一种核苷酸组合物、包含其的检测试剂盒及其应用制造技术

技术编号:24841514 阅读:24 留言:0更新日期:2020-07-10 18:58
本发明专利技术提供一种核苷酸组合物、包含其的检测试剂盒及其应用。所述核苷酸组合物包括:野生型非人源寡核苷酸链和突变型非人源寡核苷酸链,同时还提供一种包含所述核苷酸组合物的检测试剂盒。通过向待测样本中加入所述检测试剂盒中的核苷酸组合物,利用高通量测序和生物信息分析,检测靶向富集核酸Panel的灵敏度。该检测试剂盒可有效地提高靶向捕获Panel的检测效率,矫正靶向捕获技术在测序中带来的噪音,降低分析噪声,大大提高靶向捕获技术的可靠性。

【技术实现步骤摘要】
一种核苷酸组合物、包含其的检测试剂盒及其应用
本专利技术涉及分子生物学
,具体涉及一种核苷酸组合物、包含其的检测试剂盒及其应用,尤其涉及一种核苷酸组合物、包含其的用于检测靶向富集核酸Panel灵敏度的试剂盒及其应用。
技术介绍
DNA是人类遗传的物质基础,为了弄清DNA在人类遗传和发育过程中的功能和结构,DNA序列的检测成为了研究DNA最重要的手段。1977年Sanger专利技术了具有里程碑意义的末端终止测序法,同年A.M.Maxam和W.Gilbert专利技术了化学降解法。Sanger法因为既简便又快速,并经过后续的不断改良,成为了第一代DNA测序的主流。随着科学技术的不断革新,第一代DNA测序技术(Sanger)已无法满足测序的需求,1990年,美国正式启动跨世纪的“人类基因组计划”,计划历时15年,斥资30亿美元,破译人类自身遗传秘密,人类步入了后基因组时代。随着对DNA信息的海量需求,二代测序诞生了,该技术基于一项边合成边测序技术,代表公司有Roche(454),Illumina(Solexa),ABI(SOLID)。随着二代测序技术的飞速发展,该技术也被广泛用于遗传性突变,疾病发病机理,遗传机理等多种医学,遗传学等医疗领域。近几年来,随着外周血中游离循环肿瘤DNA被发现和靶向捕获测序技术的发展,越来越多的用于医疗检测特异性Panel不断涌现,这些Panel都是根据不同疾病,不同的研究目的进行设计,并且Panel合成的途径也大多不相同。在繁多的靶向Panel面前,如何选择一个捕获效果最佳的Panel成为了科研人员在使用靶向捕获技术研究相关疾病的瓶颈问题,同时如何评估靶向Panel的医学检测灵敏度也成为了一大难题。因此,如何有效的检测靶向Panel的捕获效果及灵敏度成为了迫在眉睫需要解决的问题。
技术实现思路
针对现有技术存在的不足,本专利技术的目的在于提供一种核苷酸组合物、包含其的检测试剂盒及其应用,所述核苷酸组合物、包含其的检测试剂盒能够检测靶向Panel的捕获效果及灵敏度。为达此目的,本专利技术采用以下技术方案:第一方面,本专利技术提供一种核苷酸组合物,所述核苷酸组合物包括:野生型非人源寡核苷酸链和突变型非人源寡核苷酸链。本专利技术中,所述核酸组合物包含野生型和突变型非人源寡核苷酸链,两种不同的寡核苷酸链能够更容易被靶向捕获Panel中使用的试剂盒所捕获和抓取,有效地提高检测结果的准确度和可靠性。优选地,所述野生型非人源寡核苷酸链和突变型非人源寡核苷酸链来源于东亚正钳蝎。优选地,所述野生型非人源寡核苷酸链包括至少2条寡核苷酸链,例如可以是2条、3条、4条、5条、6条、8条、10条、12条或15条等。优选地,所述突变型非人源寡核苷酸链包括至少2条寡核苷酸链,例如可以是2条、3条、4条、5条、6条、8条、10条、12条或15条等。本专利技术中,所述寡核苷酸链的数量并无具体限制,可以扩展为多条寡核苷酸链,但是综合考虑具体制备成本和时间与测量结果的准确度,本专利技术中选择4条野生型非人源寡核苷酸链和6条突变型非人源寡核苷酸链。作为本专利技术优选的技术方案,所述核苷酸组合物包括:4条野生型非人源寡核苷酸链,编号为Oligo1、Oligo2、Oligo3和Oligo4;和6条突变型非人源寡核苷酸链,编号为Oligo5、Oligo6、Oligo7、Oligo8、Oligo9和Oligo10。本专利技术中,Oligo1-10可以分别对应SEQNOID.1~10。SEQNOID.1~10的序列如下表1所示:表1优选地,所述Oligo1-10的长度均不相同,确保可以覆盖不同长度的reads。作为本专利技术优选的技术方案,所述野生型非人源寡核苷酸链和突变型非人源寡核苷酸链的长度为80-200bp,例如可以是80bp、90bp、100bp、110bp、120bp、130bp、140bp、150bp、160bp、170bp、180bp、190bp或200bp等。所述寡核苷酸链的长度为80-200bp,能够更加准确地被待测试剂盒抓取,若是寡核苷酸链的长度过长或过段,均会影响检测结果的准确性。第二方面,本专利技术提供一种检测试剂盒,包含如第一方面所述的核苷酸组合物。作为本专利技术优选的技术方案,,所述核苷酸组合物中野生型非人源寡核苷酸链的混合液的pH值为7.3-8.5,例如可以是7.3、7.5、7.6、7.8、7.9、8、8.1、8.2、8.3、8.4或8.5等。优选地,所述Oligo1-4的工作浓度相同或不同,Oligo1-4的工作浓度为0.01-0.06fg/μL,例如可以是0.01fg/μL、0.02fg/μL、0.03fg/μL、0.04fg/μL、0.05fg/μL或0.06fg/μL等。进一步优选地,所述Oligo1-4的工作浓度相同。作为本专利技术优选的技术方案,所述核苷酸组合物中突变型非人源寡核苷酸链的混合液的pH值为7.3-8.5,例如可以是7.3、7.5、7.6、7.8、7.9、8、8.1、8.2、8.3、8.4或8.5等。优选地,所述Oligo5-10的工作浓度相同或不同,所述Oligo5-10的工作浓度为0.001-0.6fg/μL,例如可以是0.001fg/μL、0.005fg/μL、0.008fg/μL、0.01fg/μL、0.02fg/μL、0.03fg/μL、0.04fg/μL、0.05fg/μL或0.06fg/μL等。作为本专利技术优选的技术方案,所述Oligo5的工作浓度为0.1-0.6fg/μL,例如可以是0.1fg/μL、0.2fg/μL、0.3fg/μL、0.4fg/μL、0.5fg/μL或0.6fg/μL等。优选地,所述Oligo6的工作浓度为0.1-0.6fg/μL,例如可以是0.1fg/μL、0.2fg/μL、0.3fg/μL、0.4fg/μL、0.5fg/μL或0.6fg/μL等。优选地,所述Oligo7的工作浓度为0.01-0.06fg/μL,例如可以是0.01fg/μL、0.02fg/μL、0.03fg/μL、0.04fg/μL、0.05fg/μL或0.06fg/μL等。优选地,所述Oligo8的工作浓度为0.01-0.06fg/μL,例如可以是0.01fg/μL、0.02fg/μL、0.03fg/μL、0.04fg/μL、0.05fg/μL或0.06fg/μL等。优选地,所述Oligo9的工作浓度为0.001-0.006fg/μL,例如可以是0.001fg/μL、0.002fg/μL、0.003fg/μL、0.004fg/μL、0.005fg/μL或0.006fg/μL等。优选地,所述Oligo10的工作浓度为0.001-0.006fg/μL,例如可以是0.001fg/μL、0.002fg/μL、0.003fg/μL、0.004fg/μL、0.005fg/μL或0.006fg/μL等。本发本文档来自技高网
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【技术保护点】
1.一种核苷酸组合物,其特征在于,所述核苷酸组合物包括:野生型非人源寡核苷酸链和突变型非人源寡核苷酸链。/n

【技术特征摘要】
1.一种核苷酸组合物,其特征在于,所述核苷酸组合物包括:野生型非人源寡核苷酸链和突变型非人源寡核苷酸链。


2.根据权利要求1所述的核苷酸组合物,其特征在于,所述野生型非人源寡核苷酸链和突变型非人源寡核苷酸链来源于东亚正钳蝎;
优选地,所述野生型非人源寡核苷酸链包括至少两条寡核苷酸链;
优选地,所述突变型非人源寡核苷酸链包括至少两条寡核苷酸链。


3.根据权利要求1或2所述的核苷酸组合物,其特征在于,所述核苷酸组合物包括:
四条野生型非人源寡核苷酸链,编号为Oligo1、Oligo2、Oligo3和Oligo4;和六条突变型非人源寡核苷酸链,编号为Oligo5、Oligo6、Oligo7、Oligo8、Oligo9和Oligo10;
优选地,所述野生型非人源寡核苷酸链和突变型非人源寡核苷酸链的长度为80-200bp;
优选地,所述Oligo1-10的长度均不相同。


4.一种检测试剂盒,其特征在于,包含如权利要求1-3任一项所述的核苷酸组合物。


5.根据权利要求4所述的检测试剂盒,其特征在于,所述核苷酸组合物中野生型非人源寡核苷酸链的混合液的pH值为7.3-8.5;
优选地,所述Oligo1-4的工作浓度相同或不同,Oligo1-4的工作浓度为0.01-0.06fg/μL,进一步优选地,所述Oligo1-4的工作浓度相同。


6.根据权利要求4或5所述的检测试剂盒,其特征在于,所述核苷酸组合物中突变型非人源寡核苷酸...

【专利技术属性】
技术研发人员:魏冬凯闻彬浦宇陆亚红张亚飞
申请(专利权)人:迈杰转化医学研究苏州有限公司
类型:发明
国别省市:江苏;32

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