【技术实现步骤摘要】
基于DNAwalker和G-四链体-血红素DNA酶检测EB病毒的序列组合和方法
本专利技术属于基因工程
,尤其涉及基于DNAwalker和G-四链体-血红素DNA酶检测EB病毒的序列组合和方法。
技术介绍
循环肿瘤DNA(ctDNA),是循环血中游离于细胞外的部分降解了的机体内源性核酸,是由于肿瘤细胞增生活跃时的自动释放、肿瘤细胞凋亡、坏死等原因进入血液,并可用于肿瘤的无创诊断。ctDNA在血液中浓度低且存在高水平的正常循环DNA的干扰,因此建立特异性高、快速、高灵敏ctDNA检测方法是一个很有挑战性的工作。为此,开发了具有信号扩增能力的各种策略,包括滚环扩增、链置换扩增、环介导等温扩增、荧光定量PCR等。这些方法多为单重信号放大技术,难以实现超高灵敏循环核酸的检测,难以对肿瘤早期进行有效预测,同时这些方法扩增目标核酸需要蛋白酶(如DNA聚合酶)的参与,然而蛋白质酶易受实验条件(温度、pH和离子浓度)的影响,容易导致检测重现性和准确性差,另外还存在检测成本高、实验过程繁琐、需要昂贵的仪器设备等缺陷,而且标记荧光 ...
【技术保护点】
1.基于DNA walker和G-四链体-血红素DNA酶检测EB病毒的序列组合,包括DNA步行者探针、轨道分子、保护序列、序列1和序列2;/n所述DNA步行者探针的核苷酸序列如SEQ ID No.1所示;/n所述轨道分子的核苷酸序列如SEQ ID No.2所示;/n所述保护序列的核苷酸序列如SEQ ID No.3所示;/n所述序列1的核苷酸序列如SEQ ID No.4所示;/n所述序列2的核苷酸序列如SEQ ID No.5所示。/n
【技术特征摘要】
1.基于DNAwalker和G-四链体-血红素DNA酶检测EB病毒的序列组合,包括DNA步行者探针、轨道分子、保护序列、序列1和序列2;
所述DNA步行者探针的核苷酸序列如SEQIDNo.1所示;
所述轨道分子的核苷酸序列如SEQIDNo.2所示;
所述保护序列的核苷酸序列如SEQIDNo.3所示;
所述序列1的核苷酸序列如SEQIDNo.4所示;
所述序列2的核苷酸序列如SEQIDNo.5所示。
2.一种非诊断目的地基于权利要求1所述的序列组合检测EB病毒的方法,其特征在于,包括以下步骤:
1)将所述DNA步行者探针和保护序列在95℃下处理5min、冷却,得到互补序列;
2)将所述轨道分子在95℃下处理5min、冷却,得到发夹结构;
3)将所述步骤1)得到的互补序列和步骤2)得到的发夹结构固定在微球上、封闭,得到固定有互补序列和发夹结构的微球;
4)将所述序列1固定在微球上、封闭,得到固定有序列1的微球;将所述序列2固定在微球上、封闭,得到固定有序列2的微球;
5)将所述步骤3)得到的固定有互补序列和发夹结构的微球与待测样品进行反应,得到反应物,将所述反应物离心,得到上清液;
6)将所述步骤4)得到的固定有序列1的微球与步骤5)得到的上清液杂交,得到杂交物;将所述步骤4)得到的固定有序列2的微球与CutsmartBuffer混合,得到混合物;将所述杂交物和混合物混合后进行孵育、离心,得到上清液;
7)将所述步骤6)得到的上清液与ABTS、双氧水混合后进行反应,在420nm处测量吸光度值,定义ΔA420nm=A420nm-A0,其中A420nm为待测样品的吸光度值,A0为EB病毒DNA浓度为0时的吸光度值,将得到的ΔA420...
【专利技术属性】
技术研发人员:张何,傅昕,周秋香,乌玉芳,邹婷,
申请(专利权)人:湖南工程学院,
类型:发明
国别省市:湖南;43
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