T细胞受体及其使用方法技术

本公开涉及能够结合酪氨酸酶表位、MAGA

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】T细胞受体及其使用方法
[0001]相关申请的交叉引用
[0002]此PCT申请要求2019年3月25日提交的美国临时专利申请第62/823,487号的优先权权益，所述临时专利申请以引用的方式整体并入本文。
[0003]经由EFS
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WEB以电子方式提交的序列表的引用
[0004]以电子方式提交的序列表(名称：4285_008PC01_SeqListing_ST25.txt，大小：69,638字节；以及创建日期：2020年3月23日)的内容以引用的方式整体并入本文。


[0005]本公开提供特异性结合选自由酪氨酸酶、MAGE
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A1、MART1、MAGE
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A3和SSX2组成的组的靶人蛋白的重组T细胞受体(“TCR”)及其用途。

技术介绍

[0006]免疫疗法已成为抗击包括癌症的多种疾病的重要工具。T细胞疗法处于免疫疗法发展的最前沿，并且已证明抗肿瘤T细胞的过继性转移诱导了癌症患者的临床反应。尽管许多T细胞疗法靶向突变的肿瘤抗原，但是绝大多数新抗原并不是共有的并且对于每个患者而言是独特的。
[0007]潜在非突变抗原的数量要比突变抗原高多个数量级。阐明来源于共有抗原的T细胞表位可促进有效且安全的过继性T细胞疗法的稳健发展，所述疗法是较大群体的癌症患者容易获得的。然而，非突变抗原的巨大数量和HLA基因的高度多态性可妨碍针对非突变抗原的抗肿瘤T细胞反应的特异性的全面分析。
[0008]本公开提供非突变抗原酪氨酸酶、MAGE
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A1、MART1、MAGE
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A3和SSX2的新颖表位和能够特异性结合所述表位的TCR。这些新颖表位与特定HLA等位基因相关。使用这些肿瘤反应性HLA限制性TCR有助于扩大TCR基因疗法的适用性，尤其在免疫肿瘤学中。

技术实现思路

[0009]本公开的某些方面涉及一种核酸分子，其包含(i)第一核苷酸序列，所述第一核苷酸序列编码特异性结合靶人蛋白的重组T细胞受体(TCR)或其抗原结合部分；和(ii)第二核苷酸序列，其中第二核苷酸序列或由第二核苷酸序列编码的多肽抑制内源性TCR的表达；其中：(a)靶人蛋白是酪氨酸酶(“抗酪氨酸酶TCR”)，其中抗酪氨酸酶TCR与参考抗酪氨酸酶TCR交叉竞争结合至人酪氨酸酶，其中参考抗酪氨酸酶TCR包含α链和β链，并且其中α链包含如SEQ ID NO:1中所陈述的氨基酸序列，并且β链包含如SEQ ID NO:2中所陈述的氨基酸序列；(b)靶人蛋白是MAGE
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A1(“抗MAGE
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A1 TCR”)，其中抗MAGE
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A1 TCR与参考抗MAGE
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A1 TCR交叉竞争结合至人MAGE
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A1，其中参考抗MAGE
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A1 TCR包含α链和β链，并且其中α链包含如SEQ ID NO:11中所陈述的氨基酸序列，并且β链包含如SEQ ID NO:12中所陈述的氨基酸序列；(c)靶人蛋白是MART1(“抗MART1 TCR”)，其中抗MART1 TCR与参考抗MART1 TCR交叉竞争结合至人MART1，其中参考抗MART1 TCR包含α链和β链，并且其中α链包含如SEQ ID NO:21中
所陈述的氨基酸序列，并且β链包含如SEQ ID NO:22中所陈述的氨基酸序列；(d)靶人蛋白是MAGE
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A3(“抗MAGE
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A3 TCR”)，其中抗MAGE
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A3 TCR与参考抗MAGE
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A3 TCR交叉竞争结合至人MAGE
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A3，其中参考抗MAGE
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A3 TCR包含α链和β链，并且其中α链包含如SEQ ID NO:31中所陈述的氨基酸序列，并且β链包含如SEQ ID NO:32中所陈述的氨基酸序列；或(e)靶人蛋白是SSX2(“抗SSX2 TCR”)，其中抗SSX2 TCR与参考抗SSX2 TCR交叉竞争结合至人SSX2，其中参考抗SSX2 TCR包含α链和β链，并且其中α链包含如SEQ ID NO:41中所陈述的氨基酸序列，并且β链包含如SEQ ID NO:42中所陈述的氨基酸序列。
[0010]本公开的某些方面涉及一种核酸分子，其包含(i)第一核苷酸序列，所述第一核苷酸序列编码特异性结合靶人蛋白的重组T细胞受体(TCR)或其抗原结合部分；和(ii)第二核苷酸序列，其中第二核苷酸序列或由第二核苷酸序列编码的多肽抑制内源性TCR的表达；其中：(a)靶人蛋白是酪氨酸酶(“抗酪氨酸酶TCR”)，其中抗酪氨酸酶TCR与参考抗酪氨酸酶TCR结合人酪氨酸酶的相同表位或重叠表位，其中参考抗酪氨酸酶TCR包含α链和β链，并且其中α链包含如SEQ ID NO:1中所陈述的氨基酸序列，并且β链包含如SEQ ID NO:2中所陈述的氨基酸序列；(b)靶人蛋白是MAGE
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A1(“抗MAGE
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A1 TCR”)，其中抗MAGE
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A1 TCR与参考抗MAGE
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A1 TCR结合人MAGE
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A1的相同表位或重叠表位，其中参考抗MAGE
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A1 TCR包含α链和β链，并且其中α链包含如SEQ ID NO:11中所陈述的氨基酸序列，并且β链包含如SEQ ID NO:12中所陈述的氨基酸序列；(c)靶人蛋白是MART1(“抗MART1 TCR”)，其中抗MART1 TCR与参考抗MART1 TCR结合人MART1的相同表位或重叠表位，其中参考抗MART1 TCR包含α链和β链，并且其中α链包含如SEQ ID NO:21中所陈述的氨基酸序列，并且β链包含如SEQ ID NO:22中所陈述的氨基酸序列；(d)靶人蛋白是MAGE
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A3(“抗MAGE
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A3 TCR”)，其中抗MAGE
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A3 TCR与参考抗MAGE
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A3 TCR结合人MAGE
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A3的相同表位或重叠表位，其中参考抗MAGE
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A3 TCR包含α链和β链，并且其中α链包含如SEQ ID NO:31中所陈述的氨基酸序列，并且β链包含如SEQ ID NO:32中所陈述的氨基酸序列；或(e)靶人蛋白是SSX2(“抗SSX2 TCR”)，其中抗SSX2 TCR与参考抗SSX2 TCR结合人SSX2的相同表位或重叠表位，其中参考抗SSX2 TCR包含α链和β链，并且其中α链包含如SEQ ID NO:41中所陈述的氨基酸序列，并且β链包含如SEQ ID NO:42中所陈述的氨基酸序列。
[0011]在一些实施方案中，(a)抗酪氨酸酶TCR结合至酪氨酸酶的表位，所述表位由如SEQ ID NO:51中所陈述的氨基酸序列组成；(b)抗MAGE
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A1 TCR结合至MAGE...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】1.一种核酸分子，其包含(i)第一核苷酸序列，所述第一核苷酸序列编码特异性结合靶人蛋白的重组T细胞受体(TCR)或其抗原结合部分；和(ii)第二核苷酸序列，其中所述第二核苷酸序列或由所述第二核苷酸序列编码的多肽抑制内源性TCR的表达；其中：(a)所述靶人蛋白是酪氨酸酶(“抗酪氨酸酶TCR”)，其中所述抗酪氨酸酶TCR与参考抗酪氨酸酶TCR交叉竞争结合至人酪氨酸酶，其中所述参考抗酪氨酸酶TCR包含α链和β链，并且其中所述α链包含如SEQ ID NO:1中所陈述的氨基酸序列，并且所述β链包含如SEQ ID NO:2中所陈述的氨基酸序列；(b)所述靶人蛋白是MAGE
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A1(“抗MAGE
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A1 TCR”)，其中所述抗MAGE
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A1 TCR与参考抗MAGE
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A1 TCR交叉竞争结合至人MAGE
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A1，其中所述参考抗MAGE
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A1 TCR包含α链和β链，并且其中所述α链包含如SEQ ID NO:11中所陈述的氨基酸序列，并且所述β链包含如SEQ ID NO:12中所陈述的氨基酸序列；(c)所述靶人蛋白是MART1(“抗MART1 TCR”)，其中所述抗MART1 TCR与参考抗MART1 TCR交叉竞争结合至人MART1，其中所述参考抗MART1 TCR包含α链和β链，并且其中所述α链包含如SEQ ID NO:21中所陈述的氨基酸序列，并且所述β链包含如SEQ ID NO:22中所陈述的氨基酸序列；(d)所述靶人蛋白是MAGE
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A3(“抗MAGE
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A3 TCR”)，其中所述抗MAGE
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A3 TCR与参考抗MAGE
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A3 TCR交叉竞争结合至人MAGE
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A3，其中所述参考抗MAGE
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A3 TCR包含α链和β链，并且其中所述α链包含如SEQ ID NO:31中所陈述的氨基酸序列，并且所述β链包含如SEQ ID NO:32中所陈述的氨基酸序列；或(e)所述靶人蛋白是SSX2(“抗SSX2 TCR”)，其中所述抗SSX2TCR与参考抗SSX2 TCR交叉竞争结合至人SSX2，其中所述参考抗SSX2 TCR包含α链和β链，并且其中所述α链包含如SEQ ID NO:41中所陈述的氨基酸序列，并且所述β链包含如SEQ ID NO:42中所陈述的氨基酸序列。2.一种核酸分子，其包含(i)第一核苷酸序列，所述第一核苷酸序列编码特异性结合靶人蛋白的重组T细胞受体(TCR)或其抗原结合部分；和(ii)第二核苷酸序列，其中所述第二核苷酸序列或由所述第二核苷酸序列编码的多肽抑制内源性TCR的表达；其中：(a)靶人蛋白是酪氨酸酶(“抗酪氨酸酶TCR”)，其中所述抗酪氨酸酶TCR与参考抗酪氨酸酶TCR结合人酪氨酸酶的相同表位或重叠表位，其中所述参考抗酪氨酸酶TCR包含α链和β链，其中所述α链包含如SEQ ID NO:1中所陈述的氨基酸序列，并且所述β链包含如SEQ ID NO:2中所陈述的氨基酸序列；(b)所述靶人蛋白是MAGE
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A1(“抗MAGE
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A1 TCR”)，其中所述抗MAGE
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A1 TCR与参考抗MAGE
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A1 TCR结合人MAGE
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A1的相同表位或重叠表位，其中所述参考抗MAGE
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A1 TCR包含α链和β链，并且其中所述α链包含如SEQ ID NO:11中所陈述的氨基酸序列，并且所述β链包含如SEQ ID NO:12中所陈述的氨基酸序列；(c)所述靶人蛋白是MART1(“抗MART1 TCR”)，其中所述抗MART1 TCR与参考抗MART1 TCR结合人MART1的相同表位或重叠表位，其中所述参考抗MART1 TCR包含α链和β链，并且其中所述α链包含如SEQ ID NO:21中所陈述的氨基酸序列，并且所述β链包含如SEQ ID NO:22中所陈述的氨基酸序列；(d)所述靶人蛋白是MAGE
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A3(“抗MAGE
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A3 TCR”)，其中所述抗MAGE
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A3 TCR与参考抗
MAGE
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A3 TCR结合人MAGE
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A3的相同表位或重叠表位，其中所述参考抗MAGE
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A3 TCR包含α链和β链，并且其中所述α链包含如SEQ ID NO:31中所陈述的氨基酸序列，并且所述β链包含如SEQ ID NO:32中所陈述的氨基酸序列；或(e)所述靶人蛋白是SSX2(“抗SSX2 TCR”)，其中所述抗SSX2TCR与参考抗SSX2 TCR结合人SSX2的相同表位或重叠表位，其中所述参考抗SSX2 TCR包含α链和β链，并且其中所述α链包含如SEQ ID NO:41中所陈述的氨基酸序列，并且所述β链包含如SEQ ID NO:42中所陈述的氨基酸序列。3.如权利要求1或2所述的核酸分子，其中：(a)所述抗酪氨酸酶TCR结合至酪氨酸酶的表位，所述表位由如SEQ ID NO:51中所陈述的氨基酸序列组成；(b)所述抗MAGE
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A1 TCR结合至MAGE
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A1的表位，所述表位由如SEQ ID NO:52中所陈述的氨基酸序列组成；(c)所述抗MART1 TCR结合至MART1的表位，所述表位由如SEQ ID NO:53中所陈述的氨基酸序列组成；(d)所述抗MAGE
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A3 TCR结合至MAGE
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A3的表位，所述表位由如SEQ ID NO:54中所陈述的氨基酸序列组成；或(e)所述抗SSX2 TCR结合至SSX2的表位，所述表位由如SEQ ID NO:55中所陈述的氨基酸序列组成。4.如权利要求2或3所述的核酸分子，其中所述表位与HLA I类分子复合。5.如权利要求4所述的核酸分子，其中所述HLA I类分子是HLA
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A、HLA
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B、HLA
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C、HLA
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E、HLA
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F或HLA
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G等位基因。6.如权利要求4所述的核酸分子，其中：(a)所述靶人蛋白是酪氨酸酶，并且所述HLA I类分子是HLA
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C*05等位基因；(b)所述靶人蛋白是MAGE
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A1，并且所述HLA I类分子是HLA
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B*07等位基因；(c)所述靶人蛋白是MART1，并且所述HLA I类分子是HLA
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B*18等位基因；(d)所述靶人蛋白是MAGE
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A3，并且所述HLA I类分子是HLA
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B*18等位基因；或(e)所述靶人蛋白是SSX2，并且所述HLA I类分子是HLA
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A*02等位基因。7.如权利要求4至6中任一项所述的核酸分子，其中：(a)所述靶人蛋白是酪氨酸酶，并且所述HLA I类分子选自HLA
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C*05:01等位基因、HLA
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C*05:03等位基因、HLA
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C*05:04等位基因、HLA
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C*05:05等位基因和HLA
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C*05:06等位基因；(b)所述靶人蛋白是MAGE
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A1，并且所述HLA I类分子选自HLA
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B*07:02等位基因、HLA
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B*07:03等位基因、HLA
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B*07:04等位基因、HLA
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B*07:05等位基因和HLA
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B*07:06等位基因；(c)所述靶人蛋白是MART1，并且所述HLA I类分子选自HLA
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B*18:01等位基因、HLA
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B*18:02等位基因、HLA
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B*18:03等位基因、HLA
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B*18:04等位基因和HLA
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B*18:05等位基因；(d)所述靶人蛋白是MAGE
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A3，并且所述HLA I类分子选自HLA
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B*18:01等位基因、HLA
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B*18:02等位基因、HLA
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B*18:03等位基因、HLA
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B*18:04等位基因和HLA
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B*18:05等位基因；或(e)所述靶人蛋白是SSX2，并且所述HLA I类分子选自HLA
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A*02:01等位基因、HLA
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A*02:02等位基因、HLA
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A*02:03等位基因、HLA
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A*02:04等位基因和HLA
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A*02:05等位基因。
8.如权利要求4至7中任一项所述的核酸分子，其中：(a)所述靶人蛋白是酪氨酸酶，并且所述HLA I类分子是HLA
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C*05:01等位基因；(b)所述靶人蛋白是MAGE
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A1，并且所述HLA I类分子是HLA
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B*07:02等位基因；(c)所述靶人蛋白是MART1，并且所述HLA I类分子是HLA
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B*18:01等位基因；(d)所述靶人蛋白是MAGE
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A3，并且所述HLA I类分子是HLA
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B*18:01等位基因；或(e)所述靶人蛋白是SSX2，并且所述HLA I类分子是HLA
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A*02:01等位基因。9.如权利要求1至8中任一项所述的核酸分子，其中特异性结合所述靶人蛋白的所述重组TCR或其抗原结合部分包含α链和β链，其中所述α链包含有包含α链CDR1、α链CDR2和α链CDR3的可变区；其中所述β链包含有包含β链CDR1、β链CDR2和β链CDR3的可变结构域；并且其中：(a)所述靶人蛋白是酪氨酸酶，并且所述α链CDR3包含如SEQ ID NO:7中所陈述的氨基酸序列；(b)所述靶人蛋白是MAGE
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A1，并且所述α链CDR3包含如SEQ ID NO:17中所陈述的氨基酸序列；(c)所述靶人蛋白是MART1，并且所述α链CDR3包含如SEQ ID NO:27中所陈述的氨基酸序列；(d)所述靶人蛋白是MAGE
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A3，并且所述α链CDR3包含如SEQ ID NO:37中所陈述的氨基酸序列；或(e)所述靶人蛋白是SSX2，并且所述α链CDR3包含如SEQ ID NO:47中所陈述的氨基酸序列。10.如权利要求9所述的核酸分子，其中：(a)所述靶人蛋白是酪氨酸酶，并且所述β链CDR3包含如SEQ ID NO:10中所陈述的氨基酸序列；(b)所述靶人蛋白是MAGE
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A1，并且所述β链CDR3包含如SEQ ID NO:20中所陈述的氨基酸序列；(c)所述靶人蛋白是MART1，并且所述β链CDR3包含如SEQ ID NO:30中所陈述的氨基酸序列；(d)所述靶人蛋白是MAGE
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A3，并且所述β链CDR3包含如SEQ ID NO:40中所陈述的氨基酸序列；或(e)所述靶人蛋白是SSX2，并且所述αβCDR3包含如SEQ ID NO:50中所陈述的氨基酸序列。11.如权利要求1至8中任一项所述的核酸分子，其中特异性结合所述靶人蛋白的所述重组TCR或其抗原结合部分包含α链和β链，其中所述α链包含有包含α链CDR1、α链CDR2和α链CDR3的可变区；其中所述β链包含有包含β链CDR1、β链CDR2和β链CDR3的可变结构域；并且其中：(a)所述靶人蛋白是酪氨酸酶，并且所述β链CDR3包含如SEQ ID NO:10中所陈述的氨基酸序列；(b)所述靶人蛋白是MAGE
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A1，并且所述β链CDR3包含如SEQ ID NO:20中所陈述的氨基酸序列；
(c)所述靶人蛋白是MART1，并且所述β链CDR3包含如SEQ ID NO:30中所陈述的氨基酸序列；(d)所述靶人蛋白是MAGE
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A3，并且所述β链CDR3包含如SEQ ID NO:40中所陈述的氨基酸序列；或(e)所述靶人蛋白是SSX2，并且所述αβCDR3包含如SEQ ID NO:50中所陈述的氨基酸序列。12.如权利要求11所述的核酸分子，其中：(a)所述靶人蛋白是酪氨酸酶，并且所述α链CDR3包含如SEQ ID NO:7中所陈述的氨基酸序列；(b)所述靶人蛋白是MAGE
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A1，并且所述α链CDR3包含如SEQ ID NO:17中所陈述的氨基酸序列；(c)所述靶人蛋白是MART1，并且所述α链CDR3包含如SEQ ID NO:27中所陈述的氨基酸序列；(d)所述靶人蛋白是MAGE
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A3，并且所述α链CDR3包含如SEQ ID NO:37中所陈述的氨基酸序列；或(e)所述靶人蛋白是SSX2，并且所述α链CDR3包含如SEQ ID NO:47中所陈述的氨基酸序列。13.如权利要求9至12中任一项所述的核酸分子，其中：(a)所述靶人蛋白是酪氨酸酶，并且所述α链CDR1包含如SEQ ID NO:5中所陈述的氨基酸序列；(b)所述靶人蛋白是MAGE
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A1，并且所述α链CDR1包含如SEQ ID NO:15中所陈述的氨基酸序列；(c)所述靶人蛋白是MART1，并且所述α链CDR1包含如SEQ ID NO:25中所陈述的氨基酸序列；(d)所述靶人蛋白是MAGE
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A3，并且所述α链CDR1包含如SEQ ID NO:35中所陈述的氨基酸序列；或(e)所述靶人蛋白是SSX2，并且所述α链CDR1包含如SEQ ID NO:45中所陈述的氨基酸序列。14.如权利要求9至13中任一项所述的核酸分子，其中：(a)所述靶人蛋白是酪氨酸酶，并且所述β链CDR1包含如SEQ ID NO:8中所陈述的氨基酸序列；(b)所述靶人蛋白是MAGE
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A1，并且所述β链CDR1包含如SEQ ID NO:18中所陈述的氨基酸序列；(c)所述靶人蛋白是MART1，并且所述β链CDR1包含如SEQ ID NO:28中所陈述的氨基酸序列；(d)所述靶人蛋白是MAGE
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A3，并且所述β链CDR1包含如SEQ ID NO:38中所陈述的氨基酸序列；或(e)所述靶人蛋白是SSX2，并且所述β链CDR1包含如SEQ ID NO:48中所陈述的氨基酸序列。
15.如权利要求9至14中任一项所述的核酸分子，其中：(a)所述靶人蛋白是酪氨酸酶，并且所述α链CDR2包含如SEQ ID NO:6中所陈述的氨基酸序列；(b)所述靶人蛋白是MAGE
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A1，并且所述α链CDR2包含如SEQ ID NO:16中所陈述的氨基酸序列；(c)所述靶人蛋白是MART1，并且所述α链CDR2包含如SEQ ID NO:26中所陈述的氨基酸序列；(d)所述靶人蛋白是MAGE
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A3，并且所述α链CDR2包含如SEQ ID NO:36中所陈述的氨基酸序列；或(e)所述靶人蛋白是SSX2，并且所述α链CDR2包含如SEQ ID NO:46中所陈述的氨基酸序列。16.如权利要求9至15中任一项所述的核酸分子，其中：(a)所述靶人蛋白是酪氨酸酶，并且所述β链CDR2包含如SEQ ID NO:9中所陈述的氨基酸序列；(b)所述靶人蛋白是MAGE
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A1，并且所述β链CDR2包含如SEQ ID NO:19中所陈述的氨基酸序列；(c)所述靶人蛋白是MART1，并且所述β链CDR2包含如SEQ ID NO:29中所陈述的氨基酸序列；(d)所述靶人蛋白是MAGE
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A3，并且所述β链CDR2包含如SEQ ID NO:39中所陈述的氨基酸序列；或(e)所述靶人蛋白是SSX2，并且所述β链CDR2包含如SEQ ID NO:49中所陈述的氨基酸序列。17.如权利要求9至16中任一项所述的核酸分子，其中：(a)所述靶人蛋白是酪氨酸酶，并且所述α链可变结构域包含在SEQ ID NO:1中所陈述的氨基酸序列中存在的可变结构域的氨基酸序列；(b)所述靶人蛋白是MAGE
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A1，并且所述α链可变结构域包含在SEQ ID NO:11中所陈述的氨基酸序列中存在的可变结构域的氨基酸序列；(c)所述靶人蛋白是MART1，并且所述α链可变结构域包含在SEQ ID NO:21中所陈述的氨基酸序列中存在的可变结构域的氨基酸序列；(d)所述靶人蛋白是MAGE
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A3，并且所述α链可变结构域包含在SEQ ID NO:31中所陈述的氨基酸序列中存在的可变结构域的氨基酸序列；或(e)所述靶人蛋白是SSX2，并且所述α链可变结构域包含SEQ ID NO:41中所陈述的氨基酸序列中存在的可变结构域的氨基酸序列。18.如权利要求9至17中任一项所述的核酸分子，其中：(a)所述靶人蛋白是酪氨酸酶，并且所述β链可变结构域包含在SEQ ID NO:2中所陈述的氨基酸序列中存在的可变结构域的氨基酸序列；(b)所述靶人蛋白是MAGE
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A1，并且所述β链可变结构域包含在SEQ ID NO:12中所陈述的氨基酸序列中存在的可变结构域的氨基酸序列；(c)所述靶人蛋白是MART1，并且所述β链可变结构域包含在SEQ ID NO:22中所陈述的
氨基酸序列中存在的可变结构域的氨基酸序列；(d)所述靶人蛋白是MAGE
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A3，并且所述β链可变结构域包含在SEQ ID NO:32中所陈述的氨基酸序列中存在的可变结构域的氨基酸序列；或(e)所述靶人蛋白是SSX2，并且所述β链可变结构域包含在SEQ ID NO:42中所陈述的氨基酸序列中存在的可变结构域的氨基酸序列。19.如权利要求9至18中任一项所述的核酸分子，其中所述α链还包含恒定区，其中所述恒定区不同于所述α链的内源性恒定区。20.如权利要求9至19中任一项所述的核酸分子，其中所述α链还包含恒定区，其中：(a)所述靶人蛋白是酪氨酸酶，并且所述α链恒定区包含与在SEQ ID NO:1中所陈述的氨基酸序列中存在的恒定区具有至少约85％、至少约90％、至少约95％、至少约96％、至少约97％、至少约98％或至少约99％序列同一性的氨基酸序列；(b)所述靶人蛋白是MAGE
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A1，并且所述α链恒定区包含与在SEQ ID NO:11中所陈述的氨基酸序列中存在的恒定区具有至少约85％、至少约90％、至少约95％、至少约96％、至少约97％、至少约98％或至少约99％序列同一性的氨基酸序列；(c)所述靶人蛋白是MART1，并且所述α链恒定区包含与在SEQ ID NO:21中所陈述的氨基酸序列中存在的恒定区具有至少约85％、至少约90％、至少约95％、至少约96％、至少约97％、至少约98％或至少约99％序列同一性的氨基酸序列；(d)所述靶人蛋白是MAGE
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A3，并且所述α链恒定区包含与在SEQ ID NO:31中所陈述的氨基酸序列中存在的恒定区具有至少约85％、至少约90％、至少约95％、至少约96％、至少约97％、至少约98％或至少约99％序列同一性的氨基酸序列；或(e)所述靶人蛋白是SSX2，并且所述α链恒定区包含与在SEQ ID NO:41中所陈述的氨基酸序列中存在的恒定区具有至少约85％、至少约90％、至少约95％、至少约96％、至少约97％、至少约98％或至少约99％序列同一性的氨基酸序列。21.如权利要求19或20的核酸分子，其中：(a)所述靶人蛋白是酪氨酸酶，并且所述α链恒定区包含相对于在SEQ ID NO:1中所陈述的氨基酸序列中存在的恒定区包含至少1个、至少2个、至少3个、至少4个或至少5个氨基酸取代的氨基酸序列；(b)所述靶人蛋白是MAGE
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A1，并且所述α链恒定区包含相对于在SEQ ID NO:11中所陈述的氨基酸序列中存在的恒定区包含至少1个、至少2个、至少3个、至少4个或至少5个氨基酸取代的氨基酸序列；(c)所述靶人蛋白是MART1，并且所述α链恒定区包含相对于在SEQ ID NO:21中所陈述的氨基酸序列中存在的恒定区包含至少1个、至少2个、至少3个、至少4个或至少5个氨基酸取代的氨基酸序列；(d)所述靶人蛋白是MAGE
‑
A3，并且所述α链恒定区包含相对于在SEQ ID NO:31中所陈述的氨基酸序列中存在的恒定区包含至少1个、至少2个、至少3个、至少4个或至少5个氨基酸取代的氨基酸序列；或(e)所述靶人蛋白是SSX2，并且所述α链恒定区包含相对于在SEQ ID NO:41中所陈述的氨基酸序列中存在的恒定区包含至少1个、至少2个、至少3个、至少4个或至少5个氨基酸取代的氨基酸序列。
22.如权利要求9至21中任一项所述的核酸分子，其中所述β链还包含恒定区，其中所述恒定区不同于所述β链的内源性恒定区。23.如权利要求9至22中任一项所述的核酸分子，其中所述β链还包含恒定区，并且其中：(a)所述靶人蛋白是酪氨酸酶，并且所述β链恒定区包含与在SEQ ID NO:2中所陈述的氨基酸序列中存在的恒定区具有至少约85％、至少约90％、至少约95％、至少约96％、至少约97％、至少约98％或至少约99％序列同一性的氨基酸序列；(b)所述靶人蛋白是MAGE
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A1，并且所述β链恒定区包含与在SEQ ID NO:12中所陈述的氨基酸序列中存在的恒定区具有至少约85％、至少约90％、至少约95％、至少约96％、至少约97％、至少约98％或至少约99％序列同一性的氨基酸序列；(c)所述靶人蛋白是MART1，并且所述β链恒定区包含与在SEQ ID NO:22中所陈述的氨基酸序列中存在的恒定区具有至少约85％、至少约90％、至少约95％、至少约96％、至少约97％、至少约98％或至少约99％序列同一性的氨基酸序列；(d)所述靶人蛋白是MAGE
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A3，并且所述β链恒定区包含与在SEQ ID NO:32中所陈述的氨基酸序列中存在的恒定区具有至少约85％、至少约90％、至少约95％、至少约96％、至少约97％、至少约98％或至少约99％序列同一性的氨基酸序列；或(e)所述靶人蛋白是SSX2，并且所述β链恒定区包含与在SEQ ID NO:42中所陈述的氨基酸序列中存在的恒定区具有至少约85％、至少约90％、至少约95％、至少约96％、至少约97％、至少约98％或至少约99％序列同一性的氨基酸序列。24.如权利要求22或23的核酸分子，其中：(a)所述靶人蛋白是酪氨酸酶，并且所述β链恒定区包含相对于在SEQ ID NO:2中所陈述的氨基酸序列中存在的恒定区包含至少1个、至少2个、至少3个、至少4个或至少5个氨基酸取代的氨基酸序列；(b)所述靶人蛋白是MAGE
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A1，并且所述β链恒定区包含相对于在SEQ ID NO:12中所陈述的氨基酸序列中存在的恒定区包含至少1个、至少2个、至少3个、至少4个或至少5个氨基酸取代的氨基酸序列；(c)所述靶人蛋白是MART1，并且所述β链恒定区包含相对于在SEQ ID NO:22中所陈述的氨基酸序列中存在的恒定区包含至少1个、至少2个、至少3个、至少4个或至少5个氨基酸取代的氨基酸序列；(d)所述靶人蛋白是MAGE
‑
A3，并且所述β链恒定区包含相对于在SEQ ID NO:32中所陈述的氨基酸序列中存在的恒定区包含至少1个、至少2个、至少3个、至少4个或至少5个氨基酸取代的氨基酸序列；或(e)所述靶人蛋白是SSX2，并且所述β链恒定区包含相对于在SEQ ID NO:42中所陈述的氨基酸序列中存在的恒定区包含至少1个、至少2个、至少3个、至少4个或至少5个氨基酸取代的氨基酸序列。25.如权利要求9至24中任一项所述的核酸分子，其中：(a)所述靶人蛋白是酪氨酸酶，并且所述α链包含如SEQ ID NO:1中所陈述的氨基酸序列；(b)所述靶人蛋白是MAGE
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A1，并且所述α链包含如SEQ ID NO:11中所陈述的氨基酸序
列；(c)所述靶人蛋白是MART1，并且所述α链包含如SEQ ID NO:21中所陈述的氨基酸序列；(d)所述靶人蛋白是MAGE
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A3，并且所述α链包含如SEQ ID NO:31中所陈述的氨基酸序列；或(e)所述靶人蛋白是SSX2，并且所述α链包含如SEQ ID NO:41中所陈述的氨基酸序列。26.如权利要求9至25中任一项所述的核酸分子，其中：(a)所述靶人蛋白是酪氨酸酶，并且所述β链包含如SEQ ID NO:2中所陈述的氨基酸序列；(b)所述靶人蛋白是MAGE
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A1，并且所述β链包含如SEQ ID NO:12中所陈述的氨基酸序列；(c)所述靶人蛋白是MART1，并且所述β链包含如SEQ ID NO:22中所陈述的氨基酸序列；(d)所述靶人蛋白是MAGE
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A3，并且所述β链包含如SEQ ID NO:32中所陈述的氨基酸序列；或(e)所述靶人蛋白是SSX2，并且所述β链包含如SEQ ID NO:42中所陈述的氨基酸序列。27.如权利要求1至26中任一项所述的核酸分子，其中所述第二核苷酸序列是一种或多种减少内源性TCR的表达的siRNA。28.如权利要求27所述的核酸分子，其中所述一种或多种siRNA与编码所述内源性TCR的恒定区的核苷酸序列内的靶序列互补。29.如权利要求27或28所述的核酸分子，其中所述一种或多种siRNA包含一个或多个选自由SEQ ID NO:57
‑
60组成的组的核苷酸序列。30.如权利要求1至29中任一项所述的核酸分子，其中所述第二核苷酸序列编码Cas9。31.如权利要求1至30中任一项所述的核酸分子，其中所述重组TCR或其抗原结合部分包含α链恒定区、β链恒定区或两者；并且其中所述α链恒定区、所述β链恒定区或两者包含相对于内源性TCR的对应氨基酸序列在所述靶序列内具有至少1个、至少2个、至少3个、至少4个或至少5个取代的氨基酸序列。32.一种载体，其包含如权利要求1至31中任一项所述的核酸分子。33.如权利要求32所述的载体，其是病毒载体、哺乳动物载体或细菌载体。34.如权利要求32或33所述的载体，其是逆转录病毒载体。35.如权利要求32至34中任一项所述的载体，其选自由以下组成的组：腺病毒载体、慢病毒、仙台病毒载体、杆状病毒载体、爱泼斯坦巴尔病毒载体、乳多空病毒载体、牛痘病毒载体、单纯性疱疹病毒载体、杂合载体和腺相关病毒(AAV)载体。36.如权利要求32至35中任一项所述的载体，其是慢病毒。37.一种T细胞受体(TCR)或其抗原结合部分，其包含如权利要求9至31中任一项所述的重组TCR或其抗原结合部分的α链可变结构域和如权利要求9至31中任一项所述的重组TCR或其抗原结合部分的β链可变结构域。38.一种特异性结合靶人蛋白的重组T细胞受体(TCR)或其抗原结合部分(“重组TCR”)，其中：(a)所述靶人蛋白是酪氨酸酶(“抗酪氨酸酶TCR”)，其中所述抗酪氨酸酶TCR与参考抗酪氨酸酶TCR交叉竞争结合至人酪氨酸酶，其中所述参考抗酪氨酸酶TCR包含α链和β链，并
且其中所述α链包含如SEQ ID NO:1中所陈述的氨基酸序列，并且所述β链包含如SEQ ID NO:2中所陈述的氨基酸序列；(b)所述靶人蛋白是MAGE
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A1(“抗MAGE
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A1 TCR”)，其中所述抗MAGE
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A1 TCR与参考抗MAGE
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A1 TCR交叉竞争结合至人MAGE
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A1，其中所述参考抗MAGE
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A1 TCR包含α链和β链，并且其中所述α链包含如SEQ ID NO:11中所陈述的氨基酸序列，并且所述β链包含如SEQ ID NO:12中所陈述的氨基酸序列；(c)所述靶人蛋白是MART1(“抗MART1 TCR”)，其中所述抗MART1 TCR与参考抗MART1 TCR交叉竞争结合至人MART1，其中所述参考抗MART1 TCR包含α链和β链，并且其中所述α链包含如SEQ ID NO:21中所陈述的氨基酸序列，并且所述β链包含如SEQ ID NO:22中所陈述的氨基酸序列；(d)所述靶人蛋白是MAGE
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A3(“抗MAGE
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A3 TCR”)，其中所述抗MAGE
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A3 TCR与参考抗MAGE
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A3 TCR交叉竞争结合至人MAGE
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A3，其中所述参考抗MAGE
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A3 TCR包含α链和β链，并且其中所述α链包含如SEQ ID NO:31中所陈述的氨基酸序列，并且所述β链包含如SEQ ID NO:32中所陈述的氨基酸序列；或(e)所述靶人蛋白是SSX2(“抗SSX2 TCR”)，其中所述抗SSX2TCR与参考抗SSX2 TCR交叉竞争结合至人SSX2，其中所述参考抗SSX2 TCR包含α链和β链，并且其中所述α链包含如SEQ ID NO:41中所陈述的氨基酸序列，并且所述β链包含如SEQ ID NO:42中所陈述的氨基酸序列。39.一种特异性结合靶人蛋白的重组T细胞受体(TCR)或其抗原结合部分(“重组TCR”)，其中：(a)靶人蛋白是酪氨酸酶(“抗酪氨酸酶TCR”)，其中所述抗酪氨酸酶TCR与参考抗酪氨酸酶TCR结合人酪氨酸酶的相同表位或重叠表位，其中所述参考抗酪氨酸酶TCR包含α链和β链，其中所述α链包含如SEQ ID NO:1中所陈述的氨基酸序列，并且所述β链包含如SEQ ID NO:2中所陈述的氨基酸序列；(b)所述靶人蛋白是MAGE
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A1(“抗MAGE
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A1 TCR”)，其中所述抗MAGE
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A1 TCR与参考抗MAGE
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A1 TCR结合人MAGE
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A1的相同表位或重叠表位，其中所述参考抗MAGE
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A1 TCR包含α链和β链，并且其中所述α链包含如SEQ ID NO:11中所陈述的氨基酸序列，并且所述β链包含如SEQ ID NO:12中所陈述的氨基酸序列；(c)所述靶人蛋白是MART1(“抗MART1 TCR”)，其中所述抗MART1 TCR与参考抗MART1 TCR结合人MART1的相同表位或重叠表位，其中所述参考抗MART1 TCR包含α链和β链，并且其中所述α链包含如SEQ ID NO:21中所陈述的氨基酸序列，并且所述β链包含如SEQ ID NO:22中所陈述的氨基酸序列；(d)所述...

【专利技术属性】
技术研发人员：平野直人，村田健二，佐生嘉代子，
申请(专利权)人：大学健康网络，
类型：发明
国别省市：