漆酶重组蛋白及其应用制造技术

技术编号:34714301 阅读:14 留言:0更新日期:2022-08-31 17:56
本发明专利技术公开了漆酶重组蛋白及其应用。本发明专利技术提供了漆酶突变体,按照包括如下制备得到:将LCC1、LCC2和Mrl2的氨基酸序列一起进行序列对比,得到氨基酸比对序列矩阵;以所述氨基酸比对序列矩阵的第123

【技术实现步骤摘要】
漆酶重组蛋白及其应用


[0001]本专利技术涉及酶工程
,具体涉及漆酶重组蛋白及其应用。

技术介绍

[0002]随着生物技术的快速发展,酶蛋白已广泛应用于食品、化工、环境、能源等各领域,推动了工业与能源的可持续发展。但是,天然酶一般难以满足工业需求,需要通过定向进化手段对其性能进行改造,如提高酶活性、稳定性、底物特异性和立体选择性等。
[0003]定向进化是在实验室模拟自然进化过程,其中重要的一步就是建立高质量突变库,供下游筛选。目前,虽然突变库构建方法已得到广泛开发,如易错PCR、基因重组、CASTing、序列饱和突变等,但突变库质量较低,存在很多无义突变或重组,因此需要筛选较大容量的突变库才能得到目标突变体。这就很大程度上限制了定向进化的高效进行。因此构建容量较小但高质量的突变库尤为重要。
[0004]结构域是因多肽链上相邻的超二级结构紧密联系,进一步折叠而成的一个或多个相对独立的致密三维实体。从功能角度看,多结构域酶蛋白活性中心往往位于结构域之间,主要可能是因为通过结构域容易构建具有特定三维排布的活性中心,而且各个结构域之间常只有一段柔性肽链相连,使结构域间容易发生相对运动,有利于活性中心结合底物、别构中心结合调节物和发生别构效应,利于酶对反应的催化。
[0005]在多结构域蛋白质中,一些蛋白质的各结构域没有明确的功能分工,或各结构域共同存在才得以行使功能。本领域技术人员通常认为各结构域之间的联系是不能被破坏的,即替换掉任意结构域很可能会使蛋白质整体失去功能。漆酶(EC 1.10.3.2)为一类多功能氧化酶,属于蓝多铜氧化酶家族,能够氧化多达250多种底物,具有广阔的工业应用前景,如木质素降解、染料脱色、有机污染物降解、生物检测、高分子合成和食品工业等领域。漆酶对富含木质素的农作物秸秆的有效降解作用,不但可以解决环境问题,并且还可以得到木质素来源的多种芳香族化合物用作化学品合成的前体。漆酶利用分子氧通过自由基-催化反应机制氧化各种芳香族和非芳香族化合物,唯一副产物是水,被认为是绿色环保的生物催化剂。然而,天然来源的漆酶活力比较低,而且难以在工业应用环境下保持稳定,从而限制了漆酶的商业化生产以及用于大规模木质素降解和环境治理等。因此如何生产廉价、高效的漆酶(高活力,高稳定性)越来越受到国内外众多学者的关注。大部分漆酶具有三个结构域,4个铜离子参与反应,1个T1铜,位于结构域3,负责从底物上得电子;T1铜附近,分别位于结构域2和结构域3的4个loops区在蛋白结构表面形成浅壑供底物结合;2个T3铜和1个T2铜组成的三核中心区,位于结构域1和3的界面上,负责将来自T1铜的电子传递给O2,生成水。漆酶的三个结构域结合在一起形成了界面间的活性中心,使漆酶获得生化活性。

技术实现思路

[0006]本专利技术申请人认为结构域间界面上氨基酸的相互作用会对酶催化功能影响很大,因此对结构域进行组合、重构将会很大程度上改变酶蛋白的催化性能及其稳定性等。因此,
本专利技术首次提出了一种通过对结构域进行重构而对蛋白进行设计改造的理念,构建高质量、小容量的聪明突变库,达到快速改造目标蛋白的目的。并且选择漆酶为模式酶蛋白进行该方法是否有效的验证,最终获得了酶活力和稳定性均提高的漆酶突变体。
[0007]第一方面,本专利技术要求保护一种漆酶突变体。
[0008]本专利技术要求保护的漆酶突变体可按照包括如下步骤的方法制备得到:将来自于白腐真菌的漆酶蛋白LCC1、来自于白腐真菌的漆酶蛋白LCC2和来自于担子菌的漆酶蛋白Mrl2的氨基酸序列一起进行序列对比,得到氨基酸比对序列矩阵;以所述氨基酸比对序列矩阵的第123

141位之间的某个位置作为重组位点1,以所述氨基酸比对序列矩阵的第306

345位之间的某个位置作为重组位点2;通过所述重组位点1和/或所述重组位点2将所述LCC1、所述LCC2和所述Mrl2这三个漆酶蛋白中的至少两个进行重组,得到重组后漆酶蛋白。
[0009]所述氨基酸比对序列矩阵具体可为采用序列比对软件(如ClustalW等)将所述LCC1、所述LCC2和所述Mrl2的氨基酸序列放在一起进行比对,软件直接输出的比对结果图谱(图谱上所标注的位置信息即为在氨基酸比对序列矩阵中的位置,如图1)。
[0010]进一步地,所述重组的方式可为如下任一:
[0011](A1)所述LCC1和所述LCC2仅在所述重组位点1处发生重组;
[0012](A2)所述LCC1和所述LCC2仅在所述重组位点2处发生重组;
[0013](A3)所述LCC1和所述LCC2在所述重组位点1和所述重组位点2处同时发生重组;
[0014](A4)所述LCC1和所述Mrl2在所述重组位点1处发生重组;
[0015](A5)所述LCC1和所述Mrl2仅在所述重组位点2处发生重组;
[0016](A6)所述LCC1和所述Mrl2在所述重组位点1和所述重组位点2处同时发生重组;
[0017](A7)所述LCC2和所述Mrl2在所述重组位点1处发生重组;
[0018](A8)所述LCC2和所述Mrl2仅在所述重组位点2处发生重组;
[0019](A9)所述LCC2和所述Mrl2在所述重组位点1和所述重组位点2处同时发生重组;
[0020](A10)所述LCC1、所述LCC2和所述Mrl2在所述重组位点1和所述重组位点2处同时发生重组。
[0021]在本专利技术中,所述(A1)具体为:1)所述LCC1位于所述氨基酸比对序列矩阵中所述重组位点1前面的部分和所述LCC2在所述氨基酸比对序列矩阵中位于所述重组位点1后面的部分重组(得到L1L2L2);或,2)所述LCC1位于所述氨基酸比对序列矩阵中所述重组位点1后面的部分和所述LCC2在所述氨基酸比对序列矩阵中位于所述重组位点1前面的部分重组(得到L2L1L1)。
[0022]在本专利技术中,所述(A2)具体为:1)所述LCC1位于所述氨基酸比对序列矩阵中所述重组位点2前面的部分和所述LCC2在所述氨基酸比对序列矩阵中位于所述重组位点2后面的部分重组(得到L1L1L2);或,2)所述LCC1位于所述氨基酸比对序列矩阵中所述重组位点2后面的部分和所述LCC2在所述氨基酸比对序列矩阵中位于所述重组位点2前面的部分重组(得到L2L2L1)。
[0023]在本专利技术中,所述(A3)具体为:1)所述LCC1位于所述氨基酸比对序列矩阵中所述重组位点1前面的部分、所述LCC2在所述氨基酸比对序列矩阵中位于所述重组位点1和所述重组位点2之间的部分和所述LCC1位于所述氨基酸比对序列矩阵中所述重组位点2后面的部分重组(得到L1L2L1);或,2)所述LCC2位于所述氨基酸比对序列矩阵中所述重组位点1前
面的部分、所述LCC1在所述氨基酸比对序列矩阵中位于所述重组位点1和所述重组位点2之间的部分和所述LCC2位于所述氨基酸比对序列矩阵中所述重组位点2后面的部分重组(得到L2L1L2)。本文档来自技高网
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【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.漆酶突变体,为按照包括如下步骤的方法制备得到的:将来自于白腐真菌的漆酶蛋白LCC1、来自于白腐真菌的漆酶蛋白LCC2和来自于担子菌的漆酶蛋白Mrl2的氨基酸序列一起进行序列对比,得到氨基酸比对序列矩阵;以所述氨基酸比对序列矩阵的第123

141位之间的某个位置作为重组位点1,以所述氨基酸比对序列矩阵的第306

345位之间的某个位置作为重组位点2;通过所述重组位点1和/或所述重组位点2将所述LCC1、所述LCC2和所述Mrl2这三个漆酶蛋白中的至少两个进行重组,得到重组后漆酶蛋白。2.根据权利要求1所述的漆酶突变体,其特征在于:所述重组方式为如下任一:(A1)所述LCC1和所述LCC2仅在所述重组位点1处发生重组;(A2)所述LCC1和所述LCC2仅在所述重组位点2处发生重组;(A3)所述LCC1和所述LCC2在所述重组位点1和所述重组位点2处同时发生重组;(A4)所述LCC1和所述Mrl2在所述重组位点1处发生重组;(A5)所述LCC1和所述Mrl2仅在所述重组位点2处发生重组;(A6)所述LCC1和所述Mrl2在所述重组位点1和所述重组位点2处同时发生重组;(A7)所述LCC2和所述Mrl2在所述重组位点1处发生重组;(A8)所述LCC2和所述Mrl2仅在所述重组位点2处发生重组;(A9)所述LCC2和所述Mrl2在所述重组位点1和所述重组位点2处同时发生重组;(A10)所述LCC1、所述LCC2和所述Mrl2在所述重组位点1和所述重组位点2处同时发生重组。3.根据权利要求2所述的漆酶突变体,其特征在于:所述(A1)为:1)所述LCC1位于所述氨基酸比对序列矩阵中所述重组位点1前面的部分和所述LCC2在所述氨基酸比对序列矩阵中位于所述重组位点1后面的部分重组;或,2)所述LCC1位于所述氨基酸比对序列矩阵中所述重组位点1后面的部分和所述LCC2在所述氨基酸比对序列矩阵中位于所述重组位点1前面的部分重组;所述(A2)为:1)所述LCC1位于所述氨基酸比对序列矩阵中所述重组位点2前面的部分和所述LCC2在所述氨基酸比对序列矩阵中位于所述重组位点2后面的部分重组;或,2)所述LCC1位于所述氨基酸比对序列矩阵中所述重组位点2后面的部分和所述LCC2在所述氨基酸比对序列矩阵中位于所述重组位点2前面的部分重组;所述(A3)为:1)所述LCC1位于所述氨基酸比对序列矩阵中所述重组位点1前面的部分、所述LCC2在所述氨基酸比对序列矩阵中位于所述重组位点1和所述重组位点2之间的部分和所述LCC1位于所述氨基酸比对序列矩阵中所述重组位点2后面的部分重组;或,2)所述LCC2位于所述氨基酸比对序列矩阵中所述重组位点1前面的部分、所述LCC1在所述氨基酸比对序列矩阵中位于所述重组位点1和所述重组位点2之间的部分和所述LCC2位于所述氨基酸比对序列矩阵中所述重组位点2后面的部分重组;所述(A4)为:1)所述LCC1位于所述氨基酸比对序列矩阵中所述重组位点1前面的部分和所述Mrl2在所述氨基酸比对序列矩阵中位于所述重组位点1后面的部分重组;或,2)所述LCC1位于所述氨基酸比对序列矩阵中所述重组位点1后面的部分和所述Mrl2在所述氨基酸比对序列矩阵中位于所述重组位点1前面的部分重组;所述(A5)为:1)所述LCC1位于所述氨基酸比对序列矩阵中所述重组位点2前面的部分和所述Mrl2在所述氨基酸比对序列矩阵中位于所述重组位点2后面的部分重组;或,2)所述
LCC1位于所述氨基酸比对序列矩阵中所述重组位点2后面的部分和所述Mrl2在所述氨基酸比对序列矩阵中位于所述重组位点2前面的部分重组;所述(A6)为:1)所述LCC1位于所述氨基酸比对序列矩阵中所述重组位点1前面的部分、所述Mrl2在所述氨基酸比对序列矩阵中位于所述重组位点1和所述重组位点2之间的部分和所述LCC1位于所述氨基酸比对序列矩阵中所述重组位点2后面的部分重组;或,2)所述Mrl2位于所述氨基酸比对序列矩阵中所述重组位点1前面的部分、所述LCC1在所述氨基酸比对序列矩阵中位于所述重组位点1和所述重组位点2之间的部分和所述Mrl2位于所述氨基酸比对序列矩阵中所述重组位点2后面的部分重组;所述(A7)为:1)所述LCC2位于所述氨基酸比对序列矩阵中所述重组位点1前面的部分和所述Mrl2在所述氨基酸比对序列矩阵中位于所述重组位点1后面的部分重组;或,2)所述LCC2位于所述氨基酸比对序列矩阵中所述重组位点1后面的部分和所述Mrl2在所述氨基酸比对序列矩阵中位于所述重组位点1前面的部分重组;所述(A8)为:1)所述LCC2位于所述氨基酸比对序列矩阵中所述重组位点2前面的部分和所述Mrl2在所述氨基酸比对序列矩阵中位于所述重组位点2后面的部分重组;或,2)所述LCC2位于所述氨基酸比对序列矩阵中所述重组位点2后面的部分和所述Mrl2在所述氨基酸比对序列矩阵中位于所述重组位点2前面的部分重组;所述(A9)为:1)所述LCC2位于所述氨基酸比对序列矩阵中所述重组位点1前面的部分、所述Mrl2在所述氨基酸比对序列矩阵中位于所述重组位点1和所述重组位点2之间的部分和所述LCC2位于所述氨基酸比对序列矩阵中所述重组位点2后面的部分重组;或,2)所述Mrl2位于所述氨基酸比对序列矩阵中所述重组位点1前面的部分、所述LCC2在所述氨基酸比对序列矩阵中位于所述重组位点1和所述重组位点2之间的部分和所述Mrl2位于所述氨基酸比对序列矩阵中所述重组位点2后面的...

【专利技术属性】
技术研发人员:朱蕾蕾杨建花谭子瑊
申请(专利权)人:中国科学院天津工业生物技术研究所
类型:发明
国别省市:

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