用于控制肠道沙门氏菌的细菌素制造技术

本发明专利技术涉及用于控制肠道沙门氏菌的细菌素(沙门菌素)。该细菌素来自沙门氏菌。该沙门菌素可在植物中表达，并且可用于预防或减少目标物被沙门氏菌感染或污染的方法中。标物被沙门氏菌感染或污染的方法中。标物被沙门氏菌感染或污染的方法中。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】用于控制肠道沙门氏菌的细菌素


[0001]本专利技术提供了能够对沙门氏菌(Salmonella)产生细胞毒性作用的蛋白，称为沙门菌素(salmocin)。本专利技术还提供了包含一种或更多种所述蛋白的组合物，包括药物组合物。还提供了预防或减少沙门氏菌对目标物的感染或污染的方法，治疗有此需要的受试者或患者的沙门氏菌感染的方法，以及生产包含所述蛋白的组合物的方法。

技术介绍

[0002]沙门氏菌是肠杆菌(Enterobacteriaceae)科的杆状革兰氏阳性菌。肠道沙门氏菌(Salmonella enterica)是模式种并进一步分成6个亚种，其中肠道沙门氏菌肠道亚种(S.enterica ssp.enterica)为包括超过2500种血清型的亚种。沙门氏菌感染是常见的，并且可以导致多变的临床表现，从无症状状态到非常严重的疾病。据估计，肠道沙门氏菌在美国每年导致100万例病例，估计导致19,000例住院病例和380人死亡。在过去的5年中，美国已经记录了46次沙门氏菌爆发，大多数食物中毒是由于被污染的家禽或蔬菜，以及红肉和鱼(CDC网站)。
[0003]预防沙门氏菌感染或减少食品受沙门氏菌污染需要在食物链的所有阶段采取控制措施，从农场的农业生产到商业机构和家庭厨房的食品加工、制造和制备。良好的卫生习惯减少了沙门氏菌对食物的污染，但不能保证产品中不含沙门氏菌。在家中对沙门氏菌采取的预防措施类似于对其他食源性细菌采取的措施。基本的食品卫生习惯，例如"煮熟"，被推荐作为针对沙门氏菌病的预防措施，参见
[0004]www.who.int/mediacentre/factsheets/fs139/en/。
[0005]抗微生物疗法可用于治疗感染沙门氏菌的人或动物。然而，抗微生物剂的耐药性是全球公共健康关注的问题，并且沙门氏菌是已经出现了一些耐药血清型并影响食物链的微生物的一种。
[0006]上述预防或治疗沙门氏菌感染或减少沙门氏菌污染的大多数方法是基本上不依赖于特定的病原菌或沙门氏菌的特定血清型的方法。这样做的好处是，在采取应对措施之前，对所涉及的特定沙门氏菌菌株或肠道沙门氏菌血清型几乎没有必要事先了解。然而，上述预防沙门氏菌感染或减少沙门氏菌污染的方法，例如加热，并不总是适用的，或者以不希望的方式改变了处理的商品或食品。其他方法可能对特定患者无效。因此，需要预防或治疗沙门氏菌感染或污染，或减少或预防沙门氏菌，特别是肠道沙门氏菌肠道亚种对目标物的污染的另外方法。
[0007]之前描述了一些对沙门氏菌有活性的蛋白(WO 2018/172065)，它们被称为“沙门菌素”。虽然WO 2018/172065中描述的沙门菌素对沙门氏菌物种和菌株显示出高活性，但局限性在于它们的毒性活性相似，即使将一些不同的已知沙门菌素组合在一起，其活性谱也受到限制。此外，中期或长期使用相同或相似沙门菌素类型可能选择出对所用沙门菌素具有抗性的沙门氏菌菌株。因此，非常需要通过其他机制起作用的其他沙门菌素。值得注意的是，期望包含两种或更多种不同类型沙门菌素的组合物来拓宽针对许多不同沙门氏菌物种
的活性范围。
[0008]对于用于技术应用的蛋白，易于生产、纯化和储存是重要的方面，其可以决定技术应用是否可行。
[0009]本专利技术的目的是提供预防或治疗沙门氏菌感染(如食源性沙门氏菌感染)的方法。另一个目的是提供预防或减少沙门氏菌对目标物(特别是食物)的污染的方法。本专利技术的另一个目的是提供预防或治疗沙门氏菌感染的方法和/或减少沙门氏菌对目标物污染的方法，所述方法对大范围的沙门氏菌血清群有效。另一个目的是提供更多的沙门菌素，它们通过不同的或另外的抗沙门氏菌的机制起作用。本专利技术的另一个目的是提供抗沙门氏菌的活性剂，其可以方便地以高稳定性生产和/或纯化和/或储存。此外，用于这些方法的化合物、试剂和组合物是期望的。

技术实现思路

[0010]因此，本专利技术提供了权利要求中定义的保护主题。本专利技术还提供了：
[0011](1)一种优选能够对沙门氏菌产生细胞毒性作用的蛋白，所述蛋白包含至少任何一个下列氨基酸序列区段(a
‑
i)至(a
‑
x)或(b
‑
i)至(b
‑
x)、(c
‑
i)至(c
‑
x)或(d
‑
i)至(d
‑
x)中所定义的其衍生物：
[0012](a
‑
i)来自ScolE2(SEQ ID NO:1)的氨基酸残基316至449的区段，
[0013](a
‑
ii)来自ScolE3(SEQ ID NO:2)的氨基酸残基315至483的区段，
[0014](a
‑
iii)来自ScolE7(SEQ ID NO:3)的氨基酸残基318至451的区段，
[0015](a
‑
iv)来自ScolE1a(SEQ ID NO:4)的氨基酸残基174至297的区段，
[0016](a
‑
v)来自ScolE1b(SEQ ID NO:5)的氨基酸残基198至322的区段，
[0017](a
‑
vi)包含SEQ ID NO:6的Spst的至少200个连续氨基酸残基的区段；
[0018](a
‑
vii)来自ScolE1c(SEQ ID NO:25)的氨基酸残基195至319的区段，
[0019](a
‑
viii)来自ScolE1d(SEQ ID NO:26)的氨基酸残基195至319的区段，
[0020](a
‑
ix)来自ScolE1e(SEQ ID NO:27)的氨基酸残基193至317的区段，
[0021](a
‑
x)来自ScolMa(SEQ ID NO:28)的氨基酸残基38至138的区段，
[0022](a
‑
xi)来自ScolMb(SEQ ID NO:33)的氨基酸残基38至138的区段，或
[0023](a
‑
xii)来自ScolMc(SEQ ID NO:34)的氨基酸残基38至138的区段；或
[0024](b
‑
i)与来自ScolE2(SEQ ID NO:1)的氨基酸残基316至449的区段具有至少75％序列同一性的区段，
[0025](b
‑
ii)与来自ScolE3(SEQ ID NO:2)的氨基酸残基315至483的区段具有至少70％序列同一性的区段，
[0026](b
‑
iii)与来自ScolE7(SEQ ID NO:3)的氨基酸残基318至451的区段具有至少77％序列同一性的区段，
[0027](b
‑
iv)与来自ScolE1a(SEQ ID NO:4)的氨基酸残基174至297的区段具有本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】1.一种蛋白，其包含至少一个以下氨基酸序列区段：(a
‑
vii)来自ScolE1c(SEQ ID NO:25)的氨基酸残基195至319的区段，(a
‑
viii)来自ScolE1d(SEQ ID NO:26)的氨基酸残基195至319的区段，(a
‑
ix)来自ScolE1e(SEQ ID NO:27)的氨基酸残基193至317的区段，(a
‑
x)来自ScolMa(SEQ ID NO:28)的氨基酸残基38至138的区段，(a
‑
xi)来自ScolMb(SEQ ID NO:33)的氨基酸残基38至138的区段，或(a
‑
xii)来自ScolMc(SEQ ID NO:34)的氨基酸残基38至138的区段；或(b
‑
vii)与来自ScolE1c(SEQ ID NO:25)的氨基酸残基195至319的区段具有至少70％序列同一性的区段，(b
‑
viii)与来自ScolE1d(SEQ ID NO:26)的氨基酸残基195至319的区段具有至少70％序列同一性的区段，(b
‑
ix)与来自ScolE1e(SEQ ID NO:27)的氨基酸残基193至317的区段具有至少70％序列同一性的区段，(b
‑
x)与来自ScolMa(SEQ ID NO:28)的氨基酸残基38至138的区段具有至少70％序列同一性的区段，(b
‑
xi)与来自ScolMb(SEQ ID NO:33)的氨基酸残基38至138的区段具有至少70％序列同一性的区段，或(b
‑
xii)与来自ScolMc(SEQ ID NO:34)的氨基酸残基38至138的区段具有至少70％序列同一性的区段；或或(c
‑
vii)与来自ScolE1c(SEQ ID NO:25)的氨基酸残基195至319的区段具有至少80％序列相似性的区段，(c
‑
viii)与来自ScolE1d(SEQ ID NO:26)的氨基酸残基195至319的区段具有至少80％序列相似性的区段，(c
‑
ix)与来自ScolE1e(SEQ ID NO:27)的氨基酸残基193至317的区段具有至少80％序列相似性的区段，(c
‑
x)与来自ScolMa(SEQ ID NO:28)的氨基酸残基38至138的区段具有至少80％序列相似性的区段，(c
‑
xi)与来自ScolMb(SEQ ID NO:33)的氨基酸残基38至138的区段具有至少80％序列相似性的区段，或(c
‑
xii)与来自ScolMc(SEQ ID NO:34)的氨基酸残基38至138的区段具有至少80％序列相似性的区段；或(d
‑
vii)与来自ScolE1c(SEQ ID NO:25)的氨基酸残基195至319的区段相比具有1至40个氨基酸取代、添加、插入或缺失的区段，(d
‑
viii)与来自ScolE1d(SEQ ID NO:26)的氨基酸残基195至319的区段相比具有1至40个氨基酸取代、添加、插入或缺失的区段，
(d
‑
ix)与来自ScolE1e(SEQ ID NO:27)的氨基酸残基193至317的区段相比具有1至40个氨基酸取代、添加、插入或缺失的区段，(d
‑
x)与来自ScolMa(SEQ ID NO:28)的氨基酸残基38至138的区段相比具有1至30个氨基酸取代、添加、插入或缺失的区段，(d
‑
xi)与来自ScolMb(SEQ ID NO:33)的氨基酸残基38至138的区段相比具有1至30个氨基酸取代、添加、插入或缺失的区段，或(d
‑
xii)与来自ScolMc(SEQ ID NO:34)的氨基酸残基38至138的区段相比具有1至30个氨基酸取代、添加、插入或缺失的区段。2.根据权利要求1所述的蛋白，其还包含具有以下活性中的任何一种或多种的细胞毒性或催化结构域：膜孔形成活性、DNA酶活性、RNA酶活性或细胞壁降解活性。3.根据权利要求1所述的蛋白，其包含含有任何一个以下氨基酸序列区段的细胞毒性或催化结构域：(a
‑
vii)
’
来自ScolE1c(SEQ ID NO:25)的氨基酸残基347至519的区段，(a
‑
viii)
’
来自ScolE1d(SEQ ID NO:26)的氨基酸残基347至519的区段，(a
‑
ix)
’
来自ScolE1e(SEQ ID NO:27)的氨基酸残基345至517的区段，(a
‑
x)
’
来自ScolMa(SEQ ID NO:28)的氨基酸残基139至269的区段，(a
‑
xi)
’
来自ScolMb(SEQ ID NO:33)的氨基酸残基139至269的区段，或(a
‑
xii)
’
来自ScolMc(SEQ ID NO:34)的氨基酸残基139至269的区段；或(b
‑
vii)
’
与来自ScolE1c(SEQ ID NO:25)的氨基酸残基347至519的区段具有至少70％序列同一性的区段，(b
‑
viii)
’
与来自ScolE1d(SEQ ID NO:26)的氨基酸残基347至519的区段具有至少70％序列同一性的区段，(b
‑
ix)
’
与来自ScolE1e(SEQ ID NO:27)的氨基酸残基345至517的区段具有至少70％序列同一性的区段，(b
‑
x)
’
与来自ScolMa(SEQ ID NO:28)的氨基酸残基139至269的区段具有至少70％序列同一性的区段，(b
‑
xi)
’
与来自ScolMb(SEQ ID NO:33)的氨基酸残基139至269的区段具有至少70％序列同一性的区段，或(b
‑
xii)
’
与来自ScolMc(SEQ ID NO:34)的氨基酸残基139至269的区段具有至少70％序列同一性的区段；或(c
‑
vii)
’
与来自ScolE1c(SEQ ID NO:25)的氨基酸残基347至519的区段具有至少80％序列相似性的区段，(c
‑
viii)
’
与来自ScolE1d(SEQ ID NO:26)的氨基酸残基347至519的区段具有至少80％序列相似性的区段，(c
‑
ix)
’
与来自ScolE1e(SEQ ID NO:27)的氨基酸残基345至517的区段具有至少80％序列相似性的区段，
(c
‑
x)
’
与来自ScolMa(SEQ ID NO:28)的氨基酸残基139至269的区段具有至少80％序列相似性的区段，(c
‑
xi)
’
与来自ScolMb(SEQ ID NO:33)的氨基酸残基139至269的区段具有至少80％序列相似性的区段，或(c
‑
xii)
’
与来自ScolMc(SEQ ID NO:34)的氨基酸残基139至269的区段具有至少80％序列相似性的区段；或(d
‑
vii)
’
与来自ScolE1c(SEQ ID NO:25)的氨基酸残基347至519的区段相比具有1至40个氨基酸取代、添加、插入或缺失的区段，(d
‑
viii)
’
与来自ScolE1d(SEQ ID NO:26)的氨基酸残基347至519的区段相比具有1至40个氨基酸取代、添加、插入或缺失的区段，(d
‑
ix)
’
与来自ScolE1e(SEQ ID NO:27)的氨基酸残基345至517的区段相比具有1至40个氨基酸取代、添加、插入或缺失的区段，(d
‑
x)
’
与来自ScolMa(SEQ ID NO:28)的氨基酸残基139至269的区段相比具有1至30个氨基酸取代、添加、插入或缺失的区段，(d
‑
xi)
’
与来自ScolMb(SEQ ID NO:33)的氨基酸残基139至269的区段相比具有1至30个氨基酸取代、添加、插入或缺失的区段，或(d
‑
xii)
’
与来自ScolMc(SEQ ID NO:34)的氨基酸残基139至269的区段相比具有1至30个氨基酸取代、添加、插入或缺失的区段。4.一种蛋白，其包含任何一个以下氨基酸序列或由其组成：(A
‑
vii)SEQ ID NO:25，(A
‑
viii)SEQ ID NO:26，(A
‑
ix)SEQ ID NO:27，(A
‑
x)SEQ ID NO:28，(A
‑
xi)SEQ ID NO:33，或(A
‑
xii)SEQ ID NO:34；或(B
‑
vii)与SEQ ID NO:25的氨基酸序列具有至少70％序列同一性的氨基酸序列，(B
‑
viii)与SEQ ID NO:26的氨基酸序列具有至少70％序列同一性的氨基酸序列，(B
‑
ix)与SEQ ID NO:27的氨基酸序列具有至少70％序列同一性的氨基酸序列，(B
‑
x)与SEQ ID NO:28的氨基酸序列具有至少70％序列同一性的氨基酸序列，(B
‑
xi)与SEQ ID NO:33的氨基酸序列具有至少70％序列同一性的氨基酸序列，或(B
‑
xii)与SEQ ID NO:34的氨基酸序列具有至少70％序列同一性的氨基酸序列；或(C
‑
vii)与SEQ ID NO:25的氨基酸序列具有至少80％序列相似性的氨基酸序列，(C
‑
viii)与SEQ ID NO:26的氨基酸序列具有至少80％序列相似性的氨基酸序列，(C
‑
ix)与SEQ ID NO:27的氨基酸序列具有至少80％序列相似性的氨基酸序列，(C
‑
x)与SEQ ID NO:28的氨基酸序列具有至少80％序列相似性的氨基酸序列，(C
‑
xi)与SEQ ID NO:33的氨基酸序列具有至少80％序列相似性的氨基酸序列，或
(C
‑
xii)与SEQ ID NO:34的氨基酸序列具有至少80％序列相似性的氨基酸序列；或(D
‑
vii)与SEQ ID NO:25的氨基酸序列相比具有1至40个氨基酸取代、添加、插入或缺失的氨基酸序列，(D
‑
viii)与SEQ ID NO:26的氨基酸序列相比具有1至40个氨基酸取代、添加、插入或缺失的氨基酸序列，(D
‑
ix)与SEQ ID NO:27的氨基酸序列相比具有1至40个氨基酸取代、添加、插入或缺失的氨基酸序列，或(D
‑
x)与SEQ ID NO:28的氨基酸序列相比具有1至40个氨基酸取代、添加、插入或缺失的氨基酸序列，(D
‑
xi)与SEQ ID NO:33的氨基酸序列相比具有1至40个氨基酸取代、添加、插入或缺失的氨基酸序列，或(D
‑
xii)与SEQ ID NO:34的氨基酸序列相比具有1至40个氨基酸取代、添加、插入或缺失的氨基酸序列；或(E
‑
vii)包含SEQ ID NO:25的至少425个连续氨基酸残基或由其组成的氨基酸序列，(E
‑
viii)包含SEQ ID NO:26的至少425个连续氨基酸残基或由其组成的氨基酸序列，(E
‑
ix)包含SEQ ID NO:27的至少425个连续氨基酸残基或由其组成的氨基酸序列，(E
‑
x)包含SEQ ID NO:28的至少215个连续氨基酸残基或由其组成的氨基酸序列，(E
‑
xi)包含SEQ ID NO:33的至少215个连续氨基酸残基或由其组成的氨基酸序列，或(E
‑
xii)包含SEQ ID NO:34的至少215个连续氨基酸残基或由其组成的氨基酸序列。5.根据权利要求1至4任一项所述的蛋白，其中所述蛋白是以下项中的蛋白：
‑
(a
‑
vii)、(b
‑
vii)、(c
‑
vii)或(d
‑
vii)，或
‑
(A
‑
vii)、(B
‑
vii)、(C
‑
vii)、(D
‑
vii)或(E
‑
vii)；或其中所述蛋白是以下项中的蛋白：
‑
(a
‑
viii)、(b
‑
viii)、(c
‑
viii)或(d
‑
viii)，或
‑
(A
‑
viii)、(B
‑
viii)、(C
‑
viii)、(D
‑
viii)或(E
‑
viii)；或其中所述蛋白是以下项中的蛋白：
‑
(a
‑
x)、(b
‑
x)、(c
‑
x)或(d
‑
x)，或
‑
(A
‑
x)、(B
‑
x)、(C
‑
x)、(D
‑
x)或(E
‑
x)；或其中所述蛋白是以下项中的蛋白：
‑
(a
‑
xi)、(b
‑
xi)、(c
‑
xi)或(d
‑
xi)，或
‑
(A
‑
xi)、(B
‑
xi)、(C
‑
xi)、(D
‑
xi)或(E
‑
xi)；或其中所述蛋白是以下项中的蛋白：
‑
(a
‑
xii)、(b
‑
xii)、(c
‑
xii)或(d
‑
xii)，或
‑
(A
‑
xii)、(B
‑
xii)、(C
‑
xii)、(D
‑
xii)或(E
‑
xii)。6.根据权利要求1至3任一项所述的蛋白，其中所述蛋白如(b
‑
x)、(c
‑
x)、(d
‑
x)、(b
‑
xi)、(c
‑
xi)、(d
‑
...

【专利技术属性】
技术研发人员：S，
申请(专利权)人：诺麦生物科学有限公司，
类型：发明
国别省市：