假阳性样本的排除方法、装置以及电子设备制造方法及图纸

本申请提供了一种假阳性样本的排除方法、装置以及电子设备，涉及数据检测技术领域，包括：获取未知样本的扩增数据，通过聚类方法从未知样本的扩增数据中确定明显扩增样本，计算明显扩增样本的多个循环信号的标准差、明显扩增样本的最大扩增高度以及最大扩增高度对应的Ct

【技术实现步骤摘要】
假阳性样本的排除方法、装置以及电子设备


[0001]本申请涉及数据检测
，尤其是涉及一种假阳性样本的排除方法、装置以及电子设备。

技术介绍

[0002]目前，诊断传染病标准的核酸定量方法多采用荧光实时定量PCR，能够量化样品模板的初始值，常被用在基因分析表达、转基因食物检测和癌症检测中。
[0003]但是，目前实际的PCR扩增曲线是较为多样的，即使是同一次扩增实验，各孔位的扩增曲线也相差很大，而且，现有的方法都无法较为精确的消除不明显扩增曲线样本的分析结果差异，目前排除假阳性样本的精确度较低，难以从总体上对所有扩增孔位进行考察。

技术实现思路

[0004]本专利技术的目的在于提供一种假阳性样本的排除方法、装置以及电子设备，以缓解目前排除假阳性样本的精确度较低的技术问题。
[0005]第一方面，本申请实施例提供了一种假阳性样本的排除方法，所述方法包括：
[0006]获取未知样本的扩增数据；
[0007]通过聚类方法从所述未知样本的扩增数据中确定明显扩增样本；
[0008]计算所述明显扩增样本的多个循环信号的标准差、所述明显扩增样本的最大扩增高度以及所述最大扩增高度对应的Ct
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max值；
[0009]基于所述标准差、所述最大扩增高度以及所述Ct
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max值，排除所述未知样本中的假阳性样本。
[0010]结合第一方面，本专利技术实施例提供了第一方面的第一种可能的实施方式，其中，所述计算所述明显扩增样本的多个循环信号的标准差、所述明显扩增样本的最大扩增高度以及所述最大扩增高度对应的Ct
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max值的步骤，包括：
[0011]计算所述明显扩增样本的多个循环信号的标准差；
[0012]根据多倍所述标准差的位置，得到所述明显扩增样本的Ct值，并基于所述Ct值查找所述明显扩增样本的最大扩增高度以及所述最大扩增高度对应的Ct
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max值。
[0013]结合第一方面，本专利技术实施例提供了第一方面的第二种可能的实施方式，其中，所述基于所述标准差、所述最大扩增高度以及所述Ct
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max值，排除所述未知样本中的假阳性样本的步骤，包括：
[0014]计算所述标准差的平均值；
[0015]根据所述平均值排除所述未知样本中的假阳性样本，并基于所述最大扩增高度以及所述Ct
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max值排除所述未知样本中的假阳性样本。
[0016]结合第一方面，本专利技术实施例提供了第一方面的第三种可能的实施方式，其中，多倍所述标准差的位置中的倍数为10倍；
[0017]所述根据所述平均值排除所述未知样本中的假阳性样本的步骤，包括：
[0018]在除所述明显扩增样本以外的样本的最大扩增高度小于10倍平均标准差时，将所述扩增数据中的扩增曲线置为0，以排除所述未知样本中的假阳性样本。
[0019]结合第一方面，本专利技术实施例提供了第一方面的第四种可能的实施方式，其中，所述基于所述最大扩增高度以及所述Ct
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max值排除所述未知样本中的假阳性的步骤，包括：
[0020]在除所述明显扩增样本以外的样本的最大扩增高度小于所述明显扩增样本的最大扩增高度的1/5，且除所述明显扩增样本以外的样本的Ct值小于所述Ct
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max值时，将所述扩增数据中的扩增曲线置为0，以排除所述未知样本中的假阳性样本。
[0021]结合第一方面，本专利技术实施例提供了第一方面的第五种可能的实施方式，其中，所述扩增数据为PCR扩增数据；
[0022]所述假阳性样本为PCR假阳性样本。
[0023]结合第一方面，本专利技术实施例提供了第一方面的第六种可能的实施方式，其中，所述聚类方法为K
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means聚类方法。
[0024]第二方面，本专利技术实施例提供了一种假阳性样本的排除装置，包括：
[0025]获取模块，用于获取未知样本的扩增数据；
[0026]确定模块，用于通过聚类方法从所述未知样本的扩增数据中确定明显扩增样本；
[0027]计算模块，用于计算所述明显扩增样本的多个循环信号的标准差、所述明显扩增样本的最大扩增高度以及所述最大扩增高度对应的Ct
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max值；
[0028]排除模块，用于基于所述标准差、所述最大扩增高度以及所述Ct
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max值，排除所述未知样本中的假阳性样本。
[0029]第三方面，本专利技术实施例还提供一种电子设备，包括存储器、处理器，所述存储器中存储有可在所述处理器上运行的计算机程序，所述处理器执行所述计算机程序时实现上述第一方面所述的方法的步骤。
[0030]第四方面，本专利技术实施例还提供一种计算机可读存储介质，所述计算机可读存储介质存储有计算机可运行指令，所述计算机可运行指令在被处理器调用和运行时，所述计算机可运行指令促使所述处理器运行上述第一方面所述的方法。
[0031]本申请实施例带来了以下有益效果：
[0032]本申请实施例提供的一种假阳性样本的排除方法、装置以及电子设备，包括：首先获取未知样本的扩增数据，然后再通过聚类方法从未知样本的扩增数据中确定明显扩增样本，之后计算明显扩增样本的多个循环信号的标准差、明显扩增样本的最大扩增高度以及最大扩增高度对应的Ct
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max值，最后在基于标准差、最大扩增高度以及所Ct
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max值，从而排除未知样本中的假阳性样本，本方案中，通过聚类方法从未知样本的扩增数据，能够确定明显扩增样本，再者，计算明显扩增样本的多个循环信号的标准差、明显扩增样本的最大扩增高度以及最大扩增高度对应的Ct
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max值，实现了最后根据标准差、最大扩增高度以及所Ct
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max值，排除未知样本中的假阳性样本，缓解了目前排除假阳性样本的精确度较低的技术问题。
附图说明
[0033]为了更清楚地说明本申请具体实施方式或现有技术中的技术方案，下面将对具体实施方式或现有技术描述中所需要使用的附图作简单地介绍，显而易见地，下面描述中的
附图是本申请的一些实施方式，对于本领域普通技术人员来讲，在不付出创造性劳动的前提下，还可以根据这些附图获得其他的附图。
[0034]图1为本申请实施例提供的一种假阳性样本的排除方法的流程示意图；
[0035]图2为本申请实施例提供的一种假阳性样本的排除方法的另一流程示意图；
[0036]图3(a)和图3(b)为本申请实施例提供的一种假阳性样本的排除方法中PCR检测系统4个孔位的原始扩增数据示意图；
[0037]图4(a)和图4(b)为本申请实施例提供的一种假阳性样本的排除方法中PCR检测系统4个孔位的分析结果示意图；
[0038]图5为本申请实施例提供的一种假阳性样本的排除装置的结构示意图；
[0039]图6为示出了本申请实施例本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种假阳性样本的排除方法，其特征在于，所述方法包括：获取未知样本的扩增数据；通过聚类方法从所述未知样本的扩增数据中确定明显扩增样本；计算所述明显扩增样本的多个循环信号的标准差、所述明显扩增样本的最大扩增高度以及所述最大扩增高度对应的Ct
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max值；基于所述标准差、所述最大扩增高度以及所述Ct
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max值，排除所述未知样本中的假阳性样本。2.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述计算所述明显扩增样本的多个循环信号的标准差、所述明显扩增样本的最大扩增高度以及所述最大扩增高度对应的Ct
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max值的步骤，包括：计算所述明显扩增样本的多个循环信号的标准差；根据多倍所述标准差的位置，得到所述明显扩增样本的Ct值，并基于所述Ct值查找所述明显扩增样本的最大扩增高度以及所述最大扩增高度对应的Ct
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max值。3.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述基于所述标准差、所述最大扩增高度以及所述Ct
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max值，排除所述未知样本中的假阳性样本的步骤，包括：计算所述标准差的平均值；根据所述平均值排除所述未知样本中的假阳性样本，并基于所述最大扩增高度以及所述Ct
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max值排除所述未知样本中的假阳性样本。4.根据权利要求3所述的方法，其特征在于，多倍所述标准差的位置中的倍数为10倍；所述根据所述平均值排除所述未知样本中的假阳性样本的步骤，包括：在除所述明显扩增样本以外的样本的最大扩增高度小于10倍平均标准差时，将所述扩增数据中的扩增曲线置为0，以排除所述未知样本中的假阳性样本。5.根据权利要...

【专利技术属性】
技术研发人员：李冬，杨智，贺贤汉，
申请(专利权)人：杭州博日科技股份有限公司，
类型：发明
国别省市：