【技术实现步骤摘要】
抑制非必需高丰度蛋白表达以提高TG酶发酵水平的方法
[0001]本专利技术属于生物工程
,涉及一种抑制非必需高丰度蛋白表达以提高TG酶发酵水平的方法,具体说是一种利用CRISPRi技术降低SMDS_5177、SMDS_758、SMDS_5989 和SMDS_6427的转录水平,抑制上述4种高丰度非必需蛋白的表达以提高谷氨酰胺转氨酶发酵水平的方法。
技术介绍
[0002]谷氨酰胺转氨酶(TG酶)是由茂源链霉菌(Streptomyces mobaraensis)产生的一种单亚基蛋白,它能够催化蛋白质中谷氨酰胺残基的γ
‑
酰胺基和赖氨酸的ε
‑
氨基之间进行酰胺基转移反应,形成ε
‑
(γ
‑
谷酰胺)
‑
赖氨酸的异型肽键,从而改变蛋白质的功能性质,被广泛应用于食品行业蛋白制品食用添加剂、交联抗体和药物分子生产抗体偶联药物、提高羊毛纺织品的强度等,市场需求量逐年上升,然而目前该酶产量仍然较低,亟待进一步提升。本专利技术发现,在茂源链霉菌生产T ...
【技术保护点】
【技术特征摘要】
1.一种TG酶高产菌株,其特征在于,所述菌株的非必需高丰度蛋白编码基因转录被抑制。2.如权利要求1所述的TG酶高产菌株,其特征在于,在茂源链霉菌IPIO中通过CRISPRi技术分别降低了基因SMDS_5177、SMDS_758、SMDS_5989、SMDS_6427的转录水平。3.一种用于降低蛋白编码基因转录水平的整合型质粒载体,其特征在于,所述载体分别抑制了茂源链霉菌IPIO的谷氨酰胺转氨酶激活金属蛋白酶抑制蛋白编码基因SMDS_5177、短杆菌肽合酶C亚基蛋白编码基因SMDS_758、苦霉素合酶模块3和4蛋白编码基因SMDS_5989、促自溶诱导蛋白编码基因SMDS_6427的转录水平,含有靶向以上4个基因启动子区域的gRNA,通过降低基因转录水平抑制蛋白表达。4.根据权利要求3所述的整合型质粒载体,其特征在于,所述基因SMDS_5177的序列如SEQ ID NO.1所示,其对应的gRNA
SMDS_5177
的序列如SEQ ID NO.2所示;所述SMDS_758的序列如SEQ ID NO.3所示,其对应的gRNA
SMDS_5989
的序列如SEQ ID NO.4所示;所述基因SMDS_5989的序列如SEQ ID NO.5所示,其对应的gRNA
SMDS_5989
的序列如SEQ ID NO.6所示;所述基因SMDS_6427的序列如SEQ ID NO.7所示,其对应的gRNA
SMDS_6427
的序列如SEQ ID NO.8所示。5.一种根据权利要求3或4所述的整合型质粒载体的构建方法,其特征在于,所述方法包括如下步骤:在CRISPy
‑
web网站上设计特异性靶向SMDS_5177启动子区域的gRNA,通过PCR扩增得到含sgRNA
SMDS_5177
基因序列的PCR片段,通过Gibson连接的方法连入整合型质粒pSET
‑
dCas9
‑
actII4
‑
NT
‑
S1中的SpeI/EcoRI位点,获得整合型质粒载体pLQ2103;或,在CRISPy
‑
web网站上设计特异性靶向SMDS_758启动子区域的gRNA,通过PCR扩增得到含sgRNA
SMDS_758
基因序列的PCR片段,通过Gibson连接的方法连入整合型质粒pSET
‑
dCas9
‑
actII4
‑
NT
‑
S1中的SpeI/EcoRI位点,获得整合型质粒载体pLQ2104;或,在CRISPy
‑
web网站上设计特异性靶向SMDS_5989启动子区域的gRNA,通过PCR扩增得到含sgRNA
SMDS_5989
基因序...
【专利技术属性】
技术研发人员:白林泉,吴邦昊,王丹,步建国,
申请(专利权)人:泰兴市东圣生物科技有限公司,
类型:发明
国别省市:
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