甲状腺结节良恶性相关标志物及其应用制造技术

本发明专利技术涉及甲状腺结节良恶性相关标志物及其应用，所述应用包括引物分子和/或探针分子在制备诊断甲状腺结节良恶性的检测试剂或诊断试剂盒中的应用，以及装置在制备诊断甲状腺结节良恶性的诊断试剂盒中的应用等；其中，所述应用所涉及的引物分子、探针分子、装置和目标标志物等如文中所述。本发明专利技术也包括用于检测并诊断个体甲状腺结节良恶性的装置，其所包含的处理器运行时可获取样品中所述一个或多个目标标志物至少一个CpG二核苷酸的甲基化水平或状态，并根据该甲基化水平或状态判读甲状腺结节良恶性。腺结节良恶性。

【技术实现步骤摘要】
甲状腺结节良恶性相关标志物及其应用


[0001]本专利技术属于分子辅助诊断领域，涉及甲状腺结节良恶性相关标志物及其应用。

技术介绍

[0002]DNA甲基化是表观遗传的一种机制，是真核细胞基因组常见的表观遗传学修饰，能够在不改变DNA序列的情况下改变遗传表现。所谓DNA甲基化是指在DNA甲基化转移酶(methyltransferase)的作用下，在基因组CpG二核苷酸的胞嘧啶5号碳位共价结合一个甲基基团。DNA甲基化在细胞增殖、分化、发育等方面起重要作用，与肿瘤的发生、发展关系密切，其效应有转录抑制、染色质结构调节、X染色体失活、基因组印记等。DNA甲基化异常可以通过影响染色质结构以及癌基因和抑癌基因的表达而参与肿瘤的发生和进展。
[0003]CpG二核苷酸是哺乳动物发生DNA甲基化的最主要靶点，分布于整个染色体组。健康人基因组中，CpG岛中的CpG位点通常处于非甲基化状态，而在CpG岛外的CpG位点则通常高甲基化，这种甲基化的形式在细胞分裂的过程中能够稳定保留。当肿瘤发生时，通常抑癌基因非CpG岛区的CpG位点甲基化程度降低，而CpG岛中的CpG则呈高度甲基化状态，DNA甲基化后核苷酸顺序及其组成虽未发生改变，但会导致染色质结构改变及抑癌基因表达的降低。
[0004]随着过去十几年来遗传学和表观遗传学的不断发展，越来越多的研究者认识到肿瘤的发生并不完全由遗传基因决定，表观遗传学的后天影响同样发挥重要作用。甲状腺癌中的表观遗传学改变主要体现为抑癌基因和甲状腺相关基因的异常甲基化。研究甲状腺癌的DNA甲基化可以为我们提供新的分子标志物，为早期诊断、治疗方案选择和预后评估提供可靠依据。
[0005]甲状腺结节(Thyroid nodule)是甲状腺细胞异常增生后在甲状腺内形成的固体或者液体填充的肿块，可随着吞咽动作随甲状腺而上下移动，甲状腺是位于颈部底部、胸骨上方的一个小腺体。甲状腺结节非常常见，尽管大多数甲状腺结节并不严重，不会引起症状，但还是有一部分甲状腺结节进展为甲状腺癌。为了更早的诊断和治疗甲状腺癌，同时降低非必要的手术治疗，亟需一种高灵敏度和特异性的体外诊断方法(In
‑
Vitro Diagnostics,IVD)对甲状腺结节的良恶性进行鉴别。
[0006]美国甲状腺协会(American Thyroid Association,ATA)将甲状腺结节定义为甲状腺上的一种离散型病变，借助影像学检查，可观测到结节与正常甲状腺组织结构不同，存在相对边界。目前对甲状腺结节的评估主要通过超声(ultrasonography,US)、细针穿刺活检(fine needle aspiration biopsy,FNAB)、电子计算机断层扫描(Computed Tomography)、核磁共振成像(Magnetic Resonance Imaging，MRI)和正电子发射计算机断层扫描(Positron Emission Computed Tomography，PET)。在甲状腺结节的诊断程序中，高分辨率的超声(US)是甲状腺结节的首选检查，可对甲状腺结节进行筛查和评估，判断其大小、类型和结节的内部结构。提示甲状腺结节为恶性的US征象包括：结节的高度大于宽度(OR＝10.15)、缺乏声晕(OR＝7.14)、微小钙化(OR＝6.76)、边界不规则(OR＝6.12)、回声减
低(OR＝5.07)、实性结节(OR＝4.69)、结节内部血流丰富(OR＝3.76)等。通过超声检测到的结节通常与甲状腺功能异常无关，且高分辨率甲状腺超声的滥用使得大量无临床意义的结节(包括甲状腺微小癌)被检出，可能使临床评估偏离甲状腺功能异常。事实上这些结节(包括甲状腺微小癌)绝大部分对患者的危害甚小，可能根本无需处理，但很多患者却因此背上了沉重的精神负担。目前，细胞学检查结果中还有高达20％的结节为不确定甲状腺结节(indeterminate thyroid nodules)，这部分结节需要结合分子检测，市面上已有Gene Expression Classifier和ThyroSeqv2产品，前者阳性预测值(positive predictive value,PPV)很低，只有46％；后者PPV也只有42％
‑
77％。
[0007]因此，开发具有低成本、无创、适合临床推广的甲状腺结节良恶性鉴别的高特异性、高灵敏度的分子诊断工具，对有效控制甲状腺癌的发病率和更深入的研究其发病机制具有重要意义。

技术实现思路

[0008]本专利技术的目的是提供一种用于鉴别个体甲状腺结节良恶性的组合物，通过运用该组合物检测含有选自CDH1基因，TSHR基因，MCC基因，TBX15基因，PRR15基因，DPYS基因，GRIA2基因，NR5A1基因，TTC34基因，RCOR2基因，F10基因，ITPKA基因，SLC16A3基因，RARG基因，FTAP2B基因，SOD3基因，RP11
‑
867G23.12基因，EMX2OS基因，TEAD3基因和DGKG基因中目标位点的一个或多个的甲基化情况，实现该个体甲状腺结节的良恶性鉴别。
[0009]本专利技术第一方面提供引物分子和/或探针分子在制备诊断个体甲状腺结节良恶性的检测试剂或诊断试剂盒中的应用，以及装置在制备诊断个体甲状腺结节良恶性的诊断试剂盒中的应用；所述引物分子相同于、互补于或在严谨条件下杂交于一个或多个目标标志物并包含至少9个连续的核苷酸；所述探针分子与一个或多个目标标志物的扩增产物在严谨条件下杂交；所述装置用于确定一个或多个目标标志物中的至少一个CpG二核苷酸的甲基化状态或水平。
[0010]本专利技术第二方面提供区分基因组DNA至少一个靶区域内甲基化和未甲基化CpG二核苷酸的至少一种试剂或成组试剂在制备用于检测和/或分类个体中甲状腺结节良恶性的方法的试剂盒中的用途，其中所述方法包括使从所述个体生物样品中分离的基因组DNA与所述至少一种试剂或成组试剂接触，其中所述靶区域等同于或互补于一个或多个目标标志物的至少16连续核苷酸的序列，其中所述连续核苷酸包含至少一个CpG二核苷酸序列，由此至少部分地提供对甲状腺结节良恶性的检测和/或分类。
[0011]本专利技术第三方面提供将5位未甲基化的胞嘧啶碱基转化为尿嘧啶或在杂交性能方面可检测地不同于胞嘧啶的其它碱基的一种或多种试剂、扩增酶以及至少一种包含至少9个连续核苷酸的引物在制备用于检测和/或分类个体中甲状腺结节良恶性的方法的试剂盒中的用途，其中所述方法包括：a)从所述个体生物样品分离基因组DNA；b)用所述一种或多种试剂处理a)的所述基因组DNA或其片段；c)使所述经处理的基因组DNA或其经处理的片段与所述扩增酶和所述至少一种引物接触，所述引物相同于、互补于或在严谨条件下杂交于一个或多个目标标志物，其中所述经处理的基因组DNA或其片段被扩增以产生至少一种扩增产物或不被扩增；以及d)基于所述扩增物是否存在或其性质，确定所述一个或多个目标标志物的至少一个CpG二核苷酸的甲基化状态或水平，或者反映所述一个或本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.引物分子和/或探针分子在制备诊断个体甲状腺结节良恶性的检测试剂或诊断试剂盒中的应用，以及装置在制备诊断个体甲状腺结节良恶性的诊断试剂盒中的应用；其特征在于：所述引物分子相同于、互补于或在严谨条件下杂交于一个或多个目标标志物并包含至少9个连续的核苷酸；所述探针分子与一个或多个目标标志物的扩增产物在严谨条件下杂交；所述装置用于确定一个或多个目标标志物的至少一个CpG二核苷酸的甲基化状态或水平；其中，所述一个或多个目标标志物选自：CDH1基因或基因组的CDH1序列、TSHR基因或基因组的TSHR序列、MCC基因或基因组的MCC序列、TBX15基因或基因组的TBX15序列、PRR15基因或基因组的PRR15序列、DPYS基因或基因组的DPYS序列、GRIA2基因或基因组的GRIA2序列、NR5A1基因或基因组的NR5A1序列、TTC34基因或基因组的TTC34序列、RCOR2基因或基因组的RCOR2序列、F10基因或基因组的F10序列、ITPKA基因或基因组的ITPKA序列、SLC16A3基因或基因组的SLC16A3序列、RARG基因或基因组的RARG序列、FTAP2B基因或基因组的FTAP2B序列、SOD3基因或基因组的SOD3序列、RP11
‑
867G23.12基因或基因组的RP11
‑
867G23.12序列、EMX2OS基因或基因组的EMX2OS序列、TEAD3基因或基因组的TEAD3序列和DGKG基因或基因组的DGKG序列中的任意一个或任意多个。2.如权利要求1所述的应用，其特征在于，所述目标标志物为SLC16A3基因或基因组的SLC16A3序列以及选自TSHR基因或基因组的TSHR序列、TTC34基因或基因组的TTC34序列、ROCR2基因或基因组的ROCR2序列、RARG基因或基因组的RARG序列、MCC基因或基因组的MCC序列和ITPKA基因或基因组的ITPKA序列中的一种或多种；优选地，目标标志物为SLC16A3基因或基因组的SLC16A3序列和TSHR基因或基因组的TSHR序列；优选地，检测来自该个体的甲状腺结节中的该目标标志物的甲基化水平；优选地，所述目标标志物为SLC16A3基因或基因组的SLC16A3序列和ROCR2基因或基因组的ROCR2序列，以及选自TTC34基因或基因组的TTC34序列、RARG基因或基因组的RARG序列、ITPKA基因或基因组的ITPKA序列和MCC基因或基因组的MCC序列中的至少一个、至少两个或至少三个；优选地，所述目标标志物为SLC16A3基因或基因组的SLC16A3序列、ROCR2基因或基因组的ROCR2序列、TTC34基因或基因组的TTC34序列和RARG基因或基因组的RARG序列，或所述目标标志物为SLC16A3基因或基因组的SLC16A3序列、ROCR2基因或基因组的ROCR2序列、ITPKA基因或基因组的ITPKA序列和MCC基因或基因组的MCC序列；优选地，检测来自该个体的血液样品如血浆中这些目标标志物的甲基化水平；优选地，所述目标标志物为SLC16A3基因或基因组的SLC16A3序列和RARG基因或基因组的RARG序列，以及选自TTC34基因或基因组的TTC34序列、ROCR2基因或基因组的ROCR2序列和ITPKA基因或基因组的ITPKA序列的至少一个、至少两个或全部三个；优选地，所述目标标志物为SLC16A3基因或基因组的SLC16A3序列、ROCR2基因或基因组的ROCR2序列、TTC34基因或基因组的TTC34序列和RARG基因或基因组的RARG序列，或所述目标标志物为SLC16A3基因或基因组的SLC16A3序列、TTC34基因或基因组的TTC34序列、ITPKA基因或基因组的ITPKA序列和RARG基因或基因组的RARG序列；优选地，检测来自该个体的血液样品如血浆中这些目
标标志物的甲基化水平；优选地，所述目标标志物为SLC16A3基因或基因组的SLC16A3序列和TTC34基因或基因组的TTC34序列，以及选自ROCR2基因或基因组的ROCR2序列、RARG基因或基因组的RARG序列和ITPKA基因或基因组的ITPKA序列的至少一个、至少两个或全部三个；优选地，所述目标标志物为SLC16A3基因或基因组的SLC16A3序列、ROCR2基因或基因组的ROCR2序列、TTC34基因或基因组的TTC34序列和RARG基因或基因组的RARG序列，或所述目标标志物为SLC16A3基因或基因组的SLC16A3序列、TTC34基因或基因组的TTC34序列、ITPKA基因或基因组的ITPKA序列和RARG基因或基因组的RARG序列；优选地，检测来自该个体的血液样品如血浆中这些目标标志物的甲基化水平；优选地，所述目标标志物为SLC16A3基因或基因组的SLC16A3序列和ITPKA基因或基因组的ITPKA序列，以及选自ROCR2基因或基因组的ROCR2序列、MCC基因或基因组的MCC序列、TTC34基因或基因组的TTC34序列和RARG基因或基因组的RARG序列和的至少一个、至少两个或全部三个；优选地，所述目标标志物为SLC16A3基因或基因组的SLC16A3序列、ROCR2基因或基因组的ROCR2序列、ITPKA基因或基因组的ITPKA序列和MCC基因或基因组的MCC序列，或所述目标标志物为SLC16A3基因或基因组的SLC16A3序列、TTC34基因或基因组的TTC34序列、ITPKA基因或基因组的ITPKA序列和RARG基因或基因组的RARG序列；优选地，检测来自该个体的血液样品如血浆中这些目标标志物的甲基化水平；优选地，所述目标标志物为SLC16A3基因或基因组的SLC16A3序列、TTC34基因或基因组的TTC34序列和RARG基因或基因组的RARG序列，以及ROCR2基因或基因组的ROCR2序列或ITPKA基因或基因组的ITPKA序列；优选地，检测来自该个体的血液样品如血浆中这些目标标志物的甲基化水平。3.如权利要求1所述的应用，其特征在于，所述目标标志物为FTAP2B基因或基因组的FTAP2B序列以及选自EMS2OS基因或基因组的EMS2OS序列、DGKG基因或基因组的DGKG序列、SOD3基因或基因组的SOD3序列、RP11
‑
867G23.12基因或基因组的RP11
‑
867G23.12序列中的至少一个、至少两个或至少三个；优选地，所述目标标志物为FTAP2B基因或基因组的FTAP2B序列、EMS2OS基因或基因组的EMS2OS序列以及任选的SOD3基因或基因组的SOD3序列；优选地，所述目标标志物为FTAP2B基因或基因组的FTAP2B序列和EMS2OS基因或基因组的EMS2OS序列，其中，检测来自该个体的甲状腺结节中的这些目标标志物的甲基化水平；优选地，所述目标标志物为FTAP2B基因或基因组的FTAP2B序列、EMS2OS基因或基因组的EMS2OS序列以及SOD3基因或基因组的SOD3序列，其中，检测血液样品如血浆中这些目标标志物的甲基化水平；优选地，所述目标标志物为为FTAP2B基因或基因组的FTAP2B序列和DGKG基因或基因组的DGKG序列，其中，检测血液样品如血浆中这些目标标志物的甲基化水平；优选地，所述目标标志物为FTAP2B基因或基因组的FTAP2B序列和SOD3基因或基因组的SOD3序列，以及EMS2OS基因或基因组的EMS2OS序列或RP11
‑
867G23.12基因或基因组的RP11
‑
867G23.12序列，其中，检测血液样品如血浆中这些目标标志物的甲基化水平。4.如权利要求1所述的应用，其特征在于，所述目标标志物为RARG基因或基因组的RARG序列，以及选自DPYS基因或基因组的DPYS序列、TSHR基因或基因组的TSHR序列、TTC34基因或基因组的TTC34序列、RCOR2基因或基因
组的RCOR2序列、SLC16A3基因或基因组的SLC16A3序列和ITPKA基因或基因组的ITPKA序列中的至少一个、至少两个、至少三个或至少四个；优选地，所述目标标志物为RARG基因或基因组的RARG序列和DPYS基因或基因组的DPYS序列，其中，检测来自该个体的甲状腺结节中的这些目标标志物的甲基化水平；优选地，所述目标标志物为RARG基因或基因组的RARG序列和TSHR基因或基因组的TSHR序列，其中，检测血液样品如血浆中这些目标标志物的甲基化水平；优选地，所述目标标志物为RARG基因或基因组的RARG序列和TTC34基因或基因组的TTC34序列，以及选自RCOR2基因或基因组的RCOR2序列、SLC16A3基因或基因组的SLC16A3序列和ITPKA基因或基因组的ITPKA序列中的至少一个或至少两个，其中，检测血液样品如血浆中这些目标标志物的甲基化水平；优选地，所述目标标志物为RARG基因或基因组的RARG序列、TTC34基因或基因组的TTC34序列、RCOR2基因或基因组的RCOR2序列和SLC16A3基因或基因组的SLC16A3序列其中，检测血液样品如血浆中这些目标标志物的甲基化水平；优选地，所述目标标志物为RARG基因或基因组的RARG序列、TTC34基因或基因组的TTC34序列、ITPKA基因或基因组的ITPKA序列和SLC16A3基因或基因组的SLC16A3序列其中，检测血液样品如血浆中这些目标标志物的甲基化水平；优选地，所述目标标志物为RARG基因或基因组的RARG序列和SLC16A3基因或基因组的SLC16A3序列，以及选自TTC34基因或基因组的TTC34序列、RCOR2基因或基因组的RCOR2序列和ITPKA基因或基因组的ITPKA序列中的至少一个或至少两个，其中，检测血液样品如血浆中这些目标标志物的甲基化水平；优选地，所述目标标志物为RARG基因或基因组的RARG序列、TTC34基因或基因组的TTC34序列、RCOR2基因或基因组的RCOR2序列和SLC16A3基因或基因组的SLC16A3序列其中，检测血液样品如血浆中这些目标标志物的甲基化水平；优选地，所述目标标志物为RARG基因或基因组的RARG序列、TTC34基因或基因组的TTC34序列、ITPKA基因或基因组的ITPKA序列和SLC16A3基因或基因组的SLC16A3序列其中，检测血液样品如血浆中这些目标标志物的甲基化水平；优选地，所述目标标志物为RARG基因或基因组的RARG序列、SLC16A3基因或基因组的SLC16A3序列和TTC34基因或基因组的TTC34序列，以及ROCR2基因或基因组的ROCR2序列或ITPKA基因或基因组的ITPKA序列；优选地，检测来自该个体的血液样品如血浆中这些目标标志物的甲基化水平。5.如权利要求1所述的应用，其特征在于，所述目标标志物为SOD3基因或基因组的SOD3序列，以及选自EMS2OS基因或基因组的EMS2OS序列、TEAD3基因或基因组的TEAD3序列、FTAP2B基因或基因组的FTAP2B序列和RP11
‑
867G23.12基因或基因组的RP11
‑
867G23.12序列中的至少一个或至少两个；优选地，所述目标标志物为SOD3基因或基因组的SOD3序列和EMS2OS基因或基因组的EMS2OS序列，以及TEAD3基因或基因组的TEAD3序列或FTAP2B基因或基因组的FTAP2B序列；优选地，检测来自该个体的血液样品如血浆中这些目标标志物的甲基化水平；优选地，所述目标标志物为SOD3基因或基因组的SOD3序列和FTAP2B基因或基因组的FTAP2B序列，以及EMS2OS基因或基因组的EMS2OS序列或RP11
‑
867G23.12基因或基因组的RP11
‑
867G23.12序列；优选地，检测来自该个体的血液样品如血浆中这些目标标志物的甲基化水平；
优选地，所述目标标志物为TEAD3基因或基因组的TEAD3序列，以及选自RP11
‑
867G23.12基因或基因组的RP11
‑
867G23.12序列、SOD3基因或基因组的SOD3序列和EMS2OS基因或基因组的EMS2OS序列中的至少一种或至少两种；优选地，所述目标标志物为TEAD3基因或基因组的TEAD3序列和RP11
‑
867G23.12基因或基因组的RP11
‑
867G23.12序列；优选地，检测来自该个体的甲状腺结节中的这些目标标志物的甲基化水平；优选地，所述目标标志物为TEAD3基因或基因组的TEAD3序列，SOD3基因或基因组的SOD3序列和EMS2OS基因或基因组的EMS2OS序列；优选地，检测来自该个体的血液样品如血浆中这些目标标志物的甲基化水平。6.如权利要求1所述的应用，其特征在于，所述目标标志物为TTC34基因或基因组的TTC34序列，以及选自RCOR2基因或基因组的RCOR2序列、ITPKA基因或基因组的ITPKA序列、CDH1基因或基因组的CDH1序列、SLC16A3基因或基因组的SLC16A3序列和RARG基因或基因组的RARG序列中的至少一个、至少两个或至少三个；优选地，检测来自该个体的血液样品如血浆中这些目标标志物的甲基化水平；优选地，所述目标标志物为TTC34基因或基因组的TTC34序列和RCOR2基因或基因组的RCOR2序列，以及选自ITPKA基因或基因组的ITPKA序列、CDH1基因或基因组的CDH1序列、SLC16A3基因或基因组的SLC16A3序列和RARG基因或基因组的RARG序列中的至少一个或至少两个；优选地，检测来自该个体的血液样品如血浆中这些目标标志物的甲基化水平；优选地，所述目标标志物为TTC34基因或基因组的TTC34序列、RCOR2基因或基因组的RCOR2序列、ITPKA基因或基因组的ITPKA序列和CDH1基因或基因组的CDH1序列；优选地，检测来自该个体的血液样品如血浆中这些目标标志物的甲基化水平；优选地，所述目标标志物为TTC34基因或基因组的TTC34序列、RCOR2基因或基因组的RCOR2序列、SLC16A3基因或基因组的SLC16A3序列和RARG基因或基因组的RARG序列；优选地，检测来自该个体的血液样品如血浆中这些目标标志物的甲基化水平；优选地，所述目标标志物为TTC34基因或基因组的TTC34序列和ITPKA基因或基因组的ITPKA序列，以及选自RCOR2基因或基因组的RCOR2序列、CDH1基因或基因组的CDH1序列、SLC16A3基因或基因组的SLC16A3序列和RARG基因或基因组的RARG序列中的至少一个或至少两个；优选地，检测来自该个体的血液样品如血浆中这些目标标志物的甲基化水平；优选地，所述目标标志物为TTC34基因或基因组的TTC34序列、ITPKA基因或基因组的ITPKA序列、RCOR2基因或基因组的RCOR2序列和CDH1基因或基因组的CDH1序列；优选地，检测来自该个体的血液样品如血浆中这些目标标志物的甲基化水平；优选地，所述目标标志物为TTC34基因或基因组的TTC34序列、ITPKA基因或基因组的ITPKA序列、SLC16A3基因或基因组的SLC16A3序列和RARG基因或基因组的RARG序列；优选地，检测来自该个体的血液样品如血浆中这些目标标志物的甲基化水平；优选地，所述目标标志物为TTC34基因或基因组的TTC34序列和SLC16A3基因或基因组的SLC16A3序列，以及选自RCOR2基因或基因组的RCOR2序列、ITPKA基因或基因组的ITPKA序列和RARG基因或基因组的RARG序列中的至少一个或至少两个；优选地，检测来自该个体的血液样品如血浆中这些目标标志物的甲基化水平；优选地，所述目标标志物为TTC34基因或基因组的TTC34序列、SLC16A3基因或基因组的SLC16A3序列、RCOR2基因或基因组的RCOR2序列和RARG基因或基因组的RARG序列；优选地，
检测来自该个体的血液样品如血浆中这些目标标志物的甲基化水平；优选地，所述目标标志物为TTC34基因或基因组的TTC34序列、SLC16A3基因或基因组的SLC16A3序列、ITPKA基因或基因组的ITPKA序列和RARG基因或基因组的RARG序列；优选地，检测来自该个体的血液样品如血浆中这些目标标志物的甲基化水平；优选地，目标标志物为TTC34基因或基因组的TTC34序列、SLC16A3基因或基因组的SLC16A3序列和RARG基因或基因组的RARG序列，以及RCOR2基因或基因组的RCOR2序列或ITPKA基因或基因组的ITPKA序列；优选地，检测来自该个体的血液样品如血浆中这些目标标志物的甲基化水平。7.如权利要求1所述的应用，其特征在于，所述目标标志物为MCC基因或基因组的MCC序列，以及选自ITPKA基因或基因组的ITPKA序列、RCOR2基因或基因组的RCOR2序列、SLC16A3基因或基因组的SLC16A3序列和CDH1基因或基因组的CDH1序列中的至少一个、至少两个或至少三个；优选地，检测来自该个体的血液样品如血浆中这些目标标志物的甲基化水平；优选地，目标标志物为MCC基因或基因组的MCC序列、ITPKA基因或基因组的ITPKA序列、RCOR2基因或基因组的RCOR2序列和SLC16A3基因或基因组的SLC16A3序列；优选地，检测来自该个体的血液样品如血浆中这些目标标志物的甲基化水平；优选地，目标标志物为MCC基因或基因组的MCC序列和CDH1基因或基因组的CDH1序列；优选地，检测来自该个体的血液样品如血浆中这些目标标志物的甲基化水平；或所述目标标志物为CDH1基因或基因组的CDH1序列，以及选自MCC基因或基因组的MCC序列、TTC34基因或基因组的TTC34序列、RCOR2基因或基因组的RCOR2序列和ITPKA基因或基因组的ITPKA序列中的至少一个、至少两个或至少三个；优选地，检测来自该个体的血液样品如血浆中这些目标标志物的甲基化水平；优选地，目标标志物为CDH1基因或基因组的CDH1序列和MCC基因或基因组的MCC序列；优选地，检测来自该个体的血液样品如血浆中这些目标标志物的甲基化水平；优选地，所述目标标志物为CDH1基因或基因组的CDH1序列、TTC34基因或基因组的TTC34序列、RCOR2基因或基因组的RCOR2序列和ITPKA基因或基因组的ITPKA序列；优选地，检测来自该个体的血液样品如血浆中这些目标标志物的甲基化水平。8.如权利要求1
‑
7中任一项所述的应用，其特征在于，所述各基因的Hg19坐标如下：CDH1基因，chr16:68771195
‑
68869439；TSHR基因，chr14:81422025
‑
81610697；MCC基因，chr5:112357803
‑
112630635；TBX15基因，chr1:119427355
‑
119530418；PRR15基因，chr7:29605149
‑
29606911；DPYS基因，chr8:105391659
‑
105479283；GRIA2基因，chr4:158141272
‑
158287226；NR5A1基因，chr9:127245034
‑
127265678；TTC34基因，chr1:2572708
‑
2717433；RCOR2基因，chr11:63678702
‑
63684636；F10基因，chr1...

【专利技术属性】
技术研发人员：苏明扬，杨世方，马建华，郗大勇，何其晔，刘蕊，
申请(专利权)人：上海鹍远生物科技股份有限公司，
类型：发明
国别省市：