一种检测融合基因及其变体的系统以及方法和应用技术方案

本发明专利技术涉及疾病基因检测技术领域，具体涉及一种检测融合基因及其变体的系统以及方法和应用。一种检测融合基因及其变体的系统，包括识别切割单元和链置换单元；所述识别切割单元包括Cas13a RNA酶、用于识别融合基因的引导RNA和触发RNA；所述链置换单元包括探针H1和探针H2。本技术方案解决了现有技术中缺少能够简单快速检测融合基因及其变体的系统以及方法的技术问题。本方案可在1小时内完成肺癌患者EML4

【技术实现步骤摘要】
一种检测融合基因及其变体的系统以及方法和应用


[0001]本专利技术涉及疾病相关基因检测
，具体涉及一种检测融合基因及其变体的系统以 及方法和应用。

技术介绍

[0002]在现有基因突变检测系统中，主要分为荧光原位杂交技术(FISH)、免疫组织化学(IHC)、 逆转录聚合酶链反应(RT
‑
PCR)、恒温扩增技术以及测序技术，具体如下。
[0003]1.荧光原位杂交技术(FISH)：
[0004]FISH主要原理：是目前融合基因检测的金标准。利用报告分子(如生物素、地高辛等) 标记核酸探针，然后将探针与染色体或DNA纤维切片上的靶DNA杂交，若两者同源互补，即 可形成靶DNA与核酸探针的杂交体。此时可利用该报告分子与荧光素标记的特异亲和素之间 的免疫化学反应，经荧光检测体系在镜下对待DNA进行定性、定量或相对定位分析。
[0005]缺点：实验操作负责，技术要求较高。对于基因融合产生的EML4
‑
ALK转录变体或对其 他ALK融合伴侣鉴定无法准确表征。
[0006]2.免疫组本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种检测融合基因及其变体的系统，其特征在于，包括识别切割单元和链置换单元；所述识别切割单元包括Cas13a RNA酶、用于识别融合基因RNA的引导RNA和触发RNA；所述链置换单元包括探针H1和探针H2。2.根据权利要求1所述的一种检测融合基因及其变体的系统，其特征在于，所述识别切割单元还包括核酸酶缓冲液；所述链置换单元还包括KCl和核酸酶缓冲液。3.根据权利要求2所述的一种检测融合基因及其变体的系统，其特征在于，所述融合基因为EMAL
‑
ALK融合基因。4.根据权利要求3所述的一种检测融合基因及其变体的系统，其特征在于，所述EMAL
‑
ALK融合基因包括变体V1、变体V2、变体V3a、变体V3b、变体V4、变体V5a和变体V5b。5.根据权利要求4所述的一种检测融合基因及其变体的系统，其特征在于，在所述链置换单元中，探针H1的序列如SEQ ID NO.4所示，探针H1第8位的T上修饰有FAM荧光基团，3
’
末端修饰有Dabcyl基团；探针H2的序列如SEQ ID NO.5所示。6.根据权利要求5所述的一种检测融合基因及其变体的系统，其特征在于，探针H1的第34位的G和第35位的A均为肽核酸；或者探针H1的第25位的C和第26位的C均为肽核酸；或者探针H2的第17位的T和第18位的G均为肽核酸；或者探针H2的第10位的C和第11位的T均为肽核酸。7.根据权利要求6所述的一种检测融合基因及其变体的系统，其特征在于，在所述识别切割单元中，引导RNA的序列如SEQ...

【专利技术属性】
技术研发人员：罗阳，袁睿，龙泉鑫，
申请(专利权)人：重庆大学，
类型：发明
国别省市：