微生物菌群在急性胰腺炎中的应用制造技术

本发明专利技术公开了微生物菌群在急性胰腺炎中的应用，所述微生物菌群为Ruminococcus_gauvreauii_group。本发明专利技术的微生物标志物预测急性胰腺炎敏感性高，特异性强，通过检测微生物标志物的丰度，可用于警示受试者，进一步通过调整饮食或医疗介入减少风险。

【技术实现步骤摘要】
微生物菌群在急性胰腺炎中的应用
本专利技术属于生物
，涉及与微生物菌群在急性胰腺炎中的应用。
技术介绍
急性胰腺炎(acutepancreatitis,AP)是一种可导致局部损伤、全身炎症反应综合征(systemicinflammatoryresponsesyndrome，SIRS)和器官衰竭的炎症性疾病。随着社会的不断发展和进步，人们生活水平的提高，高脂饮食，低运动量，过度工作压力，酗酒等饮酒习惯增加等原因，胰腺炎的发病率增加，导致急性胰腺炎的发病率增加。急性胰腺炎占急腹症的3％-10％，这是临床常见的急腹症。这种疾病对生理学有很大的破坏性。它具有起效快，发展迅速，风险高，死亡率高的特点。急性胰腺在急性期和其他的非急性胰腺炎型的急腹症鉴别相对困难，这会造成对诊断和治疗带来了延迟或耽误病情的情况，这样会给患者的生命安全构成了威胁。引发胰腺炎症反应和坏死过程的具体机制尚不清楚。中华医学会胰腺外科学会修订了“急性胰腺炎的诊断和治疗指南’，(2014)，明确了急性胰腺炎的诊断定义:通过满足或满足以下条件诊断急性胰腺炎:腹痛符合AP；血清淀粉酶和/或脂肪酶活性超过正常上限的三倍；影像学检查符合AP影像学改变(LiPinskiM,Rydzewska一RosolowskaA,RydzewskiA,etal.FluidresuscitationinacutePancreatitis:normalsalineorlactatedRinger7Ssolution.Wor1dJGastroenterol,2015，21(31):9367-9372.)。传统的诊断方法(如CT)需要很长时间，过程复杂，不利于及时，动态地监测疾病的变化。尤其是在基层医院临床应用中受到条件限制，CT扫描检查对影像医生读片的要求更高，有必要结合相应的临床症状来诊断疾病。已运用于临床的预后的评分系统很多，如格拉斯哥评分系统、阿帕奇综合肥胖评分(APACHE-O)，预后胰腺炎(POP)，急性生理和慢性健康评估II(APACHEII)，无害急性胰腺炎评分(HAPS)，急性胰腺炎严重程度的床边指标，E-胰腺炎(BISAP)，日本严重程度评分(JSS)等。但这些评分系统较为复杂、繁琐，且都有很高的假阳性率，并不被临床医生经常使用。因此在临床诊治当中，寻找合适的、便捷的预测AP患者生物学指标具有重要的意义。肠道菌群被称为人类“第二指纹”，正常情况下，肠道菌群与宿主之间和平共生，处于平衡状态，一旦平衡被打破，肠道菌群结构出现紊乱，肠道微生物可通过多种途径影响人类健康(JanssenAW,KerstenS,etal.Theroleofthegutmicrobiotainmetabolichealth[J].FASEBJourna1,2015,29(8):3111-3123.)，如胃肠道疾病如炎症性肠病、肠易激综合征、结肠癌等和胃肠外疾病如阿尔兹海默病、冠心病、肥胖、糖尿病等。目前对于急性胰腺炎患者的的微生物组特征的研究非常有限，本申请通过研究急性胰腺炎患者与健康受试者的微生物组特征，发现呈现显著性差异的微生物菌群，以期实现急性胰腺炎的诊断和治疗。
技术实现思路
针对现有技术的不足及实际的需求，本专利技术的目的在于提供一种用于评估急性胰腺炎的微生物标志物及其应用，本专利技术的微生物标志物预测急性胰腺炎风险的灵敏性好，只需要获取微生物标志物的相对含量，作为协助诊断，指导微生物环境的调整，降低急性胰腺炎的风险。为达上述目的，本专利技术采用以下技术方案：第一方面，本专利技术提供一种急性胰腺炎微生物标志物，所述微生物标志物为g_Ruminococcus_gauvreauii_group。第二方面，本专利技术提供了一种检测第一方面所述的微生物标志物的试剂。第三方面，本专利技术提供了一种第一方面所述的微生物标志物或第二方面所述的试剂的用途，所述用途包括用于构建预测急性胰腺炎风险的模型、制备诊断急性胰腺炎的产品。优选地，所述产品包括芯片、试剂盒、试纸。优选地，所述模型的输入变量为第一方面所述的微生物标志物的丰度。优选地，所述微生物标志物丰度的测定方法包括宏基因组测序、16S测序或qPCR定量检测中的任意一种或几种。第四方面，本专利技术提供了一种诊断急性胰腺炎的产品，所述产品包括第二方面所述的试剂。优选地，所述试剂包括检测第一方面所述的微生物标志物的特异性的引物、探针、反义寡核苷酸、适配体或抗体。第五方面，本专利技术提供了第一方面所述的微生物标志物在制备预防急性胰腺炎的药物或食品中的用途。优选地，所述药物或食品包括促进所述微生物标志物丰度增加的试剂。本专利技术的优点和有益效果：本专利技术首次发现了g_Ruminococcus_gauvreauii_group与急性胰腺炎相关，Ruminococcus_gauvreauii_group在急性胰腺炎患者中丰度显著降低，说明Ruminococcus_gauvreauii_group可作为检测靶标应用于急性胰腺炎的诊断和预测。本专利技术提供了一种诊断急性胰腺炎的产品，所述产品能在疾病早期进行诊断，实现早期预警，提高患者的生活质量。附图说明图1是Ruminococcus_gauvreauii_group在急性胰腺炎患者中的丰度图。图2是Ruminococcus_gauvreauii_group作为检测变量的诊断效能图。具体实施方式本专利技术通过将健康的人群和急性胰腺炎的人群作为对象，首次查明了细菌与急性胰腺炎的临床医学指标的相关性，并以此为基础提供了急性胰腺炎的早期诊断技术。为了评估微生物菌群能否作为急性胰腺炎的预测因子，本专利技术通过收集正常人群与急性胰腺炎的直肠棉拭子，综合分析16SrRNA测序、宏基因组测序和针对特定菌群的定量聚合酶链反应结果，发现与急性胰腺炎相关的微生物菌群，本专利技术通过16SrRNA测序，首次发现了g_Ruminococcus_gauvreauii_group的丰度在急性胰腺炎和正常人群中呈现显著性差异，说明g_Ruminococcus_gauvreauii_group可作为急性胰腺炎诊断的生物标志物。在本专利技术的实施方式中，本专利技术通过以下步骤来诊断急性胰腺炎：在来自个体的核酸样本中，检测与急性胰腺炎的诊断相关的菌种所对应的一个或多个核酸片段。在特定的实施方式中，检测对应于Ruminococcus_gauvreauii_group的核酸片段。在实施本文描述的方法中，使用分子生物学、蛋白质生物化学、细胞生物学、免疫学、微生物学和重组DNA方面的很多传统技术，这些技术是公知的。下文提供了本说明书中使用的一些术语的定义。除非另有说明，本文中使用的所有技术和科学用语通常具有和本专利技术所属领域的普通技术人员通常理解的意思相同的意思。本文中术语“OTU”(操作分类单元)是指系统发生树中的末端叶(terminalleaf)，由特定的遗传序列以及与该序列在科、属、种或菌株水平上享有序列同一性的全体序列来定义。本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种急性胰腺炎的微生物标志物，其特征在于，所述微生物标志物Ruminococcus_gauvreauii_group。/n

【技术特征摘要】
1.一种急性胰腺炎的微生物标志物，其特征在于，所述微生物标志物Ruminococcus_gauvreauii_group。


2.一种检测权利要求1所述的微生物标志物的试剂。


3.一种权利要求1所述的微生物标志物或权利要求2所述的试剂的用途，其特征在于，所述用途包括用于构建预测急性胰腺炎风险的模型、制备诊断急性胰腺炎的产品。


4.根据权利要求3所述的用途，其特征在于，所述产品包括芯片、试剂盒、试纸。


5.根据权利要求3所述的用途，其特征在于，所述模型的输入变量为权利要求1所述的微生物标志物的丰度。


6.根据...

【专利技术属性】
技术研发人员：吴东，李佳宁，施文，陈国榕，宋锴，龚亮，吉利，李景南，钱家鸣，
申请(专利权)人：中国医学科学院北京协和医院，
类型：发明
国别省市：北京;11