一种GP32蛋白突变体、重组载体及其构建方法和应用技术

技术编号:32809476 阅读:16 留言:0更新日期:2022-03-26 20:03
本发明专利技术公开了一种GP32蛋白突变体、重组载体及其构建方法和应用,涉及基因工程技术领域,本发明专利技术构建了一种GP32蛋白突变体,相对于其他GP32蛋白而言,该突变体结合单链DNA的效率更高,可更有效地促进限制性内切酶的水解效果、提高RT

【技术实现步骤摘要】
一种GP32蛋白突变体、重组载体及其构建方法和应用


[0001]本专利技术涉及基因工程
,具体而言,涉及一种GP32蛋白突变体、重组载体及其构建方法和应用。

技术介绍

[0002]单链结合蛋白(SSB,single strand DNA

binding protein):又称DNA结合蛋白,是DNA复制所必须的。单链结合蛋白不属于酶,大肠杆菌细胞中的单链结合蛋白由4个相同的亚基组成,相对分子质量为74000,结合单链DNA的跨度约32个核苷酸单位;DNA解旋后,DNA分子只要碱基配对,就有结合成双链的趋向。SSB结合于螺旋酶沿复制叉方向向前推进产生的单链区,防止新形成的单链DNA重新配对形成双链DNA或被核酸酶降解的蛋白质。ssb作用时表现协同效应,保证SSB在下游区段的继续结合。它不像聚合酶那样沿着复制方向向前移动,而是不停的结合,脱离。在实际应用中,gp32单链结合蛋白提升限制性内切酶的水解效果、增强T4DNA聚合酶的活性和提高PCR的产量、提高RT

PCR中反转录的效率。来自大肠杆菌的单链结合蛋白已用于体外RNA/单链结合蛋白(SSB)复合物形成试验以及蛋白质纯化,用于测定整合子attC位点的完整性和功能性。对单链DNA的高特异性结合。可用于提高PCR的特异性,启动有问题的DNA模板测序。
[0003]随着RPA技术的推广,目前T4GP32在使用中的结合效率成为了关注点,现有的GP32单链结合蛋白虽然具备结合活性,但是结合效率不高,且工业化生产中GP32单链结合蛋白单位菌体的表达量较低,纯度不够高,这也使得其在RPA中的使用效果相对较差。
[0004]鉴于此,特提出本专利技术。

技术实现思路

[0005]本专利技术的目的在于提供一种GP32蛋白突变体及其应用。
[0006]本专利技术是这样实现的:
[0007]第一方面,本专利技术实施例提供了一种GP32蛋白突变体,所述突变体的氨基酸序列如SEQ ID No.1所示。
[0008]第二方面,本专利技术实施例提供了一种分离的核酸,其包括编码如前述实施例所述的GP32蛋白突变体的核酸序列。
[0009]第三方面,本专利技术实施例提供了一种重组载体,其含有如前述实施例所述的分离的核酸。
[0010]第四方面,本专利技术实施例提供了一种重组载体的构建方法,其包括:将所述分离的核酸或其表达盒插入载体中构建获得。
[0011]第五方面,本专利技术实施例提供了一种基因工程菌,其含有如前述实施例所述的重组载体。
[0012]第六方面,本专利技术实施例提供了如前述实施例所述的GP32蛋白突变体的制备方法,其包括培养如前述实施例所述的基因工程菌,以诱导表达GP32蛋白突变体。
[0013]第七方面,本专利技术实施例提供了如前述实施例所述的GP32蛋白突变体在核酸扩增中的应用,所述核酸扩增不以疾病的诊断或治疗为直接目的。
[0014]本专利技术具有以下有益效果:
[0015]本专利技术构建了一种GP32蛋白突变体,相对于其他GP32蛋白而言,该突变体结合单链DNA的效率更高,可更有效地促进限制性内切酶的水解效果、提高RT

PCR中反转录的效率、增强T4 DNA聚合酶的活性以及提高PCR的产量,在RPA中应用效率极佳。
[0016]此外,本专利技术还提供了GP32蛋白突变体的表达载体的构建以及蛋白的纯化,克服了现有工业化生产中GP32蛋白菌体表达量较低、纯度不高的技术问题,实现了表达载体在宿主细胞中的高表达,提高了GP32蛋白的得率,为GP32蛋白的研究、应用提供了途径。
附图说明
[0017]为了更清楚地说明本专利技术实施例的技术方案,下面将对实施例中所需要使用的附图作简单地介绍,应当理解,以下附图仅示出了本专利技术的某些实施例,因此不应被看作是对范围的限定,对于本领域普通技术人员来讲,在不付出创造性劳动的前提下,还可以根据这些附图获得其他相关的附图。
[0018]图1为GP32单链结合功能的区域第27~241位氨基酸对应的三维结构;
[0019]图2为GP32蛋白突变体的纯化质控结果;
[0020]图3为GP32蛋白突变体在普通PCR中的应用效果;
[0021]图4为GP32蛋白突变体在qPCR中的应用效果。
具体实施方式
[0022]为使本专利技术实施例的目的、技术方案和优点更加清楚,下面将对本专利技术实施例中的技术方案进行清楚、完整地描述。实施例中未注明具体条件者,按照常规条件或制造商建议的条件进行。所用试剂或仪器未注明生产厂商者,均为可以通过市售购买获得的常规产品。
[0023]本专利技术实施例提供了一种GP32蛋白突变体,所述突变体的氨基酸序列如SEQ ID No.1所示:
[0024]MFKRKSTADLAAQMAKLNGNKGFSSEDKGEWKLKLDASGNGQAVIRFLPAKTDDALPFAILVNHGFKKNGKWYIETCSSTHGDYDSCPVCQYISKNDLYNTNNEGKVFKYRFGKKIWDKINAMIAVDTEMGETPVDVTCPWEGANFVLKVKQVSGFSNYDESKFLNQSAIPNIDDESFQKELFEQMVDLSEMTSKDKFKSFEELNTKFNQVLGTAALGGAAAAAASVADKVASDLDDFDKDMEAFS。
[0025]野生型的氨基酸序列为:MFKRKSTADLAAQMAKLNGNKGFSSEDKGEWKLKLDASGNGQAVIRFLPAKTDDALPFAILVNHGFKKNGKWYIETCSSTHGDYDSCPVCQYISKNDLYNTNNEGKVFKYRFGKKIWDKINAMIAVDTEMGETPVDVTCPWEGANFVLKVKQVSGFSNYDESKFLNQSAIPNIDDESFQKELFEQMVDLSEMTSKDKFKSFEELNTKFNQVLGTAALGGAAAAAASVADKVASDLDDFDKDMEAFSSAKTEDDFMSSSSSDDGDLDDLLAGL。
[0026]本专利技术通过一系列创造性劳动,分析对比了不同来源的GP32结构上的差异性,结合蛋白的三维结构分析,进行了GP32原始序列C端氨基酸序列(247~272)段的敲除,从而获得了有着高效ssDNA结合效率的GP32蛋白突变体。该突变体的单链结合功能区域为27~241段,三维结构见图1。
[0027]本专利技术实施例还提供了一种分离的核酸,其包括编码如前述实施例所述的GP32蛋白突变体的核酸序列。
[0028]优选地,其序列如SEQ ID No.2所示(5
’‑3’
):
[0029]atgtttaaacgtaagtctactgctgatttagccgcacaaatggcgaaattgaatggtaacaagggcttctcctcagaagacaaaggagagtggaagcttaaactcgatgcttcggggaatggt本文档来自技高网
...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种GP32蛋白突变体,其特征在于,所述突变体的氨基酸序列如SEQ ID No.1所示。2.一种分离的核酸,其特征在于,其包括编码如权利要求1所述的GP32蛋白突变体的核酸序列。3.根据权利要求2所述的分离的核酸,其特征在于,其序列如SEQ ID No.2所示。4.一种重组载体,其特征在于,其含有如权利要求2或3所述的分离的核酸。5.根据权利要求4所述的重组载体,其特征在于,所述重组载体是以pET系列为框架基础构建获得的;优选地,所述pET系列包括pET22

b质粒和pET32

a质粒中的任意一种。6.如权利要求4或5所述的重组载体的构建方法,其特征在于,其包括:将所述分离的核酸或其表达盒插入载体中构建获得。7.根据权利要求6所述的构建方法,其特征在于,将所述分离的核酸或其表达盒插入载体的步骤包括:对所述载体进行线性化处理,获得线性化载体;将线性化载体与所述分离的核酸或其表达盒进行重组,获得重组载体;优选地,将线性化载体与所述分离的核酸进行重组的步骤包括:采用引物对,以如权利要求1所述的GP32蛋白突变体基因为模板进行扩增;将线性化载体与扩增后的产物混合重组,获得重组载体;优选地,所述引物对的上游引物和下游引物的序列依次如SEQ ID No.3~4所示;优选地,所述载体选自质粒、噬菌体和病毒载体中的任意一种;优选地,所述质粒为pET22

b质粒,所述线性化载体为将pET22

b质粒进行XhoI和XbaI双酶切后的产物。8.一种基因工程菌,其特征在于,其含有如权利要求4或5所述的重组载体。9.如权利要求1所述的GP32蛋白突变体的制备方法,其特征在于,其包括培养如权利要求8所述的基因工程菌,以诱导表达GP32蛋白突变体;优选地...

【专利技术属性】
技术研发人员:刁含文
申请(专利权)人:南京巨匠生物科技有限公司
类型:发明
国别省市:

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