用于检测B群链球菌核酸的组合物和方法技术

公开了用于检测B群链球菌(GBS；无乳链球菌)核酸的核酸寡聚物，包括扩增寡聚物和检测探针。还公开了使用所述公开的寡聚物进行特异性核酸扩增和检测的方法以及相应的反应混合物和试剂盒。物和试剂盒。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】用于检测B群链球菌核酸的组合物和方法

技术介绍

[0001]B群链球菌(Group B Streptococcus，GBS)或无乳链球菌(Streptococcus agalactiae)是一种革兰氏阳性细菌，其与全身(包括阴道、胃肠道和尿道)粘膜的短暂定殖相关。GBS很少在健康个体中引起疾病，但可以在免疫受损的患者、老年个体和新生儿中引起严重疾病。特别令人关注的是由分娩和生产过程中的垂直传播引起的新生儿感染。从无症状定殖的母亲传播到新生儿可导致早发型侵袭性GBS疾病，这是美国新生儿的败血症和脑膜炎的主要原因。新生儿的早发型GBS疾病可导致死亡或长期残疾，如智力迟钝以及听力或视力丧失。Buchan等人,J.Clin.Microbiol.53:443
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448,2015。
[0002]在常规筛查过程中对GBS的鉴定导致施用分娩期预防，以减轻细菌的传播并降低侵袭性疾病的可能性。实施这种筛查和预防策略已将早发型G BS的发生率降低了60％至86％。Lin等人,Am.J.Obstet.Gynecol.184:1204
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【技术保护点】

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】1.一种用于确定样品中B群链球菌(GBS)的存在或不存在的组合物，所述组合物包含：(I)第一扩增寡聚物组合和第二扩增寡聚物组合中的至少一种，其中所述第一扩增寡聚物组合包含能够扩增GBS SIP靶核酸的靶区域的第一和第二SIP特异性扩增寡聚物，其中所述第一和第二SIP特异性扩增寡聚物分别包含选自以下项的第一(A)和第二(B)SIP特异性靶杂交序列：(a)(A)SEQ ID NO:3、或其RNA等同物或DNA/RNA嵌合体，以及(B)SEQ ID NO:4、或其RNA等同物或DNA/RNA嵌合体；以及(b)(A)SEQ ID NO:7、或其RNA等同物或DNA/RNA嵌合体，以及(B)SEQ ID NO:8、或其RNA等同物或DNA/RNA嵌合体；并且(II)所述第二扩增寡聚物组合包含能够扩增GBS CFB靶核酸的靶区域的第一和第二CFB特异性扩增寡聚物，其中所述第一和第二CFB特异性扩增寡聚物分别包含选自以下项的第一(A')和第二(B')CFB特异性靶杂交序列：(a)(A')作为SEQ ID NO:26的序列中含有的约17至约24个连续核苷酸的序列、或其RNA等同物或DNA/RNA嵌合体，以及(B')SEQ ID NO:13或SEQ ID NO:15、或其RNA等同物或DNA/RNA嵌合体；(b)(A')SEQ ID NO:16、或其RNA等同物或DNA/RNA嵌合体，以及(B')SEQ ID NO:17、或其RNA等同物或DNA/RNA嵌合体；(c)(A')SEQ ID NO:18、或其RNA等同物或DNA/RNA嵌合体，以及(B')SEQ ID NO:15、或其RNA等同物或DNA/RNA嵌合体；以及(d)(A')SEQ ID NO:20、或其RNA等同物或DNA/RNA嵌合体，以及(B')SEQ ID NO:21、或其RNA等同物或DNA/RNA嵌合体。2.根据权利要求1所述的组合物，其中所述第一和第二SIP特异性靶杂交序列是(I)(a)的所述靶杂交序列。3.根据权利要求1所述的组合物，其中所述第一和第二SIP特异性靶杂交序列是(I)(b)的所述靶杂交序列。4.根据权利要求1
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3中任一项所述的组合物，其中如果所述组合物包含所述第一扩增寡聚物组合，则所述组合物进一步包含SIP特异性检测探针寡聚物，所述SIP特异性检测探针寡聚物包含长度为约15至约35个核苷酸并且被配置为与可被所述第一和第二SIP特异性扩增寡聚物扩增的SIP扩增子内含有的靶序列杂交的SIP特异性检测探针靶杂交序列。5.根据权利要求4所述的组合物，其中所述第一和第二SIP特异性靶杂交序列是(I)(a)的所述靶杂交序列，并且所述SIP特异性检测探针靶杂交序列是SEQ ID NO:9、或其RNA等同物或DNA/RNA嵌合体。6.根据权利要求4所述的组合物，其中所述第一和第二SIP特异性靶杂交序列是(I)(b)的所述靶杂交序列，并且所述SIP特异性检测探针靶杂交序列是SEQ ID NO:11、或其RNA等同物或DNA/RNA嵌合体。7.根据权利要求4
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6中任一项所述的组合物，其中所述SIP特异性检测探针寡聚物进一步包含可检测标记。8.根据权利要求7所述的组合物，其中所述可检测标记是荧光或化学发光标记。
9.根据权利要求7所述的组合物，其中所述可检测标记是荧光标记，并且所述SIP特异性检测探针寡聚物进一步包含非荧光猝灭剂。10.根据权利要求1
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9中任一项所述的组合物，其中所述第一和第二CFB特异性靶杂交序列是(II)(b)的所述靶杂交序列。11.根据权利要求1
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9中任一项所述的组合物，其中所述第一和第二CFB特异性靶杂交序列是(II)(d)的所述靶杂交序列。12.根据权利要求1
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9中任一项所述的组合物，其中所述CFB特异性靶杂交序列是(II)(a)的所述靶杂交序列。13.根据权利要求12所述的组合物，其中(II)(a)的所述第一CFB特异性靶杂交序列至少包含SEQ ID NO:28的序列、或其RNA等同物或DNA/RNA嵌合体。14.根据权利要求13所述的组合物，其中(II)(a)的所述第一CFB特异性靶杂交序列包含在SEQ ID NO:27的序列、或其RNA等同物或DNA/RNA嵌合体中。15.根据权利要求14所述的组合物，其中(II)(a)的所述第一CFB特异性靶杂交序列是SEQ ID NO:12或SEQ ID NO:14、或其RNA等同物或DNA/RNA嵌合体。16.根据权利要求12所述的组合物，其中(II)(a)的所述第一CFB特异性靶杂交序列是SEQ ID NO:18、或其RNA等同物或DNA/RNA嵌合体。17.根据权利要求12所述的组合物，其中(II)(a)的所述第一(A')和第二(B')CFB特异性靶杂交序列选自(i)(A')SEQ ID NO:12、或其RNA等同物或DNA/RNA嵌合体，以及(B')SEQ ID NO:13、或其RNA等同物或DNA/RNA嵌合体；(ii)(A')SEQ ID NO:12、或其RNA等同物或DNA/RNA嵌合体，以及(B')SEQ ID NO:15、或其RNA等同物或DNA/RNA嵌合体；(iii)(A')SEQ ID NO:14、或其RNA等同物或DNA/RNA嵌合体，以及(B')SEQ ID NO:15、或其RNA等同物或DNA/RNA嵌合体；以及(iv)(A')SEQ ID NO:18、或其RNA等同物或DNA/RNA嵌合体，以及(B')SEQ ID NO:15、或其RNA等同物或DNA/RNA嵌合体。18.根据权利要求1
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9中任一项所述的组合物，其中所述第一和第二CFB特异性靶杂交序列是(II)(c)的所述靶杂交序列。19.根据权利要求1
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18中任一项所述的组合物，其中如果所述组合物包含所述第二扩增寡聚物组合，则所述组合物进一步包含CFB特异性检测探针寡聚物，所述CFB特异性检测探针寡聚物包含长度为约15至约35个核苷酸并且被配置为与可被所述第一和第二CFB特异性扩增寡聚物扩增的CFB扩增子内含有的靶序列杂交的CFB特异性检测探针靶杂交序列。20.根据权利要求19所述的组合物，其中所述第一和第二CFB特异性靶杂交序列是(II)(b)的所述靶杂交序列，并且所述CFB特异性检测探针靶杂交序列是SEQ ID NO:24、或其RNA等同物或DNA/RNA嵌合体。21.根据权利要求19所述的组合物，其中所述第一和第二CFB特异性靶杂交序列是(II)(d)的所述靶杂交序列，并且所述CFB特异性检测探针靶杂交序列是SEQ ID NO:25、或其RNA等同物或DNA/RNA嵌合体。22.根据权利要求19所述的组合物，其中所述第一和第二CFB特异性靶杂交序列是(II)
(a)的所述靶杂交序列，并且所述CFB特异性检测探针靶杂交序列是SEQ ID NO:22或SEQ ID NO:23、或其RNA等同物或DNA/RNA嵌合体。23.根据权利要求19所述的组合物，其中所述第一和第二CFB特异性靶杂交序列是(II)(c)的所述靶杂交序列，并且所述CFB特异性检测探针靶杂交序列是SEQ ID NO:23、或其RNA等同物或DNA/RNA嵌合体。24.根据权利要求19
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23中任一项所述的组合物，其中所述CFB特异性检测探针寡聚物进一步包含可检测标记。25.根据权利要求24所述的组合物，其中所述可检测标记是荧光或化学发光标记。26.根据权利要求24所述的组合物，其中所述可检测标记是荧光标记，并且所述检测探针寡聚物进一步包含非荧光猝灭剂。27.根据权利要求1
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26中任一项所述的组合物，其中所述组合物包含所述第一和第二扩增寡聚物组合两者。28.一种用于确定样品中B群链球菌(GBS)的存在或不存在的组合物，所述组合物包含：扩增寡聚物组合，所述扩增寡聚物组合包含能够扩增GBS SIP靶核酸的靶区域的第一和第二SIP特异性扩增寡聚物，其中所述第一和第二SIP特异性扩增寡聚物分别包含选自以下项的第一(A)和第二(B)SIP特异性靶杂交序列：(a)(A)SEQ ID NO:3、或其RNA等同物或DNA/RNA嵌合体，以及(B)SEQ ID NO:4、或其RNA等同物或DNA/RNA嵌合体；以及(b)(A)SEQ ID NO:7、或其RNA等同物或DNA/RNA嵌合体，以及(B)SEQ ID NO:8、或其RNA等同物或DNA/RNA嵌合体。29.根据权利要求28所述的组合物，其中所述第一和第二SIP特异性靶杂交序列是(a)的所述靶杂交序列。30.根据权利要求28所述的组合物，其中所述第一和第二SIP特异性靶杂交序列是(b)的所述靶杂交序列。31.根据权利要求28
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30中任一项所述的组合物，其中所述组合物进一步包含SIP特异性检测探针寡聚物，所述SIP特异性检测探针寡聚物包含长度为约15至约35个核苷酸并且被配置为与可被所述第一和第二SIP特异性扩增寡聚物扩增的SIP扩增子内含有的靶序列杂交的SIP特异性检测探针靶杂交序列。32.根据权利要求31所述的组合物，其中所述第一和第二SIP特异性靶杂交序列是(a)的所述靶杂交序列，并且所述SIP特异性检测探针靶杂交序列是SEQ ID NO:9、或其RNA等同物或DNA/RNA嵌合体。33.根据权利要求32所述的组合物，其中所述第一和第二SIP特异性靶杂交序列是(b)的所述靶杂交序列，并且所述SIP特异性检测探针靶杂交序列是SEQ ID NO:11、或其RNA等同物或DNA/RNA嵌合体。34.根据权利要求31
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33中任一项所述的组合物，其中所述检测探针寡聚物进一步包含可检测标记。35.根据权利要求34所述的组合物，其中所述可检测标记是荧光或化学发光标记。36.根据权利要求34所述的组合物，其中所述可检测标记是荧光标记，并且所述检测探针寡聚物进一步包含非荧光猝灭剂。
37.根据权利要求28
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36中任一项所述的组合物，其进一步包含能够扩增GBSCFB靶核酸的靶区域的第二扩增寡聚物组合。38.一种用于确定样品中B群链球菌(GBS)的存在或不存在的组合物，所述组合物包含：扩增寡聚物组合，所述扩增寡聚物组合包含能够扩增GBS CFB靶核酸的靶区域的第一和第二CFB特异性扩增寡聚物，其中所述第一和第二CFB特异性扩增寡聚物分别包含选自以下项的第一(A)和第二(B)CFB特异性靶杂交序列：(a)(A)作为SEQ ID NO:26的序列中含有的约17至约24个连续核苷酸的序列、或其RNA等同物或DNA/RNA嵌合体，以及(B)SEQ ID NO:13或SEQ ID NO:15、或其RNA等同物或DNA/RNA嵌合体；(b)(A)SEQ ID NO:16、或其RNA等同物或DNA/RNA嵌合体，以及(B)SEQ ID NO:17、或其RNA等同物或DNA/RNA嵌合体；(c)(A)SEQ ID NO:18、或其RNA等同物或DNA/RNA嵌合体，以及(B)SEQ ID NO:15、或其RNA等同物或DNA/RNA嵌合体；以及(d)(A)SEQ ID NO:20、或其RNA等同物或DNA/RNA嵌合体，以及(B)SEQ ID NO:21、或其RNA等同物或DNA/RNA嵌合体。39.根据权利要求38所述的组合物，其中所述第一和第二CFB特异性靶杂交序列是(b)的所述靶杂交序列。40.根据权利要求38所述的组合物，其中所述第一和第二CFB特异性靶杂交序列是(d)的所述靶杂交序列。41.根据权利要求38所述的组合物，其中所述CFB特异性靶杂交序列是(a)的所述靶杂交序列。42.根据权利要求41所述的组合物，其中(a)的所述第一CFB特异性靶杂交序列至少包含SEQ ID NO:28的序列、或其RNA等同物或DNA/RNA嵌合体。43.根据权利要求42所述的组合物，其中(a)的所述第一CFB特异性靶杂交序列包含在SEQ ID NO:27的序列、或其RNA等同物或DNA/RNA嵌合体中。44.根据权利要求43所述的组合物，其中(a)的所述第一CFB特异性靶杂交序列是SEQ ID NO:12或SEQ ID NO:14、或其RNA等同物或DNA/RNA嵌合体。45.根据权利要求41所述的组合物，其中(a)的所述第一CFB特异性靶杂交序列是SEQ ID NO:18、或其RNA等同物或DNA/RNA嵌合体。46.根据权利要求41所述的组合物，其中(a)的所述第一(A)和第二(B)CFB特异性靶杂交序列选自(i)(A)SEQ ID NO:12、或其RNA等同物或DNA/RNA嵌合体，以及(B)SEQ ID NO:13、或其RNA等同物或DNA/RNA嵌合体；(ii)(A)SEQ ID NO:12、或其RNA等同物或DNA/RNA嵌合体，以及(B)SEQ ID NO:15、或其RNA等同物或DNA/RNA嵌合体；(iii)(A)SEQ ID NO:14、或其RNA等同物或DNA/RNA嵌合体，以及(B)SEQ ID NO:15、或其RNA等同物或DNA/RNA嵌合体；以及(iv)(A)SEQ ID NO:18、或其RNA等同物或DNA/RNA嵌合体，以及(B)SEQ ID NO:15、或其RNA等同物或DNA/RNA嵌合体。
47.根据权利要求38所述的组合物，其中所述第一和第二CFB特异性靶杂交序列是(c)的所述靶杂交序列。48.根据权利要求38
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47中任一项所述的组合物，其中所述组合物进一步包含CFB特异性检测探针寡聚物，所述CFB特异性检测探针寡聚物包含长度为约15至约35个核苷酸并且被配置为与可被所述第一和第二CFB特异性扩增寡聚物扩增的CFB扩增子内含有的靶序列杂交的CFB特异性检测探针靶杂交序列。49.根据权利要求48所述的组合物，其中所述第一和第二CFB特异性靶杂交序列是(b)的所述靶杂交序列，并且所述CFB特异性检测探针靶杂交序列是SEQ ID NO:24、或其RNA等同物或DNA/RNA嵌合体。50.根据权利要求48所述的组合物，其中所述第一和第二CFB特异性靶杂交序列是(d)的所述靶杂交序列，并且所述CFB特异性检测探针靶杂交序列是SEQ ID NO:25、或其RNA等同物或DNA/RNA嵌合体。51.根据权利要求48所述的组合物，其中所述第一和第二CFB特异性靶杂交序列是(a)的所述靶杂交序列，并且所述CFB特异性检测探针靶杂交序列是SEQ ID NO:22或SEQ ID NO:23、或其RNA等同物或DNA/RNA嵌合体。52.根据权利要求48所述的组合物，其中所述第一和第二CFB特异性靶杂交序列是(c)的所述靶杂交序列，并且所述CFB特异性检测探针靶杂交序列是SEQ ID NO:23、或其RNA等同物或DNA/RNA嵌合体。53.根据权利要求48
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52中任一项所述的组合物，其中所述检测探针寡聚物进一步包含可检测标记。54.根据权利要求53所述的组合物，其中所述可检测标记是荧光或化学发光标记。55.根据权利要求53所述的组合物，其中所述可检测标记是荧光标记，并且所述检测探针寡聚物进一步包含非荧光猝灭剂。56.根据权利要求38
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55中任一项所述的组合物，所述组合物进一步包含能够扩增GBS SIP靶核酸的靶区域的第二扩增寡聚物组合。57.一种用于确定样品中B群链球菌(GBS)的存在或不存在的试剂盒，所述试剂盒包含：(I)第一扩增寡聚物组合和第二扩增寡聚物组合中的至少一种，其中所述第一扩增寡聚物组合包含能够扩增GBS SIP靶核酸的靶区域的第一和第二SIP特异性扩增寡聚物，其中所述第一和第二SIP特异性扩增寡聚物分别包含选自以下项的第一(A)和第二(B)SIP特异性靶杂交序列：(a)(A)SEQ ID NO:3、或其RNA等同物或DNA/RNA嵌合体，以及(B)SEQ ID NO:4、或其RNA等同物或DNA/RNA嵌合体；以及(b)(A)SEQ ID NO:7、或其RNA等同物或DNA/RNA嵌合体，以及(B)SEQ ID NO:8、或其RNA等同物或DNA/RNA嵌合体；并且(II)所述第二扩增寡聚物组合包含能够扩增GBS CFB靶核酸的靶区域的第一和第二CFB特异性扩增寡聚物，其中所述第一和第二CFB特异性扩增寡聚物分别包含选自以下项的第一(A')和第二(B')CFB特异性靶杂交序列：(a)(A')作为SEQ ID NO:26的序列中含有的约17至约24个连续核苷酸的序列、或其RNA
等同物或DNA/RNA嵌合体，以及(B')SEQ ID NO:13或SEQ ID NO:15、或其RNA等同物或DNA/RNA嵌合体；(b)(A')SEQ ID NO:16、或其RNA等同物或DNA/RNA嵌合体，以及(B')SEQ ID NO:17、或其RNA等同物或DNA/RNA嵌合体；(c)(A')SEQ ID NO:18、或其RNA等同物或DNA/RNA嵌合体，以及(B')SEQ ID NO:15、或其RNA等同物或DNA/RNA嵌合体；以及(d)(A')SEQ ID NO:20、或其RNA等同物或DNA/RNA嵌合体，以及(B')SEQ ID NO:21、或其RNA等同物或DNA/RNA嵌合体。58.根据权利要求57所述的试剂盒，其中所述第一和第二SIP特异性靶杂交序列是(I)(a)的所述靶杂交序列。59.根据权利要求57所述的试剂盒，其中所述第一和第二SIP特异性靶杂交序列是(I)(b)的所述靶杂交序列。60.根据权利要求57
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59中任一项所述的试剂盒，其中如果所述试剂盒包含所述第一扩增寡聚物组合，则所述试剂盒进一步包含SIP特异性检测探针寡聚物，所述SIP特异性检测探针寡聚物包含长度为约15至约35个核苷酸并且被配置为与可被所述第一和第二SIP特异性扩增寡聚物扩增的SIP扩增子内含有的靶序列杂交的SIP特异性检测探针靶杂交序列。61.根据权利要求60所述的试剂盒，其中所述第一和第二SIP特异性靶杂交序列是(I)(a)的所述靶杂交序列，并且所述SIP特异性检测探针靶杂交序列是SEQ ID NO:9、或其RNA等同物或DNA/RNA嵌合体。62.根据权利要求60所述的试剂盒，其中所述第一和第二SIP特异性靶杂交序列是(I)(b)的所述靶杂交序列，并且所述SIP特异性检测探针靶杂交序列是SEQ ID NO:11、或其RNA等同物或DNA/RNA嵌合体。63.根据权利要求60
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62中任一项所述的试剂盒，其中所述SIP特异性检测探针寡聚物进一步包含可检测标记。64.根据权利要求63所述的试剂盒，其中所述可检测标记是荧光或化学发光标记。65.根据权利要求63所述的试剂盒，其中所述可检测标记是荧光标记，并且所述SIP特异性检测探针寡聚物进一步包含非荧光猝灭剂。66.根据权利要求57
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65中任一项所述的试剂盒，其中所述第一和第二CFB特异性靶杂交序列是(II)(b)的所述靶杂交序列。67.根据权利要求57
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65中任一项所述的试剂盒，其中所述第一和第二CFB特异性靶杂交序列是(II)(d)的所述靶杂交序列。68.根据权利要求57
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65中任一项所述的试剂盒，其中所述CFB特异性靶杂交序列是(II)(a)的所述靶杂交序列。69.根据权利要求68所述的试剂盒，其中(II)(a)的所述第一CFB特异性靶杂交序列至少包含SEQ ID NO:28的序列、或其RNA等同物或DNA/RNA嵌合体。70.根据权利要求69所述的试剂盒，其中(II)(a)的所述第一CFB特异性靶杂交序列包含在SEQ ID NO:27的序列、或其RNA等同物或DNA/RNA嵌合体中。71.根据权利要求70所述的试剂盒，其中(II)(a)的所述第一CFB特异性靶杂交序列是SEQ ID NO:12或SEQ ID NO:14、或其RNA等同物或DNA/RNA嵌合体。
72.根据权利要求68所述的试剂盒，其中(II)(a)的所述第一CFB特异性靶杂交序列是SEQ ID NO:18、或其RNA等同物或DNA/RNA嵌合体。73.根据权利要求68所述的试剂盒，其中(II)(a)的所述第一(A')和第二(B')CFB特异性靶杂交序列选自(i)(A')SEQ ID NO:12、或其RNA等同物或DNA/RNA嵌合体，以及(B')SEQ ID NO:13、或其RNA等同物或DNA/RNA嵌合体；(ii)(A')SEQ ID NO:12、或其RNA等同物或DNA/RNA嵌合体，以及(B')SEQ ID NO:15、或其RNA等同物或DNA/RNA嵌合体；(iii)(A')SEQ ID NO:14、或其RNA等同物或DNA/RNA嵌合体，以及(B')SEQ ID NO:15、或其RNA等同物或DNA/RNA嵌合体；以及(iv)(A')SEQ ID NO:18、或其RNA等同物或DNA/RNA嵌合体，以及(B')SEQ ID NO:15、或其RNA等同物或DNA/RNA嵌合体。74.根据权利要求57
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65中任一项所述的试剂盒，其中所述第一和第二CFB特异性靶杂交序列是(II)(c)的所述靶杂交序列。75.根据权利要求57
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74中任一项所述的试剂盒，其中如果所述试剂盒包含所述第二扩增寡聚物组合，则所述试剂盒进一步包含CFB特异性检测探针寡聚物，所述CFB特异性检测探针寡聚物包含长度为约15至约35个核苷酸并且被配置为与可被所述第一和第二CFB特异性扩增寡聚物扩增的CFB扩增子内含有的靶序列杂交的CFB特异性检测探针靶杂交序列。76.根据权利要求75所述的试剂盒，其中所述第一和第二CFB特异性靶杂交序列是(II)(b)的所述靶杂交序列，并且所述CFB特异性检测探针靶杂交序列是SEQ ID NO:24、或其RNA等同物或DNA/RNA嵌合体。77.根据权利要求75所述的试剂盒，其中所述第一和第二CFB特异性靶杂交序列是(II)(d)的所述靶杂交序列，并且所述CFB特异性检测探针靶杂交序列是SEQ ID NO:25、或其RNA等同物或DNA/RNA嵌合体。78.根据权利要求75所述的试剂盒，其中所述第一和第二CFB特异性靶杂交序列是(II)(a)的所述靶杂交序列，并且所述CFB特异性检测探针靶杂交序列是SEQ ID NO:22或SEQ ID NO:23、或其RNA等同物或DNA/RNA嵌合体。79.根据权利要求75所述的试剂盒，其中所述第一和第二CFB特异性靶杂交序列是(II)(c)的所述靶杂交序列，并且所述CFB特异性检测探针靶杂交序列是SEQ ID NO:23、或其RNA等同物或DNA/RNA嵌合体。80.根据权利要求75
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79中任一项所述的试剂盒，其中所述CFB特异性检测探针寡聚物进一步包含可检测标记。81.根据权利要求80所述的试剂盒，其中所述可检测标记是荧光或化学发光标记。82.根据权利要求80所述的试剂盒，其中所述可检测标记是荧光标记，并且所述检测探针寡聚物进一步包含非荧光猝灭剂。83.根据权利要求57
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82中任一项所述的试剂盒，其中所述试剂盒包含所述第一和第二扩增寡聚物组合两者。84.一种用于确定样品中B群链球菌(GBS)的存在或不存在的试剂盒，所述试剂盒包含：扩增寡聚物组合，所述扩增寡聚物组合包含能够扩增GBS SIP靶核酸的靶区域的第一
和第二SIP特异性扩增寡聚物，其中所述第一和第二SIP特异性扩增寡聚物分别包含选自以下项的第一(A)和第二(B)SIP特异性靶杂交序列：(a)(A)SEQ ID NO:3、或其RNA等同物或DNA/RNA嵌合体，以及(B)SEQ ID NO:4、或其RNA等同物或DNA/RNA嵌合体；以及(b)(A)SEQ ID NO:7、或其RNA等同物或DNA/RNA嵌合体，以及(B)SEQ ID NO:8、或其RNA等同物或DNA/RNA嵌合体。85.根据权利要求84所述的试剂盒，其中所述第一和第二SIP特异性靶杂交序列是(a)的所述靶杂交序列。86.根据权利要求84所述的试剂盒，其中所述第一和第二SIP特异性靶杂交序列是(b)的所述靶杂交序列。87.根据权利要求84
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86中任一项所述的试剂盒，其中所述试剂盒进一步包含SIP特异性检测探针寡聚物，所述SIP特异性检测探针寡聚物包含长度为约15至约35个核苷酸并且被配置为与可被所述第一和第二SIP特异性扩增寡聚物扩增的SIP扩增子内含有的靶序列杂交的SIP特异性检测探针靶杂交序列。88.根据权利要求87所述的试剂盒，其中所述第一和第二SIP特异性靶杂交序列是(a)的所述靶杂交序列，并且所述SIP特异性检测探针靶杂交序列是SEQ ID NO:9、或其RNA等同物或DNA/RNA嵌合体。89.根据权利要求88所述的试剂盒，其中所述第一和第二SIP特异性靶杂交序列是(b)的所述靶杂交序列，并且所述SIP特异性检测探针靶杂交序列是SEQ ID NO:11、或其RNA等同物或DNA/RNA嵌合体。90.根据权利要求87
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89中任一项所述的试剂盒，其中所述检测探针寡聚物进一步包含可检测标记。91.根据权利要求90所述的试剂盒，其中所述可检测标记是荧光或化学发光标记。92.根据权利要求90所述的试剂盒，其中所述可检测标记是荧光标记，并且所述检测探针寡聚物进一步包含非荧光猝灭剂。93.根据权利要求84
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92中任一项所述的试剂盒，所述试剂盒进一步包含能够扩增GBS CFB靶核酸的靶区域的第二扩增寡聚物组合。94.一种用于确定样品中B群链球菌(GBS)的存在或不存在的试剂盒，所述试剂盒包含：扩增寡聚物组合，所述扩增寡聚物组合包含能够扩增GBS CFB靶核酸的靶区域的第一和第二CFB特异性扩增寡聚物，其中所述第一和第二CFB特异性扩增寡聚物分别包含选自以下项的第一(A)和第二(B)CFB特异性靶杂交序列：(a)(A)作为SEQ ID NO:26的序列中含有的约17至约24个连续核苷酸的序列、或其RNA等同物或DNA/RNA嵌合体，以及(B)SEQ ID NO:13或SEQ ID NO:15、或其RNA等同物或DNA/RNA嵌合体；(b)(A)SEQ ID NO:16、或其RNA等同物或DNA/RNA嵌合体，以及(B)SEQ ID NO:17、或其RNA等同物或DNA/RNA嵌合体；(c)(A)SEQ ID NO:18、或其RNA等同物或DNA/RNA嵌合体，以及(B)SEQ ID NO:15、或其RNA等同物或DNA/RNA嵌合体；以及(d)(A)SEQ ID NO:20、或其RNA等同物或DNA/RNA嵌合体，以及
NO:23、或其RNA等同物或DNA/RNA嵌合体。108.根据权利要求104所述的试剂盒，其中所述第一和第二CFB特异性靶杂交序列是(c)的所述靶杂交序列，并且所述CFB特异性检测探针靶杂交序列是SEQ ID NO:23、或其RNA等同物或DNA/RNA嵌合体。109.根据权利要求104
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108中任一项所述的试剂盒，其中所述检测探针寡聚物进一步包含可检测标记。110.根据权利要求109所述的试剂盒，其中所述可检测标记是荧光或化学发光标记。111.根据权利要求109所述的试剂盒，其中所述可检测标记是荧光标记，并且所述检测探针寡聚物进一步包含非荧光猝灭剂。112.根据权利要求94
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111中任一项所述的试剂盒，所述试剂盒进一步包含能够扩增GBS SIP靶核酸的靶区域的第二扩增寡聚物组合。113.一种用于确定样品中B群链球菌(GBS)的存在或不存在的方法，所述方法包括：(1)使怀疑含有GBS的样品与第一扩增寡聚物组合和第二扩增寡聚物组合中的至少一种接触，其中(I)所述第一扩增寡聚物组合包含用于扩增GBS SIP靶核酸的靶区域的第一和第...

【专利技术属性】
技术研发人员：B，
申请(专利权)人：简，
类型：发明
国别省市：