新型锚蛋白重复结合蛋白及其用途制造技术

本发明专利技术涉及重组结合蛋白、编码此类蛋白质的核酸、包含此类蛋白质或核酸的药物组合物，以及此类蛋白质、核酸或药物组合物在治疗冠状病毒疾病、特别是由SARS

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】新型锚蛋白重复结合蛋白及其用途


[0001]本专利技术涉及重组结合蛋白、编码此类蛋白质的核酸、包含此类蛋白质或核酸的药物组合物，以及此类蛋白质、核酸或药物组合物在治疗冠状病毒疾病、特别是由SARS
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2引起的疾病中的用途，所述重组结合蛋白包含对冠状病毒刺突蛋白具有结合特异性的一个或多个设计的锚蛋白重复结构域。

技术介绍

[0002]冠状病毒科具有28至32kb的正链RNA基因组，是最大的包膜RNA病毒。冠状病毒感染许多不同的哺乳动物和鸟类物种。它们是呼吸、肝脏、胃肠和神经系统的各种急性和慢性疾病的原因。普通感冒是轻度冠状病毒感染的实例。2003年SARS爆发和2012年MERS爆发都是由冠状病毒引起的。SARS
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2(也称为2019
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nCoV)是导致COVID
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19的病毒株。
[0003]冠状病毒有四种结构蛋白，称为刺突蛋白、包膜蛋白、膜蛋白和核衣壳蛋白。刺突蛋白是负责细胞进入的病毒膜蛋白。
[0004]冠状病毒利用高度糖基化的刺突蛋白进入宿主细胞。刺突蛋白由三个亚基组成，并且是三聚体I类融合蛋白，以亚稳态融合前构象存在，所述构象经历实质性的结构重排以将病毒膜与宿主细胞膜融合。当S1亚基与宿主细胞受体结合时，这一过程被触发。受体结合使融合前三聚体不稳定，导致S1亚基脱落和S2亚基转变为稳定的融合后构象。为了接合宿主细胞受体，S1的受体结合结构域(RBD)经历铰链样构象运动，从而暂时隐藏或暴露受体结合的决定簇。这两种状态被称为“向下”构象和“向上”构象，其中向下对应于受体不可接近的状态，并且向上对应于受体可接近的状态，这被认为不太稳定。一旦刺突蛋白处于“向上”构象，就可以与宿主细胞中的血管紧张素转化酶2(ACE2)受体结合，从而允许病毒进入细胞。刺突蛋白向“向上”构象的“活化”可通过诸如弗林蛋白酶或TMPRSS2的酶来实现，所述酶通过打开刺突蛋白来起作用，允许核衣壳蛋白离开病毒衣壳并进入细胞，从而导致感染。
[0005]一旦细胞被冠状病毒感染，治疗选项变得更加困难，因为免疫系统(或治疗剂)必须仅靶向病毒感染的细胞，而不破坏未感染的细胞。由于刺突蛋白的不可或缺的功能，它代表了抗体介导的中和的靶标。因此，一种冠状病毒治疗的方法是通过中和刺突蛋白来抑制病毒与细胞的结合，从而防止细胞感染。
[0006]蛋白是遗传工程化锚蛋白重复蛋白，其可以类似抗体模拟蛋白起作用，通常表现出高度特异性和高亲和力的靶结合。蛋白包含一个或多个设计的锚蛋白重复结构域。设计的锚蛋白重复结构域衍生自天然锚蛋白重复蛋白，并且每个设计的锚蛋白重复结构域通常以高特异性和亲和力结合靶蛋白。由于蛋白的高特异性、稳定性、效力和亲和力并且由于它们在经格式化以生成单特异性、双特异性或多特异性蛋白方面的灵活性，它们是广泛临床应用的有吸引力的治疗剂。例如，WO 2011/135067描述了用于治疗癌症和其他病理病状，包括眼病，诸如年龄相关性黄斑变性的蛋白。是Molecular Partners AG所拥有的注册商标。
[0007]本专利技术潜在的技术问题是鉴定新型重组结合蛋白，其包含对冠状病毒，优选SARS
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2具有结合特异性的一个或多个设计的锚蛋白重复结构域。此类重组结合蛋白可用于抑制冠状病毒与细胞的结合，并可用于预防细胞的病毒感染。此类重组结合蛋白和包含此类蛋白质的药物组合物可进一步可用于预防、治疗或诊断冠状病毒疾病(例如SARS
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2引起的冠状病毒疾病)的方法，和/或可用于检测冠状病毒、优选SARS
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2的方法。

技术实现思路

[0008]基于本文提供的公开内容，本领域技术人员将认识到或能够仅仅使用常规实验来确定本文描述的本专利技术的具体实施方案的许多等效物。此类等效物旨在被以下实施方案(E)所涵盖。
[0009]1.在第一实施方案中，本专利技术涉及一种重组结合蛋白，其包含第一锚蛋白重复结构域，其中所述第一锚蛋白重复结构域包含与选自由SEQ ID NO 1至11、76、77和85组成的组的锚蛋白重复结构域具有至少约90％序列同一性的氨基酸序列。
[0010]1a.在实施方案1a中，本专利技术涉及一种重组结合蛋白，其包含第一锚蛋白重复结构域，其中所述第一锚蛋白重复结构域包含与选自由SEQ ID NO 1至11组成的组的锚蛋白重复结构域具有至少约90％序列同一性的氨基酸序列。
[0011]1b.在实施方案1b中，本专利技术涉及一种重组结合蛋白，其包含第一锚蛋白重复结构域，其中所述第一锚蛋白重复结构域包含与选自由SEQ ID NO 1至11、76和77组成的组的锚蛋白重复结构域具有至少约90％序列同一性的氨基酸序列。
[0012]2.在第二实施方案中，本专利技术涉及根据实施方案1所述的重组结合蛋白，其中所述第一锚蛋白重复结构域包含与选自由SEQ ID NO 1至11、76、77和85组成的组的锚蛋白重复结构域具有至少约95％序列同一性的氨基酸序列。
[0013]2a.在实施方案2a中，本专利技术涉及根据实施方案1a所述的重组结合蛋白，其中所述第一锚蛋白重复结构域包含与选自由SEQ ID NO 1至11组成的组的锚蛋白重复结构域具有至少约95％序列同一性的氨基酸序列。
[0014]2b.在实施方案2b中，本专利技术涉及根据实施方案1b所述的重组结合蛋白，其中所述第一锚蛋白重复结构域包含与选自由SEQ ID NO 1至11、76和77组成的组的锚蛋白重复结构域具有至少约95％序列同一性的氨基酸序列。
[0015]3.在第三实施方案中，本专利技术涉及根据实施方案1所述的重组结合蛋白，其中所述第一锚蛋白重复结构域选自由SEQ ID NO 1至11、76、77和85组成的组。
[0016]3a.在实施方案3a中，本专利技术涉及根据实施方案1a所述的重组结合蛋白，其中所述第一锚蛋白重复结构域选自由SEQ ID NO 1至11组成的组。
[0017]3b.在实施方案3b中，本专利技术涉及根据实施方案1b所述的重组结合蛋白，其中所述第一锚蛋白重复结构域选自由SEQ ID NO 1至11、76和77组成的组。
[0018]4.在第四实施方案中，本专利技术涉及根据实施方案1至3中任一项所述的重组结合蛋白，其还包含第二锚蛋白重复结构域，其中所述第二锚蛋白重复结构域包含与选自由SEQ ID NO 1至11、76、77和85组成的组的锚蛋白重复结构域具有至少约90％序列同一性的氨基酸序列。
[0019]4a.在实施方案4a中，本专利技术涉及根据实施方案1a、2a或3a中任一项所述的重组结
合蛋白，其还包含第二锚蛋白重复结构域，其中所述第二锚蛋白重复结构域包含与选自由SEQ ID NO 1至11组成的组的锚蛋白重复结构域具有至少约90％序列同一性的氨基酸序列。
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【技术保护点】

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】1.一种重组结合蛋白，其包含第一锚蛋白重复结构域，其中所述第一锚蛋白重复结构域包含与选自由SEQ ID NO 1至11、76、77和85组成的组的锚蛋白重复结构域具有至少约90％序列同一性的氨基酸序列。2.根据权利要求1所述的重组结合蛋白，其中所述第一锚蛋白重复结构域包含与选自由SEQ ID NO 1至11、76、77和85组成的组的锚蛋白重复结构域具有至少约95％序列同一性的氨基酸序列。3.根据权利要求1所述的重组结合蛋白，其中所述第一锚蛋白重复结构域选自由SEQ ID NO 1至11、76、77和85组成的组。4.根据权利要求1至3中任一项所述的重组结合蛋白，其还包含第二锚蛋白重复结构域，其中所述第二锚蛋白重复结构域包含与选自由SEQ ID NO 1至11、76、77和85组成的组的锚蛋白重复结构域具有至少约90％序列同一性的氨基酸序列。5.根据权利要求4所述的重组结合蛋白，其中所述第二锚蛋白重复结构域包含与选自由SEQ ID NO 1至11、76、77和85组成的组的锚蛋白重复结构域具有至少约95％序列同一性的氨基酸序列。6.根据权利要求4所述的重组结合蛋白，其中所述第二锚蛋白重复结构域选自由SEQ ID NO 1至11、76、77和85组成的组。7.根据权利要求4至6中任一项所述的重组结合蛋白，其还包含第三锚蛋白重复结构域，其中所述第三锚蛋白重复结构域包含与选自由SEQ ID NO 1至11、76、77和85组成的组的锚蛋白重复结构域具有至少约90％序列同一性的氨基酸序列。8.根据权利要求7所述的重组结合蛋白，其中所述第三锚蛋白重复结构域包含与选自由SEQ ID NO 1至11、76、77和85组成的组的锚蛋白重复结构域具有至少约95％序列同一性的氨基酸序列。9.根据权利要求7所述的重组结合蛋白，其中所述第三锚蛋白重复结构域选自由SEQ ID NO 1至11、76、77和85组成的组。10.根据权利要求7所述的重组结合蛋白，其中所述第一锚蛋白重复结构域、第二锚蛋白重复结构域和第三锚蛋白重复结构域包含氨基酸序列，并且从N
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末端到C
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末端如下排列：(i)与SEQ ID NO 6、1和3具有至少约90％序列同一性的氨基酸序列；(ii)与SEQ ID NO 4、2和1具有至少约90％序列同一性的氨基酸序列；(iii)与SEQ ID NO 4、6和3具有至少约90％序列同一性的氨基酸序列；(iv)与SEQ ID NO 6、3和6具有至少约90％序列同一性的氨基酸序列；(v)与SEQ ID NO 7、3和6具有至少约90％序列同一性的氨基酸序列；(vi)与SEQ ID NO 8、4和1具有至少约90％序列同一性的氨基酸序列；(vii)与SEQ ID NO 3、6和7具有至少约90％序列同一性的氨基酸序列；(viii)与SEQ ID NO 4、1和8具有至少约90％序列同一性的氨基酸序列；(ix)与SEQ ID NO 3、6和9具有至少约90％序列同一性的氨基酸序列；(x)与SEQ ID NO 9、3和6具有至少约90％序列同一性的氨基酸序列；(xi)与SEQ ID NO 1、6和9具有至少约90％序列同一性的氨基酸序列；(xii)与SEQ ID NO 9、6和1具有至少约90％序列同一性的氨基酸序列；
(xiii)与SEQ ID NO 6、9和10具有至少约90％序列同一性的氨基酸序列；(xiv)与SEQ ID NO 3、9和11具有至少约90％序列同一性的氨基酸序列；(xv)与SEQ ID NO 10、9和6具有至少约90％序列同一性的氨基酸序列；(xvi)与SEQ ID NO 11、9和3具有至少约90％序列同一性的氨基酸序列；(xvii)与SEQ ID NO 5、1和3具有至少约90％序列同一性的氨基酸序列；(xviii)与SEQ ID NO 1、2和5具有至少约90％序列同一性的氨基酸序列；(xix)与SEQ ID NO 3、5和6具有至少约90％序列同一性的氨基酸序列；(xx)与SEQ ID NO 6、3和5具有至少约90％序列同一性的氨基酸序列；(xxi)与SEQ ID NO 7、3和5具有至少约90％序列同一性的氨基酸序列；(xxii)与SEQ ID NO 8、5和6具有至少约90％序列同一性的氨基酸序列；(xxiii)与SEQ ID NO 6、10和11具有至少约90％序列同一性的氨基酸序列；(xxiv)与SEQ ID NO3、10和10具有至少约90％序列同一性的氨基酸序列；(xxv)与SEQ ID NO 5、6和9具有至少约90％序列同一性的氨基酸序列；(xxvi)与SEQ ID NO 9、3和5具有至少约90％序列同一性的氨基酸序列；(xxvii)与SEQ ID NO 9、6和5具有至少约90％序列同一性的氨基酸序列；(xxviii)与SEQ ID NO 5、9和10具有至少约90％序列同一性的氨基酸序列；(xxix)与SEQ ID NO 6、9和11具有至少约90％序列同一性的氨基酸序列；(xxx)与SEQ ID NO 10、9和5具有至少约90％序列同一性的氨基酸序列；(xxxi)与SEQ ID NO 11、9和6具有至少约90％序列同一性的氨基酸序列；(xxxii)与SEQ ID NO 3、76和77具有至少约90％序列同一性的氨基酸序列；或(xxxiii)与SEQ ID NO 3、85和77具有至少约90％序列同一性的氨基酸序列。11.根据权利要求7至10中任一项所述的重组结合蛋白，其中所述结合蛋白包含多肽，其中所述多肽具有与选自由SEQ ID NO：68、69、79和89至91组成的组的序列具有至少约90％序列同一性的氨基酸序列。12.根据权利要求1至11中任一项所述的重组结合蛋白，其中所述结合蛋白结合至冠状病毒刺突蛋白。13.根据权利要求12所述的重组结合蛋白，其中所述刺突蛋白是SARS
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2刺突蛋白。14.根据权利要求12或13所述的重组结合蛋白，其中所述第一锚蛋白重复结构域、第二锚蛋白重复结构域和/或第三锚蛋白重复结构域以等于或低于约100nM的解离常数(K
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)结合所述冠状病毒刺突蛋白。15.一种重组结合蛋白，其包含至少一个锚蛋白重复结构域，其中所述锚蛋白重复结构域以等于或低于约100nM的解离常数(K
D
)结合冠状病毒刺突蛋白。16.根据任一前述权利要求所述的重组结合蛋白，其还包含至少一个血清白蛋白结合结构域。17.根据权利要求16所述的重组结合蛋白，其中所述血清白蛋白结合结构域包含与选自由SEQ ID NO：47
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49组成的组的序列具有至少约90％序列同一性的氨基酸序列。18.一种重组结合蛋白，其包含多肽，其中所述多肽具有与选自由SEQ ID NO：12
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42、75、84、87和88组成的组的序列具有至少约90％序列同一性的氨基酸序列。19.根据权利要求18所述的重组结合蛋白，其中所述多肽具有与SEQ ID NO：31具有至
少约90％序列同一性的氨基酸序列。20.根据权利要求18所述的重组结合蛋白，其中所述多肽具有与SEQ ID NO：39具有至少约90％序列同一性的氨基酸序列。21.根据权利要求18所述的重组结合蛋白，其中所述多肽具有与SEQ ID NO：75具有至少约90％...

【专利技术属性】
技术研发人员：P，
申请(专利权)人：分子合作伙伴股份公司，
类型：发明
国别省市：