与术前放化疗联合全直肠系膜切除术敏感性相关的基因及其应用制造技术

本发明专利技术公开了与术前放化疗联合全直肠系膜切除术敏感性相关的基因及其应用，所述基因为ABCC3、CTDP1、和/或CAPN12，经验证发现，所述生物标志物对预测直肠癌患者对手术治疗的敏感性或反应性具有较好的诊断效能，AUC值均较高，表明ABCC3、CTDP1、和/或CAPN12可作为评估直肠癌患者对手术治疗的敏感性或反应性的生物标志物，并将其应用于临床，以筛选出术前放化疗联合全直肠系膜切除术治疗中生存获益的直肠癌人群，实现直肠癌的个性化治疗。实现直肠癌的个性化治疗。实现直肠癌的个性化治疗。

【技术实现步骤摘要】
与术前放化疗联合全直肠系膜切除术敏感性相关的基因及其应用


[0001]本专利技术属于生物医药
，具体地，本专利技术涉及与术前放化疗联合全直肠系膜切除术敏感性相关的基因及其应用，更具体地，本专利技术涉及与术前放化疗联合全直肠系膜切除术敏感性相关的基因ABCC3、CTDP1、和/或CAPN12及其应用。

技术介绍

[0002]直肠癌(Rectal cancer)是消化道最常见的恶性肿瘤之一，是指从齿状线至直肠乙状结肠交界处之间的癌。其发病率位居我国恶性肿瘤的第3位，死亡率位居我国恶性肿瘤的第5位，具有发病年龄较轻、发病率较高的流行病学特点。有资料显示我国以中、低位直肠癌最为多见，占全部直肠癌的80％以上(Zhou ZG,Wang ZQ.Interpretation of guidelines for diagnosis and treatment of mid
‑
low rectal cancer in Europe,America and Japan[J].Chinese J Experimental Surgery,2009,4(4):291
‑
292.)。在我国目前直肠癌的发病率仍处于上升阶段，且作为近年来较为高发的一种恶性肿瘤，其发病年龄有年轻化的趋势(Binefa G,Rodr
í
guez
‑
Moranta F,Teuleet al.Colorectal cancer:from prevention to personalized medicine[J].World journal of gastroenterology:WJG,2014,20(22):6786.)。
[0003]直肠癌包括散发性直肠癌和遗传性直肠癌两种类型，其中，遗传性直肠癌约占直肠癌患者总数的15％
‑
20％。遗传性直肠癌常见的类型包括遗传性非息肉病性大肠癌(Heteditory nonpolyposis colorerectal，HNPCC)和家族性腺瘤性息肉病(Familial adenomatous polyposis，FAP)；非遗传性直肠癌也被称为散发性直肠癌(Sporadic colorectal cancer，SCC)，这种类型的直肠癌占的比例相对较大。现代社会中，人们多肉食少纤维的饮食习惯、环境因素、遗传因素和多个肿瘤相关因子(包括癌基因、抑癌基因和错配修复基因等)参与直肠癌的发病过程。直肠癌的病理类型多样，包括腺癌、腺鱗癌、未分化癌。直肠癌的类型包括肿块型、溃疡型和浸润型三种不同类型，预后也各不相同。直肠癌可通过局部浸润、淋巴道转移和血道转移等方式发生扩散和转移。
[0004]由于直肠特殊的解剖位置，导致其早期的肿瘤很难被发现，且无明显症状，确诊时大部分患者均为中晚期，其中约3/4为中低位直肠癌。直肠癌的治疗目前除了手术，还有放化疗、生物治疗、中医中药治疗等，不仅在治疗手段上有很大进步，治疗模式也在发生变化。目前在直肠癌的治疗方法中，手术切除是直肠癌根治的唯一治疗手段，对于中晚期患者单纯手术切除根治率较低且术后复发率较高，据相关文献报道复发率约30％左右。而在手术的基础上采用放化疗可使局部复发率明显下降，提高长期生存。因此，手术联合放化疗的综合治疗模式已成为局部中晚期直肠癌的标准治疗模式。目前，对于可手术切除的局部中晚期直肠癌，术前放化疗联合全直肠系膜切除术(Preoperative chemoradiotherapy(CRT)and surgical mesorectal resection)是临床上标准的治疗方案。
[0005]尽管术前放化疗联合全直肠系膜切除术是局部晚期直肠癌患者治疗的标准方法，
但是目前仍然难以预测哪些直肠癌患者会对上述联合治疗方案具有敏感性，预测直肠癌患者对治疗的敏感性或反应性仍然是一个巨大的挑战，因此，发现能够用于直肠癌对术前放化疗联合全直肠系膜切除术治疗敏感性进行准确预测的生物标志物，并将其应用于术前治疗敏感的直肠癌患者的筛查中对于本领域而言具有重要意义。

技术实现思路

[0006]鉴于此，本专利技术的目的在于提供与术前放化疗联合全直肠系膜切除术敏感性相关的基因及其应用，为患者对术前放化疗联合全直肠系膜切除术治疗的敏感性提供具有价值的生物学信息。
[0007]本专利技术的上述目的通过以下技术方案得以实现：
[0008]本专利技术的第一方面提供了检测样本中生物标志物表达水平的试剂在制备用于预测直肠癌患者对术前放化疗联合全直肠系膜切除术治疗的敏感性或反应性的产品中的应用。
[0009]进一步，所述生物标志物为ABCC3、CTDP1、和/或CAPN12。
[0010]本专利技术中所述的生物标志物包括基因ABCC3、CTDP1、CAPN12，基因ABCC3、CTDP1、CAPN12的信息分别如下：
[0011]基因ABCC3(ATP binding cassette subfamily C member 3)在NCBI中的Gene ID为8714，位于17号染色体长臂2区1带3亚带3次亚带上；
[0012]基因CTDP1(CTD phosphatase subunit 1)在NCBI中的Gene ID为9150，位于18号染色体长臂2区3带上；
[0013]基因CAPN12(calpain 12)在NCBI中的Gene ID为147968，位于19号染色体长臂1区3带2亚带上。
[0014]进一步，所述生物标志物包括ABCC3、CTDP1、CAPN12、ABCC3+CTDP1组合、ABCC3+CAPN12组合、CTDP1+CAPN12组合、ABCC3+CTDP1+CAPN12组合；
[0015]优选地，所述生物标志物包括ABCC3+CTDP1组合、ABCC3+CAPN12组合、CTDP1+CAPN12组合、ABCC3+CTDP1+CAPN12组合。
[0016]进一步，所述试剂包括检测样本中所述生物标志物的mRNA表达水平的试剂、检测样本中所述生物标志物编码的多肽和/或蛋白表达水平的试剂。
[0017]进一步，所述试剂选自：
[0018]特异性识别所述生物标志物的探针；或
[0019]特异性扩增所述生物标志物的引物；或
[0020]特异性结合所述生物标志物的配体、抗体、抗体片段、亲和性蛋白。
[0021]进一步，所述产品包括通过实时定量PCR、RT
‑
PCR、免疫检测、原位杂交、芯片检测样本中所述生物标志物表达水平的试剂；
[0022]优选地，所述样本来源于组织。
[0023]进一步，本专利技术中所述的实时定量PCR是指实时定量聚合酶链式反应，PCR通常使用变性、引物对与相反链的退火以及引物延伸的多个循环，以指数方式增加靶核酸序列的拷贝数；RT
‑
PCR则将逆转录酶用于从mRNA制备互补的DNA(cDNA)，然后将cDNA通过PCR扩增以产生DNA的多个本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.检测样本中生物标志物表达水平的试剂在制备用于预测直肠癌患者对术前放化疗联合全直肠系膜切除术治疗的敏感性或反应性的产品中的应用，其特征在于，所述生物标志物为ABCC3、CTDP1、和/或CAPN12。2.根据权利要求1所述的应用，其特征在于，所述试剂包括检测样本中所述生物标志物的mRNA表达水平的试剂、检测样本中所述生物标志物编码的多肽和/或蛋白表达水平的试剂。3.根据权利要求1或2所述的应用，其特征在于，所述试剂选自：特异性识别所述生物标志物的探针；或特异性扩增所述生物标志物的引物；或特异性结合所述生物标志物的配体、抗体、抗体片段、亲和性蛋白。4.根据权利要求1所述的应用，其特征在于，所述产品包括通过实时定量PCR、RT
‑
PCR、免疫检测、原位杂交、芯片检测样本中所述生物标志物表达水平的试剂；优选地，所述样本来源于组织。5.一种用于预测直肠癌患者对术前放化疗联合全直肠系膜切除术治疗的敏感性或反应性的试剂盒，其特征在于，所述试剂盒包含检测样本中生物标志物表达水平的试剂，所述生物标志物为ABCC3、CTDP1、和/或CAPN12；优选地，所述检测样本中生物标志物表达水平的试剂包括检测样本中所述生物标志物的mRNA表达水平的试剂、检测样本中所述生物标志物编码的多肽和/或蛋白表达水平的试剂。6.根据权利要求5所述的试剂盒，其特征在于，所述检测样本中生物标志物的mRNA表达水平的试剂包括特异性识别所述生物标志物的探针、特异性扩增所述生物标志物的引物；优选地，所述检测样本中生物标志物编码的多肽和/或蛋白表达水平的试剂包括特异性结合所述生物标志物的配体、抗体、抗体片段、亲和性蛋白。7.一种用于提高直肠癌患者对术前放化疗联合全直肠系膜切除术治疗的敏感性或反应性的药物组合物，其特征在于，所述药物组合物包括降低ABCC3表达水平的试剂、降低CTDP1表达水平的试剂、和/或降低CAPN12表达水平的试...

【专利技术属性】
技术研发人员：杨承刚，范冰燕，
申请(专利权)人：青岛泱深生物医药有限公司，
类型：发明
国别省市：