肺纤维化患者预后的效果对比示意图。
[0015]图5为本申请一实施方式中各低氧基因预测特发性肺纤维化患者预后的效果示意图。
具体实施方式
[0016]为使本专利技术的目的、技术方案和优点更加清楚，以下结合具体实施例，对本专利技术作进一步地详细说明。
[0017]在下面的描述中阐述了很多具体细节以便于充分理解本专利技术，但是，本专利技术还可以采用不同于在此描述的其他方式来实施，因此，本专利技术并不限于下面公开说明书的具体实施例的限制。
[0018]本申请提供了一种低氧相关基因集及其在特发性肺纤维化患者诊断和预测预后中的应用。
[0019]其中所述低氧相关基因及其编码序列如下：a. ASPHD1，其Gene ID: 253982；
b. BYSL ，其Gene ID: 705；c. CTSE ，其Gene ID: 1510；d. FJX1 ，其Gene ID: 24147 ；e. GNL3 ，其Gene ID: 26354；上述5个基因的编码序列包括以下任意一种DNA序列：（1）序列表中SEQ ID NO.1
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5所示的DNA序列；（2）与（1）限定的DNA序列杂交且编码相同功能蛋白质的DNA序列；（3）与（1）或（2）限定的DNA序列具有70％以上同源性，且编码相同功能蛋白质的DNA分子。
[0020]上述基因的表达水平在特发性肺纤维化患者中显著高于健康人，并且根据上述基因表达水平计算的评分高的特发性肺纤维化患者生存期显著低于评分低的患者，提示该基因集可应用于辅助特发性肺纤维化患者的诊断和预测预后。
[0021]基于此，本申请提供了一种低氧相关基因表达产物作为分子标志物在制备特发形肺纤维化患者诊断和预后工具中的应用。
[0022]同时本申请还提供了一种诊断或预后工具，使用低氧相关基因的全部基因或部分基因作为分子标志物，所述诊断或预后工具用于对特发性肺纤维化疾病诊断或预后进行检测；所述诊断或预后工具包括通过RT
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PCR、实时定量PCR、免疫组织化学、原位杂交、芯片、高通量测序平台或LC
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MS/MS质谱检测上述基因集的全部基因或部分基因的表达水平以诊断特发性肺纤维化疾病的产品。
[0023本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种低氧相关基因表达产物作为分子标志物在制备特发性肺纤维化患者诊断和预后工具中的应用。2.根据权利要求1所述的低氧相关基因表达产物作为分子标志物在制备特发性肺纤维化患者诊断和预后工具中的应用，其特征在于：所述低氧相关基因及其编码序列如下：ASPHD1，其Gene ID: 253982；BYSL ，其Gene ID: 705；CTSE ，其Gene ID: 1510；FJX1 ，其Gene ID: 24147 ；GNL3 ，其Gene ID: 26354；上述5个基因的编码序列包括以下任意一种DNA序列：（1）序列表中SEQ ID NO.1
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5所示的DNA序列；（2）与（1）限定的DNA序列杂交且编码相同功能蛋白质的DNA序列；（3）与（1）或（2）限定的DNA序列具有70％以上同源性，且编码相同功能蛋白质的DNA分子。3.一种诊断或预后工具，用于对特发性肺纤维化患者诊断和预后，其特征在于：使用权利要求2所述的低氧相关基因中的至少一种作为分子标志物。4.根据权利要求3所述的一种诊断或预后工具，其特征在于：包括通...

【专利技术属性】
技术研发人员：乔国强，袁圆，姜正林，
申请(专利权)人：南通大学，
类型：发明
国别省市：