一种同时检测3种甘薯病毒的多重检测方法及试剂盒技术

技术编号:34327206 阅读:68 留言:0更新日期:2022-07-31 01:22
一种涉及甘薯病毒检测技术领域的同时检测3种甘薯病毒的多重检测方法及试剂盒,所述试剂盒包含10

【技术实现步骤摘要】
一种同时检测3种甘薯病毒的多重检测方法及试剂盒


[0001]本专利技术涉及甘薯病毒检测
,尤其是涉及一种同时检测3种甘薯病毒的多重检测方法及试剂盒。

技术介绍

[0002]公知的,甘薯是利用块根进行无性繁殖的植物,在栽培过程中极易受病毒的侵染,病毒侵染后对甘薯的产量和品质有很大影响;近年我国甘薯病毒发生率呈上升趋势,目前在广东、福建、江苏、四川、北京、山东等地均检测到有多种病毒的混合侵染现象,据报道中国每年因甘薯病毒造成的损失高达40亿元,甘薯病毒已经成为影响甘薯生产的重要限制因素之一;目前已经鉴定的甘薯病毒有甘薯羽状斑驳病毒(Sweet potato feathery mottle virus,SPFMV)、甘薯褪绿矮化病毒(Sweet potato chlorotic stunt virus,SPCSV)、甘薯潜隐病毒(Sweet potato latent virus,SPLV)等;而经常出现的情况就是多种甘薯病毒的复合侵染,极大的影响了甘薯产量的提高,也直接制约了整个甘薯产业的整体发展;使用茎尖脱毒快繁法繁育甘薯试管苗,能最大程度减少初期甘薯病毒病的发生,诱导再生的“脱毒苗”需要经过严格的病毒检测,确认不带病毒后,才能后续供应给薯农种植,但脱毒的试管苗可能在田间种植阶段再次染上病毒病,检测甘薯病毒病的方法就显得尤为重要;但是目前进行病毒检测一个反应只能检测一种病毒,如果反应模板中含有两个以上的甘薯病毒,则需进行多次PCR,成本高且费时费力。

技术实现思路

[0003]为了克服
技术介绍
中不能同时检测两个以上的甘薯病毒的问题,本专利技术公开了一种同时检测3种甘薯病毒的多重检测方法及试剂盒。
[0004]为实现上述专利技术目的,本专利技术采用如下技术方案:一种同时检测3种甘薯病毒的多重RT

PCR检测试剂盒,包括分别盛装有10
×
反应缓冲液1.5mL、Taq酶(1U/μL)1.5mL、3种甘薯病毒的上游引物混合物SP

F(10μΜ) 0.5 mL、3种甘薯病毒的下游引物混合物SP

R(10μΜ) 0.5 mL和阳性标准品(15μg/mL)0.5 mL的离心管;3种甘薯病毒分别为甘薯褪绿矮化病毒、甘薯羽状斑驳病毒和甘薯潜隐病毒;3种甘薯病毒的上游引物和下游引物分别为:

甘薯褪绿矮化病毒 SPCSV

F/R,上游引物SPCSV

F为5'

CTTACCTCAGACCAGTTAGC

3',下游引物SPCSV

R为5'

CGTTATTGTAGCCTCACCAG

3';

甘薯羽状斑驳病毒 SPFMV F/R,上游引物SPFMV

F为5'

GGCAGATTATGACGCACTTC

3',下游引物SPFMV

R为5'

GTGTGCCTCTCCGTATCTTC

3';

甘薯潜隐病毒 SPLV F/R,上游引物SPLV

F为5'

CCAAGGCTACAAGGAGTCAG

3',
下游引物SPLV

R为5'

ACATTTCCATCCAAACCCGA

3';所述阳性标准品为提取感染的甘薯病株RNA,并分别进行反转录得cDNA,利用3种甘薯病毒的CP基因全长引物分别进行PCR扩增,将扩增产物进行测序,得到的阳性样品的CP基因进行克隆载体的构建,并将所得3个重组载体质粒按1︰1︰1进行混合作为阳性标准品液。
[0005]优选的,所述10
×
反应缓冲液为Tris

HCl 100mM、KCl 500mM和dNTPs 2.5mM。
[0006]优选的,所述试剂盒还包括阴性对照,该阴性对照为纯水或无病毒甘薯总RNA。
[0007]一种同时检测3种甘薯病毒的多重检测方法,包括以下步骤:

用RNA提取试剂盒(Takara)提取待测样本总RNA,并进行反转录得cDNA;

PCR扩增;用权利要求1所述的3种甘薯病毒的上游引物和下游引物对待测样品cDNA进行PCR扩增,其反应条件为94℃预变性2min,94℃变性30s,60℃复性30s,72℃延伸30s,循环32次,最后72℃延伸5min;

取5μL步骤

的 PCR扩增产物在含5μg/ml嗅化乙啶(EB)的2%琼脂糖凝胶上电泳,恒压100V,20min后紫外透射反射仪上观察结果;

结果判定;当150bp处出现一条特异性核酸带,而阴性对照没有目的条带,说明样品中有甘薯褪绿矮化病毒(SPCSV)侵染;当280bp处出现一条特异性核酸带,而阴性对照没有目的条带,说明样品中有甘薯羽状斑驳病毒(SPFMV)侵染;当480bp处出现一条特异性核酸带,而阴性对照没有目的条带,说明样品中有甘薯潜隐病毒(SPLV)侵染。
[0008]由于采用如上所述的技术方案,本专利技术具有如下有益效果:本专利技术公开的一种同时检测3种甘薯病毒的多重检测方法及试剂盒,可实现一次PCR反应同时检测3种甘薯病毒,减少操作次数,避免交叉污染,同时还减少试剂、引物、模板及耗材等的使用量,省时、省力、省成本;实验表明,该法能够快速、准确又简便和经济地从甘薯组织中同时检测这3种甘薯病毒,明确甘薯带毒情况,对尽早采取有效防治措施,控制病害在田间的发生、减少经济损失、抗病筛选和病害流行预测具有十分重要的意义,同时为健康种苗的发展奠定重要的基础,为方便应用本专利技术,专利技术人还设计组装了相应试剂盒,以便在基层普及推广。
附图说明
[0009]图1为本专利技术检测甘薯褪绿矮化病毒(SPCSV)CP基因的特异性扩增图;图2为本专利技术检测甘薯羽状斑驳病毒(SPFMV)CP基因的特异性扩增图;图3为本专利技术检测甘薯潜隐病毒(SPLV)CP基因的特异性扩增图;图4为本专利技术检测甘薯羽状斑驳病毒(SPFMV)、甘薯褪绿矮化病毒(SPCSV)和甘薯潜隐病毒(SPLV)CP基因的特异性扩增图。
[0010]图1中M:DNA Marker
ꢀⅠ
。 Marker;l:SPCSV。
[0011]图2中M:DNA Marker
ꢀⅠ
。 Marker;l:SPFMV。
[0012]图3中M:DNA Marker
ꢀⅠ
。 Marker;l:SPLV。
[0013]图4中M:DNA Marker
ꢀⅠ
。 Marker;l:SPCSV / SPFMV /SPLV。
具体实施方式
[0014]通过下面的实施例可以详细的本文档来自技高网
...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种同时检测3种甘薯病毒的多重RT

PCR检测试剂盒,其特征在于:包括分别盛装有10
×
反应缓冲液1.5mL、Taq酶(1U/μL)1.5mL、3种甘薯病毒的上游引物混合物SP

F(10μΜ) 0.5 mL、3种甘薯病毒的下游引物混合物SP

R(10μΜ) 0.5 mL和阳性标准品(15μg/mL)0.5 mL的离心管;3种甘薯病毒分别为甘薯褪绿矮化病毒、甘薯羽状斑驳病毒和甘薯潜隐病毒;3种甘薯病毒的上游引物和下游引物分别为:

甘薯褪绿矮化病毒 SPCSV

F/R,上游引物SPCSV

F为5'

CTTACCTCAGACCAGTTAGC

3',下游引物SPCSV

R为5'

CGTTATTGTAGCCTCACCAG

3';

甘薯羽状斑驳病毒 SPFMV F/R,上游引物SPFMV

F为5'

GGCAGATTATGACGCACTTC

3',下游引物SPFMV

R为5'

GTGTGCCTCTCCGTATCTTC

3';

甘薯潜隐病毒 SPLV F/R,上游引物SPLV

F为5'

CCAAGGCTACAAGGAGTCAG

3',下游引物SPLV

R为5'

ACATTTCCATCCAAACCCGA

3';所述阳性标...

【专利技术属性】
技术研发人员:张小梅李广录侯文邦
申请(专利权)人:洛阳薯乡薯业科创园有限公司
类型:发明
国别省市:

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