生物标志物CD83及其应用制造技术

本申请提供了用于筛查、诊断和/或监测个体中冠心病的组合物或试剂盒及相关用途，所述组合物或试剂盒包含用于检测来自所述个体的样本中CD83特异性序列表达水平的试剂，包括引物或探针。物或探针。

【技术实现步骤摘要】
生物标志物CD83及其应用


[0001]本申请涉及医学领域，特别是疾病筛查、诊断、和/或监测领域；具体而言，本申请提供了用于冠心病的筛查、诊断、和/或监测的生物标志物及相关产品和用途。
[0002]资助信息
[0003]本专利申请得到了中国科技部的资助，涉及国家重点研发计划：新生儿/儿童危重症体外生命支持应用评价和质量改善研究(批准号：2021YFC2701700；2021YFC2701703)。
[0004]专利技术背景
[0005]冠心病具有较高致死率和致残率，已经成为全球重大公共健康问题。冠心病发病正趋向年轻化，严重威胁青年人群体身体健康。早发冠心病被认为是45岁之前的急性心肌梗死或冠状动脉造影中观察到的70％以上的冠状动脉狭窄。传统冠心病危险因素如代谢性疾病、吸烟和不健康的生活方式在冠心病发病中发挥关键作用。但是，经典的传统冠心病危险因素作为疾病预测和危险分层的指标存在明显不足。流行病学调查研究发现，约40％的冠心病患者具有遗传易感性特征，LDL
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C≧190mg/dL的个体更可能携带家族性高胆固醇血症基因，其冠心病患病概率是不携带这些突变个体的3倍。遗传易感性与冠心病的发病机制密切相关。多种基因变异可以直接或间接作用通过参与多种生物学途径发挥致病作用，包括血压、血脂血糖代谢、血管稳态、抗炎促炎失衡等。没有明确传统冠心病危险因素的早发冠心病群体发病可能更容易受到遗传危险因素的影响。因此，在较少合并传统冠心病危险因素的早发冠心病群体中，遗传易感性被认为是不可忽略的危险因素。r/>[0006]因此，阐明早发冠心病遗传易感性特征和鉴别新的生物标志物对于早发冠心病的早期预警、诊疗和/或改善临床预后至关重要。

技术实现思路

[0007]第一方面，本申请提供了用于检测CD83特异性核酸序列的试剂或包含所述试剂的组合物，其中所述试剂包含引物或探针，优选地，所述特异性核酸序列的长度为至少约20个核苷酸，更优选30
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441个核苷酸，最优选为42
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132个核苷酸。
[0008]第二方面，本申请提供了用于筛查、诊断和/或监测个体中冠心病的试剂盒，其包含如上述第一方面所述的试剂或组合物、或者检测由上述第一方面所述的特异性核酸序列编码的多肽的试剂。
[0009]第三方面，本申请提供了用于检测来自个体的样本中CD83特异性核酸序列表达水平的试剂在制备用于筛查、诊断和/或监测所述个体中冠心病的试剂盒或药物中的用途，其中如果CD83特异性序列的表达水平高于在对照样本中的水平，则所述个体患有或可能患有冠心病。
[0010]在一些实施方案中，所述试剂检测CD83特异性核酸序列。在一些实施方案中，所述特异性核酸序列包含如SEQ ID NOs:1
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11和45中任一项所示的序列或由如SEQ ID NOs:1
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11和45中任一项所示的序列组成。
[0011]在一些实施方案中，所述引物包含如SEQ ID NOs:23
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44中任一项所示的序列。
[0012]在一些实施方案中，所述多肽包含如SEQ.ID NOs:12
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22和46中任一项所示的序列或由如SEQ ID NOs:12
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22和46中任一项所示的序列组成。
[0013]在具体实施方案中，上述述冠心病为早发冠心病。
[0014]在一些实施方案中，上述用于测量由CD83基因表达的蛋白的量的试剂包括特异性结合由CD83基因表达的蛋白的抗体或适配体。
[0015]在一些实施方案中，CD83 mRNA的量通过选自以下的至少一种方法测量：原位杂交、聚合酶链式反应(PCR)、逆转录(RT)
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PCR、实时PCR、RNA酶保护测定(RPA)、northern印迹、微阵列和高通量测序等。
[0016]在一些实施方案中，CD83蛋白的量通过选自以下的至少一种方法测量：蛋白质印迹、放射免疫测定(RIA)、放射免疫扩散法、酶联免疫吸附测定(ELISA)、免疫沉淀、流式细胞术、免疫荧光、Ouchterlony双向免疫扩散法、补体固定测定和蛋白质芯片等。
[0017]在一些实施方案中，上述样本是外周血、全血、血清、或血浆样品。在优选的实施方案中，所述样本为外周血样本。
[0018]在本申请中，鉴定了与冠心病相关的表达特异性增加的生物标志物，因此可以通过测量所述生物标志物基因的特异性序列的表达水平(例如mRNA或蛋白质水平)来筛查、诊断和/或监测冠心病特别是早发性冠心病的发生。然而，本申请的效果不限于上述效果，本专利技术所属
的技术人员将从以下描述中清楚地理解未提及的其它效果。
[0019]附图简述
[0020]图1显示了差异表达基因(Differentially expressed genes,DEGs)的识别。图1A显示GSE66360数据集的冠心病患者样本和健康对象样本之间的DEGs；图1B显示高通量测序数据集的早发冠心病患者样本和健康对象样本之间的DEGs，其中蓝色点代表下调基因，灰色点代表非显著表达基因，红色点代表上调基因。图1C显示GSE66360数据集的冠心病患者样本和健康对象样本之间的DEGs；图1D显示高通量测序数据集的早发冠心病患者样本和健康对象样本之间DEGs，其中蓝色矩形代表低表达基因，红色矩形代表高表达基因。图1E和F分别显示两个数据集重叠共有的上调及下调基因数。
[0021]图2显示了DEGs的富集分析。图2A和D显示DEGs的显著富集通路。图2B和C显示BP和MF两个层面中DEGs的富集显著项。图2的气泡图中，Y轴代表富集显著项，X轴代表基因占比率；和弦图中，DEGs显示在图的左半侧，显著富集通路显示在图的右半侧。
[0022]图3显示了早发冠心病所有DEGs的富集分析。图3A显示DEGs的显著富集通路。图3B分别从BP、CC及MF三个功能显示DEGs显著富集项。
[0023]图4显示了高通量测序数据集的GSEA分析。
[0024]图5的A显示了高通量测序数据集的免疫浸润分析，示出了免疫细胞亚群的比例。
[0025]图6A显示了一个由17个节点和28条边的PPI交互网络；图6B显示了将所有高通量测序数据集的DEGs放入STRING中，并使用cytohubba算法筛选出的前100个核心基因。
[0026]图7显示了核心基因的外部验证结果。
[0027]图8显示了目标ncRNAs预测和网络构建，其中图8A为来自GSE31568数据集和在线miRNA数据库的重叠miRNA的维恩图；图8B为来自GSE160717数据集和在线circRNAs数据库的重叠circRNAs的维恩图。图8为CD83的ceRNA网络，其中红色节点代表核心基因，蓝色节点代表靶向miRNA，橙色节点代表靶向circRNA。
具体实施方式
[0028]在下文中，将更详细地描述本申请。除非本文另本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.用于检测CD83特异性核酸序列的试剂或包含所述试剂的组合物，其中所述试剂包含引物或探针，优选地，所述特异性核酸序列的长度为至少约20个核苷酸，更优选为30
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441个核苷酸，最优选为42
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132个核苷酸。2.如权利要求1所述的试剂或组合物，其中所述特异性核酸序列包含如SEQ ID NOs:1
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11和45中任一项所示的序列或由如SEQ ID NOs:1
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11和45中任一项所示的序列组成。3.用于筛查、诊断和/或监测个体中冠心病的试剂盒，其包含如权利要求1所述的试剂或组合物、或者检测由权利要求1所述的特异性核酸序列编码的多肽的试剂。4.用于检测权利要求1所述的特异性核酸序列表达水平的试剂在制备用于筛查、诊断和/或监测个体中冠心病的试剂盒或药物中的用途。5.如权利要求1所述的试剂或组合物、权利要求3所述的试剂盒、或权利要求4所述的用途，其中所述冠心病为早发冠心病。6.如权利要求1所述的试剂或组合物、权利要求3所述的试剂盒、或权利要求4所述的用途，其中所述...

【专利技术属性】
技术研发人员：张然，王海明，蒋敏，刘子凡，张皓旻，
申请(专利权)人：中国人民解放军总医院第一医学中心，
类型：发明
国别省市：