一组用于鉴别大麻品种的SSR分子标记及其应用制造技术

本发明专利技术提供一组用于鉴别大麻品种的SSR分子标记及其应用。所述用于鉴别大麻品种的SSR分子标记，共11个SSR分子标记，基于这11个SSR分子标记，本发明专利技术还提供一套适于毛细管电泳平台的检测所述SSR分子标记的引物组合。利用这11个SSR分子标记可以：鉴定大麻品种及分析遗传多样性分析；区分大麻格列西亚和火麻一号、龙大麻5号和汉麻7号、龙大麻1号和尤纱

【技术实现步骤摘要】
一组用于鉴别大麻品种的SSR分子标记及其应用


[0001]本专利技术涉及农作物分子育种与鉴定
，具体涉及一组用于鉴别大麻品种的SSR分子标记及其应用。

技术介绍

[0002]大麻(Cannabis sativa L.)属荨麻目大麻科大麻属一年生草本植物。其下有三个变种分别是工业大麻、印度大麻和野生大麻。工业大麻是最常见的类型，是指四氢大麻酚含量低于0.3％的大麻品种，其有着很高的经济利用价值。大麻籽油由于含有均衡的ω
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3和ω
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6不饱和脂肪酸，多在食品、化妆品和药品中应用；大麻中的大麻二酚(CBD,cannabidiol)，其属于萜酚类化合物，具有丰富的药理学作用；大麻纤维和秆芯是建筑材料、特供军需品、婴儿内衣、纺织品等方面的优良原材料，大麻纤维具有防辐射、抗菌、弹性好等优点，市场前景广阔、经济效益巨大。
[0003]随着工业大麻产业的发展，多家科研机构针对产业发展需求培育出许多工业大麻品种。这使工业大麻的种质资源更加的丰富，也使工业大麻种子市场容易出现同名异物、同物异名以及鱼龙混杂现象。工业大麻因其品种在培育过程中极易接受外来花粉，所以品种内易混杂、纯度低，严重影响工业大麻种子质量和新品种培育。大麻尤纱
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31是中国从乌克兰引进的高纤维含量品种。格列西亚、火麻一号、龙大麻5号、汉麻7号和龙大麻1号是中国经过育种改良的杂交品种。火麻一号除纤维含量高以外，其抗倒伏、抗旱、耐盐碱的优点也十分突出，是黑龙江省大麻的主栽品种。而格列西亚虽然也是纤用大麻，但其优势没有火麻一号明显。二者无论是在种子外观还是植株外观都十分相似，难以分辨，因此对格列西亚和火麻一号的品种鉴定是下游市场或育种前的必要前提。龙大麻1号和尤纱
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31也是类似的情况。龙大麻1号具有很强的抗灰霉病和杆腐病能力，此外，也具有抗倒伏、抗旱、耐盐碱的优点。但其与尤纱
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31在种子形态外观上很相似，如在收获阶段或种子保存阶段发生混淆，会影响种子纯度。药用型大麻龙大麻5号和汉麻7号都属于CBD含量均较高、THC含量低的优势品种，具有相同的品种特性，其差异在于CBD和THC含量有所不同。含量不同指引着下游应用的方向不同。为避免这两个特性相似的品种发生混淆，对其进行准确的品种鉴定和区分是重要的前提。各品种的特性及品种鉴定缘由见表1。
[0004]简单重复序列(Simple sequence repeat，SSR)，又称为微卫星DNA(Microsatellite DNA)，通常是指以2
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4个核苷酸为单位多次串联重复的DNA序列。SSR是近年发展起来的建立在PCR基础上新型的DNA指纹技术，具有可靠性强、重复性高、多态性丰富等优点，是目前品种鉴定中应用最多的技术，已经广泛地应用到玉米、水稻、小麦、大豆等品种审定、种质资源核心种质库的构建及种质资源遗传多样性分析。目前，鲜有大麻SSR指纹图谱构建的报道。而利用基于PCR的SSR技术对大麻品种进行鉴定、遗传多样性分析及DNA指纹数据库的构建，对于大麻品种管理、品种选育以及种质资源收集和保护具有重要意义。
[0005]表1各品种的特性及品种鉴定缘由
[0006][0007]
技术实现思路

[0008]本专利技术的目的是提供一组用于鉴别大麻品种的SSR分子标记及其应用。
[0009]为了实现本专利技术目的，本专利技术通过收集来源广泛、表型和基因型种类丰富、代表性强的大麻材料，对相应材料的大麻基因组进行测序并比较，进而获得了一组用于鉴别大麻品种的SSR分子标记。
[0010]本专利技术提供的用于鉴别大麻品种的SSR分子标记包括以下11个SSR分子标记的一个或多个，11个SSR分子标记分别为ANUCS304，CAN0031，23，25，ANUCS201，B01CANN1，E07CANN1，ANUCS305，33，CAN0039，CAN0055。
[0011]所述11个SSR分子标记分别依次通过以下引物扩增得到：SEQ ID NO.1
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2，SEQ ID NO.3
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4，SEQ ID NO.5
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6，SEQ ID NO.7
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8，SEQ ID NO.9
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10，SEQ ID NO.11
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14，SEQ ID NO.15
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16，SEQ ID NO.17
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18，SEQ ID NO.19
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20，SEQ ID NO.21
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22。
[0012]上述SSR分子标记可采用本领域常规技术手段进行检测，同时，能够适用于毛细管电泳检测技术。基于毛细管电泳检测技术的SSR分子标记技术可以得到定量的DNA片段分析数据。与常规的聚丙烯酰胺凝胶电泳检测方法相比，其结果更为精确、灵敏、高效，更适用于大批量品种的检测分析。
[0013]在进行毛细管电泳检测时，可将上述SSR分子标记分为若干个不同荧光标记组，每组内的荧光标记相同。
[0014]作为本专利技术的一种实施方式，可将上述SSR分子标记分为四个不同荧光标记组，每组内的荧光标记相同：
[0015]第一组由SSR分子标记ANUCS304，CAN0031组成；第二组由SSR分子标记23，25组成；第三组由SSR分子标记ANUCS201，B01CANN1组成；第四组由SSR分子标记E07CANN1，ANUCS305，33，CAN0039，CAN0055组成。
[0016]进一步，本专利技术提供了用于扩增上述SSR分子标记的特异性引物对。
[0017]优选地，所述特异性引物对包括如下引物对中的一个或多个：SEQ ID NO.1
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2，SEQ ID NO.3
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4，SEQ ID NO.5
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6，SEQ ID NO.7
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8，SEQ ID NO.9
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16，SEQ ID NO.17
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18，SEQ ID NO.19
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20，SEQ ID NO.21
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22。
[0018]本专利技术还提供一种试剂盒，其含有上述用于扩增上述SSR分子标记的特异性引物对。
[0019]本专利技术还提供大麻基因组芯片，其含有上述大麻SSR分子标记。
[0020]本专利技术提供上述SSR分子标记、上述特异性引物、上述试剂盒、上述大麻基因组芯片在构建大麻品种DNA指纹数据库中的应用。
[0021]本专利技术提供上述SSR分子标记、上述特异性引物、上述试剂盒、上述大麻基因组芯片在大麻种质资源遗传多样性分析或种子质量检测中的应用。
[0022本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一组用于鉴别大麻品种的SSR分子标记，其特征在于，所述SSR分子标记包括以下11个SSR分子标记的一个或多个，分别为ANUCS304，CAN0031，23，25，ANUCS201，B01CANN1，E07CANN1，ANUCS305，33，CAN0039，CAN0055。2.根据权利要求1所述的大麻SSR分子标记，其特征在于，所述11个SSR分子标记分别依次通过以下引物扩增得到：SEQ ID NO.1
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2，SEQ ID NO.3
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4，SEQ ID NO.5
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8，SEQ ID NO.9
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12，SEQ ID NO.13
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14，SEQ ID NO.15
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16，SEQ ID NO.17
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18，SEQ ID NO.19
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20，SEQ ID NO.21
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22。3.用于扩增权利要求1或2所述的SSR分子标记的特异性引物；优选地，所述特异性引物包括如下引物对中的一个或多个：SEQ ID NO.1
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2，SEQ ID NO.3
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4，SEQ ID NO.5
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6，SEQ ID NO.7
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8，SEQ ID NO.9
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【专利技术属性】
技术研发人员：关海涛，张晓磊，陈中华，张瑞英，尹阳，兰青阔，
申请(专利权)人：黑龙江省农业科学院农产品质量安全研究所，
类型：发明
国别省市：