水稻抽穗期调控基因OsGI的分子标记及其应用制造技术

本发明专利技术公开了一种水稻抽穗期调控基因OsGI的分子标记及其应用，通过设计OsGI基因的InDel分子标记，不存在遗传交换，准确性高；由于扩增片段酶切后存在较大的差异，可以直接用于琼脂糖电泳检测，更为方便；且属于共显性标记，可以鉴定纯合和杂合个体，缩短育种周期，提高育种效率。高育种效率。高育种效率。

【技术实现步骤摘要】
水稻抽穗期调控基因OsGI的分子标记及其应用


[0001]本专利技术属于分子遗传学领域，具体涉及一个水稻抽穗期调控基因OsGI的分子标记及其应用的分子标记及其应用。

技术介绍

[0002]水稻是全世界近一半人口的主粮，同时，也是我国最重要的粮食作物。水稻的生育期(或者抽穗期)是影响水稻产量的重要因素之一。所以在育种过程中我们需要根据目标种植环境选种不同生育期的品种进行种植才能保证水稻高产稳产。
[0003]水稻生育期(或者抽穗期)是典型的数量性状，受多基因控。分子标记辅助选择是一种利用与抽穗期基因紧密连锁标记或者基因内功能标记，在后代中结合基因型和表型鉴定对目标性状进行选择的现代育种技术。
[0004]为了大大缩短水稻抽穗期的育种年限、提高育种效率，节约大量的人力与物力成本，有必要找到一种水稻抽穗期调控基因的分子标记将其应用于水稻育种中。

技术实现思路

[0005]基于此，本专利技术的目的在于提供一种水稻抽穗期调控基因OsGI的分子标记、及其正反引物与应用。具体技术方案如下：
[0006]本专利技术提供了一种水稻抽穗期调控基因OsGI的分子标记，所述分子标记为OsGI_InDel_255，用于扩增所述分子标记的引物的核苷酸序列如下：
[0007]OsGI_InDel_255F：5
’‑
GTATCATCGTACAAAAGGCAGGT
‑3’
，SEQ ID NO.1；
[0008]OsGI_InDel_255R：5
’‑<br/>GACGACAAGCATACAGAGACTCC
‑3’
SEQ ID NO.2。
[0009]进一步地，所述分子标记位于水稻基因组第1号染色体。
[0010]进一步地，所述水稻抽穗期调控基因OsGI的分子标记由核苷酸序列为SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2的引物对在基因组位置上下游300bp内扩增得到。
[0011]本专利技术还提供了所述水稻抽穗期调控基因的应用。具体技术方案如下：
[0012]所述的分子标记在水稻抽穗期的检测和/或预测中的应用，和/或所述的分子标记在水稻育种中的应用。
[0013]在其中一些实施例中，所述水稻育种包括：调控水稻抽穗期育种：选择晚抽穗水稻或早抽穗水稻；和/或
[0014]在其中一些实施例中，所述水稻育种包括：鉴定水稻抽穗期调控基因OsGI的基因型，缩短水稻育种周期。
[0015]本专利技术还提供了一种使用水稻抽穗期调控基因OsGI的分子标记基因型鉴定及水稻育种的方法，包括以下步骤：
[0016](1)提取供试水稻样品基因组DNA；
[0017](2)利用核苷酸序列如SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2所示的引物对步骤1)中所提取基因组进行PCR扩增，获得扩增产物；
[0018](3)琼脂糖检测扩增产物；
[0019]如果有328bp的单条带，则表示所述样品为早抽穗品种；如果有583bp的单条带，则表示所述样品为晚抽穗品种；如果有328bp和583bp两条带，则表示所述样品为OsGI杂合基因型。
[0020]在其中一些实施例中，所述PCR扩增的扩增体系包含：Taq酶，模板DNA，核苷酸序列如SEQ ID NO.1和SEQ IDNO.2所示的引物，PCR buffer。
[0021]在其中一些实施例中，所述PCR扩增的PCR反应程序为：95
±
1℃预变性4
‑
6min，然后按98
±
1℃28
‑
32s，52
±
1℃下28
‑
32s，72
±
1℃下28
‑
32s进行30
‑
35个循环，最后72
±
1℃下延伸4
‑
6min。
[0022]本专利技术还提供了一种水稻抽穗期调控基因OsGI的鉴定试剂盒，包括：核苷酸序列如SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2所示的引物，所述引物用于扩增水稻抽穗期调控基因OsGI的分子标记，所述分子标记为OsGI_InDel_255。
[0023]基于上述技术方案，本专利技术具有以下有益效果：
[0024]本专利技术通过设计OsGI基因的InDel分子标记，不存在遗传交换，准确性高；由于扩增片段酶切后存在较大的差异，可以直接用于琼脂糖电泳检测，更为方便；且属于共显性标记，可以鉴定纯合和杂合个体，缩短育种周期，提高育种效率。
[0025]OsGI属于生物钟基因，可以调控水稻的抽穗期，OsGI早抽穗等位基因型主要来源于籼型水稻品种，OsGI晚抽穗等位基因型主要来源于粳型水稻品种。可以通过分子标记辅助选择技术选择OsGI不同等位基型调控水稻抽穗期以适应不同纬度的种植，扩大优良品种的种植范围。
附图说明
[0026]图1是本专利技术中分子标记OsGI_InDel_255对9个水稻品种的电泳检测图。
具体实施方式
[0027]为了便于理解本专利技术，下面将参照实施例对本专利技术进行更全面的描述，以下给出了本专利技术的较佳实施例。但是，本专利技术可以以许多不同的形式来实现，并不限于本文所描述的实施例。提供这些实施例的目的是使对本专利技术的公开内容的理解更加透彻全面。应理解，下列实施例中未注明具体条件的实验方法，通常按照常规条件，或按照制造厂商所建议的条件。实施例中所用到的各种常用试剂，均为市售产品。
[0028]除非另有定义，本文所使用的所有的技术和科学术语与属于本专利技术的
的技术人员通常理解的含义相同。在本专利技术的说明书中所使用的术语只是为了描述具体的实施例的目的，不是旨在于限制本专利技术。本文所使用的术语“和/或”包括一个或多个相关的所列项目的任意的和所有的组合。
[0029]下面通过实施例对本专利技术进行水稻抽穗期调控基因OsGI的分子标记及其应用做进一步说明及详细介绍：
[0030]实施例1水稻抽穗期调控基因OsGI分子标记的开发
[0031](1)供试材料：早抽穗品种：珍汕97B；晚抽穗品种：IRAT109。
[0032](2)水稻基因组DNA提取方法：在研钵中，取15mg水稻叶片，加入适量的液氮，将水
稻叶片研磨成粉末，加入400μL 1.5
×
CTAB(1.5％CTAB,75mmol/L Tris
‑
HCl,15mmol/L EDTA,1.05mol/L NaCl,pH＝8.0)研磨成匀浆，再加入400μL1.5
×
CTAB，吸取研磨液至1.5ml离心管中，加入560μL氯仿，混匀，12000r/min离心15min，取上清至另一离心管，加入预冷的等体积异丙醇，12000r/min离心5min，去上清，干燥沉淀物，最后加入100μL ddH2O溶解即可。
[0033](3)基因分子标记OsGI的开发：OsGI位于第1号染色体本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.水稻抽穗期调控基因OsGI的分子标记，其特征在于，所述分子标记为OsGI_InDel_255，用于扩增所述分子标记的引物的核苷酸序列如下：OsGI_InDel_255F：5
’‑
GTATCATCGTACAAAAGGCAGGT
‑3’
，SEQ ID NO.1；OsGI_InDel_255R：5
’‑
GACGACAAGCATACAGAGACTCC
‑3’
SEQ ID NO.2。2.根据权利要求1所述的水稻抽穗期调控基因OsGI的分子标记，其特征在于，所述分子标记位于水稻基因组第1号染色体。3.根据权利要求1或2所述的水稻抽穗期调控基因OsGI的分子标记，其特征在于，所述水稻抽穗期调控基因OsGI的分子标记由核苷酸序列为SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2的引物对在基因组位置上下游300bp内扩增得到。4.权利要求1
‑
3任一项所述的分子标记在水稻抽穗期的检测和/或预测中的应用。5.权利要求1
‑
3任一项所述的分子标记在水稻育种中的应用。6.根据权利要求5所述的应用，其特征在于，所述水稻育种包括：(1)调控水稻抽穗期育种：选择晚抽穗水稻或早抽穗水稻；和/或(2)鉴定水稻抽穗期调控基因OsGI的基因型，缩短水稻育种周期。7.一种使用水稻抽穗期调控基因OsGI的分子标记基因型鉴定及水稻育种的方法，其特征在于，包括以下步骤：1)提取供试水稻样品基因组D...

【专利技术属性】
技术研发人员：马孝松，刘鸿艳，罗利军，李恩熙，
申请(专利权)人：上海市农业生物基因中心，
类型：发明
国别省市：