溶于复杂混合物中的不同分子靶的分离和/或分析设备制造技术

技术编号:2584864 阅读:162 留言:0更新日期:2012-04-11 18:40
本发明专利技术涉及分离和/或分析溶于复杂混合物中的一些靶分子的设备,其特征在于其包括a)微型柱阵列,其中每个微型柱(2)包括固定的分子探针,其通过特定探针/靶连接能保留在该复杂混合物中含有的特异分子靶,b)第一毛细管网(3),将加到本发明专利技术设备的复杂混合物循环到在a)定义的阵列的每个微型柱中,c)第二毛细管网(4),在洗脱后将保留在所述微型柱上的分子靶循环到进行其回收和/或分析的检测器(5)中,以及d)如果必要,用于回收和/或分析不同的分子靶的检测器(5),优选为质谱仪形式。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】
本专利技术涉及分离和/或分析溶于复杂混合物中的不同分子靶、特别是核酸或蛋白质分子靶的设备。本专利技术特别涉及分离或分析分子靶的设备,其中包括由生物聚合物探针构成的芯片或阵列。这样设备用于分离和/或检测溶于复杂溶液中的多种分子靶。根据本专利技术的第一个实施方式,设备包括a.微型柱阵列,其包括放置在同一平面上的N个行和P个列的微型柱,每个微型柱包括一种固定的分子探针型,根据本专利技术的一个实施方式,通过探针/靶特异连接,能保留在复杂混合物中存在的特异分子靶,b.平行于所述微型柱阵列平面并在其上面的平面内的第一毛细管网,所述的第一毛细管网能将接到所述设备中的复杂混合物循环到如在a中定义的阵列的每个微型柱中,c.平行于该微型柱阵列平面并在其下面的平面内的第二毛细管网,所述的第二毛细管网能将洗脱后的分子靶循环到一个或多个检测器中,由此回收它们和/或对它们进行分析,d.如果必要,用于回收和/或分析不同的分子靶的检测器,优选质谱仪。本专利技术还涉及分离和/或检测溶于复杂溶液中的多种分子靶的设备,所述的设备包括a.毛细管网,它能使加入所述设备的复杂混合物循环,b.两组置于毛细管网两侧的电极-官能化电极组,其中这些电极接入由点组成的探针,每种探针通过探针/靶的特异连接能保留在该复杂混合物存在的特异分子靶,-非官能化电极组。本专利技术还涉及这样一种设备尤其在分离和/或分析生物试样中含有的DNA或RNA分子中的用途。人们知道可采用质谱法分析测定大分子的质量,例如DNA、RNA或蛋白质的质量。如果采用这种方法分析伴随有分子分解,还可以测定它们的序列。不过,对于具有不同尺寸和序列的分子混合物,采用这种技术就变得很困难,甚至不可能鉴别这些不同的分子。可采用其它方法替代质谱进行检测。因此,表面等离子体共振(SPR)能够测定用具有自由电子金属(例如金或铂等)制成的小厚度(xnm)薄片表面上小距离(200nm以下)内的累计物质密度。事实上,在该金属薄片的其中一个面上反射波随在另一面附近物质的密度和量成比例地改变。然而,确实不可能区分引起反射波改变的不同类分子。此外,采用这种方法,检测在生物-芯片上固定靶的灵敏度目前低于使用标记分子荧光所达到的灵敏度。在该金属表面上探针存在本身因远离金属靶而降低其检测灵敏度。动力学测量靶/探针相互作用时,在该表面附近存在的自由靶分子使这种测量走样。一般而言,由于效能的缘故,采用SPR方法检测需要使用比荧光或放射性标记法多的材料量。因此,采用SPR检测还与一些实验不相容,特别在诊断领域更是如此。另外,可以求助于测量在不同分子状态之间存在的阻抗变化。具有一定序列的单链DNA分子的阻抗与相应的双链配对复合体的不同。这种性质用于评估DNA芯片上的杂交比例,因此可评估在生物-芯片上生成的探针-靶复合体数(ref.)。一般而言,这些阻抗变化可以用于研究分子间的相互作用,例如配体固定在其受体上,但也可以用于研究DNA或蛋白质与药物、离子等之间的相互作用。不过,对于这些生物芯片,这种检测方法受到下述因素制约1)难以制造2000个点以上的高密度芯片。事实上,由于制造这些阻抗芯片所使用的电极尺寸和连接物几何结构,点数一超过800个,杂交面积就变得非常大。然而大的杂交面积要求应该布满很大杂交面积的试样体积,因此需要大量的生物材料,以便达到这种检测的最小浓度。这与例如对于这些诊断可使用材料不多的实验有矛盾。2)所研究分子的构象变化(探针和/或靶)会造成测量结果的假改变,导致不能解释测量的阻抗变化。例如,由于分子内序列或杂交而产生的DNA变形与杂交所引起阻抗的变化为相同的数量级。在现有技术中采用场效应晶体管作为电流放大器,测量与DNA分子杂交相关的阻抗变化(ref.)。把探针接到晶体管栅极。这些靶固定后,它们改变了栅极阻抗,这样引起在(晶体管输入)电源与晶体管输出漏极之间的电流改变。但是,还没有描述过这类检测器的任何网状结构。使用场效应晶体管作为电流放大器这个事实制约了为证明与杂交相关阻抗变化而可使用的交流电流频率,自此制约了检测器的灵敏度(ref.)。此外在上述说明中,这种栅极控制了晶体管中电流通过,其中植入这些探针消除了使用如电极的晶体管不同端子来控制靶运动,由此引导杂交集中在靶与探针层面上的可能。由生物聚合物探针组成的阵列(DNA芯片、蛋白质芯片等)能够定性和定量地分离在混合物中存在的生物聚合物,这在理论上是可行的,不管其数量、序列和复杂性。但是,例如核酸网络不能绝对精确地计算杂交分子数。此外,采用实际可用的技术,检测生物芯片上的生物聚合物(微-阵列)是间接的,因此需要一个对它们进行标记的步骤(荧光、放射性等)。如果在生物聚合物中放射性标记残留物和冷残留物加入效率几乎相同时,这与使用荧光标记物不同(Martinez等人,《Nucl.Acids.Res.》2003,31,第18页;Hoen等人,《Nucleic Acids Res.》,2003年3月1日,31(5),第20页)。合成加入荧光标记物CY3和CY5的DNA分子时尤其会遇到这些标记问题。由该后一类标记得到的立体阻塞物还可能严重地改变反应(通常的杂交、抗体-抗原反应、靶-配体反应等)的动力学和化学计算量平衡。采用放射性同位素可克服这些立体阻塞物问题;不过,这些放射性同位素牵涉到放射性废物的管理。另外,采用放射性方法标记分子的检测技术,即实质上放射性的磷成像类检测技术(Bertucci F等人,《Hum Mol Genet.》,1999年9月,8(9),第1715-22页;Erratum in,《Hum Mol Genet.》1999年10月,8(11),第2129页),与不同类型的荧光检测扫描仪,对于达到进行测量的检测阈值和再现性,在芯片上待杂交生物材料量方面有一些限制。事实上,不可能使用含有低细胞数(约1000个细胞)的试样通过细胞检测以某些拷贝数存在的分子,然而,这些细胞数量却与通常的临床取样情况相对应。使用经典DNA芯片的另一种选择在于使用沿整个毛细管长度呈环状排列的探针使该毛细管内官能化,每个环是由对一种基因特异的探针型构成的。较小的毛细管直径(约100μm)能够在理论上减少可分析试样的体积,因此例如使用较低的标记生物材料量就能够达到荧光法可检测的浓度。然而,与降低反应体积相同,在探针环中每个进行杂交靶的浓度依赖于整个毛细管的体积。探针数增加得越大,毛细管的长度就应该越长,达到检测浓度需要的材料量(例如待分析试样)就越大(毛细管的体积与其长度成正比)。使用毛细管时,与试样标记相关的这些问题依然相同。另外,使用大量不同探针生产官能化的毛细管是棘手的,费用也高。最后,一般而言在该技术状况中描述的DNA或蛋白质芯片是单次使用,这样使每个实验点的使用成本非常高。这种使用的独特性大大制约了这些技术在为诊断所作的临床研究和试验方面的普及。本专利技术提供一种设备,它能够分离和/或分析在复杂混合物中存在的特异分子靶,特别是生物聚合物分子靶,例如RNA、DNA或蛋白质分子。本专利技术的设备在大量实验中是可重复使用的,还能够测量约微微微摩尔(10-18),甚至zepto摩尔(10-21)的产物浓度。使用有限细胞数,例如约千个,甚至百个细胞,这些极限能够通过细胞鉴定单拷贝存在的分子。另外本文档来自技高网...

【技术保护点】
分离和/或分析溶于复杂混合物中的不同分子靶的设备,所述的设备包括:    a.微型柱阵列,其包括放置在同一平面上的N个行和P个列的微型柱,每个微型柱包括固定的分子探针型,通过探针/靶特异连接,以保留复杂混合物中存在的特异分子靶,    b.平行于所述微型柱阵列平面、并位于所述微型柱阵列平面之上的平面内的第一毛细管网,所述的第一毛细管网可将接到该设备中的复杂混合物循环到a中定义的阵列的每个微型柱中,    c.平行于微型柱阵列平面、并位于所述微型柱阵列之下的平面内的第二毛细管网,所述的第二毛细管网可将洗脱后的所述分子靶循环到一个或多个检测器中,以此对其回收和/或分析,    d.如果必要,检测器,其回收和/或分析所述不同的分子靶,优选其为质谱仪。

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】...

【专利技术属性】
技术研发人员:尼古拉斯乌戈林西尔维舍维拉尔卡特琳奥里热罗姆勒博
申请(专利权)人:原子能委员会
类型:发明
国别省市:FR[法国]

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