花生单株荚果数主效QTL位点qPN7的连锁分子标记及其应用制造技术

本发明专利技术公开了花生单株荚果数主效QTL位点qPN7的连锁分子标记及其应用。所述连锁分子标记位于花生基因组第7染色体上，包括分子标记Marker4240、分子标记Marker4243和分子标记Marker4251。所述分子标记Marker4240的核苷酸序列如SEQ ID No.1所示；所述Marker4243的核苷酸序列如SEQ ID No.3所示；所述Marker4251的核苷酸序列如SEQ ID No.5所示。所述连锁分子标记是利用引物组合物获得的。本发明专利技术公开的花生单株荚果数主效QTL位点qPN7及其连锁分子标记和鉴定方法，适用于花生单株荚果数基因定位和分子标记辅助选择育种。位和分子标记辅助选择育种。位和分子标记辅助选择育种。

【技术实现步骤摘要】
花生单株荚果数主效QTL位点qPN7的连锁分子标记及其应用


[0001]本专利技术属于花生分子遗传育种
，具体涉及花生单株荚果数主效QTL位点qPN7的连锁分子标记及其应用。

技术介绍

[0002]花生(Arachis hypogea L.)是全球的五大油料作物之一，也是我国食用油和蛋白质的重要来源。近年来随着我国经济和人口的增长，花生消费需求呈刚性增长态势，我国花生自给能力面临重大挑战。依靠品种改良提高花生单产，是在耕地资源约束的前提下提高花生总产、满足市场供需平衡的主要途径。
[0003]单株荚果数，是花生产量性状之一，属于数量性状，易受环境影响。在传统育种中，仅依靠表型进行后代选择的效果不佳，往往导致育种效率较低。通过构建高密度遗传连锁图谱，定位控制该性状的基因/QTL位点和开发连锁分子标记，利用分子标记进行辅助选择，可有效的实现对目标性状的预测、验证和聚合，显著提高育种效率。
[0004]近年来国内外研究人员针对花生多种产量性状进行了遗传研究，检测到了一批控制花生荚果大小、荚果重量、籽仁大小、籽仁重量等性状的QTL。但目前鲜有针对花生单株荚果数的定位研究，更加缺少相关主效QTL和连锁分子标记的报道。因此，筛选一个可稳定表达的花生单株荚果数主效QTL位点对加速花生单株荚果数基因图位克隆和培育单株荚果数性状优良花生新品种具有重要的意义。

技术实现思路

[0005]本专利技术针对现有技术的不足，提供了花生单株荚果数主效QTL位点qPN7的连锁分子标记及其应用。
[0006]为实现上述专利技术目的，本专利技术采取的技术方案为：本专利技术提供了花生单株荚果数主效QTL位点qPN7的连锁分子标记，所述连锁分子标记与花生单株荚果数主效QTL位点qPN7共位于花生基因组第7染色体上，包括分子标记Marker4240、分子标记Marker4243和分子标记Marker4251。
[0007]进一步的，所述分子标记Marker4240的核苷酸序列如SEQ ID No.1所示；所述Marker4243的核苷酸序列如SEQ ID No.3所示；所述Marker4251的核苷酸序列如SEQ ID No.5所示。
[0008]进一步的，所述分子标记Marker4240的多态性为A/G，与其具有多态性差异的核苷酸序列如SEQ ID No.2所示；所述分子标记Marker4243的多态性为T/C，与其具有多态性差异的核苷酸序列如SEQ ID No.4所示；所述分子标记Marker4251的多态性为C/T，与其具有多态性差异的核苷酸序列如SEQ ID No.6所示。
[0009]本专利技术还提供了一种引物组合物，所述引物组合物包括6条引物，其核苷酸序列分别如SEQ ID No.7
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SEQ ID No.12所示。
[0010]进一步的，所述引物组合物含有核苷酸序列如SEQ ID No.7和SEQ ID No.8所示的
扩增分子标记Marker4240的引物、核苷酸序列如SEQ ID No.9和SEQ ID No.10所示的扩增分子标记Marker4243的引物、核苷酸序列如SEQ ID No.11和SEQ ID No.12所示的扩增分子标记Marker4251的引物。
[0011]本专利技术还提供了一种花生单株荚果数主效QTL位点qPN7的鉴定方法，所述鉴定方法包括如下步骤：提取待鉴定花生材料的基因组DNA，并以基因组DNA为模板，利用所述引物组合物对模板进行PCR扩增，对扩增产物进行测序分析，根据测序结果判断所述连锁分子标记的多态性。
[0012]进一步的，根据待鉴定花生材料的测序结果，若所述连锁分子标记具有多态性，即所述连锁分子标记的核苷酸序列与品系6
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13相同，则判断该花生材料的单株荚果数大于或等于20；若所述连锁分子标记不具有多态性，即所述连锁分子标记的核苷酸序列与品种花育36号相同，则判断该花生材料的单株荚果数小于20。
[0013]进一步的，所述品系6
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13在分子标记Marker4240的第801位碱基为G，所述品种花育36号在分子标记Marker4240的第801位碱基为A；所述品系6
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13在分子标记Marker4243的第801位碱基为C，所述品种花育36号在分子标记Marker4243的第801位碱基为T；所述品系6
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13在分子标记Marker4251的第801位碱基为T，所述品种花育36号在分子标记Marker4251的第801位碱基为C。
[0014]进一步的，所述PCR扩增的反应程序为：94℃ 5 min；98℃ 10 s，60℃ 30 s，68℃ 1 min，共35个循环；68℃ 10 min延伸终止，4℃保存。
[0015]进一步的，所述PCR扩增的反应体系为50 μL，具体包括10~20 ng的DNA模板2 μL，引物对各1.5 μL，dNTP 10 μL，KOD buffer溶液25μL，KOD聚合酶1 μL，ddH2O 9 μL。
[0016]本专利技术还提供了花生单株荚果数主效QTL位点qPN7在调控花生单株荚果数性状中的应用，所述花生单株荚果数主效QTL位点qPN7的物理位置为花生基因组第7染色体208645~1146586碱基位之间，其能够通过SEQ ID No.7
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SEQ ID No.12所示的引物检测得到；所述花生单株荚果数主效QTL位点qPN7的增效等位基因来自花生品系6
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13，能够增加花生单株荚果数。
[0017]本专利技术还提供了所述的连锁分子标记或所述的引物组合物在选育高单株荚果数花生品种或品系中的应用。
[0018]本专利技术还提供了所述的连锁分子标记或所述的引物组合物在花生分子育种、培育转基因花生或花生种质资源改良中的应用。
[0019]与现有技术相比，本专利技术的有益效果为：1、本专利技术首次公开了增效等位基因来自栽培花生品系6
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13的花生单株荚果数主效QTL位点qPN7，位于栽培种花生基因组第7染色体208645~1146586碱基位之间，其不同基因型对花生单株荚果数具有不同的调控作用，对选育高单株荚果数花生品种或品系具有较高的利用价值。
[0020]2、本专利技术首次筛选并公开了花生单株荚果数主效QTL位点qPN7的三个连锁分子标记Marker4240、Marker4243、Marker4251，以及扩增连锁分子标记的分子标记引物对和分子标记方法，可以有效的应用于花生单株荚果数基因图位克隆，辅助花生单株荚果数性状后代选择，有利于提高育种效率，加速花生单株荚果数性状遗传改良。
附图说明
[0021]图1为本专利技术中花生单株荚果数主效位点qPN7在第7染色体的定位，其中竖向柱表示花生第7染色体，竖向柱上的短横线表示分子标记；与花生单株荚果数主效位点qPN7连锁的3个分子标记为Marker4251、Marker4240、Marker4本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.花生单株荚果数主效QTL位点qPN7的连锁分子标记，其特征在于，所述连锁分子标记与花生单株荚果数主效QTL位点qPN7共位于花生基因组第7染色体上，包括分子标记Marker4240、分子标记Marker4243和分子标记Marker4251。2.根据权利要求1所述的连锁分子标记，其特征在于，所述分子标记Marker4240的核苷酸序列如SEQ ID No.1所示；所述Marker4243的核苷酸序列如SEQ ID No.3所示；所述Marker4251的核苷酸序列如SEQ ID No.5所示。3.根据权利要求2所述的连锁分子标记，其特征在于，所述分子标记Marker4240的多态性为A/G，与其具有多态性差异的核苷酸序列如SEQ ID No.2所示；所述分子标记Marker4243的多态性为T/C，与其具有多态性差异的核苷酸序列如SEQ ID No.4所示；所述分子标记Marker4251的多态性为C/T，与其具有多态性差异的核苷酸序列如SEQ ID No.6所示。4.一种引物组合物，其特征在于，所述引物组合物包括6条引物，其核苷酸序列分别如SEQ ID No.7
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SEQ ID No.12所示。5.一种花生单株荚果数主效QTL位点qPN7的鉴定方法，其特征在于，所述鉴定方法包括如下步骤：提取待鉴定花生材料的基因组DNA，并以基因组DNA为模板，利用所述引物组合物对模板进行PCR扩增，对扩增产物进行测序分析，根据测序结果判断所述连锁分子标记的多态性。6.根据权利要求5所述的鉴定方法，其特征在于，根据待鉴定花生材料的测序结果，若所述连锁分子标记具有多态...

【专利技术属性】
技术研发人员：张胜忠，陈静，胡晓辉，苗华荣，王菲菲，
申请(专利权)人：山东省花生研究所，
类型：发明
国别省市：