模拟血浆cfDNA及制备方法和测序文库的构建方法技术

技术编号:24005773 阅读:142 留言:0更新日期:2020-05-02 00:11
本发明专利技术涉及一种模拟血浆cfDNA及制备方法和测序文库的构建方法。该模拟血浆cfDNA的制备方法包括:提供培养细胞,利用消化液对所述细胞进行破碎处理,分离获得含有基因组DNA的样本;利用亚特兰提斯双链DNA酶对所述含有基因组DNA的样本进行酶切处理,以便获得所述模拟血浆cfDNA。通过该方法获得的模拟血浆cfDNA具有和天然血浆cfDNA相似的片段大小、分布和序列复杂度,而且制备方法简单,不需要片段化仪器,节约仪器成本。

Simulated plasma cfdna and its preparation and construction of sequencing Library

【技术实现步骤摘要】
模拟血浆cfDNA及制备方法和测序文库的构建方法
本专利技术涉及生物
,具体涉及一种模拟血浆cfDNA及制备方法和测序文库的构建方法。
技术介绍
据全球癌症统计,2018年世界范围新发癌症病例为1810万,新增死亡病例960万,癌症已成为人类的第一杀手。伴随癌症的发病率和死亡率的增长,科技创新和基因检测水平的发展,癌症的分子筛查、基因辅助治疗也日益成为当代科学家和各个科研机构的研究热点和精准用药的重要辅助手段。液体活检技术正日益成为实验室检测癌症分子的主要手段,相较于组织活检经常存在的样本不足,取样异质性等问题,血浆ctDNA的液体活检具有的取样便利性和非入侵性等优势,也越来越受到癌症患者和医学研究者的青睐。但是血浆ctDNA液体活检也存在一些技术上的挑战,最重要的是需要建立一套完整的实验体系和生信分析,并经过严格的性能验证,从而能保证更低频率的突变信息被稳定、可重复的检出。这也需要一种可以稳定制备、长期保存、性能稳定、突变覆盖率高的模拟血浆cfDNA。如何获得性能稳定的、与天然cfDNA性能接近的模拟血浆cfDNA,还需本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种制备模拟血浆cfDNA的方法,其特征在于,包括:/n提供培养细胞,利用消化液对所述细胞进行破碎处理,分离获得含有基因组DNA的样本;/n利用亚特兰提斯双链DNA酶对所述含有基因组DNA的样本进行酶切处理,以便获得所述模拟血浆cfDNA。/n

【技术特征摘要】
1.一种制备模拟血浆cfDNA的方法,其特征在于,包括:
提供培养细胞,利用消化液对所述细胞进行破碎处理,分离获得含有基因组DNA的样本;
利用亚特兰提斯双链DNA酶对所述含有基因组DNA的样本进行酶切处理,以便获得所述模拟血浆cfDNA。


2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述酶切处理的温度为37~42摄氏度,优选为42摄氏度。


3.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,每106个细胞需要亚特兰提斯双链DNA酶的用量为1U以上;
任选地,所述酶切处理的时间为20~60分钟。


4.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述模拟血浆cfDNA中大小在80~220bp的核酸占比在70%以上。


5.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述细胞为携带基因突变的细胞株或野生型细胞株。


6.根据权利要求5所述的方法,其特征在于,进一步包括:
将通过携带基因突变的细...

【专利技术属性】
技术研发人员:毛瑞芳王量闫慧慧
申请(专利权)人:杭州瑞普基因科技有限公司
类型:发明
国别省市:浙江;33

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