一种用于质谱流式数据挖掘的网络分析方法技术

本发明专利技术公开了一种用于质谱流式数据挖掘的网络分析方法，涉及数据分析模型技术领域。开发样本分组和细胞簇之间的直接关联网络(Sample Classification and direct Association Network of Cell types，SCANCell)分析方法，将隐藏在高维质谱流式数据中的可用信息转化为细胞簇之间的直接关联(direct association,DA)网络的拓扑结构。DA网络表征了免疫细胞簇间直接交互作用的强度，排除了间接干扰的分布，使得SCANCell能够在DA网络拓扑结构层面上定量识别疾病特异性异常交互模式。SCANCell通过考虑细胞的蛋白表达量和细胞簇的丰度，为疾病的发病机制提供新的理解维度。本发明专利技术深入挖掘高维蛋白质组数据，更好地理解疾病特异性细胞和分子畸变；是首次以细胞簇间交互作用的角度描绘疾病发病机制的探索性研究，可促进潜在药物靶点的识别。可促进潜在药物靶点的识别。可促进潜在药物靶点的识别。

【技术实现步骤摘要】
一种用于质谱流式数据挖掘的网络分析方法


[0001]本专利技术涉及数据分析模型
，尤其涉及一种用于质谱流式数据挖掘的网络分析方法。

技术介绍

[0002]系统性红斑狼疮(Systemic lupus erythematosus，SLE)是一种系统性自身免疫性疾病，可引起皮肤、关节、肾脏和中枢神经系统等多器官损害。疾病的发病模式非常多变，包括皮肤科、肾脏科、神经科、血液科或风湿科，这使得准确诊断和临床治疗面临挑战。尽管存在这些挑战，但对SLE发病机制的认识进展有利于临床患者的治疗。
[0003]系统性红斑狼疮发病机制的研究进展强调了I型干扰素(IFN)和多种免疫细胞类型对自身抗体产生和组织损伤的贡献。慢性IFN的产生及其对免疫系统激活的影响已成为SLE的核心机制。IFN是由Toll样受体(TLRs)介导的先天性浆细胞树突状细胞(pDCs)激活后产生的。B细胞和T细胞免疫反应的过度激活以及对自身抗原的免疫耐受性的丧失也是SLE发病的原因之一。T滤泡辅助细胞可以促进产生自身抗体的B细胞分化。调节性T(Treg)细胞可以抑制免疫反应和维持本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种用于质谱流式数据挖掘的网络分析方法，其特征在于，样本分组和细胞簇间DA网络的构建。2.如权利要求1所述的用于质谱流式数据挖掘的网络分析方法，其特征在于，利用从样本中提取的特征将所有样本分为不同的子组，并为每个子组构建所有细胞簇的DA网络。3.如权利要求1所述的用于质谱流式数据挖掘的网络分析方法，其特征在于，将所有样本的细胞划分为不同的细胞簇，同时提取簇中相应的细胞丰度直方图作为每个样本的特征。4.如权利要求1所述的用于质谱流式数据挖掘的网络分析方法，其特征在于，利用部分互信息量化细胞簇间的交互作用强度。5.如权利要求2所述的用于质谱流式数据挖掘的网络分析方法，其特征在于，所述DA网络，每个节点代表一个细胞簇，每条边表示两个细胞簇之间的交互作用，边的权重表示交互强度。6.如权利要求2所述的用于质谱流式数据挖掘的网络分析方法，其特征在于，所述DA网络由Cytoscape软件可视化。7.如权利要求1所述的用于质谱流式数据挖掘的网络分析方法，其特征在于，包括如下步骤：步骤1、细胞聚类；步骤2、样本分组；步骤3、DA网络的构建。8.如权利要求7所述的用于质谱流式数据挖掘的网络分析方法，其特征在于，所述步骤1包括如下步骤：步骤1.1、所有的SLE数据都被一个反双曲正弦(arcs...

【专利技术属性】
技术研发人员：丁显廷，刘晓，张璐璐，朱大为，
申请(专利权)人：上海交通大学，
类型：发明
国别省市：