一组肿瘤检测标志物及其用途制造技术

本申请涉及一组肿瘤检测标志物及其用途，具体涉及一种确认肝肿瘤的存在、评估肝肿瘤形成或形成风险和/或评估肝肿瘤的进展的方法，包含评估待测样本中一组标志物基因所在DNA区域或其片段的修饰状态的存在和/或含量。本申请还涉及用于评估一组DNA区域修饰状态的核酸、核酸组和/或试剂盒，及其制备方法。及其制备方法。

【技术实现步骤摘要】
一组肿瘤检测标志物及其用途


[0001]本申请涉及生物医药领域，具体的涉及一组肿瘤检测标志物及其用途。

技术介绍

[0002]寻找更高效的肿瘤标志物一直是肿瘤相关研究中重要的一个方向，基于液体活检的血浆游离DNA检测技术对于肿瘤标志物的发现有了更高的需求。其基本原理为：肿瘤细胞死亡后，释放游离DNA进入血液，通过检测血液中的DNA突变、DNA甲基化、miRNA、组蛋白修饰等肿瘤细胞相关信息，可探测到极早期的肿瘤信号。已有研究发现DNA甲基化变化可能早于DNA突变的发生，是肿瘤早期筛查的更行之有效的检测标志物。
[0003]但目前早期癌症中，释放入血的肿瘤细胞极少，并且本领域急需寻找到更多的对于肝肿瘤有效的检测标志物。因此，亟需开发一种方法和/或试剂盒，通过检测准确、稳定、有效的肝癌生物标志物或其组合，且可以从生物样品中数量极为有限的细胞外游离DNA高效地读取到该表观遗传学信息，更优的，该方法应可以在医院检验科里很容易地配置并可靠地应用。

技术实现思路

[0004]本申请提供的方法可以将更多高效的甲基化标志物，用于确认或辅助确认疾病的存在、评估疾病形成或形成风险和/或评估疾病的进展，可以提高肿瘤，例如肝肿瘤的早筛早诊效率，解决肝癌早诊率低、临床治疗负担重等问题。
[0005]一方面，本申请提供了一种确认肝肿瘤的存在、评估肝肿瘤形成或形成风险和/或评估肝肿瘤的进展的方法，包含确定待测样本中目标基因所在DNA区域或其片段的修饰状态的存在和/或含量，所述目标基因包含CHFR和GRASP。/>[0006]另一方面，本申请还提供了一种评估肝肿瘤相关DNA区域甲基化状态的方法，包含确定待测样本中目标基因所在DNA区域或其片段的修饰状态的存在和/或含量，所述目标基因包含CHFR和GRASP。
[0007]另一方面，本申请还提供了一种确认疾病的存在、评估疾病形成或形成风险和/或评估疾病的进展的方法，包含确定待测样本中目标DNA区域、或其互补区域、或上述的片段的修饰状态的存在和/或含量，所述目标DNA区域包含来源于人chr12:133483901
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133485740和来源于人chr12:52400724
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52401698定义的区域。
[0008]另一方面，本申请还提供了一种确定DNA区域甲基化状态的方法，包含确定待测样本中目标DNA区域、或其互补区域、或上述的片段的修饰状态的存在和/或含量，所述目标DNA区域包含来源于人chr12:133483901
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133485740和来源于人chr12:52400724
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52401698定义的区域。
[0009]另一方面，本申请还提供了一种核酸，所述核酸包含能够结合如本申请的方法中所述目标基因所在DNA区域、或其互补区域、或上述的转化而来的区域、或上述的片段的序列；或者所述核酸包含能够结合如本申请的方法中所述目标DNA区域、或其互补区域、或上
述的转化而来的区域、或上述的片段的序列。
[0010]另一方面，本申请还提供了一种制备核酸的方法，所述方法包含根据如本申请的方法中所述目标基因所在DNA区域、或其互补区域、或上述的转化而来的区域、或上述的片段的修饰状态，设计能够结合所述目标基因所在DNA区域、或其互补区域、或上述的转化而来的区域、或上述的片段的核酸；或者所述方法包含根据如本申请的方法中所述目标DNA区域、或其互补区域、或上述的转化而来的区域、或上述的片段的修饰状态，设计能够结合所述目标DNA区域、或其互补区域、或上述的转化而来的区域、或上述的片段的核酸。
[0011]另一方面，本申请还提供了一种核酸组，所述核酸组包含能够结合如本申请的方法中所述目标基因所在DNA区域、或其互补区域、或上述的转化而来的区域、或上述的片段的序列；或者所述核酸组包含能够结合如本申请的方法中所述目标DNA区域、或其互补区域、或上述的转化而来的区域、或上述的片段的序列。
[0012]另一方面，本申请还提供了一种制备核酸组的方法，所述方法包含根据如本申请的方法中所述目标基因所在DNA区域、或其互补区域、或上述的转化而来的区域、或上述的片段的修饰状态，设计能够结合所述目标基因所在DNA区域、或其互补区域、或上述的转化而来的区域、或上述的片段的核酸组；或者所述方法包含根据如本申请的方法中所述目标DNA区域、或其互补区域、或上述的转化而来的区域、或上述的片段的修饰状态，设计能够结合所述目标DNA区域、或其互补区域、或上述的转化而来的区域、或上述的片段的核酸组。
[0013]另一方面，本申请还提供了一种试剂盒，包含如本申请的核酸和/或本申请的核酸组。
[0014]另一方面，本申请还提供了如本申请的核酸、如本申请的核酸组和/或本申请的试剂盒，在制备确定DNA区域或其片段的修饰状态的物质中的应用。
[0015]另一方面，本申请还提供了如本申请的核酸、如本申请的核酸组和/或本申请的试剂盒，在制备疾病检测产品中的应用。
[0016]另一方面，本申请还提供了如本申请的核酸、如本申请的核酸组和/或本申请的试剂盒，在制备确认疾病的存在、评估疾病形成或形成风险和/或评估疾病的进展的物质中的应用。
[0017]另一方面，本申请还提供了用于确定DNA区域修饰状态的核酸、核酸组和/或试剂盒，在制备用于确认肝肿瘤的存在、评估肝肿瘤形成或形成风险和/或评估肝肿瘤的进展的物质中的应用，所述用于确定的DNA区域包含如本申请的方法中所述目标基因所在DNA区域或其片段。
[0018]另一方面，本申请还提供了用于确定DNA区域修饰状态的核酸、核酸组和/或试剂盒，在制备用于确认疾病的存在、评估疾病形成或形成风险和/或评估疾病的进展的物质中的应用，所述用于确定的DNA区域包含如本申请的方法中所述目标DNA区域、或其互补区域、或上述的片段。
[0019]另一方面，本申请还提供了如本申请的方法中所述目标基因所在DNA区域、或其转化而来的区域、或上述的片段的核酸或其组合，在制备用于确认肝肿瘤的存在、评估肝肿瘤形成或形成风险和/或评估肝肿瘤的进展的物质中的应用。
[0020]另一方面，本申请还提供了如本申请的方法中所述目标DNA区域、或其互补区域、或上述的转化而来的区域、或上述的片段的核酸或其组合，在制备用于确认疾病的存在、评
估疾病形成或形成风险和/或评估疾病的进展的物质中的应用。
[0021]另一方面，本申请还提供了一种储存介质，其记载可以运行本申请的方法的程序。
[0022]另一方面，本申请还提供了一种设备，其包含本申请的储存介质。
[0023]本领域技术人员能够从下文的详细描述中容易地洞察到本申请的其它方面和优势。下文的详细描述中仅显示和描述了本申请的示例性实施方式。如本领域技术人员将认识到的，本申请的内容使得本领域技术人员能够对所公开的具体实施方式进行改动而不脱离本申请所涉及专利技术的精神和范围。相应地，本申请的说明书中的描述仅仅是示例性本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种确认肝肿瘤的存在、评估肝肿瘤形成或形成风险和/或评估肝肿瘤的进展的方法和/或评估肝肿瘤相关DNA区域甲基化状态的方法，包含确定待测样本中目标基因所在DNA区域或其片段的修饰状态的存在和/或含量，所述目标基因包含CHFR和GRASP。2.如权利要求1所述的方法，所述目标基因还包含选自以下组的基因：IRF4、IKZF1、基因间隔区1(chr7:26415938
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26416740)、和BCAT1。3.一种确认疾病的存在、评估疾病形成或形成风险和/或评估疾病的进展的方法和/或确定DNA区域甲基化状态的方法，包含确定待测样本中目标DNA区域、或其互补区域、或上述的片段的修饰状态的存在和/或含量，所述目标DNA区域包含来源于人chr12:133483901
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133485740和来源于人chr12:52400724
‑
52401698定义的区域。4.如权利要求3所述的方法，所述目标DNA区域还包含选自以下组定义的区域：来源于人chr6:391739
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394056、来源于人chr7:50343720
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50344547、来源于人chr7:26415938
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26416740、和来源于人chr12:25101630
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25102393。5.一种核酸，所述核酸包含能够结合如权利要求1
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2中任一项所述的方法中所述目标基因所在DNA区域、或其互补区域、或上述的转...

【专利技术属性】
技术研发人员：王辉，苏志熙，杨其昌，刘轶颖，周爽，马成城，刘蕊，
申请(专利权)人：上海鹍远生物科技股份有限公司，
类型：发明
国别省市：